MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	TGAAA	2	10	1164	1173	60 %	20 %	20 %	0 %	152998485
2	NC_009661	GAATC	2	10	1359	1368	40 %	20 %	20 %	20 %	152998485
3	NC_009661	AATTG	2	10	5610	5619	40 %	40 %	20 %	0 %	152998490
4	NC_009661	GTGAC	2	10	8107	8116	20 %	20 %	40 %	20 %	152998492
5	NC_009661	AAAGC	2	10	10867	10876	60 %	0 %	20 %	20 %	152998494
6	NC_009661	AAGCA	2	10	11051	11060	60 %	0 %	20 %	20 %	152998494
7	NC_009661	TCGAC	2	10	13120	13129	20 %	20 %	20 %	40 %	152998498
8	NC_009661	GGTCT	2	10	15226	15235	0 %	40 %	40 %	20 %	152998500
9	NC_009661	ACGTC	2	10	15623	15632	20 %	20 %	20 %	40 %	152998500
10	NC_009661	CCACA	2	10	15634	15643	40 %	0 %	0 %	60 %	152998500
11	NC_009661	CTTCA	2	10	15870	15879	20 %	40 %	0 %	40 %	152998500
12	NC_009661	TTTTC	2	10	15910	15919	0 %	80 %	0 %	20 %	152998500
13	NC_009661	GTCAC	2	10	16726	16735	20 %	20 %	20 %	40 %	152998501
14	NC_009661	TGGTC	2	10	20657	20666	0 %	40 %	40 %	20 %	152998503
15	NC_009661	GCGTT	2	10	21858	21867	0 %	40 %	40 %	20 %	152998504
16	NC_009661	CTTGG	2	10	22378	22387	0 %	40 %	40 %	20 %	152998504
17	NC_009661	ATCAT	2	10	22653	22662	40 %	40 %	0 %	20 %	152998505
18	NC_009661	CACGT	2	10	26784	26793	20 %	20 %	20 %	40 %	152998509
19	NC_009661	GTGAC	2	10	28502	28511	20 %	20 %	40 %	20 %	152998510
20	NC_009661	CTTGT	2	10	34045	34054	0 %	60 %	20 %	20 %	152998514
21	NC_009661	GCCAA	2	10	35105	35114	40 %	0 %	20 %	40 %	152998516
22	NC_009661	TTCGC	2	10	36122	36131	0 %	40 %	20 %	40 %	152998518
23	NC_009661	GATAT	2	10	36840	36849	40 %	40 %	20 %	0 %	152998518
24	NC_009661	CAAAA	2	10	39421	39430	80 %	0 %	0 %	20 %	152998523
25	NC_009661	GAGAA	2	10	41288	41297	60 %	0 %	40 %	0 %	152998525
26	NC_009661	TTTAT	2	10	41713	41722	20 %	80 %	0 %	0 %	152998526
27	NC_009661	CTGTT	2	10	43924	43933	0 %	60 %	20 %	20 %	152998526
28	NC_009661	GCTGT	2	10	45147	45156	0 %	40 %	40 %	20 %	152998526
29	NC_009661	TTTGT	2	10	45731	45740	0 %	80 %	20 %	0 %	152998526
30	NC_009661	GCTCT	2	10	47409	47418	0 %	40 %	20 %	40 %	152998526
31	NC_009661	TTCTT	2	10	47491	47500	0 %	80 %	0 %	20 %	152998526
32	NC_009661	GCCGC	2	10	47518	47527	0 %	0 %	40 %	60 %	152998526
33	NC_009661	TGCGC	2	10	48019	48028	0 %	20 %	40 %	40 %	152998527
34	NC_009661	TGGTT	2	10	49027	49036	0 %	60 %	40 %	0 %	152998527
35	NC_009661	CACAC	2	10	49177	49186	40 %	0 %	0 %	60 %	152998527
36	NC_009661	TAGCA	2	10	49788	49797	40 %	20 %	20 %	20 %	152998527
37	NC_009661	TTTTG	2	10	52399	52408	0 %	80 %	20 %	0 %	152998529
38	NC_009661	GCCTT	2	10	54383	54392	0 %	40 %	20 %	40 %	152998530
39	NC_009661	TGGTT	2	10	56985	56994	0 %	60 %	40 %	0 %	152998533
40	NC_009661	TTTGC	2	10	59261	59270	0 %	60 %	20 %	20 %	152998535
41	NC_009661	AAATG	2	10	60351	60360	60 %	20 %	20 %	0 %	152998536
42	NC_009661	TGCCA	2	10	62465	62474	20 %	20 %	20 %	40 %	152998539
43	NC_009661	CTTCT	2	10	63145	63154	0 %	60 %	0 %	40 %	152998539
44	NC_009661	ATGCA	2	10	63411	63420	40 %	20 %	20 %	20 %	152998539
45	NC_009661	ATGGC	2	10	66772	66781	20 %	20 %	40 %	20 %	152998542
46	NC_009661	GACGA	2	10	67177	67186	40 %	0 %	40 %	20 %	152998543
47	NC_009661	TGTTT	2	10	67233	67242	0 %	80 %	20 %	0 %	152998543
48	NC_009661	ACGAA	2	10	69971	69980	60 %	0 %	20 %	20 %	152998546
49	NC_009661	AAGGT	2	10	76758	76767	40 %	20 %	40 %	0 %	152998551
50	NC_009661	CGATG	2	10	81200	81209	20 %	20 %	40 %	20 %	152998553
51	NC_009661	GCAGA	2	10	81297	81306	40 %	0 %	40 %	20 %	152998553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.