MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	ACAGGA	2	12	538	549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152998485
2	NC_009661	GCAGAT	2	12	607	618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152998485
3	NC_009661	GATTGA	2	12	4067	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998488
4	NC_009661	TCACTA	2	12	5179	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998489
5	NC_009661	TTTTAG	2	12	5635	5646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152998490
6	NC_009661	ATTACT	2	12	9155	9166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152998493
7	NC_009661	GTTTGT	2	12	13937	13948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998499
8	NC_009661	TAATGA	2	12	31655	31666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152998512
9	NC_009661	AACGTG	2	12	33521	33532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152998514
10	NC_009661	TAGCGT	2	12	40464	40475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152998524
11	NC_009661	TACCCG	2	12	44351	44362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152998526
12	NC_009661	TTTTGA	2	12	44440	44451	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152998526
13	NC_009661	ATAGAA	2	12	48763	48774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152998527
14	NC_009661	GATCGT	2	12	53791	53802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152998530
15	NC_009661	ATAGGT	2	12	55137	55148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998531
16	NC_009661	GGCTTG	2	12	58497	58508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152998534
17	NC_009661	GATAGC	2	12	59699	59710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152998536
18	NC_009661	GCTAAT	2	12	72601	72612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152998548
19	NC_009661	GAATGG	2	12	74589	74600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152998550
20	NC_009661	TTATTG	2	12	74902	74913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152998550
21	NC_009661	TATCAA	2	12	77426	77437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152998551
22	NC_009661	TAATGG	2	12	78096	78107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998552
23	NC_009661	GAAGGC	2	12	80486	80497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152998553
24	NC_009661	GATTTG	2	12	81909	81920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152998553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.