MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	ATTT	2	8	679	686	25 %	75 %	0 %	0 %	153941554
2	NC_009700	CTAT	2	8	756	763	25 %	50 %	0 %	25 %	153941554
3	NC_009700	TTGT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	153941563
4	NC_009700	TAAT	2	8	1695	1702	50 %	50 %	0 %	0 %	153941569
5	NC_009700	ATAA	2	8	2243	2250	75 %	25 %	0 %	0 %	153941566
6	NC_009700	TAAT	2	8	2381	2388	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
7	NC_009700	AAAT	2	8	2396	2403	75 %	25 %	0 %	0 %	153941561
8	NC_009700	ATGA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	25 %	0 %	153941565
9	NC_009700	GGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	50 %	25 %	153941565
10	NC_009700	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
11	NC_009700	TTAT	3	12	4723	4734	25 %	75 %	0 %	0 %	153941558
12	NC_009700	TTTG	2	8	5183	5190	0 %	75 %	25 %	0 %	153941558
13	NC_009700	ATCT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	0 %	25 %	153941548
14	NC_009700	CTTT	2	8	5760	5767	0 %	75 %	0 %	25 %	153941548
15	NC_009700	CTTT	2	8	5982	5989	0 %	75 %	0 %	25 %	153941548
16	NC_009700	AATA	2	8	6005	6012	75 %	25 %	0 %	0 %	153941548
17	NC_009700	TAAA	2	8	6248	6255	75 %	25 %	0 %	0 %	153941548
18	NC_009700	TTAT	2	8	6270	6277	25 %	75 %	0 %	0 %	153941548
19	NC_009700	TAAT	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
20	NC_009700	AATT	2	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
21	NC_009700	AATA	2	8	7577	7584	75 %	25 %	0 %	0 %	153941551
22	NC_009700	TACA	2	8	8554	8561	50 %	25 %	0 %	25 %	153941560
23	NC_009700	TAAA	2	8	9092	9099	75 %	25 %	0 %	0 %	153941560
24	NC_009700	AGTA	2	8	9460	9467	50 %	25 %	25 %	0 %	153941559
25	NC_009700	ACTG	2	8	9565	9572	25 %	25 %	25 %	25 %	153941559
26	NC_009700	ATAA	2	8	9920	9927	75 %	25 %	0 %	0 %	153941549
27	NC_009700	TAAT	2	8	10032	10039	50 %	50 %	0 %	0 %	153941568
28	NC_009700	GCTT	2	8	10113	10120	0 %	50 %	25 %	25 %	153941568
29	NC_009700	AATA	2	8	10178	10185	75 %	25 %	0 %	0 %	153941568
30	NC_009700	ATTT	2	8	10343	10350	25 %	75 %	0 %	0 %	153941570
31	NC_009700	TTCA	2	8	10428	10435	25 %	50 %	0 %	25 %	153941570
32	NC_009700	ATCT	2	8	10499	10506	25 %	50 %	0 %	25 %	153941570
33	NC_009700	TTTA	2	8	11269	11276	25 %	75 %	0 %	0 %	153941562
34	NC_009700	CTAT	2	8	11963	11970	25 %	50 %	0 %	25 %	153941562
35	NC_009700	ATTT	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	153941562
36	NC_009700	ACTG	2	8	12539	12546	25 %	25 %	25 %	25 %	153941562
37	NC_009700	ATAC	2	8	12879	12886	50 %	25 %	0 %	25 %	153941555
38	NC_009700	AATT	2	8	13525	13532	50 %	50 %	0 %	0 %	153941555
39	NC_009700	CTAT	2	8	13848	13855	25 %	50 %	0 %	25 %	153941564
40	NC_009700	TTTA	2	8	14216	14223	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
41	NC_009700	ATTT	2	8	14276	14283	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
42	NC_009700	ATTT	2	8	14519	14526	25 %	75 %	0 %	0 %	153941564
43	NC_009700	TCCC	2	8	15156	15163	0 %	25 %	0 %	75 %	153941567
44	NC_009700	TACC	2	8	15233	15240	25 %	25 %	0 %	50 %	153941567
45	NC_009700	ATTC	2	8	15372	15379	25 %	50 %	0 %	25 %	153941567
46	NC_009700	GCTC	2	8	15395	15402	0 %	25 %	25 %	50 %	153941567
47	NC_009700	TAAA	2	8	15657	15664	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
48	NC_009700	TATT	2	8	15735	15742	25 %	75 %	0 %	0 %	153941567
49	NC_009700	TTAT	2	8	16205	16212	25 %	75 %	0 %	0 %	153941567
50	NC_009700	CTAT	2	8	16502	16509	25 %	50 %	0 %	25 %	153941567
51	NC_009700	TAAA	2	8	16672	16679	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
52	NC_009700	TAAA	2	8	17133	17140	75 %	25 %	0 %	0 %	153941567
53	NC_009700	CCTT	2	8	17222	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	153941567

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.