MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 12382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
2	NC_009698	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	153935412
3	NC_009698	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	153935412
4	NC_009698	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	153935412
5	NC_009698	ATGC	2	8	481	488	25 %	25 %	25 %	25 %	153935412
6	NC_009698	AATT	3	12	563	574	50 %	50 %	0 %	0 %	153935412
7	NC_009698	AAAT	2	8	606	613	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
8	NC_009698	AGAA	2	8	666	673	75 %	0 %	25 %	0 %	153935412
9	NC_009698	AACA	2	8	718	725	75 %	0 %	0 %	25 %	153935412
10	NC_009698	TAAA	2	8	1322	1329	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
11	NC_009698	TTAT	2	8	1378	1385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009698	AAAT	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	153937046
13	NC_009698	TTTA	2	8	2272	2279	25 %	75 %	0 %	0 %	153937046
14	NC_009698	AATT	2	8	2746	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	153936289
15	NC_009698	TTCT	2	8	2773	2780	0 %	75 %	0 %	25 %	153936289
16	NC_009698	TAAT	2	8	2986	2993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009698	GAAA	2	8	3484	3491	75 %	0 %	25 %	0 %	153935303
18	NC_009698	AAGT	2	8	3797	3804	50 %	25 %	25 %	0 %	153935303
19	NC_009698	ATAA	2	8	3805	3812	75 %	25 %	0 %	0 %	153935303
20	NC_009698	GGAT	2	8	4241	4248	25 %	25 %	50 %	0 %	153937594
21	NC_009698	GCAT	2	8	4653	4660	25 %	25 %	25 %	25 %	153936801
22	NC_009698	TTTA	2	8	5088	5095	25 %	75 %	0 %	0 %	153936801
23	NC_009698	GATG	2	8	5150	5157	25 %	25 %	50 %	0 %	153936801
24	NC_009698	GACA	2	8	5409	5416	50 %	0 %	25 %	25 %	153936801
25	NC_009698	ATTT	2	8	5666	5673	25 %	75 %	0 %	0 %	153936801
26	NC_009698	AATG	2	8	5758	5765	50 %	25 %	25 %	0 %	153936801
27	NC_009698	GTAA	2	8	6375	6382	50 %	25 %	25 %	0 %	153935617
28	NC_009698	ATAA	2	8	6750	6757	75 %	25 %	0 %	0 %	153935617
29	NC_009698	ATAC	2	8	7894	7901	50 %	25 %	0 %	25 %	153935617
30	NC_009698	ATAA	2	8	8960	8967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009698	CTTC	2	8	9349	9356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009698	GGTA	2	8	10485	10492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009698	AGAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009698	TTCT	2	8	10811	10818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009698	GTTT	2	8	10880	10887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009698	AGAA	2	8	11222	11229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009698	AGGT	2	8	12652	12659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009698	TGCT	2	8	13039	13046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009698	TTAA	2	8	14817	14824	50 %	50 %	0 %	0 %	153934873
40	NC_009698	TAAA	2	8	14848	14855	75 %	25 %	0 %	0 %	153934873
41	NC_009698	AGAA	2	8	14921	14928	75 %	0 %	25 %	0 %	153937121
42	NC_009698	TATG	2	8	15257	15264	25 %	50 %	25 %	0 %	153937121
43	NC_009698	TACT	2	8	15319	15326	25 %	50 %	0 %	25 %	153937121
44	NC_009698	GGAA	2	8	16065	16072	50 %	0 %	50 %	0 %	153936038
45	NC_009698	TTTA	2	8	16645	16652	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
46	NC_009698	TAAA	2	8	16854	16861	75 %	25 %	0 %	0 %	153937022
47	NC_009698	TTTA	2	8	17230	17237	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
48	NC_009698	GCTA	2	8	17303	17310	25 %	25 %	25 %	25 %	153937022
49	NC_009698	AGTA	2	8	17416	17423	50 %	25 %	25 %	0 %	153937022
50	NC_009698	AGCA	2	8	17641	17648	50 %	0 %	25 %	25 %	153937022
51	NC_009698	TAAA	2	8	18129	18136	75 %	25 %	0 %	0 %	153937022
52	NC_009698	ATTT	2	8	18528	18535	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
53	NC_009698	ATGG	2	8	18773	18780	25 %	25 %	50 %	0 %	153937022
54	NC_009698	ATTT	2	8	18843	18850	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
55	NC_009698	AATT	2	8	19397	19404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009698	TACT	2	8	19450	19457	25 %	50 %	0 %	25 %	153937535
57	NC_009698	TACA	2	8	19486	19493	50 %	25 %	0 %	25 %	153937535
58	NC_009698	AAGA	2	8	19494	19501	75 %	0 %	25 %	0 %	153937535
59	NC_009698	AAAT	2	8	19540	19547	75 %	25 %	0 %	0 %	153937535
60	NC_009698	GGAT	2	8	19761	19768	25 %	25 %	50 %	0 %	153937535
61	NC_009698	ATTC	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	153937535
62	NC_009698	TCAA	2	8	20904	20911	50 %	25 %	0 %	25 %	153935047
63	NC_009698	AAAT	2	8	21070	21077	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
64	NC_009698	ATAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
65	NC_009698	TAGT	2	8	21235	21242	25 %	50 %	25 %	0 %	153935047
66	NC_009698	AAAG	2	8	21260	21267	75 %	0 %	25 %	0 %	153935047
67	NC_009698	TAAA	2	8	21499	21506	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
68	NC_009698	AAAT	2	8	21533	21540	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
69	NC_009698	ATTT	2	8	21645	21652	25 %	75 %	0 %	0 %	153934720
70	NC_009698	GTTA	2	8	21786	21793	25 %	50 %	25 %	0 %	153934720
71	NC_009698	TATT	2	8	22325	22332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009698	AATA	2	8	22342	22349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009698	CAAG	2	8	23440	23447	50 %	0 %	25 %	25 %	153937253
74	NC_009698	TAAA	2	8	23741	23748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009698	ATTT	2	8	24296	24303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009698	ATAA	2	8	24783	24790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009698	TTGA	2	8	25466	25473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009698	ATTT	3	12	25514	25525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009698	TTTA	2	8	25969	25976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009698	GACT	2	8	26328	26335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009698	ATTT	2	8	26458	26465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009698	AAAT	2	8	26486	26493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009698	TATG	2	8	26522	26529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009698	TGGC	2	8	26834	26841	0 %	25 %	50 %	25 %	153936471
85	NC_009698	GTAA	2	8	27585	27592	50 %	25 %	25 %	0 %	153936191
86	NC_009698	TAAA	2	8	27862	27869	75 %	25 %	0 %	0 %	153936191
87	NC_009698	TTGT	2	8	28094	28101	0 %	75 %	25 %	0 %	153936228
88	NC_009698	CTAT	2	8	29143	29150	25 %	50 %	0 %	25 %	153935706
89	NC_009698	CATT	2	8	29628	29635	25 %	50 %	0 %	25 %	153934746
90	NC_009698	TATT	2	8	29974	29981	25 %	75 %	0 %	0 %	153934746
91	NC_009698	TTGA	2	8	31272	31279	25 %	50 %	25 %	0 %	153937664
92	NC_009698	ATTT	3	12	31320	31331	25 %	75 %	0 %	0 %	153937664
93	NC_009698	ATTA	2	8	31545	31552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009698	ATCT	2	8	31821	31828	25 %	50 %	0 %	25 %	153937271
95	NC_009698	AAAT	2	8	32194	32201	75 %	25 %	0 %	0 %	153937271
96	NC_009698	AAAT	2	8	32215	32222	75 %	25 %	0 %	0 %	153937271
97	NC_009698	TAAA	2	8	33252	33259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009698	ATAA	2	8	34127	34134	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
99	NC_009698	GATA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	153935787
100	NC_009698	ATGT	2	8	34478	34485	25 %	50 %	25 %	0 %	153935787
101	NC_009698	AGAA	2	8	35137	35144	75 %	0 %	25 %	0 %	153935787
102	NC_009698	TAAA	2	8	35187	35194	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
103	NC_009698	TAAA	2	8	35199	35206	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
104	NC_009698	TAAA	2	8	35235	35242	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
105	NC_009698	AATG	2	8	35440	35447	50 %	25 %	25 %	0 %	153935787
106	NC_009698	TGTA	2	8	35530	35537	25 %	50 %	25 %	0 %	153935787
107	NC_009698	AATA	2	8	35538	35545	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
108	NC_009698	AAGA	2	8	36789	36796	75 %	0 %	25 %	0 %	153937734
109	NC_009698	TAAA	2	8	36964	36971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009698	AATA	2	8	36996	37003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009698	ATGA	2	8	37028	37035	50 %	25 %	25 %	0 %	153937691
112	NC_009698	ATGT	2	8	37244	37251	25 %	50 %	25 %	0 %	153937691
113	NC_009698	TATT	2	8	37511	37518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009698	GGAA	2	8	37889	37896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009698	AATA	2	8	38352	38359	75 %	25 %	0 %	0 %	153935315
116	NC_009698	AAAG	2	8	39331	39338	75 %	0 %	25 %	0 %	153935315
117	NC_009698	AGAA	2	8	39909	39916	75 %	0 %	25 %	0 %	153934643
118	NC_009698	TGCA	2	8	40048	40055	25 %	25 %	25 %	25 %	153934643
119	NC_009698	AAAG	2	8	40066	40073	75 %	0 %	25 %	0 %	153934643
120	NC_009698	GAAG	2	8	40750	40757	50 %	0 %	50 %	0 %	153937733
121	NC_009698	AATT	2	8	40960	40967	50 %	50 %	0 %	0 %	153936595
122	NC_009698	TTAT	2	8	41369	41376	25 %	75 %	0 %	0 %	153935371
123	NC_009698	AAAT	2	8	41721	41728	75 %	25 %	0 %	0 %	153937461
124	NC_009698	AATT	2	8	42433	42440	50 %	50 %	0 %	0 %	153936479
125	NC_009698	TAAA	2	8	42769	42776	75 %	25 %	0 %	0 %	153936479
126	NC_009698	GATT	2	8	42794	42801	25 %	50 %	25 %	0 %	153936479
127	NC_009698	ATAA	2	8	43356	43363	75 %	25 %	0 %	0 %	153935104
128	NC_009698	AATT	2	8	43460	43467	50 %	50 %	0 %	0 %	153935104
129	NC_009698	ATTA	2	8	43992	43999	50 %	50 %	0 %	0 %	153934545
130	NC_009698	ATAA	2	8	44224	44231	75 %	25 %	0 %	0 %	153934545
131	NC_009698	ATAA	2	8	44356	44363	75 %	25 %	0 %	0 %	153934545
132	NC_009698	ATAA	2	8	44674	44681	75 %	25 %	0 %	0 %	153937588
133	NC_009698	TTAG	2	8	45332	45339	25 %	50 %	25 %	0 %	153935856
134	NC_009698	CTAT	2	8	45467	45474	25 %	50 %	0 %	25 %	153935856
135	NC_009698	TAAA	2	8	45513	45520	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
136	NC_009698	AAAT	2	8	45655	45662	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
137	NC_009698	TAAA	2	8	45910	45917	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
138	NC_009698	ATAA	2	8	46068	46075	75 %	25 %	0 %	0 %	153935425
139	NC_009698	TCTT	2	8	46206	46213	0 %	75 %	0 %	25 %	153935425
140	NC_009698	TTTA	2	8	46447	46454	25 %	75 %	0 %	0 %	153935425
141	NC_009698	GAAA	2	8	46544	46551	75 %	0 %	25 %	0 %	153935425
142	NC_009698	TTTA	2	8	47048	47055	25 %	75 %	0 %	0 %	153935425
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144	NC_009698	ATTT	2	8	47348	47355	25 %	75 %	0 %	0 %	153934499
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