MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	TTAT	2	8	669	676	25 %	75 %	0 %	0 %	152998485
2	NC_009661	AAAC	2	8	756	763	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
3	NC_009661	AAAC	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
4	NC_009661	AAGA	2	8	1098	1105	75 %	0 %	25 %	0 %	152998485
5	NC_009661	GGTT	2	8	1346	1353	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
6	NC_009661	CCAA	2	8	1389	1396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009661	CCAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009661	CTAA	2	8	1653	1660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009661	GCTT	2	8	1757	1764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009661	AGTT	2	8	1910	1917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009661	ACTG	2	8	1950	1957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009661	GAAT	2	8	2555	2562	50 %	25 %	25 %	0 %	152998486
13	NC_009661	TACT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
14	NC_009661	TCAT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
15	NC_009661	GTAA	2	8	2959	2966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009661	ATTT	2	8	2993	3000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009661	CTTC	2	8	3142	3149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009661	ATCA	2	8	3439	3446	50 %	25 %	0 %	25 %	152998487
19	NC_009661	TCAG	2	8	3452	3459	25 %	25 %	25 %	25 %	152998487
20	NC_009661	ACTT	2	8	3555	3562	25 %	50 %	0 %	25 %	152998487
21	NC_009661	TTTA	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	152998488
22	NC_009661	GAAG	2	8	4406	4413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009661	GCGG	2	8	4613	4620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009661	AATA	2	8	5205	5212	75 %	25 %	0 %	0 %	152998489
25	NC_009661	ATTG	2	8	5220	5227	25 %	50 %	25 %	0 %	152998489
26	NC_009661	GCTT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	25 %	25 %	152998490
27	NC_009661	TACC	2	8	6001	6008	25 %	25 %	0 %	50 %	152998490
28	NC_009661	GTTG	2	8	6138	6145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009661	ATGC	2	8	6286	6293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009661	TTTA	2	8	6990	6997	25 %	75 %	0 %	0 %	152998491
31	NC_009661	GGAA	2	8	7562	7569	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
32	NC_009661	GAAA	2	8	7665	7672	75 %	0 %	25 %	0 %	152998492
33	NC_009661	AAGG	2	8	7929	7936	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
34	NC_009661	TCGT	2	8	7957	7964	0 %	50 %	25 %	25 %	152998492
35	NC_009661	CAAC	2	8	8445	8452	50 %	0 %	0 %	50 %	152998492
36	NC_009661	TAAA	2	8	8837	8844	75 %	25 %	0 %	0 %	152998493
37	NC_009661	AATG	2	8	8864	8871	50 %	25 %	25 %	0 %	152998493
38	NC_009661	TTCA	2	8	8951	8958	25 %	50 %	0 %	25 %	152998493
39	NC_009661	AAGC	2	8	9239	9246	50 %	0 %	25 %	25 %	152998493
40	NC_009661	GATA	2	8	10149	10156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009661	TCAA	2	8	10593	10600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009661	AGCA	2	8	10931	10938	50 %	0 %	25 %	25 %	152998494
43	NC_009661	GATC	2	8	11450	11457	25 %	25 %	25 %	25 %	152998495
44	NC_009661	ATGG	2	8	11657	11664	25 %	25 %	50 %	0 %	152998495
45	NC_009661	CCCA	2	8	11889	11896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_009661	GGAA	2	8	12625	12632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009661	CAAC	2	8	12784	12791	50 %	0 %	0 %	50 %	152998498
48	NC_009661	AAAC	2	8	13990	13997	75 %	0 %	0 %	25 %	152998499
49	NC_009661	TCAA	2	8	14298	14305	50 %	25 %	0 %	25 %	152998499
50	NC_009661	AGCG	2	8	14317	14324	25 %	0 %	50 %	25 %	152998499
51	NC_009661	GATC	2	8	14682	14689	25 %	25 %	25 %	25 %	152998499
52	NC_009661	ACGA	2	8	16878	16885	50 %	0 %	25 %	25 %	152998501
53	NC_009661	CCTT	2	8	16906	16913	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
54	NC_009661	TTTC	2	8	17170	17177	0 %	75 %	0 %	25 %	152998501
55	NC_009661	TTCC	2	8	17273	17280	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
56	NC_009661	ATCA	2	8	18299	18306	50 %	25 %	0 %	25 %	152998502
57	NC_009661	AAGC	2	8	18319	18326	50 %	0 %	25 %	25 %	152998502
58	NC_009661	GGGT	2	8	18395	18402	0 %	25 %	75 %	0 %	152998502
59	NC_009661	TGAA	2	8	18680	18687	50 %	25 %	25 %	0 %	152998502
60	NC_009661	AAGA	2	8	18792	18799	75 %	0 %	25 %	0 %	152998502
61	NC_009661	ACTT	2	8	19318	19325	25 %	50 %	0 %	25 %	152998503
62	NC_009661	TGGG	2	8	19756	19763	0 %	25 %	75 %	0 %	152998503
63	NC_009661	AATA	2	8	19970	19977	75 %	25 %	0 %	0 %	152998503
64	NC_009661	AGCG	2	8	20090	20097	25 %	0 %	50 %	25 %	152998503
65	NC_009661	CAAC	2	8	20250	20257	50 %	0 %	0 %	50 %	152998503
66	NC_009661	GCAT	2	8	20856	20863	25 %	25 %	25 %	25 %	152998503
67	NC_009661	TTAG	2	8	20988	20995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009661	GGTG	2	8	21955	21962	0 %	25 %	75 %	0 %	152998504
69	NC_009661	CAAC	2	8	22172	22179	50 %	0 %	0 %	50 %	152998504
70	NC_009661	ATAG	2	8	22835	22842	50 %	25 %	25 %	0 %	152998505
71	NC_009661	TAAT	2	8	23487	23494	50 %	50 %	0 %	0 %	152998505
72	NC_009661	CAAA	2	8	23838	23845	75 %	0 %	0 %	25 %	152998506
73	NC_009661	GAAT	2	8	23877	23884	50 %	25 %	25 %	0 %	152998506
74	NC_009661	GATT	2	8	24048	24055	25 %	50 %	25 %	0 %	152998506
75	NC_009661	TGAA	2	8	24424	24431	50 %	25 %	25 %	0 %	152998507
76	NC_009661	GTAT	2	8	25744	25751	25 %	50 %	25 %	0 %	152998508
77	NC_009661	TTTA	2	8	25786	25793	25 %	75 %	0 %	0 %	152998508
78	NC_009661	TAAA	2	8	25831	25838	75 %	25 %	0 %	0 %	152998508
79	NC_009661	ACTC	2	8	27133	27140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009661	GCTG	2	8	27207	27214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009661	GGAA	2	8	27957	27964	50 %	0 %	50 %	0 %	152998510
82	NC_009661	GAAA	2	8	28060	28067	75 %	0 %	25 %	0 %	152998510
83	NC_009661	AAGG	2	8	28324	28331	50 %	0 %	50 %	0 %	152998510
84	NC_009661	TCGT	2	8	28352	28359	0 %	50 %	25 %	25 %	152998510
85	NC_009661	CAAC	2	8	28840	28847	50 %	0 %	0 %	50 %	152998510
86	NC_009661	ACTG	2	8	29768	29775	25 %	25 %	25 %	25 %	152998511
87	NC_009661	CGAA	2	8	29864	29871	50 %	0 %	25 %	25 %	152998511
88	NC_009661	GCTT	2	8	30229	30236	0 %	50 %	25 %	25 %	152998511
89	NC_009661	TTGT	2	8	30664	30671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009661	AAGA	2	8	30704	30711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009661	TCAT	2	8	30719	30726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009661	GTTT	2	8	30967	30974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009661	TCGG	2	8	31969	31976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009661	GCAA	2	8	32018	32025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009661	TGTC	2	8	32269	32276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009661	GCAA	2	8	32365	32372	50 %	0 %	25 %	25 %	152998514
97	NC_009661	GCCA	2	8	32399	32406	25 %	0 %	25 %	50 %	152998514
98	NC_009661	GCGG	2	8	33170	33177	0 %	0 %	75 %	25 %	152998514
99	NC_009661	AGTT	2	8	33312	33319	25 %	50 %	25 %	0 %	152998514
100	NC_009661	TCTG	2	8	33674	33681	0 %	50 %	25 %	25 %	152998514
101	NC_009661	AGCC	2	8	33811	33818	25 %	0 %	25 %	50 %	152998514
102	NC_009661	AGAA	2	8	33891	33898	75 %	0 %	25 %	0 %	152998514
103	NC_009661	TAAA	2	8	34285	34292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009661	TGAA	2	8	34546	34553	50 %	25 %	25 %	0 %	152998515
105	NC_009661	TGGC	2	8	34596	34603	0 %	25 %	50 %	25 %	152998515
106	NC_009661	CAAA	2	8	34634	34641	75 %	0 %	0 %	25 %	152998515
107	NC_009661	TGAT	2	8	35129	35136	25 %	50 %	25 %	0 %	152998516
108	NC_009661	TTGA	2	8	35179	35186	25 %	50 %	25 %	0 %	152998516
109	NC_009661	AGCG	2	8	35547	35554	25 %	0 %	50 %	25 %	152998517
110	NC_009661	TCGG	2	8	35871	35878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009661	GCAA	2	8	35920	35927	50 %	0 %	25 %	25 %	152998518
112	NC_009661	GCGA	2	8	36162	36169	25 %	0 %	50 %	25 %	152998518
113	NC_009661	AGCA	2	8	36212	36219	50 %	0 %	25 %	25 %	152998518
114	NC_009661	AAAG	2	8	37997	38004	75 %	0 %	25 %	0 %	152998521
115	NC_009661	ATAA	2	8	38490	38497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009661	AGCA	2	8	38651	38658	50 %	0 %	25 %	25 %	152998522
117	NC_009661	GCAA	2	8	39013	39020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009661	GCGA	2	8	39255	39262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009661	AGCA	2	8	39305	39312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009661	TTAA	2	8	40550	40557	50 %	50 %	0 %	0 %	152998524
121	NC_009661	CAGA	2	8	40620	40627	50 %	0 %	25 %	25 %	152998524
122	NC_009661	TTAT	2	8	42202	42209	25 %	75 %	0 %	0 %	152998526
123	NC_009661	CTTG	2	8	42383	42390	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
124	NC_009661	GAGT	2	8	42408	42415	25 %	25 %	50 %	0 %	152998526
125	NC_009661	GTTC	2	8	42539	42546	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
126	NC_009661	TTAA	2	8	42610	42617	50 %	50 %	0 %	0 %	152998526
127	NC_009661	GTTA	2	8	43041	43048	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
128	NC_009661	TGAT	2	8	43771	43778	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
129	NC_009661	ATTG	2	8	43962	43969	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
130	NC_009661	TCAA	2	8	44065	44072	50 %	25 %	0 %	25 %	152998526
131	NC_009661	GTCT	2	8	44516	44523	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
132	NC_009661	TTTG	2	8	45215	45222	0 %	75 %	25 %	0 %	152998526
133	NC_009661	CTTG	2	8	45809	45816	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
134	NC_009661	CTTT	2	8	46199	46206	0 %	75 %	0 %	25 %	152998526
135	NC_009661	CAAA	2	8	46802	46809	75 %	0 %	0 %	25 %	152998526
136	NC_009661	GTGA	2	8	47002	47009	25 %	25 %	50 %	0 %	152998526
137	NC_009661	GCAA	2	8	47215	47222	50 %	0 %	25 %	25 %	152998526
138	NC_009661	CATC	2	8	48640	48647	25 %	25 %	0 %	50 %	152998527
139	NC_009661	CTTT	2	8	49977	49984	0 %	75 %	0 %	25 %	152998528
140	NC_009661	TAAG	2	8	50035	50042	50 %	25 %	25 %	0 %	152998528
141	NC_009661	TTGA	2	8	50542	50549	25 %	50 %	25 %	0 %	152998529
142	NC_009661	GTTG	2	8	51200	51207	0 %	50 %	50 %	0 %	152998529
143	NC_009661	ACAT	2	8	51429	51436	50 %	25 %	0 %	25 %	152998529
144	NC_009661	GCTT	2	8	51635	51642	0 %	50 %	25 %	25 %	152998529
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.