MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	TCTATT	2	12	1552	1563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009699	TAAAAG	2	12	29104	29115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009699	AATATA	2	12	36543	36554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009699	AATATG	2	12	64169	64180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009699	TAAAAA	2	12	79378	79389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009699	AATAAA	2	12	90233	90244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009699	TTTCAA	2	12	95334	95345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009699	TATTAA	2	12	115288	115299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009699	ACATTA	2	12	160556	160567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009699	AAGGAA	2	12	163314	163325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009699	AAACTT	2	12	164372	164383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009699	TTTATT	2	12	166894	166905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009699	ATATTT	2	12	180061	180072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009699	TTTAAT	2	12	190892	190903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009699	AATATT	2	12	210046	210057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009699	ATTAAT	2	12	210098	210109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009699	ATTAAT	2	12	211215	211226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009699	ATTATA	2	12	217727	217738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009699	AATTAT	2	12	217749	217760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009699	ATTTTA	2	12	233153	233164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009699	AATAAA	2	12	258852	258863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009699	ATTTAA	2	12	261495	261506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009699	ATTAAA	2	12	274031	274042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009699	GAAATA	2	12	282192	282203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009699	ATTTGA	2	12	285387	285398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009699	AGGAAC	2	12	297500	297511	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009699	TTGTAA	2	12	300249	300260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009699	TTTATA	2	12	302692	302703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009699	TAATTT	2	12	331606	331617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009699	TTTTTA	2	12	331719	331730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009699	TAATTT	2	12	342612	342623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009699	TAAAAG	2	12	345537	345548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009699	AAAATA	2	12	355547	355558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009699	AAAATG	2	12	366986	366997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009699	TTTAAT	2	12	376342	376353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009699	ATTAAA	2	12	385374	385385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009699	GAGATC	2	12	390535	390546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009699	TATAAA	2	12	397084	397095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009699	TGTGAG	2	12	397316	397327	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009699	TAATAT	2	12	404369	404380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009699	ATTTTA	2	12	407096	407107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009699	TATTTT	2	12	411124	411135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009699	TAAATA	2	12	417406	417417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009699	TATTTT	2	12	417637	417648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009699	TTAAAA	2	12	427630	427641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009699	AGAATA	2	12	451418	451429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009699	AAATTA	2	12	457949	457960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009699	TTTATT	2	12	462591	462602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009699	TATAGA	2	12	464716	464727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009699	AATAGC	2	12	466145	466156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009699	ATTAAA	2	12	469371	469382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009699	ATATAA	2	12	473782	473793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009699	AATATT	2	12	481109	481120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009699	TACAAG	2	12	490274	490285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009699	ATTAAT	2	12	496131	496142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009699	ATTAAA	2	12	497481	497492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009699	ATTTTT	2	12	505311	505322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009699	TTCAAT	2	12	505425	505436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009699	AAAGCA	2	12	507847	507858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009699	ATATTA	2	12	518690	518701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009699	GTATTA	2	12	518887	518898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009699	TTTAAT	2	12	523593	523604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009699	TTTTTA	2	12	527076	527087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009699	TTAAAA	2	12	531936	531947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009699	TAAAAT	2	12	537232	537243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009699	AAAACA	2	12	542042	542053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009699	TGTAAA	2	12	542204	542215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009699	GTTAAT	2	12	548372	548383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009699	ATTAAA	2	12	550106	550117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009699	TTAATT	2	12	562073	562084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009699	ATTAAA	2	12	562305	562316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009699	TTTATT	2	12	569593	569604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009699	AAAATA	2	12	575630	575641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009699	TTCATG	2	12	576865	576876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009699	TTATAT	2	12	579925	579936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009699	ATTTAA	2	12	580397	580408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009699	TATAAA	2	12	585035	585046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009699	AATTTT	2	12	594629	594640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009699	ATTAAA	2	12	594674	594685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009699	ATATTT	2	12	594733	594744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009699	TTATTT	2	12	594752	594763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009699	TAAAAA	2	12	617893	617904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009699	TTTAAT	2	12	617909	617920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009699	TTAAAA	2	12	618029	618040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009699	TTTTAA	2	12	624640	624651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009699	TTTAAA	2	12	627491	627502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009699	TTTAAG	2	12	630685	630696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009699	ATTAAA	2	12	634592	634603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009699	TAAAAA	2	12	643271	643282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009699	GTATTA	2	12	648862	648873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009699	TTTTAC	2	12	654080	654091	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009699	TTTAAT	2	12	655134	655145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009699	AATATT	2	12	655263	655274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009699	ATTTTT	2	12	659423	659434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009699	TTTAAT	2	12	661711	661722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009699	TTTAAT	2	12	667745	667756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009699	TAAAAA	2	12	667988	667999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009699	ATTTTT	2	12	680808	680819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009699	ATTTTA	2	12	682872	682883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009699	ATTTTT	2	12	683045	683056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009699	AAATTA	2	12	684443	684454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009699	TATTGT	2	12	688019	688030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009699	AATGGA	2	12	712375	712386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009699	TTTAAT	2	12	720801	720812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009699	TTATAA	2	12	725012	725023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009699	TTTAAT	2	12	727302	727313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009699	TAAAGT	2	12	733852	733863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009699	TTATTT	2	12	734544	734555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009699	TTTGAA	2	12	745711	745722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009699	TCCGCT	2	12	747312	747323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009699	AATATA	2	12	752340	752351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009699	AAAATA	2	12	755523	755534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009699	TAAATA	2	12	755553	755564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009699	TTAAAC	2	12	755831	755842	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009699	GAATAA	2	12	760127	760138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009699	TGGCTA	2	12	771191	771202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009699	AAATAA	2	12	772690	772701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009699	CAAAGT	2	12	781067	781078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009699	TATTTT	2	12	782219	782230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009699	AGATAA	2	12	787494	787505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009699	TTTCAT	2	12	813157	813168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009699	CTTGTA	2	12	815784	815795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009699	ATTATA	2	12	821916	821927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009699	TCATTC	2	12	829875	829886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009699	AATATA	2	12	830360	830371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009699	CCTCTA	2	12	851567	851578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009699	AAAACA	2	12	861449	861460	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009699	TTTTAT	2	12	863348	863359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009699	TTTTAT	2	12	871863	871874	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009699	CAAATT	2	12	887592	887603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_009699	TTAAAA	2	12	887983	887994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009699	GTTTAT	2	12	895792	895803	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009699	ATTAAT	2	12	903766	903777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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