MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	TCTATT	2	12	1561	1572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009698	AGATTT	2	12	24311	24322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009698	ATTTAG	2	12	25332	25343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009698	ATATAA	2	12	30455	30466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009698	AATATA	2	12	41201	41212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009698	TAAAAA	2	12	77488	77499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009698	AATAAA	2	12	88343	88354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009698	TTTCAA	2	12	93445	93456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009698	TATTAA	2	12	113288	113299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009698	ACATTA	2	12	158420	158431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009698	AAGGAA	2	12	161178	161189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009698	AAACTT	2	12	162236	162247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009698	TTTATT	2	12	164706	164717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009698	ATATTT	2	12	177875	177886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009698	TTTAAT	2	12	188649	188660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009698	AAAAAT	2	12	203964	203975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009698	AATATT	2	12	207667	207678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009698	ATTAAT	2	12	207719	207730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009698	ATTAAT	2	12	208836	208847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009698	ATTATA	2	12	215348	215359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009698	AATTAT	2	12	215370	215381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009698	TATTTT	2	12	216531	216542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009698	ATTTTA	2	12	230764	230775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009698	TTTAAT	2	12	248512	248523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009698	ATTTAA	2	12	258924	258935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009698	TAAGTT	2	12	269499	269510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009698	ATTAAA	2	12	271304	271315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009698	CTTCAC	2	12	280348	280359	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009698	ATTTAA	2	12	280509	280520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009698	TTGTAA	2	12	287699	287710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009698	TTTATA	2	12	290142	290153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009698	AAAATA	2	12	298206	298217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009698	TAAATA	2	12	298236	298247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009698	ATTTGG	2	12	303418	303429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009698	AACAGT	2	12	307560	307571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009698	TAATTT	2	12	318409	318420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009698	TTTTTA	2	12	318523	318534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009698	TAATTT	2	12	329532	329543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009698	TAAAAG	2	12	332380	332391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009698	AAAATA	2	12	342408	342419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009698	TAAATA	2	12	342438	342449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009698	TTTTAA	2	12	353604	353615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009698	TAAATA	2	12	353621	353632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009698	AAAATG	2	12	353863	353874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009698	TTTAAT	2	12	365197	365208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009698	ATTAAA	2	12	373464	373475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009698	TAAATT	2	12	376424	376435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009698	TAATAT	2	12	376579	376590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009698	GAGATC	2	12	378654	378665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009698	TGTGAG	2	12	385493	385504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009698	TGTAAA	2	12	388507	388518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009698	TAATAT	2	12	392439	392450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009698	ATTTTA	2	12	395166	395177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009698	TATTTT	2	12	399184	399195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009698	TTAAAA	2	12	415331	415342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009698	TTTAAG	2	12	447883	447894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009698	TAAAAA	2	12	460529	460540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009698	GTATTA	2	12	466179	466190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009698	ATTAAT	2	12	470351	470362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009698	ATTAAA	2	12	471701	471712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009698	ATTTTT	2	12	479472	479483	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009698	TTCAAT	2	12	479586	479597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009698	AAAGCA	2	12	481858	481869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009698	ATATTA	2	12	492541	492552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009698	GTATTA	2	12	492738	492749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009698	TTTAAT	2	12	506296	506307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009698	TTTTTA	2	12	509777	509788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009698	TAAAAT	2	12	518937	518948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009698	GTTAAT	2	12	529616	529627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009698	ATTAAA	2	12	531351	531362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009698	AAATAA	2	12	531384	531395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009698	TAAATA	2	12	534760	534771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009698	TTTAAT	2	12	542722	542733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009698	AATTAA	2	12	542797	542808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009698	TAATAT	2	12	545850	545861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009698	TATTAA	2	12	547319	547330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009698	TTTATT	2	12	551550	551561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009698	AAAATA	2	12	557684	557695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009698	TTATAT	2	12	561985	561996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009698	ATGGGG	2	12	563446	563457	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009698	TATAAA	2	12	564394	564405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009698	TTTATT	2	12	565582	565593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009698	TATAAA	2	12	570373	570384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009698	AATTTT	2	12	579851	579862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009698	ATTAAA	2	12	579896	579907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009698	ATATTT	2	12	579955	579966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009698	AAAGTA	2	12	584733	584744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009698	TAAAAA	2	12	602075	602086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009698	TTTAAT	2	12	602091	602102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009698	TTAAAA	2	12	602211	602222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009698	TTTTAA	2	12	608782	608793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009698	TTTAAA	2	12	611677	611688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009698	TACATA	2	12	616276	616287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009698	TTTTAC	2	12	617659	617670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009698	TTTAAT	2	12	618715	618726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009698	TTAAAT	2	12	618785	618796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009698	AATATT	2	12	618843	618854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009698	ATTTTT	2	12	623000	623011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009698	TAATCT	2	12	626663	626674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009698	TTTAAT	2	12	630800	630811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009698	TATTGA	2	12	631202	631213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009698	ATGTAT	2	12	641460	641471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009698	AAATTA	2	12	646890	646901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009698	ATTATA	2	12	648616	648627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009698	ATAAAA	2	12	648731	648742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009698	ATGGAA	2	12	673213	673224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009698	TTATAT	2	12	680509	680520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009698	TTTTTA	2	12	681428	681439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009698	TTTAAT	2	12	681469	681480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009698	TTATAA	2	12	685549	685560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009698	TAAATA	2	12	689292	689303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009698	TAAAGT	2	12	694344	694355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009698	TTATTT	2	12	695036	695047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009698	TAAAAT	2	12	697868	697879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009698	AATATA	2	12	713260	713271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009698	TTTTAA	2	12	731086	731097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009698	TTAAAT	2	12	744630	744641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009698	AATATA	2	12	760620	760631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009698	AATTAG	2	12	769825	769836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009698	TTGAAA	2	12	786042	786053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009698	CCTCTA	2	12	810463	810474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009698	AAAACA	2	12	820674	820685	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009698	AATATA	2	12	822318	822329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009698	TATAAA	2	12	823346	823357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009698	TTTTAT	2	12	827618	827629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009698	ACAGCA	2	12	837508	837519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009698	TATAAA	2	12	837580	837591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009698	ATATTT	2	12	837601	837612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009698	TTCATA	2	12	846229	846240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_009698	ATTAAT	2	12	854421	854432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009698	GAAAAA	2	12	854747	854758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009698	ATTAAA	2	12	863494	863505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009698	TAAAAT	2	12	891647	891658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009698	AAAATA	2	12	891680	891691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_009698	AAAATA	2	12	1667247	1667258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009698	ATTTTA	2	12	1683401	1683412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_009698	GCAATT	2	12	2565850	2565861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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386	NC_009698	TATACC	3	18	2643140	2643157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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