MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitratiruptor sp. SB155-2

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009662	GCCAT	2	10	1361	1370	20 %	20 %	20 %	40 %	152989754
2	NC_009662	TAACA	2	10	1592	1601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009662	GACAA	2	10	3254	3263	60 %	0 %	20 %	20 %	152989756
4	NC_009662	ACGAT	2	10	4478	4487	40 %	20 %	20 %	20 %	152989756
5	NC_009662	GTATG	2	10	5217	5226	20 %	40 %	40 %	0 %	152989757
6	NC_009662	TTTTC	2	10	6063	6072	0 %	80 %	0 %	20 %	152989757
7	NC_009662	TTTGC	2	10	6084	6093	0 %	60 %	20 %	20 %	152989757
8	NC_009662	TCGTT	2	10	6134	6143	0 %	60 %	20 %	20 %	152989757
9	NC_009662	ATTTC	2	10	8755	8764	20 %	60 %	0 %	20 %	152989760
10	NC_009662	AAAAT	2	10	10583	10592	80 %	20 %	0 %	0 %	152989760
11	NC_009662	GAAGA	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009662	TCGAT	2	10	11899	11908	20 %	40 %	20 %	20 %	152989761
13	NC_009662	AAAGC	2	10	13925	13934	60 %	0 %	20 %	20 %	152989763
14	NC_009662	TTGGA	2	10	14233	14242	20 %	40 %	40 %	0 %	152989763
15	NC_009662	TGAAA	2	10	14977	14986	60 %	20 %	20 %	0 %	152989765
16	NC_009662	AAAAT	2	10	15366	15375	80 %	20 %	0 %	0 %	152989765
17	NC_009662	AGTGA	2	10	21029	21038	40 %	20 %	40 %	0 %	152989771
18	NC_009662	AGGAA	2	10	21887	21896	60 %	0 %	40 %	0 %	152989772
19	NC_009662	GTATA	2	10	22886	22895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009662	TATTT	2	10	23512	23521	20 %	80 %	0 %	0 %	152989774
21	NC_009662	TGGGA	2	10	23765	23774	20 %	20 %	60 %	0 %	152989774
22	NC_009662	TTCAA	2	10	24629	24638	40 %	40 %	0 %	20 %	152989775
23	NC_009662	TTCTC	2	10	25252	25261	0 %	60 %	0 %	40 %	152989775
24	NC_009662	AAGCA	2	10	25641	25650	60 %	0 %	20 %	20 %	152989776
25	NC_009662	GGCTC	2	10	26861	26870	0 %	20 %	40 %	40 %	152989777
26	NC_009662	GTATC	2	10	27277	27286	20 %	40 %	20 %	20 %	152989778
27	NC_009662	GAGTG	2	10	27898	27907	20 %	20 %	60 %	0 %	152989778
28	NC_009662	GGAAT	2	10	27988	27997	40 %	20 %	40 %	0 %	152989778
29	NC_009662	TAAAA	2	10	28047	28056	80 %	20 %	0 %	0 %	152989778
30	NC_009662	GCTTG	2	10	31432	31441	0 %	40 %	40 %	20 %	152989782
31	NC_009662	TAGCA	2	10	31932	31941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009662	ATTAA	2	10	33258	33267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009662	CTGTC	2	10	33613	33622	0 %	40 %	20 %	40 %	152989785
34	NC_009662	TGTAC	2	10	34359	34368	20 %	40 %	20 %	20 %	152989785
35	NC_009662	TTTCA	2	10	35593	35602	20 %	60 %	0 %	20 %	152989787
36	NC_009662	GATCA	2	10	37056	37065	40 %	20 %	20 %	20 %	152989790
37	NC_009662	TTTCT	2	10	40612	40621	0 %	80 %	0 %	20 %	152989793
38	NC_009662	ACTCC	2	10	44187	44196	20 %	20 %	0 %	60 %	152989798
39	NC_009662	TGAGC	2	10	46284	46293	20 %	20 %	40 %	20 %	152989800
40	NC_009662	CATTG	2	10	47472	47481	20 %	40 %	20 %	20 %	152989801
41	NC_009662	CAAAA	2	10	47597	47606	80 %	0 %	0 %	20 %	152989801
42	NC_009662	AGTAT	2	10	49852	49861	40 %	40 %	20 %	0 %	152989805
43	NC_009662	AATCG	2	10	50545	50554	40 %	20 %	20 %	20 %	152989805
44	NC_009662	AAGAC	2	10	52255	52264	60 %	0 %	20 %	20 %	152989806
45	NC_009662	AACGA	2	10	53381	53390	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009662	CAAGC	2	10	53747	53756	40 %	0 %	20 %	40 %	152989807
47	NC_009662	CGATC	2	10	54197	54206	20 %	20 %	20 %	40 %	152989807
48	NC_009662	ATATT	2	10	57135	57144	40 %	60 %	0 %	0 %	152989810
49	NC_009662	TGAAA	2	10	57357	57366	60 %	20 %	20 %	0 %	152989811
50	NC_009662	ATATG	2	10	58307	58316	40 %	40 %	20 %	0 %	152989812
51	NC_009662	GCATC	2	10	58547	58556	20 %	20 %	20 %	40 %	152989812
52	NC_009662	CAAGC	2	10	60732	60741	40 %	0 %	20 %	40 %	152989814
53	NC_009662	CACCC	2	10	67077	67086	20 %	0 %	0 %	80 %	152989821
54	NC_009662	GAAAA	2	10	69182	69191	80 %	0 %	20 %	0 %	152989825
55	NC_009662	GATGT	2	10	70432	70441	20 %	40 %	40 %	0 %	152989826
56	NC_009662	ATCAG	2	10	71332	71341	40 %	20 %	20 %	20 %	152989827
57	NC_009662	CAAAA	2	10	73418	73427	80 %	0 %	0 %	20 %	152989828
58	NC_009662	TTTGG	2	10	73706	73715	0 %	60 %	40 %	0 %	152989828
59	NC_009662	GGTTT	2	10	77018	77027	0 %	60 %	40 %	0 %	152989831
60	NC_009662	GATCA	2	10	77202	77211	40 %	20 %	20 %	20 %	152989832
61	NC_009662	TAAAA	2	10	77248	77257	80 %	20 %	0 %	0 %	152989832
62	NC_009662	TGGAT	2	10	78770	78779	20 %	40 %	40 %	0 %	152989835
63	NC_009662	TTAGC	2	10	82660	82669	20 %	40 %	20 %	20 %	152989842
64	NC_009662	GTGAT	2	10	83804	83813	20 %	40 %	40 %	0 %	152989843
65	NC_009662	TCTGT	2	10	85391	85400	0 %	60 %	20 %	20 %	152989845
66	NC_009662	AACAA	2	10	85565	85574	80 %	0 %	0 %	20 %	152989845
67	NC_009662	GAAGA	2	10	86014	86023	60 %	0 %	40 %	0 %	152989847
68	NC_009662	TGGAT	2	10	86732	86741	20 %	40 %	40 %	0 %	152989847
69	NC_009662	TTTTG	2	10	87783	87792	0 %	80 %	20 %	0 %	152989847
70	NC_009662	ATTGT	2	10	88465	88474	20 %	60 %	20 %	0 %	152989848
71	NC_009662	TGATT	2	10	92313	92322	20 %	60 %	20 %	0 %	152989852
72	NC_009662	GATAT	2	10	92590	92599	40 %	40 %	20 %	0 %	152989852
73	NC_009662	AAAAG	2	10	92946	92955	80 %	0 %	20 %	0 %	152989853
74	NC_009662	GTTCT	2	10	96073	96082	0 %	60 %	20 %	20 %	152989857
75	NC_009662	TGCGA	2	10	96497	96506	20 %	20 %	40 %	20 %	152989858
76	NC_009662	TGGCG	2	10	98717	98726	0 %	20 %	60 %	20 %	152989860
77	NC_009662	TATAA	2	10	99933	99942	60 %	40 %	0 %	0 %	152989860
78	NC_009662	GTATT	2	10	104612	104621	20 %	60 %	20 %	0 %	152989866
79	NC_009662	ATCTC	2	10	108378	108387	20 %	40 %	0 %	40 %	152989869
80	NC_009662	ATATT	2	10	109074	109083	40 %	60 %	0 %	0 %	152989870
81	NC_009662	GAAGA	2	10	109528	109537	60 %	0 %	40 %	0 %	152989870
82	NC_009662	CGAAA	2	10	110048	110057	60 %	0 %	20 %	20 %	152989870
83	NC_009662	GGATT	2	10	111126	111135	20 %	40 %	40 %	0 %	152989871
84	NC_009662	TGTTT	2	10	111340	111349	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009662	ATATC	2	10	112141	112150	40 %	40 %	0 %	20 %	152989873
86	NC_009662	TATCT	2	10	113571	113580	20 %	60 %	0 %	20 %	152989874
87	NC_009662	TTTAC	2	10	114031	114040	20 %	60 %	0 %	20 %	152989874
88	NC_009662	GATTT	2	10	114609	114618	20 %	60 %	20 %	0 %	152989875
89	NC_009662	ACTCG	2	10	115017	115026	20 %	20 %	20 %	40 %	152989875
90	NC_009662	ATCTC	2	10	115231	115240	20 %	40 %	0 %	40 %	152989876
91	NC_009662	TTCTT	2	10	119126	119135	0 %	80 %	0 %	20 %	152989878
92	NC_009662	GCAAA	2	10	120065	120074	60 %	0 %	20 %	20 %	152989880
93	NC_009662	CGTTT	2	10	120333	120342	0 %	60 %	20 %	20 %	152989880
94	NC_009662	ATCGA	2	10	125497	125506	40 %	20 %	20 %	20 %	152989885
95	NC_009662	GGATC	2	10	126265	126274	20 %	20 %	40 %	20 %	152989885
96	NC_009662	CCAGT	2	10	127141	127150	20 %	20 %	20 %	40 %	152989886
97	NC_009662	GAAAA	2	10	131135	131144	80 %	0 %	20 %	0 %	152989887
98	NC_009662	GAATG	2	10	133001	133010	40 %	20 %	40 %	0 %	152989891
99	NC_009662	AAAAC	2	10	133529	133538	80 %	0 %	0 %	20 %	152989892
100	NC_009662	CGTTA	2	10	134152	134161	20 %	40 %	20 %	20 %	152989892
101	NC_009662	TGCAA	2	10	134551	134560	40 %	20 %	20 %	20 %	152989893
102	NC_009662	CGAAA	2	10	135475	135484	60 %	0 %	20 %	20 %	152989894
103	NC_009662	GAAGA	2	10	137045	137054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009662	TTTTA	2	10	137995	138004	20 %	80 %	0 %	0 %	152989896
105	NC_009662	GAATC	2	10	139565	139574	40 %	20 %	20 %	20 %	152989898
106	NC_009662	AACAA	2	10	140820	140829	80 %	0 %	0 %	20 %	152989899
107	NC_009662	CATTA	2	10	140980	140989	40 %	40 %	0 %	20 %	152989899
108	NC_009662	GAAAG	2	10	141439	141448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009662	TATTT	2	10	142346	142355	20 %	80 %	0 %	0 %	152989900
110	NC_009662	AAAAC	2	10	144794	144803	80 %	0 %	0 %	20 %	152989903
111	NC_009662	GCTTT	2	10	145146	145155	0 %	60 %	20 %	20 %	152989904
112	NC_009662	CAGAA	2	10	145242	145251	60 %	0 %	20 %	20 %	152989904
113	NC_009662	AAACC	2	10	146862	146871	60 %	0 %	0 %	40 %	152989906
114	NC_009662	AAAGA	2	10	148796	148805	80 %	0 %	20 %	0 %	152989907
115	NC_009662	TGTTT	2	10	152345	152354	0 %	80 %	20 %	0 %	152989911
116	NC_009662	AGTGG	2	10	152773	152782	20 %	20 %	60 %	0 %	152989912
117	NC_009662	ACTCT	2	10	153335	153344	20 %	40 %	0 %	40 %	152989912
118	NC_009662	CGGGA	2	10	154464	154473	20 %	0 %	60 %	20 %	152989912
119	NC_009662	ATTGG	2	10	157442	157451	20 %	40 %	40 %	0 %	152989916
120	NC_009662	GCATT	2	10	158100	158109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009662	CAAAA	2	10	158329	158338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009662	TCAGT	2	10	163730	163739	20 %	40 %	20 %	20 %	152989921
123	NC_009662	TTTTG	2	10	163921	163930	0 %	80 %	20 %	0 %	152989921
124	NC_009662	TACCA	2	10	164287	164296	40 %	20 %	0 %	40 %	152989921
125	NC_009662	TTTGT	2	10	165455	165464	0 %	80 %	20 %	0 %	152989922
126	NC_009662	CGATC	2	10	166526	166535	20 %	20 %	20 %	40 %	152989923
127	NC_009662	GAAAA	2	10	167847	167856	80 %	0 %	20 %	0 %	152989924
128	NC_009662	TTCCA	2	10	168275	168284	20 %	40 %	0 %	40 %	152989925
129	NC_009662	AGAGT	2	10	168540	168549	40 %	20 %	40 %	0 %	152989926
130	NC_009662	TCTCT	2	10	172417	172426	0 %	60 %	0 %	40 %	152989929
131	NC_009662	GTGCC	2	10	172878	172887	0 %	20 %	40 %	40 %	152989929
132	NC_009662	TGGAG	2	10	172934	172943	20 %	20 %	60 %	0 %	152989929
133	NC_009662	AATAA	2	10	175047	175056	80 %	20 %	0 %	0 %	152989930
134	NC_009662	AGCGC	2	10	175281	175290	20 %	0 %	40 %	40 %	152989931
135	NC_009662	AAATC	2	10	175619	175628	60 %	20 %	0 %	20 %	152989931
136	NC_009662	TCTGT	2	10	176037	176046	0 %	60 %	20 %	20 %	152989932
137	NC_009662	TGAGG	2	10	182157	182166	20 %	20 %	60 %	0 %	152989935
138	NC_009662	TGTTT	2	10	182794	182803	0 %	80 %	20 %	0 %	152989936
139	NC_009662	ACTGA	2	10	182834	182843	40 %	20 %	20 %	20 %	152989936
140	NC_009662	GCTTT	2	10	183551	183560	0 %	60 %	20 %	20 %	152989936
141	NC_009662	TGTAG	2	10	183715	183724	20 %	40 %	40 %	0 %	152989936
142	NC_009662	CTTTT	2	10	184923	184932	0 %	80 %	0 %	20 %	152989937
143	NC_009662	TGGAA	2	10	185697	185706	40 %	20 %	40 %	0 %	152989937
144	NC_009662	CATCA	2	10	189150	189159	40 %	20 %	0 %	40 %	152989939
145	NC_009662	AATCG	2	10	189543	189552	40 %	20 %	20 %	20 %	152989939
146	NC_009662	GGCAA	2	10	190036	190045	40 %	0 %	40 %	20 %	152989939
147	NC_009662	CCAAA	2	10	192337	192346	60 %	0 %	0 %	40 %	152989942
148	NC_009662	AATAT	2	10	198379	198388	60 %	40 %	0 %	0 %	152989944
149	NC_009662	ATGAG	2	10	198517	198526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009662	TATCA	2	10	198529	198538	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_009662	GGGAT	2	10	199967	199976	20 %	20 %	60 %	0 %	152989945
152	NC_009662	AGATA	2	10	200435	200444	60 %	20 %	20 %	0 %	152989945
153	NC_009662	TACGC	2	10	201066	201075	20 %	20 %	20 %	40 %	152989945
154	NC_009662	TTTTC	2	10	204135	204144	0 %	80 %	0 %	20 %	152989947
155	NC_009662	AGCAT	2	10	204802	204811	40 %	20 %	20 %	20 %	152989948
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157	NC_009662	TGTAG	2	10	206746	206755	20 %	40 %	40 %	0 %	152989949
158	NC_009662	CTTTG	2	10	207208	207217	0 %	60 %	20 %	20 %	152989949
159	NC_009662	ATTCA	2	10	208735	208744	40 %	40 %	0 %	20 %	152989950
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168	NC_009662	GCCTG	2	10	223794	223803	0 %	20 %	40 %	40 %	152989966
169	NC_009662	GCTTT	2	10	224115	224124	0 %	60 %	20 %	20 %	152989966
170	NC_009662	TAAAT	2	10	225199	225208	60 %	40 %	0 %	0 %	152989969
171	NC_009662	ATTTG	2	10	225214	225223	20 %	60 %	20 %	0 %	152989969
172	NC_009662	ATTTC	2	10	225689	225698	20 %	60 %	0 %	20 %	152989970
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176	NC_009662	CAAAA	2	10	231051	231060	80 %	0 %	0 %	20 %	152989979
177	NC_009662	GTGAT	2	10	231634	231643	20 %	40 %	40 %	0 %	152989982
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188	NC_009662	GAAGT	2	10	246419	246428	40 %	20 %	40 %	0 %	152990007
189	NC_009662	TTAAT	2	10	248431	248440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_009662	TCATA	2	10	249980	249989	40 %	40 %	0 %	20 %	152990011
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199	NC_009662	TCAGA	2	10	259312	259321	40 %	20 %	20 %	20 %	152990018
200	NC_009662	CTTAC	2	10	260242	260251	20 %	40 %	0 %	40 %	152990018
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205	NC_009662	ATTTT	2	10	265277	265286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_009662	TTATC	2	10	279675	279684	20 %	60 %	0 %	20 %	152990037
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240	NC_009662	ATGGA	2	10	306045	306054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
241	NC_009662	TTTGG	2	10	307445	307454	0 %	60 %	40 %	0 %	152990060
242	NC_009662	TATTT	2	10	307675	307684	20 %	80 %	0 %	0 %	152990060
243	NC_009662	TGCAA	2	10	309033	309042	40 %	20 %	20 %	20 %	152990062
244	NC_009662	TTACA	2	10	309732	309741	40 %	40 %	0 %	20 %	152990062
245	NC_009662	AATAC	2	10	309805	309814	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
246	NC_009662	TCAAA	2	10	313377	313386	60 %	20 %	0 %	20 %	152990067
247	NC_009662	ACGGT	2	10	315279	315288	20 %	20 %	40 %	20 %	152990070
248	NC_009662	CGAAA	2	10	316122	316131	60 %	0 %	20 %	20 %	152990071
249	NC_009662	TTCGT	2	10	316844	316853	0 %	60 %	20 %	20 %	152990072
250	NC_009662	GCCAA	2	10	319751	319760	40 %	0 %	20 %	40 %	152990075
251	NC_009662	TAAAA	2	10	319877	319886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009662	ATCTC	2	10	324668	324677	20 %	40 %	0 %	40 %	152990079
253	NC_009662	TCGTT	2	10	324776	324785	0 %	60 %	20 %	20 %	152990079
254	NC_009662	TCTTG	2	10	325013	325022	0 %	60 %	20 %	20 %	152990079
255	NC_009662	AAAAT	2	10	325878	325887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_009662	TAATG	2	10	326246	326255	40 %	40 %	20 %	0 %	152990082
257	NC_009662	TCAAA	2	10	326924	326933	60 %	20 %	0 %	20 %	152990084
258	NC_009662	TATCT	2	10	328212	328221	20 %	60 %	0 %	20 %	152990085
259	NC_009662	TTTTG	2	10	332469	332478	0 %	80 %	20 %	0 %	152990088
260	NC_009662	AATTT	2	10	345234	345243	40 %	60 %	0 %	0 %	152990103
261	NC_009662	GTATC	2	10	348000	348009	20 %	40 %	20 %	20 %	152990108
262	NC_009662	AGCAA	2	10	349697	349706	60 %	0 %	20 %	20 %	152990110
263	NC_009662	GATGC	2	10	349957	349966	20 %	20 %	40 %	20 %	152990110
264	NC_009662	ACGAT	2	10	350758	350767	40 %	20 %	20 %	20 %	152990111
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266	NC_009662	CAAAG	2	10	355417	355426	60 %	0 %	20 %	20 %	152990114
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389	NC_009662	TGTAT	2	10	511491	511500	20 %	60 %	20 %	0 %	152990267
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392	NC_009662	GATAT	2	10	517243	517252	40 %	40 %	20 %	0 %	152990272
393	NC_009662	AAATC	2	10	520865	520874	60 %	20 %	0 %	20 %	152990275
394	NC_009662	TTTGT	2	10	524039	524048	0 %	80 %	20 %	0 %	152990277
395	NC_009662	AAGAA	3	15	524827	524841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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