MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 2598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153940298
2	NC_009699	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940298
3	NC_009699	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009699	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153939951
5	NC_009699	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938642
6	NC_009699	CAAATA	2	12	3075	3086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153940655
7	NC_009699	ATAAAG	2	12	3171	3182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153940655
8	NC_009699	ATAAAA	2	12	3305	3316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940655
9	NC_009699	GAAGTA	2	12	4803	4814	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153939432
10	NC_009699	GATTAG	2	12	6500	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938259
11	NC_009699	TTTAAA	2	12	7365	7376	50 %	50 %	0 %	0 %	153938259
12	NC_009699	GATATA	2	12	7810	7821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938259
13	NC_009699	ATAGAT	2	12	17648	17659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153941427
14	NC_009699	ACAAAT	2	12	18557	18568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153941427
15	NC_009699	AATAAA	2	12	19530	19541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153938168
16	NC_009699	GCAAAA	2	12	23386	23397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153939104
17	NC_009699	AATTGT	2	12	25214	25225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153939868
18	NC_009699	AGCTAC	2	12	27627	27638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153940296
19	NC_009699	TAAAAG	2	12	29104	29115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009699	AGATGA	2	12	35348	35359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153941296
21	NC_009699	CTATAG	2	12	35529	35540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153938661
22	NC_009699	AATATA	2	12	36543	36554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009699	AGAAAA	2	12	37352	37363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153938208
24	NC_009699	ATGTTT	2	12	42406	42417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153940471
25	NC_009699	AATATG	2	12	64169	64180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009699	TAAAAA	2	12	79378	79389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009699	ATTATA	2	12	82918	82929	50 %	50 %	0 %	0 %	153940352
28	NC_009699	AATATG	2	12	82938	82949	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153940352
29	NC_009699	AATTAT	2	12	84960	84971	50 %	50 %	0 %	0 %	153939243
30	NC_009699	GAAAAA	2	12	85501	85512	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153939884
31	NC_009699	TGTAGA	2	12	86336	86347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938720
32	NC_009699	AAAATA	2	12	87953	87964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153939457
33	NC_009699	GTTTTA	2	12	88186	88197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153939457
34	NC_009699	AGAAAA	2	12	88221	88232	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153939457
35	NC_009699	ATCACA	2	12	89165	89176	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153939454
36	NC_009699	GTAAGA	2	12	89625	89636	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153939454
37	NC_009699	AATAAA	2	12	90233	90244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009699	TTTCAA	2	12	95334	95345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009699	ATTTAA	2	12	99326	99337	50 %	50 %	0 %	0 %	153941273
40	NC_009699	ATAAAT	2	12	103405	103416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939628
41	NC_009699	AGTTAA	2	12	105269	105280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153940925
42	NC_009699	AGAACA	2	12	108141	108152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153939474
43	NC_009699	AATATA	2	12	110499	110510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940277
44	NC_009699	AGGACA	2	12	111247	111258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153941283
45	NC_009699	GTAGAT	2	12	111515	111526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153941283
46	NC_009699	TACTGA	2	12	114172	114183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153938568
47	NC_009699	TATTAA	2	12	115288	115299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009699	AATAAA	2	12	117349	117360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940906
49	NC_009699	GATATA	2	12	117437	117448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153940906
50	NC_009699	TAAAGA	2	12	118685	118696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153938050
51	NC_009699	TTAAAT	2	12	122454	122465	50 %	50 %	0 %	0 %	153941177
52	NC_009699	TCAAAA	2	12	124970	124981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153938315
53	NC_009699	TTTGCT	2	12	125996	126007	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153938315
54	NC_009699	GAAAAA	2	12	128131	128142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153938250
55	NC_009699	AATGTA	2	12	129203	129214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938250
56	NC_009699	TGGATA	2	12	132254	132265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939486
57	NC_009699	CATGAA	2	12	133427	133438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153938796
58	NC_009699	GAACAC	2	12	133466	133477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	153938796
59	NC_009699	CATGAG	2	12	133481	133492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153938796
60	NC_009699	ATAAAT	2	12	133547	133558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938796
61	NC_009699	ATAAGA	2	12	139145	139156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153941223
62	NC_009699	ATATAA	2	12	141829	141840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939705
63	NC_009699	ATTTTT	2	12	144749	144760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153938209
64	NC_009699	GTAAGT	2	12	144983	144994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938209
65	NC_009699	TTGAAA	2	12	145181	145192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153941017
66	NC_009699	AGCAAG	2	12	146366	146377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153939750
67	NC_009699	AAAGAA	2	12	149774	149785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153940356
68	NC_009699	AATATA	2	12	150853	150864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941125
69	NC_009699	ATTAGT	2	12	153718	153729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153940290
70	NC_009699	AAATTT	2	12	157657	157668	50 %	50 %	0 %	0 %	153940034
71	NC_009699	TTAAAG	2	12	158748	158759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938973
72	NC_009699	TACCTA	2	12	159835	159846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153938004
73	NC_009699	ACATTA	2	12	160556	160567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009699	GTAGAA	2	12	162822	162833	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153938098
75	NC_009699	AAGGAA	2	12	163314	163325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009699	AAAAGA	2	12	163381	163392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153938625
77	NC_009699	ATAAAT	2	12	163622	163633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938625
78	NC_009699	ATAGAA	2	12	164041	164052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153941464
79	NC_009699	AAACTT	2	12	164372	164383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009699	AGATTT	2	12	164633	164644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153941095
81	NC_009699	AAAGAA	2	12	164820	164831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153941095
82	NC_009699	ATGAAT	2	12	166622	166633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938245
83	NC_009699	TTTATT	2	12	166894	166905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009699	GTGGTA	2	12	170852	170863	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153937927
85	NC_009699	ATATAA	2	12	172058	172069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939567
86	NC_009699	AGGTAT	2	12	175711	175722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938808
87	NC_009699	TTGAAA	2	12	176135	176146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938056
88	NC_009699	AGTTAT	2	12	177957	177968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153940019
89	NC_009699	TACAAC	2	12	179050	179061	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153941374
90	NC_009699	ATATTT	2	12	180061	180072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009699	AAAAAT	2	12	180592	180603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940611
92	NC_009699	ATGGTA	2	12	184600	184611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938889
93	NC_009699	AACATA	2	12	184668	184679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153938889
94	NC_009699	AATTAA	2	12	187050	187061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153941350
95	NC_009699	TAATTT	2	12	187767	187778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938470
96	NC_009699	AATAAA	2	12	188745	188756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153939289
97	NC_009699	ATAAAA	2	12	188818	188829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153939289
98	NC_009699	ATTAAT	2	12	190596	190607	50 %	50 %	0 %	0 %	153941186
99	NC_009699	TTTAAT	2	12	190892	190903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009699	TAAAGT	2	12	191768	191779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938329
101	NC_009699	AATGGT	2	12	195970	195981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153938476
102	NC_009699	TTAAAA	2	12	197331	197342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939064
103	NC_009699	TAAATA	2	12	198091	198102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939064
104	NC_009699	AAAGAT	2	12	198708	198719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153939064
105	NC_009699	TGTAAT	2	12	203468	203479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153940144
106	NC_009699	AAAGAA	2	12	204399	204410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153940144
107	NC_009699	GTAGAA	2	12	204636	204647	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153940144
108	NC_009699	GAAATA	2	12	205743	205754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153938890
109	NC_009699	AATTAA	2	12	206717	206728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938079
110	NC_009699	GAAAAA	2	12	208553	208564	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153941426
111	NC_009699	AATATT	2	12	210046	210057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009699	ATTAAT	2	12	210098	210109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009699	ATTAAT	2	12	211215	211226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009699	GGGTAA	2	12	212668	212679	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153939371
115	NC_009699	ATATAG	2	12	213158	213169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938549
116	NC_009699	TAAGAT	2	12	213690	213701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153939298
117	NC_009699	CAGATA	2	12	214766	214777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153938367
118	NC_009699	GATAAA	2	12	215746	215757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153938367
119	NC_009699	TAAAAG	2	12	216164	216175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153938367
120	NC_009699	CTATAT	2	12	217317	217328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153939453
121	NC_009699	ATTATA	2	12	217727	217738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009699	AATTAT	2	12	217749	217760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009699	TATAAA	2	12	218326	218337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940428
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240	NC_009699	TATTTT	2	12	411124	411135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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