MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 3293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009665	AGCCG	2	10	723	732	20 %	0 %	40 %	40 %	152998556
2	NC_009665	AGTGA	2	10	5220	5229	40 %	20 %	40 %	0 %	152998559
3	NC_009665	TGAAT	2	10	8571	8580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009665	TTTCG	2	10	11529	11538	0 %	60 %	20 %	20 %	152998563
5	NC_009665	ATGGC	2	10	12035	12044	20 %	20 %	40 %	20 %	152998564
6	NC_009665	CATTC	2	10	16834	16843	20 %	40 %	0 %	40 %	152998566
7	NC_009665	GCATC	2	10	20739	20748	20 %	20 %	20 %	40 %	152998571
8	NC_009665	ACATC	2	10	21123	21132	40 %	20 %	0 %	40 %	152998571
9	NC_009665	AGTTT	2	10	22424	22433	20 %	60 %	20 %	0 %	152998571
10	NC_009665	TGCAG	2	10	23860	23869	20 %	20 %	40 %	20 %	152998572
11	NC_009665	CTATT	2	10	26387	26396	20 %	60 %	0 %	20 %	152998574
12	NC_009665	CATGG	2	10	29367	29376	20 %	20 %	40 %	20 %	152998578
13	NC_009665	TTGTC	2	10	31494	31503	0 %	60 %	20 %	20 %	152998580
14	NC_009665	GCGCC	2	10	32047	32056	0 %	0 %	40 %	60 %	152998580
15	NC_009665	GCGAG	2	10	32752	32761	20 %	0 %	60 %	20 %	152998581
16	NC_009665	GTGAT	2	10	34823	34832	20 %	40 %	40 %	0 %	152998583
17	NC_009665	CTGGG	2	10	35512	35521	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009665	CGAAA	2	10	36100	36109	60 %	0 %	20 %	20 %	152998584
19	NC_009665	TTCGT	2	10	36772	36781	0 %	60 %	20 %	20 %	152998585
20	NC_009665	GGTCA	2	10	41843	41852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009665	ATTGA	2	10	41976	41985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009665	AGTCG	2	10	45382	45391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009665	AGGCT	2	10	45709	45718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009665	ATCCC	2	10	47412	47421	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009665	TCCGC	2	10	47598	47607	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009665	CTAGC	2	10	47696	47705	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009665	GATTG	2	10	51678	51687	20 %	40 %	40 %	0 %	152998597
28	NC_009665	GATAG	2	10	54326	54335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009665	AAGTT	2	10	54470	54479	40 %	40 %	20 %	0 %	152998600
30	NC_009665	TGTGA	2	10	55643	55652	20 %	40 %	40 %	0 %	152998601
31	NC_009665	AGAAA	2	10	55822	55831	80 %	0 %	20 %	0 %	152998601
32	NC_009665	AAAGG	2	10	55878	55887	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009665	ACCGC	2	10	57038	57047	20 %	0 %	20 %	60 %	152998602
34	NC_009665	TCTTT	2	10	57836	57845	0 %	80 %	0 %	20 %	152998603
35	NC_009665	AGTTA	2	10	60059	60068	40 %	40 %	20 %	0 %	152998604
36	NC_009665	CCAGC	2	10	60791	60800	20 %	0 %	20 %	60 %	152998604
37	NC_009665	TGGTG	2	10	61670	61679	0 %	40 %	60 %	0 %	152998605
38	NC_009665	GCGCA	2	10	62516	62525	20 %	0 %	40 %	40 %	152998606
39	NC_009665	TTGCA	2	10	63588	63597	20 %	40 %	20 %	20 %	152998607
40	NC_009665	CTTTA	2	10	65212	65221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009665	ACCTT	2	10	65995	66004	20 %	40 %	0 %	40 %	152998609
42	NC_009665	GGTAT	2	10	68725	68734	20 %	40 %	40 %	0 %	152998611
43	NC_009665	GGCTG	2	10	73513	73522	0 %	20 %	60 %	20 %	152998616
44	NC_009665	TTGAT	2	10	73778	73787	20 %	60 %	20 %	0 %	152998616
45	NC_009665	GATTT	2	10	73873	73882	20 %	60 %	20 %	0 %	152998616
46	NC_009665	ATGGT	2	10	75068	75077	20 %	40 %	40 %	0 %	152998617
47	NC_009665	GTTTG	2	10	75204	75213	0 %	60 %	40 %	0 %	152998617
48	NC_009665	AACCT	2	10	78579	78588	40 %	20 %	0 %	40 %	152998618
49	NC_009665	AAAGC	2	10	79935	79944	60 %	0 %	20 %	20 %	152998619
50	NC_009665	TTTCA	2	10	80273	80282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009665	AGCAA	2	10	80305	80314	60 %	0 %	20 %	20 %	152998620
52	NC_009665	ATTTA	2	10	83140	83149	40 %	60 %	0 %	0 %	152998621
53	NC_009665	GTGAG	2	10	83262	83271	20 %	20 %	60 %	0 %	152998621
54	NC_009665	TGAGT	2	10	89067	89076	20 %	40 %	40 %	0 %	152998623
55	NC_009665	CTTCA	2	10	90222	90231	20 %	40 %	0 %	40 %	152998624
56	NC_009665	CAGTT	2	10	90637	90646	20 %	40 %	20 %	20 %	152998625
57	NC_009665	TGCGC	2	10	93598	93607	0 %	20 %	40 %	40 %	152998628
58	NC_009665	TTGTT	2	10	94640	94649	0 %	80 %	20 %	0 %	152998629
59	NC_009665	CTGTG	2	10	96848	96857	0 %	40 %	40 %	20 %	152998630
60	NC_009665	GCCGA	2	10	97897	97906	20 %	0 %	40 %	40 %	152998631
61	NC_009665	TAAAT	2	10	99278	99287	60 %	40 %	0 %	0 %	152998631
62	NC_009665	CGAAT	2	10	104862	104871	40 %	20 %	20 %	20 %	152998639
63	NC_009665	GTTCT	2	10	105657	105666	0 %	60 %	20 %	20 %	152998640
64	NC_009665	TGGAA	2	10	106246	106255	40 %	20 %	40 %	0 %	152998641
65	NC_009665	AGTGC	2	10	107479	107488	20 %	20 %	40 %	20 %	152998642
66	NC_009665	TGGGT	2	10	109102	109111	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009665	CCATG	2	10	112293	112302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009665	ACGGG	2	10	113350	113359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009665	TTATT	2	10	115266	115275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009665	GCCAA	2	10	116414	116423	40 %	0 %	20 %	40 %	152998649
71	NC_009665	GGTTG	2	10	120942	120951	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009665	AAAAC	2	10	121023	121032	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009665	GTGAA	2	10	123211	123220	40 %	20 %	40 %	0 %	152998653
74	NC_009665	AAGCC	2	10	123505	123514	40 %	0 %	20 %	40 %	152998653
75	NC_009665	TGGTG	2	10	124957	124966	0 %	40 %	60 %	0 %	152998654
76	NC_009665	GATGT	2	10	125791	125800	20 %	40 %	40 %	0 %	152998655
77	NC_009665	TTACT	2	10	129892	129901	20 %	60 %	0 %	20 %	152998658
78	NC_009665	ATGAC	2	10	131663	131672	40 %	20 %	20 %	20 %	152998660
79	NC_009665	TTGCT	2	10	133321	133330	0 %	60 %	20 %	20 %	152998662
80	NC_009665	GCAAC	2	10	133670	133679	40 %	0 %	20 %	40 %	152998662
81	NC_009665	AGTGA	2	10	134604	134613	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009665	AGGTT	2	10	135761	135770	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009665	GCGAA	2	10	136408	136417	40 %	0 %	40 %	20 %	152998664
84	NC_009665	CCATG	2	10	137636	137645	20 %	20 %	20 %	40 %	152998666
85	NC_009665	TGGAT	2	10	137898	137907	20 %	40 %	40 %	0 %	152998666
86	NC_009665	CGAGC	2	10	139292	139301	20 %	0 %	40 %	40 %	152998668
87	NC_009665	TAATG	2	10	139720	139729	40 %	40 %	20 %	0 %	152998669
88	NC_009665	CCGCA	2	10	141802	141811	20 %	0 %	20 %	60 %	152998671
89	NC_009665	CTGTG	2	10	145070	145079	0 %	40 %	40 %	20 %	152998675
90	NC_009665	CTGAG	2	10	145282	145291	20 %	20 %	40 %	20 %	152998675
91	NC_009665	TTCAA	2	10	146025	146034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009665	GAAGT	2	10	146084	146093	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009665	CGCGA	2	10	150549	150558	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009665	CATCG	2	10	153377	153386	20 %	20 %	20 %	40 %	152998683
95	NC_009665	CGGCG	2	10	157107	157116	0 %	0 %	60 %	40 %	152998686
96	NC_009665	CACTC	2	10	159554	159563	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_009665	ATCTA	2	10	159687	159696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009665	CATTT	2	10	159776	159785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009665	TGTGA	2	10	159789	159798	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009665	TGCCG	2	10	160361	160370	0 %	20 %	40 %	40 %	152998687
101	NC_009665	TCACT	2	10	160744	160753	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009665	GTTGT	2	10	161997	162006	0 %	60 %	40 %	0 %	152998688
103	NC_009665	TGCAA	2	10	164230	164239	40 %	20 %	20 %	20 %	152998690
104	NC_009665	ATTGG	2	10	171802	171811	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009665	GTGCG	2	10	172017	172026	0 %	20 %	60 %	20 %	152998697
106	NC_009665	ATTTG	2	10	175309	175318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009665	ATTTT	2	10	175349	175358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009665	GCCGA	2	10	184729	184738	20 %	0 %	40 %	40 %	152998708
109	NC_009665	TGCGC	2	10	189665	189674	0 %	20 %	40 %	40 %	152998714
110	NC_009665	GCTTG	2	10	190763	190772	0 %	40 %	40 %	20 %	152998715
111	NC_009665	CTATG	2	10	192632	192641	20 %	40 %	20 %	20 %	152998716
112	NC_009665	AACTG	2	10	192909	192918	40 %	20 %	20 %	20 %	152998716
113	NC_009665	CTATG	2	10	193762	193771	20 %	40 %	20 %	20 %	152998717
114	NC_009665	TTTGT	2	10	193859	193868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009665	GCACC	2	10	196274	196283	20 %	0 %	20 %	60 %	152998719
116	NC_009665	ATTTA	2	10	198663	198672	40 %	60 %	0 %	0 %	152998719
117	NC_009665	CTTAT	2	10	206010	206019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009665	TTGTC	2	10	207341	207350	0 %	60 %	20 %	20 %	152998721
119	NC_009665	GCAGG	2	10	213716	213725	20 %	0 %	60 %	20 %	152998727
120	NC_009665	ATTGT	2	10	215460	215469	20 %	60 %	20 %	0 %	152998729
121	NC_009665	ATCGC	2	10	215985	215994	20 %	20 %	20 %	40 %	152998729
122	NC_009665	CAATG	2	10	216643	216652	40 %	20 %	20 %	20 %	152998730
123	NC_009665	AGTCG	2	10	221784	221793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009665	AGGCT	2	10	222111	222120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009665	ATCCC	2	10	223762	223771	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_009665	GCATG	2	10	224346	224355	20 %	20 %	40 %	20 %	152998732
127	NC_009665	TGAAT	2	10	226980	226989	40 %	40 %	20 %	0 %	152998734
128	NC_009665	CGTAC	2	10	228099	228108	20 %	20 %	20 %	40 %	152998735
129	NC_009665	AGCAA	2	10	236939	236948	60 %	0 %	20 %	20 %	152998743
130	NC_009665	CTGAT	2	10	236990	236999	20 %	40 %	20 %	20 %	152998743
131	NC_009665	TCTGT	2	10	237075	237084	0 %	60 %	20 %	20 %	152998743
132	NC_009665	GAAAA	2	10	241917	241926	80 %	0 %	20 %	0 %	152998745
133	NC_009665	GTTCT	2	10	242400	242409	0 %	60 %	20 %	20 %	152998746
134	NC_009665	ACTGA	2	10	243420	243429	40 %	20 %	20 %	20 %	152998746
135	NC_009665	CGTAC	2	10	244862	244871	20 %	20 %	20 %	40 %	152998747
136	NC_009665	TGGCG	2	10	247231	247240	0 %	20 %	60 %	20 %	152998750
137	NC_009665	AAGCC	2	10	252880	252889	40 %	0 %	20 %	40 %	152998763
138	NC_009665	GTTGA	2	10	254251	254260	20 %	40 %	40 %	0 %	152998766
139	NC_009665	TCGCG	2	10	254926	254935	0 %	20 %	40 %	40 %	152998768
140	NC_009665	ATGGC	2	10	257187	257196	20 %	20 %	40 %	20 %	152998772
141	NC_009665	ACGTG	2	10	258900	258909	20 %	20 %	40 %	20 %	152998774
142	NC_009665	AGTTG	2	10	259056	259065	20 %	40 %	40 %	0 %	152998774
143	NC_009665	AATGC	2	10	264141	264150	40 %	20 %	20 %	20 %	152998782
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145	NC_009665	AAGGT	2	10	268117	268126	40 %	20 %	40 %	0 %	152998785
146	NC_009665	TTGAT	2	10	269081	269090	20 %	60 %	20 %	0 %	152998787
147	NC_009665	AGTCG	2	10	273088	273097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009665	AGGCT	2	10	273415	273424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_009665	ATCCC	2	10	275061	275070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_009665	TCCGC	2	10	275247	275256	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_009665	TAATT	2	10	276516	276525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009665	TTTGA	2	10	279021	279030	20 %	60 %	20 %	0 %	152998792
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155	NC_009665	GCAGC	2	10	286700	286709	20 %	0 %	40 %	40 %	152998802
156	NC_009665	ATCGA	2	10	287239	287248	40 %	20 %	20 %	20 %	152998802
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158	NC_009665	GGTCG	2	10	291721	291730	0 %	20 %	60 %	20 %	152998805
159	NC_009665	ATTGA	2	10	293218	293227	40 %	40 %	20 %	0 %	152998806
160	NC_009665	AGGTG	2	10	293483	293492	20 %	20 %	60 %	0 %	152998806
161	NC_009665	AGATC	2	10	294164	294173	40 %	20 %	20 %	20 %	152998807
162	NC_009665	ATTCA	2	10	294495	294504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_009665	AGCTT	2	10	302219	302228	20 %	40 %	20 %	20 %	152998816
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169	NC_009665	TGGCT	2	10	304236	304245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_009665	TCGGT	2	10	305873	305882	0 %	40 %	40 %	20 %	152998819
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176	NC_009665	AAGTT	2	10	310917	310926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009665	CTTAT	2	10	310960	310969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_009665	GGGCA	2	10	311270	311279	20 %	0 %	60 %	20 %	152998824
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181	NC_009665	AATTG	2	10	323013	323022	40 %	40 %	20 %	0 %	152998835
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201	NC_009665	GTATT	2	10	343668	343677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_009665	AAGCC	2	10	410510	410519	40 %	0 %	20 %	40 %	152998916
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243	NC_009665	TTCAA	2	10	413093	413102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_009665	GAAGT	2	10	413152	413161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_009665	TTACC	2	10	433299	433308	20 %	40 %	0 %	40 %	152998938
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262	NC_009665	TCGCG	2	10	438855	438864	0 %	20 %	40 %	40 %	152998942
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264	NC_009665	ATCCC	2	10	439655	439664	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
265	NC_009665	ATCCA	2	10	439899	439908	40 %	20 %	0 %	40 %	152998943
266	NC_009665	GCTGC	2	10	446574	446583	0 %	20 %	40 %	40 %	152998949
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