MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nitratiruptor sp. SB155-2

Total Repeats: 702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009662	ATCACT	2	12	3375	3386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152989756
2	NC_009662	CCGATG	2	12	4255	4266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152989756
3	NC_009662	GAAAGA	2	12	4826	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152989756
4	NC_009662	AAAATA	2	12	6613	6624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	152989758
5	NC_009662	CTTTTC	2	12	9568	9579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152989760
6	NC_009662	GTACGA	2	12	12492	12503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152989762
7	NC_009662	GGATGT	2	12	17664	17675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152989768
8	NC_009662	AAAAGC	2	12	19022	19033	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152989769
9	NC_009662	GCTGAA	2	12	21618	21629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152989772
10	NC_009662	GCTGCA	2	12	30663	30674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152989780
11	NC_009662	TTTTGC	2	12	32769	32780	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152989784
12	NC_009662	TTTGGA	2	12	32884	32895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989784
13	NC_009662	GTTGTC	2	12	33503	33514	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152989785
14	NC_009662	GAAGTG	2	12	35712	35723	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152989787
15	NC_009662	TCCAAA	2	12	36194	36205	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152989788
16	NC_009662	GCAAAA	2	12	40344	40355	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152989793
17	NC_009662	AAAGAG	2	12	40498	40509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152989793
18	NC_009662	TGGAGC	2	12	50202	50213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152989805
19	NC_009662	TGATCT	2	12	50649	50660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152989805
20	NC_009662	AGAAAT	2	12	53775	53786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152989807
21	NC_009662	CTGCAT	2	12	57384	57395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152989811
22	NC_009662	TCCCCT	2	12	60054	60065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152989814
23	NC_009662	AAATCG	2	12	70520	70531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152989826
24	NC_009662	ACACCA	2	12	75075	75086	50 %	0 %	0 %	50 %	152989829
25	NC_009662	TTGGCG	2	12	78629	78640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152989835
26	NC_009662	ATATCC	2	12	83428	83439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152989842
27	NC_009662	CATCCA	2	12	91201	91212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152989851
28	NC_009662	ATGTAT	2	12	92524	92535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152989852
29	NC_009662	AGTGGT	2	12	93089	93100	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152989853
30	NC_009662	TACGGT	2	12	93933	93944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989854
31	NC_009662	CGATAC	2	12	106205	106216	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152989867
32	NC_009662	TTTATG	2	12	112775	112786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152989873
33	NC_009662	AATCGA	2	12	120368	120379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152989880
34	NC_009662	TGCCCG	2	12	120475	120486	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152989880
35	NC_009662	GCAGAA	2	12	122780	122791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152989883
36	NC_009662	CACGAT	2	12	123682	123693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152989883
37	NC_009662	ACGGTT	2	12	123850	123861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989883
38	NC_009662	TATTGG	2	12	124436	124447	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989883
39	NC_009662	ATTTGG	2	12	124630	124641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989884
40	NC_009662	CGATTG	2	12	125979	125990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989885
41	NC_009662	AGATTT	2	12	127629	127640	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152989886
42	NC_009662	AAAGAG	2	12	128923	128934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152989886
43	NC_009662	ATTCAA	2	12	129000	129011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152989886
44	NC_009662	TATCGA	2	12	129066	129077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152989886
45	NC_009662	ATAAAG	2	12	129772	129783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152989886
46	NC_009662	AAATAT	2	12	132960	132971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152989891
47	NC_009662	GCGATT	2	12	133089	133100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989891
48	NC_009662	AATTGA	2	12	134781	134792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152989893
49	NC_009662	AAGTCC	2	12	135076	135087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152989893
50	NC_009662	GCAACA	2	12	135137	135148	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152989894
51	NC_009662	TTTCGA	2	12	136109	136120	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152989894
52	NC_009662	GATGTA	2	12	136832	136843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152989895
53	NC_009662	GGATGG	2	12	138305	138316	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	152989896
54	NC_009662	GAGTTT	2	12	138814	138825	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989898
55	NC_009662	TTTCTC	2	12	140186	140197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152989899
56	NC_009662	TGGCAT	2	12	140523	140534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989899
57	NC_009662	TATTTT	2	12	142023	142034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	152989900
58	NC_009662	AAAAGC	2	12	143999	144010	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152989902
59	NC_009662	AATTTG	2	12	145079	145090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152989904
60	NC_009662	ATACAG	2	12	146185	146196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152989905
61	NC_009662	AGAAAC	2	12	149588	149599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152989908
62	NC_009662	CAAAAA	2	12	153085	153096	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	152989912
63	NC_009662	ATCTTG	2	12	154352	154363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152989912
64	NC_009662	GAAAAG	2	12	155549	155560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152989914
65	NC_009662	GCAGAA	2	12	155611	155622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152989914
66	NC_009662	AAACGA	2	12	156056	156067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152989914
67	NC_009662	AAAGAA	2	12	156151	156162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152989914
68	NC_009662	CGATAT	2	12	160936	160947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152989918
69	NC_009662	TGGGGC	2	12	162289	162300	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	152989919
70	NC_009662	GGCAGT	2	12	163782	163793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152989921
71	NC_009662	CAAAAC	2	12	171056	171067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152989928
72	NC_009662	CCAAAT	2	12	171079	171090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152989928
73	NC_009662	TGGCAA	2	12	171248	171259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152989928
74	NC_009662	TGGTAT	2	12	172686	172697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989929
75	NC_009662	TACCTC	2	12	175936	175947	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152989931
76	NC_009662	GTAATG	2	12	176526	176537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152989932
77	NC_009662	AAATAG	2	12	176884	176895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152989932
78	NC_009662	GTTTTG	2	12	181553	181564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152989935
79	NC_009662	TGATAT	2	12	181948	181959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152989935
80	NC_009662	TTTTTC	2	12	182696	182707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152989936
81	NC_009662	ATCGGT	2	12	184542	184553	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152989936
82	NC_009662	CAGATT	2	12	188305	188316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152989938
83	NC_009662	GAGATA	2	12	189414	189425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152989939
84	NC_009662	GCAAGT	2	12	190420	190431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152989940
85	NC_009662	CTTTTT	2	12	191097	191108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152989940
86	NC_009662	TGCGAC	2	12	194717	194728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152989942
87	NC_009662	TGATAG	2	12	195058	195069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152989942
88	NC_009662	ATCGAT	2	12	203947	203958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152989947
89	NC_009662	TCGAAA	2	12	206670	206681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152989949
90	NC_009662	TTTTGC	2	12	207892	207903	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152989950
91	NC_009662	GAAAAA	2	12	211084	211095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152989954
92	NC_009662	CTTTCT	2	12	218366	218377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152989961
93	NC_009662	TTTGAT	2	12	222150	222161	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152989965
94	NC_009662	TTTCTC	2	12	223690	223701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152989966
95	NC_009662	TTTGAG	2	12	223702	223713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152989966
96	NC_009662	TTTGCT	2	12	224003	224014	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152989966
97	NC_009662	AAATTT	2	12	225383	225394	50 %	50 %	0 %	0 %	152989969
98	NC_009662	AAAAGA	2	12	233969	233980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152989988
99	NC_009662	AAGAGA	2	12	240079	240090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152989998
100	NC_009662	TATCGA	2	12	243759	243770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990005
101	NC_009662	AATCGA	2	12	245430	245441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152990007
102	NC_009662	TTCGAT	2	12	245666	245677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152990007
103	NC_009662	TGAAAT	2	12	249196	249207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152990009
104	NC_009662	AAGAGG	2	12	253499	253510	50 %	0 %	50 %	0 %	152990017
105	NC_009662	TAAAGA	2	12	256023	256034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152990017
106	NC_009662	AAAGAG	2	12	258722	258733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152990018
107	NC_009662	CTATCC	2	12	265913	265924	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152990022
108	NC_009662	CAAATA	2	12	266119	266130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152990022
109	NC_009662	GGTTTC	2	12	271310	271321	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152990027
110	NC_009662	ATCGAT	2	12	272713	272724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990028
111	NC_009662	CAGTTG	2	12	276363	276374	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152990034
112	NC_009662	CAAAAA	2	12	280323	280334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	152990038
113	NC_009662	AAGAGA	2	12	280679	280690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152990039
114	NC_009662	GCAGAG	2	12	284643	284654	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152990042
115	NC_009662	AGATTA	2	12	286985	286996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152990044
116	NC_009662	GCCAAA	2	12	287167	287178	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152990044
117	NC_009662	CGTTAC	2	12	287193	287204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152990044
118	NC_009662	TCTTTT	2	12	290307	290318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152990045
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228	NC_009662	ATGTAG	2	12	571936	571947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152990320
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231	NC_009662	GGAAGA	2	12	579496	579507	50 %	0 %	50 %	0 %	152990327
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233	NC_009662	AAGATA	2	12	582445	582456	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152990332
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341	NC_009662	GATCAT	2	12	876096	876107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990621
342	NC_009662	TTTTTG	2	12	880503	880514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	152990624
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344	NC_009662	AACTAC	2	12	889123	889134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152990633
345	NC_009662	GTAGGA	2	12	900468	900479	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152990642
346	NC_009662	GGTTTT	2	12	903450	903461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152990644
347	NC_009662	ATCTTT	2	12	904996	905007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152990646
348	NC_009662	TATCGA	2	12	908507	908518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990648
349	NC_009662	GCGATA	2	12	909466	909477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152990648
350	NC_009662	AGTTTT	2	12	911249	911260	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152990649
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356	NC_009662	GCAGTC	2	12	934784	934795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152990669
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359	NC_009662	GATGTG	2	12	946146	946157	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152990678
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363	NC_009662	TTCAAG	2	12	955050	955061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990686
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372	NC_009662	CAATGA	2	12	993598	993609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152990716
373	NC_009662	TTGAAC	2	12	994103	994114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990717
374	NC_009662	AGCATA	2	12	995152	995163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152990718
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381	NC_009662	ATGTCC	2	12	1034853	1034864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152990762
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440	NC_009662	TATCAA	2	12	1204442	1204453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152990931
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448	NC_009662	TCTTTT	2	12	1230372	1230383	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152990949
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450	NC_009662	ATCAAA	2	12	1234446	1234457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152990953
451	NC_009662	TTATTG	2	12	1235293	1235304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152990954
452	NC_009662	TCGTTA	2	12	1237055	1237066	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152990956
453	NC_009662	CTTCAA	2	12	1238805	1238816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152990958
454	NC_009662	AAGATA	2	12	1241739	1241750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152990962
455	NC_009662	ACTGCT	2	12	1244353	1244364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152990965
456	NC_009662	TCAAGT	2	12	1246707	1246718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152990968
457	NC_009662	GATCTC	2	12	1246862	1246873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152990968
458	NC_009662	TTCTAT	2	12	1249515	1249526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152990972
459	NC_009662	CAGCCA	2	12	1255689	1255700	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152990980
460	NC_009662	CCACAT	2	12	1256852	1256863	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152990981
461	NC_009662	ATAGCC	2	12	1257699	1257710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152990983
462	NC_009662	CAAGAG	2	12	1257912	1257923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152990983
463	NC_009662	ATGCCA	2	12	1258278	1258289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152990984
464	NC_009662	CATCTA	2	12	1266926	1266937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152990991
465	NC_009662	TAAAAG	2	12	1266986	1266997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152990991
466	NC_009662	ATTTTC	2	12	1269962	1269973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152990994
467	NC_009662	CAAAGA	2	12	1270210	1270221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152990994
468	NC_009662	GCATTG	2	12	1272660	1272671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152990996
469	NC_009662	ATATTA	2	12	1275604	1275615	50 %	50 %	0 %	0 %	152991000
470	NC_009662	TCTTTT	2	12	1279859	1279870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152991004
471	NC_009662	GCATTG	2	12	1281825	1281836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991005
472	NC_009662	TGCAAT	2	12	1282839	1282850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991006
473	NC_009662	GATGTG	2	12	1300319	1300330	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152991025
474	NC_009662	GACAAA	2	12	1300733	1300744	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991026
475	NC_009662	AAAAGA	2	12	1311936	1311947	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152991039
476	NC_009662	CAAATG	2	12	1312675	1312686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152991040
477	NC_009662	CCTCAT	2	12	1313652	1313663	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152991041
478	NC_009662	CGCTTC	2	12	1317201	1317212	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152991046
479	NC_009662	TCTTCC	2	12	1325447	1325458	0 %	50 %	0 %	50 %	152991056
480	NC_009662	ATCCAA	2	12	1325484	1325495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152991056
481	NC_009662	CCTTCA	2	12	1327091	1327102	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152991058
482	NC_009662	AAGTGG	2	12	1328599	1328610	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152991059
483	NC_009662	CCTTAC	2	12	1329922	1329933	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152991061
484	NC_009662	AAAATC	2	12	1335262	1335273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152991065
485	NC_009662	CTGCTT	2	12	1335422	1335433	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152991065
486	NC_009662	TTTCAT	2	12	1335465	1335476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152991065
487	NC_009662	CCATCT	2	12	1335868	1335879	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152991065
488	NC_009662	TTCTCC	2	12	1337208	1337219	0 %	50 %	0 %	50 %	152991068
489	NC_009662	TTCCAA	2	12	1343264	1343275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991076
490	NC_009662	TCAAAT	2	12	1344027	1344038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991076
491	NC_009662	GCCAAT	2	12	1345179	1345190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991078
492	NC_009662	TACCGA	2	12	1347973	1347984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991080
493	NC_009662	ACACCT	2	12	1351769	1351780	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152991083
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495	NC_009662	ATGAAG	2	12	1357348	1357359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991087
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497	NC_009662	AAGATC	2	12	1361018	1361029	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152991089
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499	NC_009662	AAAGAT	2	12	1362203	1362214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152991090
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