MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 1925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009663	ATCAA	2	10	1154	1163	60 %	20 %	0 %	20 %	152991598
2	NC_009663	CCATG	2	10	1288	1297	20 %	20 %	20 %	40 %	152991598
3	NC_009663	TTCTC	2	10	1686	1695	0 %	60 %	0 %	40 %	152991599
4	NC_009663	TTCCT	2	10	3123	3132	0 %	60 %	0 %	40 %	152991600
5	NC_009663	GCGTG	2	10	3739	3748	0 %	20 %	60 %	20 %	152991600
6	NC_009663	TCGCT	2	10	4821	4830	0 %	40 %	20 %	40 %	152991601
7	NC_009663	ATAAA	2	10	5859	5868	80 %	20 %	0 %	0 %	152991601
8	NC_009663	TCTGT	2	10	9299	9308	0 %	60 %	20 %	20 %	152991606
9	NC_009663	TTTTA	2	10	9711	9720	20 %	80 %	0 %	0 %	152991607
10	NC_009663	TGAAT	2	10	11524	11533	40 %	40 %	20 %	0 %	152991608
11	NC_009663	AAGAG	2	10	11824	11833	60 %	0 %	40 %	0 %	152991608
12	NC_009663	GCATC	2	10	15025	15034	20 %	20 %	20 %	40 %	152991611
13	NC_009663	AGCCA	2	10	15954	15963	40 %	0 %	20 %	40 %	152991612
14	NC_009663	CTTTT	2	10	17277	17286	0 %	80 %	0 %	20 %	152991613
15	NC_009663	TTCTC	2	10	22681	22690	0 %	60 %	0 %	40 %	152991621
16	NC_009663	TGTGC	2	10	23074	23083	0 %	40 %	40 %	20 %	152991621
17	NC_009663	CTACA	2	10	23378	23387	40 %	20 %	0 %	40 %	152991622
18	NC_009663	GAAAA	2	10	23488	23497	80 %	0 %	20 %	0 %	152991622
19	NC_009663	GCAAA	2	10	24696	24705	60 %	0 %	20 %	20 %	152991623
20	NC_009663	CAAAG	2	10	32482	32491	60 %	0 %	20 %	20 %	152991630
21	NC_009663	CCAGG	2	10	32753	32762	20 %	0 %	40 %	40 %	152991630
22	NC_009663	GAGGT	2	10	35082	35091	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009663	CAAAT	2	10	35517	35526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009663	TCAAT	2	10	37142	37151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009663	TCGTG	2	10	38516	38525	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009663	TTAGT	2	10	41009	41018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009663	CCGTA	2	10	41209	41218	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009663	AGATG	2	10	43360	43369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009663	ATCTC	2	10	43509	43518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009663	GTTCA	2	10	44492	44501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009663	AGAGA	2	10	45147	45156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009663	GCTTT	2	10	45600	45609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009663	TGCCT	2	10	45650	45659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009663	TAAAG	2	10	51195	51204	60 %	20 %	20 %	0 %	152991642
35	NC_009663	CTGAA	2	10	53467	53476	40 %	20 %	20 %	20 %	152991645
36	NC_009663	TATGG	2	10	54653	54662	20 %	40 %	40 %	0 %	152991646
37	NC_009663	AAAAT	2	10	56549	56558	80 %	20 %	0 %	0 %	152991648
38	NC_009663	GAAGT	2	10	57694	57703	40 %	20 %	40 %	0 %	152991650
39	NC_009663	ATTTT	2	10	57905	57914	20 %	80 %	0 %	0 %	152991650
40	NC_009663	GATAA	2	10	59523	59532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009663	GTAAA	2	10	59670	59679	60 %	20 %	20 %	0 %	152991653
42	NC_009663	AAACT	2	10	60914	60923	60 %	20 %	0 %	20 %	152991654
43	NC_009663	TATTT	2	10	61606	61615	20 %	80 %	0 %	0 %	152991654
44	NC_009663	CAGTT	2	10	63042	63051	20 %	40 %	20 %	20 %	152991656
45	NC_009663	TTGCT	2	10	63224	63233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009663	TTTGT	2	10	64494	64503	0 %	80 %	20 %	0 %	152991658
47	NC_009663	TGTCA	2	10	66327	66336	20 %	40 %	20 %	20 %	152991660
48	NC_009663	CTCTG	2	10	67723	67732	0 %	40 %	20 %	40 %	152991661
49	NC_009663	TGGCA	2	10	68354	68363	20 %	20 %	40 %	20 %	152991662
50	NC_009663	CTGGC	2	10	68992	69001	0 %	20 %	40 %	40 %	152991663
51	NC_009663	GATGA	2	10	69534	69543	40 %	20 %	40 %	0 %	152991664
52	NC_009663	TGTTC	2	10	71015	71024	0 %	60 %	20 %	20 %	152991666
53	NC_009663	ACCGT	2	10	72005	72014	20 %	20 %	20 %	40 %	152991668
54	NC_009663	GAAAC	2	10	72291	72300	60 %	0 %	20 %	20 %	152991668
55	NC_009663	CAAAA	2	10	72701	72710	80 %	0 %	0 %	20 %	152991668
56	NC_009663	AAAAT	2	10	73159	73168	80 %	20 %	0 %	0 %	152991668
57	NC_009663	TCTAT	2	10	75844	75853	20 %	60 %	0 %	20 %	152991672
58	NC_009663	CAAGC	2	10	77910	77919	40 %	0 %	20 %	40 %	152991675
59	NC_009663	GGGGA	2	10	80730	80739	20 %	0 %	80 %	0 %	152991678
60	NC_009663	AGAGA	2	10	80883	80892	60 %	0 %	40 %	0 %	152991678
61	NC_009663	AAACC	2	10	82171	82180	60 %	0 %	0 %	40 %	152991679
62	NC_009663	AGCAG	2	10	83105	83114	40 %	0 %	40 %	20 %	152991681
63	NC_009663	GGCAG	2	10	84814	84823	20 %	0 %	60 %	20 %	152991683
64	NC_009663	TGAAG	2	10	84862	84871	40 %	20 %	40 %	0 %	152991683
65	NC_009663	CAGGG	2	10	85617	85626	20 %	0 %	60 %	20 %	152991684
66	NC_009663	ATGAG	2	10	88595	88604	40 %	20 %	40 %	0 %	152991685
67	NC_009663	TGTCA	2	10	91694	91703	20 %	40 %	20 %	20 %	152991688
68	NC_009663	AAATA	2	10	93024	93033	80 %	20 %	0 %	0 %	152991689
69	NC_009663	ACCTA	2	10	93044	93053	40 %	20 %	0 %	40 %	152991689
70	NC_009663	ATTTT	2	10	94896	94905	20 %	80 %	0 %	0 %	152991691
71	NC_009663	TGGGA	2	10	95673	95682	20 %	20 %	60 %	0 %	152991692
72	NC_009663	TTCTG	2	10	96183	96192	0 %	60 %	20 %	20 %	152991692
73	NC_009663	AAAAT	2	10	96555	96564	80 %	20 %	0 %	0 %	152991693
74	NC_009663	CTATA	2	10	99434	99443	40 %	40 %	0 %	20 %	152991695
75	NC_009663	TAAAA	2	10	99719	99728	80 %	20 %	0 %	0 %	152991696
76	NC_009663	TGTAC	2	10	102664	102673	20 %	40 %	20 %	20 %	152991699
77	NC_009663	TATTT	2	10	102922	102931	20 %	80 %	0 %	0 %	152991699
78	NC_009663	TCTTT	2	10	103267	103276	0 %	80 %	0 %	20 %	152991699
79	NC_009663	GATCA	2	10	103679	103688	40 %	20 %	20 %	20 %	152991699
80	NC_009663	GTATG	2	10	106185	106194	20 %	40 %	40 %	0 %	152991702
81	NC_009663	TTGAA	2	10	106940	106949	40 %	40 %	20 %	0 %	152991702
82	NC_009663	TGAAA	2	10	110117	110126	60 %	20 %	20 %	0 %	152991705
83	NC_009663	ACGAT	2	10	110495	110504	40 %	20 %	20 %	20 %	152991706
84	NC_009663	ACAAA	2	10	111180	111189	80 %	0 %	0 %	20 %	152991708
85	NC_009663	GCTGC	2	10	118020	118029	0 %	20 %	40 %	40 %	152991715
86	NC_009663	GGAAG	2	10	118900	118909	40 %	0 %	60 %	0 %	152991715
87	NC_009663	TACTG	2	10	129182	129191	20 %	40 %	20 %	20 %	152991727
88	NC_009663	GACCA	2	10	129483	129492	40 %	0 %	20 %	40 %	152991727
89	NC_009663	TCTCT	2	10	132398	132407	0 %	60 %	0 %	40 %	152991728
90	NC_009663	TGAAA	2	10	133977	133986	60 %	20 %	20 %	0 %	152991728
91	NC_009663	GCAGA	2	10	135565	135574	40 %	0 %	40 %	20 %	152991728
92	NC_009663	CACAC	2	10	136616	136625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_009663	ATTCA	2	10	136739	136748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009663	TAATA	2	10	139997	140006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009663	GCATG	2	10	141669	141678	20 %	20 %	40 %	20 %	152991736
96	NC_009663	GTTCT	2	10	142388	142397	0 %	60 %	20 %	20 %	152991736
97	NC_009663	CAGTG	2	10	143824	143833	20 %	20 %	40 %	20 %	152991737
98	NC_009663	TAAAA	2	10	145502	145511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009663	TGCTT	2	10	150827	150836	0 %	60 %	20 %	20 %	152991743
100	NC_009663	AAGAT	2	10	151845	151854	60 %	20 %	20 %	0 %	152991744
101	NC_009663	CTCTT	2	10	153642	153651	0 %	60 %	0 %	40 %	152991747
102	NC_009663	TTCGC	2	10	153804	153813	0 %	40 %	20 %	40 %	152991747
103	NC_009663	GGTGG	2	10	154718	154727	0 %	20 %	80 %	0 %	152991748
104	NC_009663	GCATT	2	10	158677	158686	20 %	40 %	20 %	20 %	152991753
105	NC_009663	TACGG	2	10	163429	163438	20 %	20 %	40 %	20 %	152991758
106	NC_009663	ATGCT	2	10	163975	163984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009663	AAAGA	2	10	164884	164893	80 %	0 %	20 %	0 %	152991760
108	NC_009663	GTCTT	2	10	166486	166495	0 %	60 %	20 %	20 %	152991762
109	NC_009663	ACTGA	2	10	167442	167451	40 %	20 %	20 %	20 %	152991762
110	NC_009663	CTCCG	2	10	168161	168170	0 %	20 %	20 %	60 %	152991762
111	NC_009663	TTCCT	2	10	168873	168882	0 %	60 %	0 %	40 %	152991763
112	NC_009663	AAAGA	2	10	170347	170356	80 %	0 %	20 %	0 %	152991764
113	NC_009663	TCTTT	2	10	172698	172707	0 %	80 %	0 %	20 %	152991766
114	NC_009663	TCGCC	2	10	172968	172977	0 %	20 %	20 %	60 %	152991766
115	NC_009663	TTCTC	2	10	174004	174013	0 %	60 %	0 %	40 %	152991767
116	NC_009663	ATTGG	2	10	175065	175074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009663	ACGGC	2	10	176384	176393	20 %	0 %	40 %	40 %	152991768
118	NC_009663	CAAAG	2	10	177492	177501	60 %	0 %	20 %	20 %	152991770
119	NC_009663	AAAGG	2	10	181502	181511	60 %	0 %	40 %	0 %	152991773
120	NC_009663	CTTTA	2	10	182956	182965	20 %	60 %	0 %	20 %	152991774
121	NC_009663	CGGAC	2	10	184830	184839	20 %	0 %	40 %	40 %	152991777
122	NC_009663	GTGAT	2	10	185735	185744	20 %	40 %	40 %	0 %	152991779
123	NC_009663	GGTAC	2	10	187937	187946	20 %	20 %	40 %	20 %	152991781
124	NC_009663	CGACA	2	10	188007	188016	40 %	0 %	20 %	40 %	152991781
125	NC_009663	AAAGG	2	10	189528	189537	60 %	0 %	40 %	0 %	152991782
126	NC_009663	CGCTG	2	10	191142	191151	0 %	20 %	40 %	40 %	152991783
127	NC_009663	ATCGA	2	10	191231	191240	40 %	20 %	20 %	20 %	152991783
128	NC_009663	GAAGA	2	10	191806	191815	60 %	0 %	40 %	0 %	152991783
129	NC_009663	GCACT	2	10	191926	191935	20 %	20 %	20 %	40 %	152991783
130	NC_009663	TTTGC	2	10	192400	192409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009663	AAAAG	2	10	192892	192901	80 %	0 %	20 %	0 %	152991785
132	NC_009663	CCTGT	2	10	196087	196096	0 %	40 %	20 %	40 %	152991788
133	NC_009663	CAATT	2	10	196464	196473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009663	TGAAC	2	10	197017	197026	40 %	20 %	20 %	20 %	152991789
135	NC_009663	CGGGG	2	10	198457	198466	0 %	0 %	80 %	20 %	152991789
136	NC_009663	TATGG	2	10	199860	199869	20 %	40 %	40 %	0 %	152991791
137	NC_009663	TACAG	2	10	200034	200043	40 %	20 %	20 %	20 %	152991791
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380	NC_009663	TGCTT	2	10	534246	534255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
381	NC_009663	TGGTC	2	10	535418	535427	0 %	40 %	40 %	20 %	152992122
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383	NC_009663	ATCAC	2	10	536072	536081	40 %	20 %	0 %	40 %	152992122
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385	NC_009663	ATAGA	2	10	536645	536654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_009663	ATGCA	2	10	541469	541478	40 %	20 %	20 %	20 %	152992128
389	NC_009663	GGATT	2	10	542371	542380	20 %	40 %	40 %	0 %	152992128
390	NC_009663	GGCCT	2	10	543057	543066	0 %	20 %	40 %	40 %	152992130
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393	NC_009663	GGTAT	2	10	547362	547371	20 %	40 %	40 %	0 %	152992133
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395	NC_009663	GGAGG	2	10	547748	547757	20 %	0 %	80 %	0 %	152992133
396	NC_009663	GGTTC	2	10	547972	547981	0 %	40 %	40 %	20 %	152992133
397	NC_009663	CGATT	2	10	548123	548132	20 %	40 %	20 %	20 %	152992133
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