MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 4467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	TAAAT	2	10	3604	3613	60 %	40 %	0 %	0 %	153940655
2	NC_009699	TGGAT	2	10	4868	4877	20 %	40 %	40 %	0 %	153939432
3	NC_009699	ACTTT	2	10	5928	5937	20 %	60 %	0 %	20 %	153939432
4	NC_009699	AAGAT	2	10	6316	6325	60 %	20 %	20 %	0 %	153939432
5	NC_009699	TAAAA	2	10	6969	6978	80 %	20 %	0 %	0 %	153938259
6	NC_009699	GAATA	2	10	7101	7110	60 %	20 %	20 %	0 %	153938259
7	NC_009699	ATACC	2	10	7123	7132	40 %	20 %	0 %	40 %	153938259
8	NC_009699	GGTAA	2	10	9496	9505	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009699	TCGTG	2	10	10287	10296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009699	TAAGT	2	10	11961	11970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009699	AAAAT	2	10	13812	13821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009699	AAATT	2	10	14547	14556	60 %	40 %	0 %	0 %	153938793
13	NC_009699	AATAA	2	10	15285	15294	80 %	20 %	0 %	0 %	153938011
14	NC_009699	ATATA	2	10	15663	15672	60 %	40 %	0 %	0 %	153940224
15	NC_009699	TTTTA	2	10	16225	16234	20 %	80 %	0 %	0 %	153940224
16	NC_009699	AATAA	2	10	16574	16583	80 %	20 %	0 %	0 %	153941427
17	NC_009699	TTATT	2	10	17017	17026	20 %	80 %	0 %	0 %	153941427
18	NC_009699	TATAA	2	10	17663	17672	60 %	40 %	0 %	0 %	153941427
19	NC_009699	CAAAG	2	10	18452	18461	60 %	0 %	20 %	20 %	153941427
20	NC_009699	TAATG	2	10	18637	18646	40 %	40 %	20 %	0 %	153941427
21	NC_009699	TAAAA	2	10	19185	19194	80 %	20 %	0 %	0 %	153941427
22	NC_009699	GAAAT	2	10	19474	19483	60 %	20 %	20 %	0 %	153938168
23	NC_009699	ATATT	2	10	19913	19922	40 %	60 %	0 %	0 %	153938168
24	NC_009699	TAATA	2	10	19973	19982	60 %	40 %	0 %	0 %	153938168
25	NC_009699	AATTT	2	10	21521	21530	40 %	60 %	0 %	0 %	153939164
26	NC_009699	ATTAT	2	10	22198	22207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009699	ATTTT	2	10	22668	22677	20 %	80 %	0 %	0 %	153939104
28	NC_009699	ATTAA	2	10	23602	23611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009699	TATTT	2	10	23674	23683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009699	AAGAT	2	10	25012	25021	60 %	20 %	20 %	0 %	153939868
31	NC_009699	TAATT	2	10	27826	27835	40 %	60 %	0 %	0 %	153940296
32	NC_009699	TATTT	2	10	28278	28287	20 %	80 %	0 %	0 %	153940296
33	NC_009699	ATTTT	2	10	28655	28664	20 %	80 %	0 %	0 %	153941134
34	NC_009699	ATATA	2	10	29280	29289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009699	AATAA	2	10	29847	29856	80 %	20 %	0 %	0 %	153938244
36	NC_009699	AATAA	2	10	30849	30858	80 %	20 %	0 %	0 %	153938244
37	NC_009699	AAAAT	2	10	32458	32467	80 %	20 %	0 %	0 %	153941479
38	NC_009699	AATAC	2	10	32550	32559	60 %	20 %	0 %	20 %	153941479
39	NC_009699	ATATT	2	10	32889	32898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009699	AATAA	2	10	32947	32956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009699	GATTT	2	10	33966	33975	20 %	60 %	20 %	0 %	153941061
42	NC_009699	TAATA	2	10	36499	36508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009699	GAATA	2	10	36586	36595	60 %	20 %	20 %	0 %	153938785
44	NC_009699	TTATT	2	10	36602	36611	20 %	80 %	0 %	0 %	153938785
45	NC_009699	ATAAA	2	10	36981	36990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009699	GATTT	2	10	37336	37345	20 %	60 %	20 %	0 %	153938208
47	NC_009699	AAAAG	2	10	37595	37604	80 %	0 %	20 %	0 %	153938208
48	NC_009699	TTGTA	2	10	37860	37869	20 %	60 %	20 %	0 %	153940223
49	NC_009699	ATAGA	2	10	39258	39267	60 %	20 %	20 %	0 %	153939241
50	NC_009699	GCAAT	2	10	39915	39924	40 %	20 %	20 %	20 %	153939241
51	NC_009699	AAAGA	2	10	39932	39941	80 %	0 %	20 %	0 %	153939241
52	NC_009699	AGTAT	2	10	40941	40950	40 %	40 %	20 %	0 %	153941392
53	NC_009699	TTAAT	2	10	41978	41987	40 %	60 %	0 %	0 %	153940471
54	NC_009699	ATTGT	2	10	43161	43170	20 %	60 %	20 %	0 %	153939436
55	NC_009699	ATAGA	2	10	43266	43275	60 %	20 %	20 %	0 %	153939436
56	NC_009699	TGGTA	2	10	44052	44061	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009699	TCGTG	2	10	44844	44853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009699	TAAGT	2	10	46582	46591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009699	AAAAT	2	10	48433	48442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009699	AATAA	2	10	49018	49027	80 %	20 %	0 %	0 %	153939172
61	NC_009699	GAATA	2	10	49369	49378	60 %	20 %	20 %	0 %	153939172
62	NC_009699	GGTAA	2	10	50571	50580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009699	TCGTG	2	10	51362	51371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009699	TAAGT	2	10	53036	53045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009699	AAAAT	2	10	54887	54896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009699	TTATA	2	10	55385	55394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009699	AAAGG	2	10	57253	57262	60 %	0 %	40 %	0 %	153939523
68	NC_009699	GGTAA	2	10	58371	58380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009699	TCGTG	2	10	59162	59171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009699	TAAGT	2	10	60900	60909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009699	AAAAT	2	10	62751	62760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009699	TAAAT	2	10	63331	63340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009699	AAGAA	2	10	63830	63839	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009699	TTATA	2	10	64481	64490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009699	GGTAA	2	10	65376	65385	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009699	TCGTG	2	10	66167	66176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009699	TAAGT	2	10	67841	67850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009699	GAAGA	2	10	70198	70207	60 %	0 %	40 %	0 %	153940453
79	NC_009699	AAATA	2	10	70816	70825	80 %	20 %	0 %	0 %	153940453
80	NC_009699	ATTAT	2	10	70938	70947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009699	GGTAA	2	10	71590	71599	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009699	TCGTG	2	10	72381	72390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009699	TAAGT	2	10	74055	74064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009699	TTGAA	2	10	77242	77251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009699	CAATC	2	10	77393	77402	40 %	20 %	0 %	40 %	153941083
86	NC_009699	TTATT	2	10	79670	79679	20 %	80 %	0 %	0 %	153940892
87	NC_009699	ATTTT	2	10	80040	80049	20 %	80 %	0 %	0 %	153940892
88	NC_009699	AAAAT	2	10	80074	80083	80 %	20 %	0 %	0 %	153940892
89	NC_009699	TTTCC	2	10	80755	80764	0 %	60 %	0 %	40 %	153938694
90	NC_009699	ATTTT	2	10	80770	80779	20 %	80 %	0 %	0 %	153938694
91	NC_009699	GAATA	2	10	81329	81338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009699	TATAA	2	10	82908	82917	60 %	40 %	0 %	0 %	153940352
93	NC_009699	TAAAT	2	10	84758	84767	60 %	40 %	0 %	0 %	153939243
94	NC_009699	TAAAT	2	10	85551	85560	60 %	40 %	0 %	0 %	153939884
95	NC_009699	TAGAA	2	10	85680	85689	60 %	20 %	20 %	0 %	153939884
96	NC_009699	ATGGA	2	10	87493	87502	40 %	20 %	40 %	0 %	153938423
97	NC_009699	AGGAT	2	10	87989	87998	40 %	20 %	40 %	0 %	153939457
98	NC_009699	AATGG	2	10	88236	88245	40 %	20 %	40 %	0 %	153939457
99	NC_009699	AAATT	2	10	88421	88430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009699	AAAGA	2	10	88977	88986	80 %	0 %	20 %	0 %	153939454
101	NC_009699	AAGAA	2	10	89102	89111	80 %	0 %	20 %	0 %	153939454
102	NC_009699	ATTTA	2	10	90072	90081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009699	TACAA	2	10	90330	90339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009699	TTTAA	2	10	90737	90746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009699	AAGTT	2	10	91631	91640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009699	TATAA	2	10	94187	94196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009699	ATTTT	2	10	95257	95266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009699	ATTTA	2	10	95459	95468	40 %	60 %	0 %	0 %	153941482
109	NC_009699	TAATA	2	10	95729	95738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009699	TAATA	2	10	96914	96923	60 %	40 %	0 %	0 %	153938418
111	NC_009699	ATATT	2	10	99098	99107	40 %	60 %	0 %	0 %	153940469
112	NC_009699	AGAAA	2	10	101598	101607	80 %	0 %	20 %	0 %	153938113
113	NC_009699	AAAAC	2	10	101643	101652	80 %	0 %	0 %	20 %	153938113
114	NC_009699	AAATT	2	10	102743	102752	60 %	40 %	0 %	0 %	153939628
115	NC_009699	AAATG	2	10	103011	103020	60 %	20 %	20 %	0 %	153939628
116	NC_009699	GAAGT	2	10	104024	104033	40 %	20 %	40 %	0 %	153940001
117	NC_009699	GAAAA	2	10	105589	105598	80 %	0 %	20 %	0 %	153940925
118	NC_009699	AAAAT	2	10	111072	111081	80 %	20 %	0 %	0 %	153941283
119	NC_009699	ATAAA	2	10	111162	111171	80 %	20 %	0 %	0 %	153941283
120	NC_009699	ATTTA	2	10	112049	112058	40 %	60 %	0 %	0 %	153937987
121	NC_009699	TTATG	2	10	114658	114667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009699	GAAAT	2	10	115357	115366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009699	ATTTT	2	10	116398	116407	20 %	80 %	0 %	0 %	153937910
124	NC_009699	ATACA	2	10	116915	116924	60 %	20 %	0 %	20 %	153940906
125	NC_009699	AATAT	2	10	117219	117228	60 %	40 %	0 %	0 %	153940906
126	NC_009699	AAGAA	2	10	118484	118493	80 %	0 %	20 %	0 %	153938050
127	NC_009699	TAATA	2	10	118772	118781	60 %	40 %	0 %	0 %	153938050
128	NC_009699	AGAGA	2	10	118806	118815	60 %	0 %	40 %	0 %	153938050
129	NC_009699	TAAAT	2	10	119396	119405	60 %	40 %	0 %	0 %	153938050
130	NC_009699	TTCTA	2	10	120684	120693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009699	AATTC	2	10	121735	121744	40 %	40 %	0 %	20 %	153940392
132	NC_009699	GAAAA	2	10	123837	123846	80 %	0 %	20 %	0 %	153938315
133	NC_009699	GTAAC	2	10	123891	123900	40 %	20 %	20 %	20 %	153938315
134	NC_009699	AAAAG	2	10	124621	124630	80 %	0 %	20 %	0 %	153938315
135	NC_009699	TTAAA	2	10	124683	124692	60 %	40 %	0 %	0 %	153938315
136	NC_009699	GCTTA	2	10	125598	125607	20 %	40 %	20 %	20 %	153938315
137	NC_009699	AGAAA	2	10	125849	125858	80 %	0 %	20 %	0 %	153938315
138	NC_009699	TATAA	2	10	126734	126743	60 %	40 %	0 %	0 %	153939069
139	NC_009699	GAAAG	2	10	128806	128815	60 %	0 %	40 %	0 %	153938250
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141	NC_009699	ATTAT	2	10	129303	129312	40 %	60 %	0 %	0 %	153938250
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