MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	TGG	3	9	138	146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
2	NC_009700	GCT	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941553
3	NC_009700	GGT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
4	NC_009700	TGG	2	6	201	206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941553
5	NC_009700	ATG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941553
6	NC_009700	TGG	2	6	309	314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
7	NC_009700	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
8	NC_009700	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941557
9	NC_009700	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
10	NC_009700	TGT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941557
11	NC_009700	AGC	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153941557
12	NC_009700	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
13	NC_009700	TGG	2	6	420	425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941557
14	NC_009700	ATG	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941557
15	NC_009700	TCT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941554
16	NC_009700	CTA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941554
17	NC_009700	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941554
18	NC_009700	TTA	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941554
19	NC_009700	CAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941563
20	NC_009700	CAC	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153941563
21	NC_009700	AGA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941569
22	NC_009700	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941569
23	NC_009700	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941552
24	NC_009700	TGA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941552
25	NC_009700	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941552
26	NC_009700	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153941552
27	NC_009700	TGC	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941552
28	NC_009700	GTT	3	9	1841	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941552
29	NC_009700	ACA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941552
30	NC_009700	ATA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941552
31	NC_009700	TAT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
32	NC_009700	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
33	NC_009700	TAA	3	9	2088	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
34	NC_009700	CAC	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153941566
35	NC_009700	ATA	2	6	2191	2196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941566
36	NC_009700	TAT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
37	NC_009700	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941566
38	NC_009700	TTC	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941566
39	NC_009700	TAT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941566
40	NC_009700	TTA	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941561
41	NC_009700	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941565
42	NC_009700	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153941565
43	NC_009700	GAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941565
44	NC_009700	TAG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941556
45	NC_009700	TTG	2	6	4597	4602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941558
46	NC_009700	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941558
47	NC_009700	ATG	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941558
48	NC_009700	TAT	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941558
49	NC_009700	TGT	2	6	4939	4944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941558
50	NC_009700	GAA	2	6	4971	4976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941558
51	NC_009700	ATA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941558
52	NC_009700	TTC	2	6	5080	5085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941558
53	NC_009700	AAT	2	6	5111	5116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941558
54	NC_009700	TTA	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941558
55	NC_009700	TAA	2	6	5621	5626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941548
56	NC_009700	ATT	2	6	5669	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
57	NC_009700	CAA	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941548
58	NC_009700	ATT	2	6	5753	5758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
59	NC_009700	TTA	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
60	NC_009700	TTC	2	6	5849	5854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941548
61	NC_009700	CTT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941548
62	NC_009700	TAA	2	6	6049	6054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941548
63	NC_009700	CTT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941548
64	NC_009700	TTA	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
65	NC_009700	CTA	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941548
66	NC_009700	TTA	2	6	6442	6447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
67	NC_009700	ATC	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941548
68	NC_009700	AGG	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153941548
69	NC_009700	ATT	2	6	6587	6592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941548
70	NC_009700	TTC	2	6	6612	6617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941548
71	NC_009700	GAA	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941551
72	NC_009700	ATA	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941551
73	NC_009700	TAT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941551
74	NC_009700	GCA	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153941551
75	NC_009700	ATT	2	6	7404	7409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941551
76	NC_009700	AGA	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941551
77	NC_009700	ATA	2	6	7595	7600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941551
78	NC_009700	TAA	2	6	7716	7721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941551
79	NC_009700	TCA	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941560
80	NC_009700	AGC	2	6	8485	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153941560
81	NC_009700	ATT	2	6	8496	8501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941560
82	NC_009700	TTC	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
83	NC_009700	TTC	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
84	NC_009700	TTC	2	6	8780	8785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
85	NC_009700	TAT	2	6	8792	8797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941560
86	NC_009700	TTC	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
87	NC_009700	AGT	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941560
88	NC_009700	ATC	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941560
89	NC_009700	TAT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941560
90	NC_009700	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941560
91	NC_009700	CTA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941560
92	NC_009700	GAA	3	9	8955	8963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941560
93	NC_009700	AAT	2	6	8966	8971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941560
94	NC_009700	TAT	2	6	9532	9537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941559
95	NC_009700	ATG	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941559
96	NC_009700	GTA	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941559
97	NC_009700	AGT	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941559
98	NC_009700	TAT	2	6	9663	9668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941559
99	NC_009700	ATA	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941559
100	NC_009700	AGA	2	6	9737	9742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941549
101	NC_009700	AGA	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941549
102	NC_009700	AGA	2	6	9788	9793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941549
103	NC_009700	TAG	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941549
104	NC_009700	AAC	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153941549
105	NC_009700	AGA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153941549
106	NC_009700	TCA	2	6	10020	10025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941568
107	NC_009700	TCT	4	12	10062	10073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941568
108	NC_009700	TAA	2	6	10106	10111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941568
109	NC_009700	CCT	2	6	10229	10234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153941570
110	NC_009700	ATC	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941570
111	NC_009700	TAT	2	6	10439	10444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941570
112	NC_009700	TCT	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941570
113	NC_009700	GTA	3	9	10612	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941570
114	NC_009700	TAG	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941570
115	NC_009700	TCT	2	6	10672	10677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941570
116	NC_009700	TCA	2	6	10927	10932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153941547
117	NC_009700	TTA	2	6	11165	11170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941562
118	NC_009700	TAA	2	6	11245	11250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941562
119	NC_009700	TTG	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153941562
120	NC_009700	TCT	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
121	NC_009700	TCT	2	6	11356	11361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
122	NC_009700	CTT	2	6	11367	11372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
123	NC_009700	TAT	2	6	11380	11385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941562
124	NC_009700	TTC	2	6	11404	11409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
125	NC_009700	ACC	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153941562
126	NC_009700	CTT	2	6	11541	11546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
127	NC_009700	TTA	2	6	11573	11578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153941562
128	NC_009700	CTT	2	6	11688	11693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
129	NC_009700	TTC	2	6	11796	11801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
130	NC_009700	TTC	2	6	11854	11859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153941562
131	NC_009700	AAT	2	6	12135	12140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941562
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.