MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	CCAA	2	8	1389	1396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009661	CCAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009661	CTAA	2	8	1653	1660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009661	GCTT	2	8	1757	1764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009661	AGTT	2	8	1910	1917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009661	ACTG	2	8	1950	1957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009661	GTAA	2	8	2959	2966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009661	ATTT	2	8	2993	3000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009661	CTTC	2	8	3142	3149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009661	GAAG	2	8	4406	4413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009661	GCGG	2	8	4613	4620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009661	GTTG	2	8	6138	6145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009661	ATGC	2	8	6286	6293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009661	GATA	2	8	10149	10156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009661	TCAA	2	8	10593	10600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009661	CCCA	2	8	11889	11896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009661	GGAA	2	8	12625	12632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009661	TTAG	2	8	20988	20995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009661	ACTC	2	8	27133	27140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009661	GCTG	2	8	27207	27214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009661	TTGT	2	8	30664	30671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009661	AAGA	2	8	30704	30711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009661	TCAT	2	8	30719	30726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009661	GTTT	2	8	30967	30974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009661	TCGG	2	8	31969	31976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009661	GCAA	2	8	32018	32025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009661	TGTC	2	8	32269	32276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009661	TAAA	2	8	34285	34292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009661	TCGG	2	8	35871	35878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009661	ATAA	2	8	38490	38497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009661	GCAA	2	8	39013	39020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009661	GCGA	2	8	39255	39262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009661	AGCA	2	8	39305	39312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009661	GCAA	2	8	54791	54798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009661	ATGC	2	8	54812	54819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009661	ATGT	2	8	68749	68756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009661	AACA	2	8	68816	68823	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009661	TTGC	2	8	68919	68926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009661	TCAA	2	8	69199	69206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009661	GTTA	2	8	69585	69592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009661	GTCA	2	8	69873	69880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009661	ATAA	2	8	70707	70714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009661	GTAT	2	8	70829	70836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009661	CTTA	2	8	70907	70914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009661	GTAA	2	8	74060	74067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009661	TGTT	2	8	75228	75235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.