MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 48401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
2	NC_009698	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935412
3	NC_009698	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
4	NC_009698	AGA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
5	NC_009698	ATA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
6	NC_009698	ATG	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935412
7	NC_009698	CTA	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935412
8	NC_009698	GCA	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153935412
9	NC_009698	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153935412
10	NC_009698	AGT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935412
11	NC_009698	TCT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153935412
12	NC_009698	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935412
13	NC_009698	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935412
14	NC_009698	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
15	NC_009698	AGA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
16	NC_009698	TAA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
17	NC_009698	TAG	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935412
18	NC_009698	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935412
19	NC_009698	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
20	NC_009698	ATT	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935412
21	NC_009698	AAG	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
22	NC_009698	TAT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935412
23	NC_009698	AGA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
24	NC_009698	AGA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
25	NC_009698	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935412
26	NC_009698	TAC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935412
27	NC_009698	TAA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935412
28	NC_009698	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
29	NC_009698	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
30	NC_009698	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
31	NC_009698	AGA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
32	NC_009698	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
33	NC_009698	AGA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
34	NC_009698	ATA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
35	NC_009698	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
36	NC_009698	TAG	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937046
37	NC_009698	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
38	NC_009698	GTT	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153937046
39	NC_009698	AGA	3	9	2224	2232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
40	NC_009698	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
41	NC_009698	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
42	NC_009698	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
43	NC_009698	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
44	NC_009698	ATA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
45	NC_009698	AAG	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
46	NC_009698	GAT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937046
47	NC_009698	TAA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
48	NC_009698	GAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937046
49	NC_009698	AGT	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937046
50	NC_009698	TAT	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937046
51	NC_009698	AAT	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937046
52	NC_009698	ATA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936289
53	NC_009698	CAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153936289
54	NC_009698	GAC	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153936289
55	NC_009698	TAA	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936289
56	NC_009698	ATT	2	6	2930	2935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153936289
57	NC_009698	TAA	2	6	3029	3034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
58	NC_009698	ATG	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935303
59	NC_009698	TAA	2	6	3096	3101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
60	NC_009698	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
61	NC_009698	TGT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153935303
62	NC_009698	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935303
63	NC_009698	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
64	NC_009698	TAT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935303
65	NC_009698	ATA	2	6	3467	3472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
66	NC_009698	ATG	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935303
67	NC_009698	ATT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935303
68	NC_009698	AAG	2	6	3634	3639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935303
69	NC_009698	AGA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935303
70	NC_009698	ATT	2	6	3714	3719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935303
71	NC_009698	GAT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935303
72	NC_009698	ACA	2	6	3843	3848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153935303
73	NC_009698	CAT	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935303
74	NC_009698	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
75	NC_009698	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
76	NC_009698	GAT	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935303
77	NC_009698	TAA	2	6	4004	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
78	NC_009698	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935303
79	NC_009698	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935303
80	NC_009698	TTC	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153937594
81	NC_009698	GTA	3	9	4146	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937594
82	NC_009698	TTG	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153937594
83	NC_009698	ATG	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
84	NC_009698	TCA	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153936801
85	NC_009698	ATA	2	6	4545	4550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936801
86	NC_009698	CTG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153936801
87	NC_009698	TAA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936801
88	NC_009698	TGG	3	9	4723	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153936801
89	NC_009698	TGG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153936801
90	NC_009698	TGT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153936801
91	NC_009698	AGA	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153936801
92	NC_009698	TGA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
93	NC_009698	CAA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153936801
94	NC_009698	TGA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
95	NC_009698	GAT	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
96	NC_009698	CAG	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153936801
97	NC_009698	TAG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
98	NC_009698	ATA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936801
99	NC_009698	AGA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153936801
100	NC_009698	TTC	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153936801
101	NC_009698	CAT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153936801
102	NC_009698	GAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153936801
103	NC_009698	ATA	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936801
104	NC_009698	AAT	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936801
105	NC_009698	ACC	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153936801
106	NC_009698	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153936801
107	NC_009698	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153936801
108	NC_009698	AAC	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153936801
109	NC_009698	ACT	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153936801
110	NC_009698	TTA	2	6	6185	6190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153936801
111	NC_009698	AAG	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153936801
112	NC_009698	AGT	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936801
113	NC_009698	GAA	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935617
114	NC_009698	AGA	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935617
115	NC_009698	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
116	NC_009698	ATC	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935617
117	NC_009698	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153935617
118	NC_009698	TAG	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935617
119	NC_009698	AGC	3	9	6686	6694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153935617
120	NC_009698	GAA	4	12	6792	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935617
121	NC_009698	TTC	2	6	6848	6853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153935617
122	NC_009698	CTA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153935617
123	NC_009698	AAT	3	9	6917	6925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
124	NC_009698	ATA	2	6	7107	7112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
125	NC_009698	TAA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
126	NC_009698	AAT	2	6	7325	7330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
127	NC_009698	TAA	2	6	7346	7351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
128	NC_009698	TAA	2	6	7414	7419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935617
129	NC_009698	GAA	3	9	7420	7428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153935617
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