MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 13092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
2	NC_009699	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	153940298
3	NC_009699	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	153940298
4	NC_009699	TTTA	2	8	429	436	25 %	75 %	0 %	0 %	153940298
5	NC_009699	ATGC	2	8	472	479	25 %	25 %	25 %	25 %	153940298
6	NC_009699	AATT	3	12	554	565	50 %	50 %	0 %	0 %	153940298
7	NC_009699	AAAT	2	8	597	604	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
8	NC_009699	AGAA	2	8	657	664	75 %	0 %	25 %	0 %	153940298
9	NC_009699	AACA	2	8	709	716	75 %	0 %	0 %	25 %	153940298
10	NC_009699	AAAC	2	8	1036	1043	75 %	0 %	0 %	25 %	153940298
11	NC_009699	TAAA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
12	NC_009699	TTAT	2	8	1369	1376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009699	AAAT	2	8	1860	1867	75 %	25 %	0 %	0 %	153939951
14	NC_009699	TTTA	2	8	2263	2270	25 %	75 %	0 %	0 %	153939951
15	NC_009699	AATT	2	8	2737	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	153938642
16	NC_009699	TTCT	2	8	2764	2771	0 %	75 %	0 %	25 %	153938642
17	NC_009699	TAAT	2	8	2987	2994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009699	TAAA	2	8	3297	3304	75 %	25 %	0 %	0 %	153940655
19	NC_009699	GAAA	2	8	3485	3492	75 %	0 %	25 %	0 %	153940655
20	NC_009699	AAGT	2	8	3798	3805	50 %	25 %	25 %	0 %	153940655
21	NC_009699	GGAT	2	8	4242	4249	25 %	25 %	50 %	0 %	153939945
22	NC_009699	ACTA	2	8	4347	4354	50 %	25 %	0 %	25 %	153939945
23	NC_009699	TTTA	2	8	5089	5096	25 %	75 %	0 %	0 %	153939432
24	NC_009699	GATG	2	8	5151	5158	25 %	25 %	50 %	0 %	153939432
25	NC_009699	GACA	2	8	5410	5417	50 %	0 %	25 %	25 %	153939432
26	NC_009699	ATTT	2	8	5667	5674	25 %	75 %	0 %	0 %	153939432
27	NC_009699	AATG	2	8	5759	5766	50 %	25 %	25 %	0 %	153939432
28	NC_009699	GTAA	2	8	6376	6383	50 %	25 %	25 %	0 %	153938259
29	NC_009699	ATAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	153938259
30	NC_009699	GAAA	2	8	7777	7784	75 %	0 %	25 %	0 %	153938259
31	NC_009699	ATAC	2	8	7895	7902	50 %	25 %	0 %	25 %	153938259
32	NC_009699	CTTC	2	8	9320	9327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009699	GGTA	2	8	10456	10463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009699	AGAA	2	8	10769	10776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009699	TTCT	2	8	10782	10789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009699	AGAA	2	8	11130	11137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009699	AGGT	2	8	12560	12567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009699	TGCT	2	8	12947	12954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009699	TTAA	2	8	14727	14734	50 %	50 %	0 %	0 %	153938793
40	NC_009699	TAAA	2	8	14758	14765	75 %	25 %	0 %	0 %	153938793
41	NC_009699	AGAA	2	8	14831	14838	75 %	0 %	25 %	0 %	153938011
42	NC_009699	TATG	2	8	15167	15174	25 %	50 %	25 %	0 %	153938011
43	NC_009699	TACT	2	8	15229	15236	25 %	50 %	0 %	25 %	153938011
44	NC_009699	GGAA	2	8	15975	15982	50 %	0 %	50 %	0 %	153940224
45	NC_009699	TTTA	2	8	16555	16562	25 %	75 %	0 %	0 %	153941427
46	NC_009699	TAAA	2	8	16764	16771	75 %	25 %	0 %	0 %	153941427
47	NC_009699	GCTA	2	8	17213	17220	25 %	25 %	25 %	25 %	153941427
48	NC_009699	TAAA	2	8	18039	18046	75 %	25 %	0 %	0 %	153941427
49	NC_009699	ATTT	2	8	18438	18445	25 %	75 %	0 %	0 %	153941427
50	NC_009699	ATGG	2	8	18683	18690	25 %	25 %	50 %	0 %	153941427
51	NC_009699	ATTT	2	8	18753	18760	25 %	75 %	0 %	0 %	153941427
52	NC_009699	AATT	2	8	19307	19314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009699	TACA	2	8	19396	19403	50 %	25 %	0 %	25 %	153938168
54	NC_009699	AAAT	2	8	19450	19457	75 %	25 %	0 %	0 %	153938168
55	NC_009699	GGAT	2	8	19671	19678	25 %	25 %	50 %	0 %	153938168
56	NC_009699	ATTC	2	8	19944	19951	25 %	50 %	0 %	25 %	153938168
57	NC_009699	AAAT	2	8	20980	20987	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
58	NC_009699	ATAA	2	8	20997	21004	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
59	NC_009699	TAGT	2	8	21145	21152	25 %	50 %	25 %	0 %	153939164
60	NC_009699	AAAG	2	8	21170	21177	75 %	0 %	25 %	0 %	153939164
61	NC_009699	TAAA	2	8	21409	21416	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
62	NC_009699	AAAT	2	8	21443	21450	75 %	25 %	0 %	0 %	153939164
63	NC_009699	ATTT	2	8	21555	21562	25 %	75 %	0 %	0 %	153938251
64	NC_009699	GTTA	2	8	21696	21703	25 %	50 %	25 %	0 %	153938251
65	NC_009699	TATT	2	8	22235	22242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009699	AATA	2	8	22252	22259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009699	CAAG	2	8	23350	23357	50 %	0 %	25 %	25 %	153939104
68	NC_009699	TAAA	2	8	23651	23658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009699	AAAG	2	8	24248	24255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009699	GAAA	2	8	24347	24354	75 %	0 %	25 %	0 %	153939868
71	NC_009699	TTTG	2	8	24707	24714	0 %	75 %	25 %	0 %	153939868
72	NC_009699	TTTA	2	8	24726	24733	25 %	75 %	0 %	0 %	153939868
73	NC_009699	TGAA	2	8	25186	25193	50 %	25 %	25 %	0 %	153939868
74	NC_009699	ATAA	2	8	25920	25927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009699	ATTT	3	12	26651	26662	25 %	75 %	0 %	0 %	153938292
76	NC_009699	AAAT	2	8	27525	27532	75 %	25 %	0 %	0 %	153940296
77	NC_009699	AAAT	2	8	27546	27553	75 %	25 %	0 %	0 %	153940296
78	NC_009699	TAAA	2	8	28583	28590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009699	ATAA	2	8	29457	29464	75 %	25 %	0 %	0 %	153938244
80	NC_009699	GATA	2	8	29537	29544	50 %	25 %	25 %	0 %	153938244
81	NC_009699	ATGT	2	8	29808	29815	25 %	50 %	25 %	0 %	153938244
82	NC_009699	AGAA	2	8	30467	30474	75 %	0 %	25 %	0 %	153938244
83	NC_009699	TAAA	2	8	30517	30524	75 %	25 %	0 %	0 %	153938244
84	NC_009699	TAAA	2	8	30565	30572	75 %	25 %	0 %	0 %	153938244
85	NC_009699	AATG	2	8	30782	30789	50 %	25 %	25 %	0 %	153938244
86	NC_009699	TGTA	2	8	30872	30879	25 %	50 %	25 %	0 %	153938244
87	NC_009699	AATA	2	8	30880	30887	75 %	25 %	0 %	0 %	153938244
88	NC_009699	CATA	2	8	31621	31628	50 %	25 %	0 %	25 %	153939022
89	NC_009699	AAGA	2	8	32131	32138	75 %	0 %	25 %	0 %	153939022
90	NC_009699	TAAA	2	8	32306	32313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009699	AATA	2	8	32338	32345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009699	ATGA	2	8	32370	32377	50 %	25 %	25 %	0 %	153941479
93	NC_009699	ATGT	2	8	32586	32593	25 %	50 %	25 %	0 %	153941479
94	NC_009699	TATT	2	8	32853	32860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009699	GGAA	2	8	33231	33238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009699	AATA	2	8	33694	33701	75 %	25 %	0 %	0 %	153941061
97	NC_009699	ACAG	2	8	34208	34215	50 %	0 %	25 %	25 %	153941061
98	NC_009699	AAAG	2	8	34673	34680	75 %	0 %	25 %	0 %	153941061
99	NC_009699	AGAA	2	8	35251	35258	75 %	0 %	25 %	0 %	153941296
100	NC_009699	TGCA	2	8	35390	35397	25 %	25 %	25 %	25 %	153941296
101	NC_009699	AAAG	2	8	35408	35415	75 %	0 %	25 %	0 %	153941296
102	NC_009699	GAAG	2	8	36092	36099	50 %	0 %	50 %	0 %	153938661
103	NC_009699	AATT	2	8	36302	36309	50 %	50 %	0 %	0 %	153939706
104	NC_009699	TTAT	2	8	36711	36718	25 %	75 %	0 %	0 %	153938785
105	NC_009699	AAAT	2	8	37063	37070	75 %	25 %	0 %	0 %	153938208
106	NC_009699	AATT	2	8	37775	37782	50 %	50 %	0 %	0 %	153940223
107	NC_009699	GATT	2	8	38136	38143	25 %	50 %	25 %	0 %	153940223
108	NC_009699	ATAA	2	8	38698	38705	75 %	25 %	0 %	0 %	153939792
109	NC_009699	AATT	2	8	38802	38809	50 %	50 %	0 %	0 %	153939792
110	NC_009699	ATTA	2	8	39334	39341	50 %	50 %	0 %	0 %	153939241
111	NC_009699	ATAA	2	8	39566	39573	75 %	25 %	0 %	0 %	153939241
112	NC_009699	ATAA	2	8	40016	40023	75 %	25 %	0 %	0 %	153938127
113	NC_009699	TTAG	2	8	40674	40681	25 %	50 %	25 %	0 %	153941392
114	NC_009699	CTAT	2	8	40809	40816	25 %	50 %	0 %	25 %	153941392
115	NC_009699	TAAA	2	8	40855	40862	75 %	25 %	0 %	0 %	153941392
116	NC_009699	AAAT	2	8	40997	41004	75 %	25 %	0 %	0 %	153941392
117	NC_009699	TAAA	2	8	41252	41259	75 %	25 %	0 %	0 %	153941392
118	NC_009699	ATAA	2	8	41410	41417	75 %	25 %	0 %	0 %	153940471
119	NC_009699	TCTT	2	8	41548	41555	0 %	75 %	0 %	25 %	153940471
120	NC_009699	TTTA	2	8	41789	41796	25 %	75 %	0 %	0 %	153940471
121	NC_009699	GAAA	2	8	41886	41893	75 %	0 %	25 %	0 %	153940471
122	NC_009699	TTTA	2	8	42390	42397	25 %	75 %	0 %	0 %	153940471
123	NC_009699	ATTT	2	8	42653	42660	25 %	75 %	0 %	0 %	153939436
124	NC_009699	ATTT	2	8	42690	42697	25 %	75 %	0 %	0 %	153939436
125	NC_009699	AAAT	2	8	42717	42724	75 %	25 %	0 %	0 %	153939436
126	NC_009699	TTTA	2	8	42774	42781	25 %	75 %	0 %	0 %	153939436
127	NC_009699	GAAG	2	8	43213	43220	50 %	0 %	50 %	0 %	153939436
128	NC_009699	TTAA	2	8	43463	43470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009699	GATA	2	8	43613	43620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009699	CTTC	2	8	43877	43884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009699	GGTA	2	8	45013	45020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009699	AGAA	2	8	45326	45333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009699	TTCT	2	8	45339	45346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009699	GTTT	2	8	45408	45415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009699	AGAA	2	8	45751	45758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009699	AGGT	2	8	47181	47188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009699	TGCT	2	8	47568	47575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009699	AAAT	2	8	48479	48486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009699	GATG	2	8	48977	48984	25 %	25 %	50 %	0 %	153939172
140	NC_009699	TCCT	2	8	49496	49503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009699	TAGT	2	8	49772	49779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009699	CTTC	2	8	50395	50402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009699	GGTA	2	8	51531	51538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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