MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98 plasmid pBC9801

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009673	TCT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
2	NC_009673	TTC	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
3	NC_009673	TAA	2	6	273	278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973843
4	NC_009673	CAT	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
5	NC_009673	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973843
6	NC_009673	GAC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973843
7	NC_009673	ACC	2	6	414	419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973843
8	NC_009673	AGT	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
9	NC_009673	CAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
10	NC_009673	CAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973843
11	NC_009673	CTT	2	6	702	707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
12	NC_009673	TGA	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
13	NC_009673	TAG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
14	NC_009673	CAT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
15	NC_009673	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973843
16	NC_009673	ATC	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
17	NC_009673	CAT	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
18	NC_009673	TCA	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
19	NC_009673	TAA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973843
20	NC_009673	TCC	2	6	1079	1084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973843
21	NC_009673	TTC	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973844
22	NC_009673	GTG	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973844
23	NC_009673	ATA	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973844
24	NC_009673	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973844
25	NC_009673	TCT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973844
26	NC_009673	TTA	2	6	2040	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973846
27	NC_009673	ATC	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973846
28	NC_009673	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973846
29	NC_009673	AAT	2	6	2129	2134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973846
30	NC_009673	TAA	2	6	2141	2146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973846
31	NC_009673	TCT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973847
32	NC_009673	ATC	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973847
33	NC_009673	GGT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973848
34	NC_009673	TCA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
35	NC_009673	GAA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973848
36	NC_009673	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
37	NC_009673	TTC	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
38	NC_009673	CTT	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
39	NC_009673	ATC	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
40	NC_009673	AGG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973848
41	NC_009673	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
42	NC_009673	CAT	3	9	3939	3947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
43	NC_009673	ATC	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
44	NC_009673	ACA	2	6	3998	4003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
45	NC_009673	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973848
46	NC_009673	CAT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
47	NC_009673	CTT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
48	NC_009673	CAT	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
49	NC_009673	ACA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
50	NC_009673	GTC	2	6	4402	4407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973848
51	NC_009673	CTA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
52	NC_009673	TTC	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973850
53	NC_009673	TCT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973850
54	NC_009673	ATC	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973850
55	NC_009673	TAC	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973850
56	NC_009673	AAC	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973851
57	NC_009673	TAA	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973851
58	NC_009673	TCT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973851
59	NC_009673	TAT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973851
60	NC_009673	ATA	2	6	5633	5638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973851
61	NC_009673	GTT	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973851
62	NC_009673	CTA	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973851
63	NC_009673	AGA	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973851
64	NC_009673	TTC	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973851
65	NC_009673	TAC	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973851
66	NC_009673	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973851
67	NC_009673	TGT	2	6	6051	6056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973852
68	NC_009673	TAG	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973852
69	NC_009673	TAT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973852
70	NC_009673	CTT	2	6	6191	6196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973852
71	NC_009673	TCA	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973853
72	NC_009673	AAC	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973853
73	NC_009673	TAA	2	6	6568	6573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973853
74	NC_009673	CTT	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973853
75	NC_009673	TCC	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973853
76	NC_009673	TCA	2	6	6712	6717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973853
77	NC_009673	ATT	2	6	6761	6766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973853
78	NC_009673	TAT	2	6	6793	6798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973853
79	NC_009673	AAT	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973853

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.