MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009700	GA	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	153941553
2	NC_009700	TA	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009700	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	153941554
4	NC_009700	CT	3	6	1224	1229	0 %	50 %	0 %	50 %	153941563
5	NC_009700	CT	3	6	1247	1252	0 %	50 %	0 %	50 %	153941563
6	NC_009700	AT	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	153941563
7	NC_009700	AC	3	6	1343	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	153941563
8	NC_009700	TA	3	6	1413	1418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009700	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
10	NC_009700	TA	4	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
11	NC_009700	TA	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
12	NC_009700	TA	3	6	2291	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
13	NC_009700	AT	3	6	2304	2309	50 %	50 %	0 %	0 %	153941566
14	NC_009700	TA	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009700	TA	5	10	2628	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009700	TA	3	6	2651	2656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009700	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
18	NC_009700	AT	3	6	3185	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
19	NC_009700	AT	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	153941565
20	NC_009700	TC	3	6	3656	3661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009700	AT	3	6	3866	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009700	TA	3	6	4469	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009700	TA	4	8	4607	4614	50 %	50 %	0 %	0 %	153941558
24	NC_009700	AT	3	6	4632	4637	50 %	50 %	0 %	0 %	153941558
25	NC_009700	TA	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	153941558
26	NC_009700	CT	4	8	4699	4706	0 %	50 %	0 %	50 %	153941558
27	NC_009700	CA	3	6	4798	4803	50 %	0 %	0 %	50 %	153941558
28	NC_009700	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	153941558
29	NC_009700	TA	4	8	5242	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	153941558
30	NC_009700	TA	3	6	5342	5347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009700	AT	3	6	5485	5490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009700	TA	3	6	5595	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009700	TA	3	6	5951	5956	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
34	NC_009700	AT	3	6	6578	6583	50 %	50 %	0 %	0 %	153941548
35	NC_009700	AG	3	6	7469	7474	50 %	0 %	50 %	0 %	153941551
36	NC_009700	AT	3	6	7491	7496	50 %	50 %	0 %	0 %	153941551
37	NC_009700	TA	3	6	7554	7559	50 %	50 %	0 %	0 %	153941551
38	NC_009700	AT	3	6	7725	7730	50 %	50 %	0 %	0 %	153941551
39	NC_009700	TA	3	6	7818	7823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009700	TC	3	6	8063	8068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009700	AT	4	8	8082	8089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009700	AT	3	6	8172	8177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009700	CT	3	6	8703	8708	0 %	50 %	0 %	50 %	153941560
44	NC_009700	CT	3	6	8977	8982	0 %	50 %	0 %	50 %	153941560
45	NC_009700	AT	3	6	9177	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009700	AT	4	8	9415	9422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009700	TA	3	6	9976	9981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009700	CT	3	6	10011	10016	0 %	50 %	0 %	50 %	153941568
49	NC_009700	AT	3	6	10533	10538	50 %	50 %	0 %	0 %	153941570
50	NC_009700	TA	3	6	11040	11045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009700	TA	3	6	11640	11645	50 %	50 %	0 %	0 %	153941562
52	NC_009700	TC	3	6	11660	11665	0 %	50 %	0 %	50 %	153941562
53	NC_009700	TA	3	6	11763	11768	50 %	50 %	0 %	0 %	153941562
54	NC_009700	TA	3	6	11875	11880	50 %	50 %	0 %	0 %	153941562
55	NC_009700	TA	3	6	12074	12079	50 %	50 %	0 %	0 %	153941562
56	NC_009700	TA	4	8	12214	12221	50 %	50 %	0 %	0 %	153941562
57	NC_009700	TC	3	6	13475	13480	0 %	50 %	0 %	50 %	153941555
58	NC_009700	TA	3	6	13519	13524	50 %	50 %	0 %	0 %	153941555
59	NC_009700	TA	3	6	13834	13839	50 %	50 %	0 %	0 %	153941564
60	NC_009700	AT	3	6	14062	14067	50 %	50 %	0 %	0 %	153941564
61	NC_009700	TA	3	6	14866	14871	50 %	50 %	0 %	0 %	153941564
62	NC_009700	AT	3	6	15052	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	153941564
63	NC_009700	TC	3	6	15100	15105	0 %	50 %	0 %	50 %	153941564
64	NC_009700	AT	3	6	15301	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	153941567
65	NC_009700	AT	3	6	15678	15683	50 %	50 %	0 %	0 %	153941567
66	NC_009700	AC	3	6	16227	16232	50 %	0 %	0 %	50 %	153941567
67	NC_009700	TA	3	6	16467	16472	50 %	50 %	0 %	0 %	153941567
68	NC_009700	TC	3	6	16578	16583	0 %	50 %	0 %	50 %	153941567
69	NC_009700	AT	3	6	16857	16862	50 %	50 %	0 %	0 %	153941567
70	NC_009700	CT	3	6	17245	17250	0 %	50 %	0 %	50 %	153941567
71	NC_009700	TA	3	6	17384	17389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009700	AT	3	6	17525	17530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.