MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 32034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009663	AAG	2	6	48	53	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009663	ACC	2	6	434	439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991598
3	NC_009663	CTG	3	9	665	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991598
4	NC_009663	GAC	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991598
5	NC_009663	CAG	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991598
6	NC_009663	AGG	2	6	714	719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991598
7	NC_009663	CAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991598
8	NC_009663	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152991598
9	NC_009663	CAT	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991598
10	NC_009663	GAT	2	6	1103	1108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991598
11	NC_009663	TAA	2	6	1412	1417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009663	AAC	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009663	ACT	3	9	1542	1550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009663	ATT	2	6	1561	1566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009663	ATC	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
16	NC_009663	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
17	NC_009663	ATC	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
18	NC_009663	ATC	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
19	NC_009663	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991599
20	NC_009663	ACA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991599
21	NC_009663	GAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991599
22	NC_009663	TAT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991599
23	NC_009663	ATC	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
24	NC_009663	CTT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991599
25	NC_009663	ATC	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
26	NC_009663	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991599
27	NC_009663	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991599
28	NC_009663	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
29	NC_009663	ATC	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991599
30	NC_009663	CAA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991600
31	NC_009663	GCA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
32	NC_009663	AAC	3	9	2930	2938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991600
33	NC_009663	TTG	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991600
34	NC_009663	GGT	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991600
35	NC_009663	CTT	2	6	3197	3202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991600
36	NC_009663	TGC	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991600
37	NC_009663	CAG	2	6	3319	3324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
38	NC_009663	GGA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991600
39	NC_009663	ATC	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991600
40	NC_009663	AGA	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991600
41	NC_009663	GCG	2	6	3683	3688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152991600
42	NC_009663	TGG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991600
43	NC_009663	CGA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991600
44	NC_009663	ATG	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991600
45	NC_009663	GAT	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991600
46	NC_009663	CAT	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
47	NC_009663	ACG	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
48	NC_009663	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
49	NC_009663	CGA	2	6	4519	4524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
50	NC_009663	ATT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991601
51	NC_009663	AGA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991601
52	NC_009663	TAT	2	6	4744	4749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152991601
53	NC_009663	GAA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991601
54	NC_009663	ATG	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
55	NC_009663	TGG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152991601
56	NC_009663	AGC	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991601
57	NC_009663	GCC	2	6	5063	5068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991601
58	NC_009663	GGA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991601
59	NC_009663	ATC	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
60	NC_009663	TTG	2	6	5280	5285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991601
61	NC_009663	ACC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991601
62	NC_009663	GAT	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
63	NC_009663	TCA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991601
64	NC_009663	AGG	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152991601
65	NC_009663	TGA	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991601
66	NC_009663	ACC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991602
67	NC_009663	CTG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991602
68	NC_009663	AGC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009663	CCG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
70	NC_009663	TCT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991603
71	NC_009663	ACC	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152991603
72	NC_009663	CCG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
73	NC_009663	CCT	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152991603
74	NC_009663	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991603
75	NC_009663	AGA	2	6	6846	6851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991603
76	NC_009663	CGC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991603
77	NC_009663	TCC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152991603
78	NC_009663	GTT	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991603
79	NC_009663	ATG	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
80	NC_009663	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991604
81	NC_009663	CGT	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991604
82	NC_009663	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
83	NC_009663	CGA	2	6	7651	7656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
84	NC_009663	CCG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991604
85	NC_009663	GAT	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
86	NC_009663	GAT	3	9	8099	8107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991604
87	NC_009663	TTC	3	9	8112	8120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991604
88	NC_009663	GTT	2	6	8162	8167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991604
89	NC_009663	CGA	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991604
90	NC_009663	TTG	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991604
91	NC_009663	AGG	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009663	AGG	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009663	ATA	2	6	8671	8676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009663	GCA	2	6	8708	8713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991605
95	NC_009663	GAT	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991605
96	NC_009663	TTG	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991605
97	NC_009663	GAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991605
98	NC_009663	ATG	2	6	9014	9019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991605
99	NC_009663	ATG	2	6	9026	9031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991605
100	NC_009663	TTC	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991605
101	NC_009663	TGA	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991605
102	NC_009663	TGA	2	6	9119	9124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991606
103	NC_009663	TCA	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991606
104	NC_009663	TCT	2	6	9203	9208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991606
105	NC_009663	CGC	2	6	9212	9217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152991606
106	NC_009663	ACG	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991606
107	NC_009663	GAT	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991606
108	NC_009663	GCA	2	6	9425	9430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152991606
109	NC_009663	TCG	2	6	9481	9486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991606
110	NC_009663	TGA	2	6	9532	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991606
111	NC_009663	TCC	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152991606
112	NC_009663	CTT	2	6	9644	9649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991606
113	NC_009663	TCT	2	6	9748	9753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991607
114	NC_009663	TCT	2	6	9784	9789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991607
115	NC_009663	ATA	2	6	9800	9805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152991607
116	NC_009663	GCT	2	6	9818	9823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991607
117	NC_009663	CTG	2	6	9962	9967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991607
118	NC_009663	TCG	2	6	9981	9986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991607
119	NC_009663	TCT	3	9	10030	10038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991607
120	NC_009663	CAT	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991607
121	NC_009663	TCT	2	6	10170	10175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991607
122	NC_009663	TGA	2	6	10287	10292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991607
123	NC_009663	CGG	2	6	10387	10392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152991607
124	NC_009663	TTC	2	6	10404	10409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991607
125	NC_009663	CAT	2	6	10450	10455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991607
126	NC_009663	TAG	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991607
127	NC_009663	CTG	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991607
128	NC_009663	GTT	2	6	10583	10588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991607
129	NC_009663	TGC	2	6	10591	10596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991607
130	NC_009663	AGA	2	6	10791	10796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991608
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255	NC_009663	ATG	2	6	21574	21579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009663	TAT	2	6	21584	21589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_009663	TCT	2	6	22278	22283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991620
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500	NC_009663	AGG	2	6	40653	40658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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