MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitratiruptor sp. SB155-2

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009662	TAACA	2	10	1592	1601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009662	GAAGA	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009662	GTATA	2	10	22886	22895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009662	TAGCA	2	10	31932	31941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009662	ATTAA	2	10	33258	33267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009662	AACGA	2	10	53381	53390	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009662	TGTTT	2	10	111340	111349	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009662	GAAGA	2	10	137045	137054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009662	GAAAG	2	10	141439	141448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009662	GCATT	2	10	158100	158109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009662	CAAAA	2	10	158329	158338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009662	ATGAG	2	10	198517	198526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009662	TATCA	2	10	198529	198538	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009662	TTAAT	2	10	248431	248440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009662	CCTGC	2	10	249942	249951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009662	ATTTT	2	10	265277	265286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009662	CTTTT	2	10	279366	279375	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009662	ATGGA	2	10	306045	306054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009662	AATAC	2	10	309805	309814	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009662	TAAAA	2	10	319877	319886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009662	AAAAT	2	10	325878	325887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009662	TTACA	2	10	359385	359394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009662	AATAA	2	10	369729	369738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009662	AAAAT	2	10	375142	375151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009662	ATGGG	2	10	389215	389224	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009662	TCGTG	2	10	390043	390052	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009662	TACGC	2	10	390811	390820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009662	TTAAG	2	10	390987	390996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009662	CCGTA	2	10	392719	392728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009662	ACGGA	2	10	393852	393861	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009662	AAGCT	2	10	394188	394197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009662	ATTTT	2	10	394437	394446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009662	TGAAG	2	10	425031	425040	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009662	ATTCT	2	10	473954	473963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009662	TAAAC	2	10	499430	499439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009662	AATAT	2	10	499486	499495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009662	CATGA	2	10	504071	504080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009662	AAGAA	3	15	524827	524841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009662	TTAAT	2	10	531434	531443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009662	TGCAG	2	10	544544	544553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009662	TTATA	2	10	545074	545083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009662	GGATA	2	10	577826	577835	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009662	TCATT	2	10	597049	597058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009662	ATGGG	2	10	654766	654775	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009662	TCGTG	2	10	655594	655603	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009662	TACGC	2	10	656363	656372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009662	CCGTA	2	10	658273	658282	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009662	ACGGA	2	10	659407	659416	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009662	AAGCT	2	10	659743	659752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009662	TGATA	2	10	717978	717987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009662	TTTAT	2	10	726927	726936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009662	TAAAT	2	10	749892	749901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009662	AAGAA	2	10	750558	750567	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009662	TTACT	2	10	750804	750813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009662	ATGGT	2	10	752987	752996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009662	GAAAA	2	10	754227	754236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009662	TACCA	2	10	790675	790684	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_009662	CATTG	2	10	807249	807258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009662	ACTAA	2	10	829911	829920	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009662	AACAA	2	10	850443	850452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009662	CTTTA	2	10	851615	851624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009662	TACAA	2	10	852020	852029	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009662	TGTTT	2	10	905990	905999	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009662	GTAGA	2	10	907015	907024	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009662	TACGC	2	10	907027	907036	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009662	CGATA	2	10	907245	907254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009662	GATTC	2	10	915331	915340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009662	CGTTA	2	10	959480	959489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009662	AAATC	2	10	967164	967173	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009662	ATATA	2	10	967247	967256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009662	TTTTA	2	10	1030471	1030480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009662	TCTCT	2	10	1036527	1036536	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009662	CAATA	2	10	1048689	1048698	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009662	TATAT	2	10	1113038	1113047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009662	AGTGT	2	10	1144329	1144338	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009662	AAAGA	2	10	1190411	1190420	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009662	TGTAT	2	10	1206729	1206738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009662	AACTA	2	10	1231093	1231102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009662	CGAAG	2	10	1301775	1301784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009662	CATTT	2	10	1305975	1305984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009662	GATTT	2	10	1318985	1318994	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009662	AAATA	2	10	1321102	1321111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009662	AGATT	2	10	1321775	1321784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009662	TCGCT	2	10	1334152	1334161	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009662	TTGTT	2	10	1338196	1338205	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009662	TTTTC	2	10	1399956	1399965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009662	TTCAA	2	10	1403758	1403767	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009662	TCATT	2	10	1408545	1408554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009662	TTCAA	2	10	1408684	1408693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009662	GAATT	2	10	1409375	1409384	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009662	GAAAA	2	10	1450141	1450150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009662	ATTTA	2	10	1462217	1462226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009662	GTTTG	2	10	1474997	1475006	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009662	GTTTG	2	10	1512303	1512312	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009662	TTTGT	2	10	1536559	1536568	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009662	TTGTT	2	10	1556378	1556387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009662	TTATC	2	10	1570454	1570463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009662	GGGGA	2	10	1576464	1576473	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009662	CAAAG	2	10	1586244	1586253	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009662	ACTCA	2	10	1586341	1586350	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009662	GAGAT	2	10	1605136	1605145	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009662	CCAAT	2	10	1605982	1605991	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009662	TGATT	2	10	1687920	1687929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009662	CTTCA	2	10	1698597	1698606	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009662	TAATA	2	10	1706660	1706669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009662	TTTTC	2	10	1721860	1721869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009662	CACTT	2	10	1758414	1758423	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009662	ACTAT	2	10	1766515	1766524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009662	TCCCC	2	10	1826797	1826806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_009662	CATAA	2	10	1829666	1829675	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009662	TTTTG	2	10	1837996	1838005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009662	TATTG	2	10	1856183	1856192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009662	AGCTT	2	10	1856291	1856300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009662	TCCGT	2	10	1856627	1856636	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009662	TACGG	2	10	1857761	1857770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009662	AGCGT	2	10	1859670	1859679	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009662	CACGA	2	10	1860440	1860449	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009662	CCCAT	2	10	1861268	1861277	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_009662	TGCTT	2	10	1865924	1865933	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009662	TGCTT	2	10	1866088	1866097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.