MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 2440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153935412
2	NC_009698	AAAAAT	2	12	1340	1351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935412
3	NC_009698	TCTATT	2	12	1561	1572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009698	GATAAT	2	12	2159	2170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937046
5	NC_009698	AAGTTA	2	12	2841	2852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153936289
6	NC_009698	CAAATA	2	12	3074	3085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153935303
7	NC_009698	ATAAAG	2	12	3170	3181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153935303
8	NC_009698	GAAGTA	2	12	4802	4813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153936801
9	NC_009698	TTGATA	2	12	5853	5864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936801
10	NC_009698	GATTAG	2	12	6499	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935617
11	NC_009698	TTTAAA	2	12	7364	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	153935617
12	NC_009698	CAAGCT	2	12	7590	7601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153935617
13	NC_009698	GATATA	2	12	7809	7820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935617
14	NC_009698	ATAGAT	2	12	17738	17749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937022
15	NC_009698	ACAAAT	2	12	18647	18658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153937022
16	NC_009698	AATAAA	2	12	19620	19631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153937535
17	NC_009698	GCAAAA	2	12	23476	23487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153937253
18	NC_009698	AGATTT	2	12	24311	24322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009698	ATTTAG	2	12	25332	25343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009698	TATAAT	2	12	29355	29366	50 %	50 %	0 %	0 %	153935706
21	NC_009698	ATATAA	2	12	30455	30466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009698	ATTTAG	2	12	31138	31149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153937664
23	NC_009698	ATATAG	2	12	32454	32465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937271
24	NC_009698	AGAAGC	2	12	32872	32883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153937271
25	NC_009698	AGATGA	2	12	40006	40017	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153934643
26	NC_009698	CTATAG	2	12	40187	40198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153937733
27	NC_009698	AATATA	2	12	41201	41212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009698	AGAAAA	2	12	42010	42021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937461
29	NC_009698	ATGTTT	2	12	47064	47075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153935425
30	NC_009698	TAAAAA	2	12	77488	77499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009698	ATTTAA	2	12	77910	77921	50 %	50 %	0 %	0 %	153936188
32	NC_009698	ATTATA	2	12	81028	81039	50 %	50 %	0 %	0 %	153935270
33	NC_009698	AATATG	2	12	81048	81059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935270
34	NC_009698	AATTAT	2	12	83070	83081	50 %	50 %	0 %	0 %	153935866
35	NC_009698	GAAAAA	2	12	83611	83622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153935087
36	NC_009698	TGTAGA	2	12	84446	84457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937748
37	NC_009698	AAAATA	2	12	86063	86074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153936779
38	NC_009698	GTTTTA	2	12	86296	86307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153936779
39	NC_009698	AGAAAA	2	12	86331	86342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153936779
40	NC_009698	GTAAGA	2	12	87735	87746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153937146
41	NC_009698	AATAAA	2	12	88343	88354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009698	TTTCAA	2	12	93445	93456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009698	ATTTAA	2	12	97437	97448	50 %	50 %	0 %	0 %	153936342
44	NC_009698	ATAAAT	2	12	101386	101397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937583
45	NC_009698	AGTTAA	2	12	103250	103261	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935585
46	NC_009698	AGAACA	2	12	106122	106133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153937636
47	NC_009698	AATATA	2	12	108496	108507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936181
48	NC_009698	AGGACA	2	12	109244	109255	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153937786
49	NC_009698	GTAGAT	2	12	109512	109523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937786
50	NC_009698	TACTGA	2	12	112169	112180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153935572
51	NC_009698	TATTAA	2	12	113288	113299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009698	AATAAA	2	12	115349	115360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935494
53	NC_009698	GATATA	2	12	115437	115448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935494
54	NC_009698	TAAAGA	2	12	116685	116696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153935349
55	NC_009698	TTAAAT	2	12	120456	120467	50 %	50 %	0 %	0 %	153937324
56	NC_009698	TCAAAA	2	12	122972	122983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153934659
57	NC_009698	TTTGCT	2	12	123998	124009	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153934659
58	NC_009698	GAAAAA	2	12	126133	126144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937141
59	NC_009698	AGGAAA	2	12	126395	126406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937141
60	NC_009698	AATGTA	2	12	127205	127216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937141
61	NC_009698	TGGATA	2	12	130256	130267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936480
62	NC_009698	CATGAA	2	12	131429	131440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153937649
63	NC_009698	ATAAAT	2	12	131543	131554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937649
64	NC_009698	ATAAGA	2	12	137141	137152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153937177
65	NC_009698	ATATAA	2	12	139825	139836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937527
66	NC_009698	ATTTTT	2	12	142746	142757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153934675
67	NC_009698	GTAAGT	2	12	142980	142991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153934675
68	NC_009698	TTGAAA	2	12	143178	143189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935800
69	NC_009698	TGATTT	2	12	143644	143655	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153935800
70	NC_009698	AAAGAA	2	12	147772	147783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937052
71	NC_009698	AATATA	2	12	148851	148862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935877
72	NC_009698	ATTAGT	2	12	151716	151727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936778
73	NC_009698	TTAAAG	2	12	156612	156623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935571
74	NC_009698	TACCTA	2	12	157699	157710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153936337
75	NC_009698	ACATTA	2	12	158420	158431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009698	GTAGAA	2	12	160686	160697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153937112
77	NC_009698	AAGGAA	2	12	161178	161189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009698	AAAAGA	2	12	161245	161256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153936129
79	NC_009698	ATAAAT	2	12	161486	161497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936129
80	NC_009698	ATAGAA	2	12	161905	161916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936916
81	NC_009698	AAACTT	2	12	162236	162247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009698	AGATTT	2	12	162497	162508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153937013
83	NC_009698	AAAGAA	2	12	162684	162695	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937013
84	NC_009698	ATGAAT	2	12	164434	164445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153934496
85	NC_009698	TTTATT	2	12	164706	164717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009698	GTGGTA	2	12	168664	168675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153935975
87	NC_009698	ATATAA	2	12	169870	169881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936703
88	NC_009698	AGGTAT	2	12	173524	173535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935683
89	NC_009698	AGTTAT	2	12	175771	175782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936575
90	NC_009698	TACAAC	2	12	176864	176875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153937423
91	NC_009698	ATATTT	2	12	177875	177886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009698	AAAAAT	2	12	178406	178417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153936404
93	NC_009698	ATGGTA	2	12	182414	182425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935396
94	NC_009698	AACATA	2	12	182482	182493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153935396
95	NC_009698	AATTAA	2	12	184864	184875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153934961
96	NC_009698	TAATTT	2	12	185580	185591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935794
97	NC_009698	AATAAA	2	12	186558	186569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935043
98	NC_009698	ATAAAA	2	12	186631	186642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935043
99	NC_009698	TTTAAT	2	12	188649	188660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009698	TAAAGT	2	12	189524	189535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153936256
101	NC_009698	AATGGT	2	12	193723	193734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936792
102	NC_009698	TTAAAA	2	12	195084	195095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936042
103	NC_009698	TAAATA	2	12	195844	195855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936042
104	NC_009698	AAAGAT	2	12	196461	196472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936042
105	NC_009698	TGTAAT	2	12	201221	201232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153935608
106	NC_009698	AAAGAA	2	12	202152	202163	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153935608
107	NC_009698	GTAGAA	2	12	202389	202400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153935608
108	NC_009698	GAAATA	2	12	203496	203507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936079
109	NC_009698	AAAAAT	2	12	203964	203975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009698	AATTAA	2	12	204338	204349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935137
111	NC_009698	GAAAAA	2	12	206174	206185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153934599
112	NC_009698	CTATAT	2	12	206799	206810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153934599
113	NC_009698	AATATT	2	12	207667	207678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009698	ATTAAT	2	12	207719	207730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009698	ATTAAT	2	12	208836	208847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009698	GGGTAA	2	12	210289	210300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153936476
117	NC_009698	ATATAG	2	12	210779	210790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935408
118	NC_009698	TAAGAT	2	12	211311	211322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153934587
119	NC_009698	CAGATA	2	12	212387	212398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153936679
120	NC_009698	GATAAA	2	12	213367	213378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936679
121	NC_009698	TAAAAG	2	12	213785	213796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936679
122	NC_009698	CTATAT	2	12	214938	214949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153935874
123	NC_009698	ATTATA	2	12	215348	215359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_009698	AAAAAG	2	12	416067	416078	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153936467
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