MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 chromosome

Total Repeats: 4361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009697	AATAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	153933867
2	NC_009697	TAAAT	2	10	3603	3612	60 %	40 %	0 %	0 %	153933867
3	NC_009697	TAAAA	2	10	4083	4092	80 %	20 %	0 %	0 %	153933867
4	NC_009697	ACTTT	2	10	5927	5936	20 %	60 %	0 %	20 %	153931278
5	NC_009697	AAGAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	153931278
6	NC_009697	TAAAA	2	10	6968	6977	80 %	20 %	0 %	0 %	153932201
7	NC_009697	GGTAA	2	10	9525	9534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009697	TCGTG	2	10	10316	10325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009697	TAAGT	2	10	12053	12062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009697	AAATT	2	10	14637	14646	60 %	40 %	0 %	0 %	153933340
11	NC_009697	AATAA	2	10	15375	15384	80 %	20 %	0 %	0 %	153934316
12	NC_009697	ATATA	2	10	15753	15762	60 %	40 %	0 %	0 %	153930946
13	NC_009697	TTTTA	2	10	16315	16324	20 %	80 %	0 %	0 %	153930946
14	NC_009697	AATAA	2	10	16664	16673	80 %	20 %	0 %	0 %	153932174
15	NC_009697	TTATT	2	10	17107	17116	20 %	80 %	0 %	0 %	153932174
16	NC_009697	TATAA	2	10	17753	17762	60 %	40 %	0 %	0 %	153932174
17	NC_009697	CAAAG	2	10	18542	18551	60 %	0 %	20 %	20 %	153932174
18	NC_009697	TAATG	2	10	18727	18736	40 %	40 %	20 %	0 %	153932174
19	NC_009697	TAAAA	2	10	19275	19284	80 %	20 %	0 %	0 %	153932174
20	NC_009697	GAAAT	2	10	19564	19573	60 %	20 %	20 %	0 %	153931833
21	NC_009697	ATATT	2	10	20003	20012	40 %	60 %	0 %	0 %	153931833
22	NC_009697	TAATA	2	10	20063	20072	60 %	40 %	0 %	0 %	153931833
23	NC_009697	ATAGT	2	10	21121	21130	40 %	40 %	20 %	0 %	153932880
24	NC_009697	AATTT	2	10	21611	21620	40 %	60 %	0 %	0 %	153932880
25	NC_009697	ATTAT	2	10	22288	22297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009697	CTAAA	2	10	22541	22550	60 %	20 %	0 %	20 %	153931011
27	NC_009697	TGAAA	2	10	22584	22593	60 %	20 %	20 %	0 %	153931011
28	NC_009697	TCAAT	2	10	23199	23208	40 %	40 %	0 %	20 %	153931011
29	NC_009697	TTTAA	2	10	23672	23681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009697	ATTAA	2	10	23692	23701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009697	TATTT	2	10	23764	23773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009697	TTTTA	2	10	26425	26434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009697	AATTA	2	10	26506	26515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009697	ATATT	2	10	26567	26576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009697	TTAAT	2	10	26980	26989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009697	AATAA	2	10	27870	27879	80 %	20 %	0 %	0 %	153932329
37	NC_009697	TATGT	2	10	28699	28708	20 %	60 %	20 %	0 %	153931023
38	NC_009697	TTATT	2	10	28817	28826	20 %	80 %	0 %	0 %	153933982
39	NC_009697	GGATT	2	10	29020	29029	20 %	40 %	40 %	0 %	153933982
40	NC_009697	ATTAT	2	10	29810	29819	40 %	60 %	0 %	0 %	153931424
41	NC_009697	ATTTT	2	10	30320	30329	20 %	80 %	0 %	0 %	153931424
42	NC_009697	TAATT	2	10	32495	32504	40 %	60 %	0 %	0 %	153933391
43	NC_009697	ATTTT	2	10	33324	33333	20 %	80 %	0 %	0 %	153933485
44	NC_009697	TAAAT	2	10	33662	33671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009697	ATATA	2	10	33950	33959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009697	AATAA	2	10	35507	35516	80 %	20 %	0 %	0 %	153931039
47	NC_009697	AAAAT	2	10	37116	37125	80 %	20 %	0 %	0 %	153931005
48	NC_009697	CAATA	2	10	37207	37216	60 %	20 %	0 %	20 %	153931005
49	NC_009697	ATATT	2	10	37547	37556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009697	AATAA	2	10	37605	37614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009697	GATTT	2	10	38624	38633	20 %	60 %	20 %	0 %	153932975
52	NC_009697	TAATA	2	10	41157	41166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009697	GAATA	2	10	41244	41253	60 %	20 %	20 %	0 %	153931214
54	NC_009697	TTATT	2	10	41260	41269	20 %	80 %	0 %	0 %	153931214
55	NC_009697	ATAAA	2	10	41639	41648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009697	GATTT	2	10	41994	42003	20 %	60 %	20 %	0 %	153931903
57	NC_009697	ACACC	2	10	42203	42212	40 %	0 %	0 %	60 %	153931903
58	NC_009697	AAAAG	2	10	42253	42262	80 %	0 %	20 %	0 %	153931903
59	NC_009697	ATAGA	2	10	43916	43925	60 %	20 %	20 %	0 %	153932739
60	NC_009697	GCAAT	2	10	44573	44582	40 %	20 %	20 %	20 %	153932739
61	NC_009697	AAAGA	2	10	44590	44599	80 %	0 %	20 %	0 %	153932739
62	NC_009697	AGTAT	2	10	45599	45608	40 %	40 %	20 %	0 %	153933799
63	NC_009697	TTAAT	2	10	46636	46645	40 %	60 %	0 %	0 %	153933366
64	NC_009697	ATTGT	2	10	47819	47828	20 %	60 %	20 %	0 %	153934039
65	NC_009697	ATAGA	2	10	47924	47933	60 %	20 %	20 %	0 %	153934039
66	NC_009697	GGTAA	2	10	48711	48720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009697	TCGTG	2	10	49502	49511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009697	TAAGT	2	10	51240	51249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009697	AAAAT	2	10	53091	53100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009697	AATAA	2	10	53765	53774	80 %	20 %	0 %	0 %	153931907
71	NC_009697	GAATA	2	10	54116	54125	60 %	20 %	20 %	0 %	153931907
72	NC_009697	GGTAA	2	10	55339	55348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009697	TCGTG	2	10	56130	56139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009697	TAAGT	2	10	57867	57876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009697	AAAAT	2	10	59718	59727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009697	TTATA	2	10	60297	60306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009697	GGTAA	2	10	63283	63292	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009697	TCGTG	2	10	64074	64083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009697	TAAGT	2	10	65812	65821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009697	AAAAT	2	10	67663	67672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009697	GAAGA	2	10	68172	68181	60 %	0 %	40 %	0 %	153931321
82	NC_009697	AAATA	2	10	68790	68799	80 %	20 %	0 %	0 %	153931321
83	NC_009697	ATTAT	2	10	68913	68922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009697	TCGTG	2	10	70356	70365	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009697	TAAGT	2	10	72094	72103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009697	AAAAT	2	10	73945	73954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009697	ATTTT	2	10	74430	74439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009697	TTGAA	2	10	75351	75360	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009697	CAATC	2	10	75502	75511	40 %	20 %	0 %	40 %	153932350
90	NC_009697	TTATT	2	10	77779	77788	20 %	80 %	0 %	0 %	153933952
91	NC_009697	ATTTT	2	10	77796	77805	20 %	80 %	0 %	0 %	153933952
92	NC_009697	ATTTT	2	10	78149	78158	20 %	80 %	0 %	0 %	153933952
93	NC_009697	AAAAT	2	10	78183	78192	80 %	20 %	0 %	0 %	153933952
94	NC_009697	TTTCC	2	10	78864	78873	0 %	60 %	0 %	40 %	153931577
95	NC_009697	ATTTT	2	10	78879	78888	20 %	80 %	0 %	0 %	153931577
96	NC_009697	GAATA	2	10	79438	79447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009697	TATAA	2	10	81016	81025	60 %	40 %	0 %	0 %	153933078
98	NC_009697	AATAT	2	10	82050	82059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009697	TAAAT	2	10	82866	82875	60 %	40 %	0 %	0 %	153933729
100	NC_009697	TAAAT	2	10	83659	83668	60 %	40 %	0 %	0 %	153930936
101	NC_009697	TAGAA	2	10	83788	83797	60 %	20 %	20 %	0 %	153930936
102	NC_009697	GATAG	2	10	85396	85405	40 %	20 %	40 %	0 %	153931253
103	NC_009697	AGGAT	2	10	86097	86106	40 %	20 %	40 %	0 %	153933655
104	NC_009697	AATGG	2	10	86344	86353	40 %	20 %	40 %	0 %	153933655
105	NC_009697	AAATT	2	10	86529	86538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009697	AAAGA	2	10	87085	87094	80 %	0 %	20 %	0 %	153931064
107	NC_009697	ATTTA	2	10	88180	88189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009697	CAATA	2	10	88440	88449	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009697	TTTAA	2	10	88846	88855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009697	AAGTT	2	10	89740	89749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009697	TAAAT	2	10	91201	91210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009697	TATAA	2	10	92296	92305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009697	ATTTT	2	10	93366	93375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009697	ATTTA	2	10	93568	93577	40 %	60 %	0 %	0 %	153932671
115	NC_009697	TAATA	2	10	93838	93847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009697	TAATA	2	10	95023	95032	60 %	40 %	0 %	0 %	153931348
117	NC_009697	ATATT	2	10	97207	97216	40 %	60 %	0 %	0 %	153933715
118	NC_009697	AGAAA	2	10	99707	99716	80 %	0 %	20 %	0 %	153931420
119	NC_009697	AAAAC	2	10	99752	99761	80 %	0 %	0 %	20 %	153931420
120	NC_009697	AAATT	2	10	100722	100731	60 %	40 %	0 %	0 %	153931982
121	NC_009697	AAATG	2	10	100990	100999	60 %	20 %	20 %	0 %	153931982
122	NC_009697	GAAGT	2	10	102003	102012	40 %	20 %	40 %	0 %	153932762
123	NC_009697	AGATA	2	10	102625	102634	60 %	20 %	20 %	0 %	153932762
124	NC_009697	GAAAA	2	10	103568	103577	80 %	0 %	20 %	0 %	153932954
125	NC_009697	ACATT	2	10	106579	106588	40 %	40 %	0 %	20 %	153933996
126	NC_009697	AAAAT	2	10	109067	109076	80 %	20 %	0 %	0 %	153930962
127	NC_009697	ATTTA	2	10	110044	110053	40 %	60 %	0 %	0 %	153933074
128	NC_009697	GTTAT	2	10	112655	112664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009697	GAAAT	2	10	113355	113364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009697	ATTTT	2	10	114396	114405	20 %	80 %	0 %	0 %	153930953
131	NC_009697	ATACA	2	10	114913	114922	60 %	20 %	0 %	20 %	153931920
132	NC_009697	AATAT	2	10	115217	115226	60 %	40 %	0 %	0 %	153931920
133	NC_009697	TAAAA	2	10	115509	115518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009697	AAGAA	2	10	116482	116491	80 %	0 %	20 %	0 %	153933790
135	NC_009697	TAATA	2	10	116770	116779	60 %	40 %	0 %	0 %	153933790
136	NC_009697	AGAGA	2	10	116804	116813	60 %	0 %	40 %	0 %	153933790
137	NC_009697	TAAAT	2	10	117394	117403	60 %	40 %	0 %	0 %	153933790
138	NC_009697	TAATT	2	10	119734	119743	40 %	60 %	0 %	0 %	153932576
139	NC_009697	ATTAT	2	10	120466	120475	40 %	60 %	0 %	0 %	153931647
140	NC_009697	GAAAA	2	10	121837	121846	80 %	0 %	20 %	0 %	153932381
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142	NC_009697	AAAAG	2	10	122621	122630	80 %	0 %	20 %	0 %	153932381
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