MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	AT	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
2	NC_009661	GA	3	6	59	64	50 %	0 %	50 %	0 %	152998484
3	NC_009661	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
4	NC_009661	TG	3	6	457	462	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
5	NC_009661	AG	4	8	2366	2373	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
6	NC_009661	TA	4	8	2498	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
7	NC_009661	AT	3	6	2604	2609	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
8	NC_009661	GA	3	6	2613	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
9	NC_009661	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	152998487
10	NC_009661	CT	3	6	5651	5656	0 %	50 %	0 %	50 %	152998490
11	NC_009661	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	152998490
12	NC_009661	TA	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	152998491
13	NC_009661	GA	3	6	6915	6920	50 %	0 %	50 %	0 %	152998491
14	NC_009661	GA	3	6	7701	7706	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
15	NC_009661	CA	3	6	8805	8810	50 %	0 %	0 %	50 %	152998493
16	NC_009661	CG	3	6	13056	13061	0 %	0 %	50 %	50 %	152998498
17	NC_009661	GA	3	6	14465	14470	50 %	0 %	50 %	0 %	152998499
18	NC_009661	AT	3	6	15459	15464	50 %	50 %	0 %	0 %	152998500
19	NC_009661	AG	3	6	16039	16044	50 %	0 %	50 %	0 %	152998500
20	NC_009661	TC	3	6	17136	17141	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
21	NC_009661	TG	3	6	17986	17991	0 %	50 %	50 %	0 %	152998502
22	NC_009661	AT	5	10	19678	19687	50 %	50 %	0 %	0 %	152998503
23	NC_009661	TA	3	6	20369	20374	50 %	50 %	0 %	0 %	152998503
24	NC_009661	CT	3	6	23504	23509	0 %	50 %	0 %	50 %	152998505
25	NC_009661	AC	4	8	25526	25533	50 %	0 %	0 %	50 %	152998508
26	NC_009661	TA	3	6	25601	25606	50 %	50 %	0 %	0 %	152998508
27	NC_009661	AG	3	6	25707	25712	50 %	0 %	50 %	0 %	152998508
28	NC_009661	GA	3	6	26733	26738	50 %	0 %	50 %	0 %	152998509
29	NC_009661	GA	3	6	28096	28101	50 %	0 %	50 %	0 %	152998510
30	NC_009661	TG	3	6	29603	29608	0 %	50 %	50 %	0 %	152998511
31	NC_009661	TG	3	6	30157	30162	0 %	50 %	50 %	0 %	152998511
32	NC_009661	GC	4	8	31179	31186	0 %	0 %	50 %	50 %	152998512
33	NC_009661	GA	3	6	31866	31871	50 %	0 %	50 %	0 %	152998513
34	NC_009661	CG	3	6	32814	32819	0 %	0 %	50 %	50 %	152998514
35	NC_009661	CG	3	6	33283	33288	0 %	0 %	50 %	50 %	152998514
36	NC_009661	GC	3	6	36136	36141	0 %	0 %	50 %	50 %	152998518
37	NC_009661	AC	3	6	36226	36231	50 %	0 %	0 %	50 %	152998518
38	NC_009661	AG	3	6	37189	37194	50 %	0 %	50 %	0 %	152998519
39	NC_009661	CA	3	6	37765	37770	50 %	0 %	0 %	50 %	152998520
40	NC_009661	CG	3	6	37864	37869	0 %	0 %	50 %	50 %	152998520
41	NC_009661	CA	3	6	38047	38052	50 %	0 %	0 %	50 %	152998521
42	NC_009661	AC	3	6	39320	39325	50 %	0 %	0 %	50 %	152998523
43	NC_009661	GT	3	6	39524	39529	0 %	50 %	50 %	0 %	152998523
44	NC_009661	TA	3	6	40410	40415	50 %	50 %	0 %	0 %	152998524
45	NC_009661	AC	3	6	41436	41441	50 %	0 %	0 %	50 %	152998525
46	NC_009661	CG	4	8	42450	42457	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
47	NC_009661	CG	3	6	43029	43034	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
48	NC_009661	TG	3	6	43173	43178	0 %	50 %	50 %	0 %	152998526
49	NC_009661	GC	5	10	44047	44056	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
50	NC_009661	GT	3	6	44241	44246	0 %	50 %	50 %	0 %	152998526
51	NC_009661	TG	3	6	44287	44292	0 %	50 %	50 %	0 %	152998526
52	NC_009661	GC	3	6	44603	44608	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
53	NC_009661	AT	3	6	44978	44983	50 %	50 %	0 %	0 %	152998526
54	NC_009661	GT	3	6	45637	45642	0 %	50 %	50 %	0 %	152998526
55	NC_009661	CT	3	6	46288	46293	0 %	50 %	0 %	50 %	152998526
56	NC_009661	CG	3	6	46427	46432	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
57	NC_009661	GC	4	8	46961	46968	0 %	0 %	50 %	50 %	152998526
58	NC_009661	GC	3	6	49135	49140	0 %	0 %	50 %	50 %	152998527
59	NC_009661	GC	3	6	51947	51952	0 %	0 %	50 %	50 %	152998529
60	NC_009661	CG	3	6	52354	52359	0 %	0 %	50 %	50 %	152998529
61	NC_009661	CG	3	6	53925	53930	0 %	0 %	50 %	50 %	152998530
62	NC_009661	GT	3	6	54649	54654	0 %	50 %	50 %	0 %	152998530
63	NC_009661	TG	3	6	55275	55280	0 %	50 %	50 %	0 %	152998531
64	NC_009661	GA	3	6	56169	56174	50 %	0 %	50 %	0 %	152998533
65	NC_009661	GC	3	6	56441	56446	0 %	0 %	50 %	50 %	152998533
66	NC_009661	GC	3	6	57176	57181	0 %	0 %	50 %	50 %	152998534
67	NC_009661	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	152998534
68	NC_009661	AC	4	8	57249	57256	50 %	0 %	0 %	50 %	152998534
69	NC_009661	TG	3	6	59330	59335	0 %	50 %	50 %	0 %	152998535
70	NC_009661	AG	3	6	59460	59465	50 %	0 %	50 %	0 %	152998535
71	NC_009661	AC	3	6	59927	59932	50 %	0 %	0 %	50 %	152998536
72	NC_009661	CG	3	6	60266	60271	0 %	0 %	50 %	50 %	152998536
73	NC_009661	CG	3	6	60708	60713	0 %	0 %	50 %	50 %	152998537
74	NC_009661	GT	3	6	60770	60775	0 %	50 %	50 %	0 %	152998537
75	NC_009661	CG	3	6	60924	60929	0 %	0 %	50 %	50 %	152998537
76	NC_009661	CG	3	6	61550	61555	0 %	0 %	50 %	50 %	152998538
77	NC_009661	GC	3	6	61796	61801	0 %	0 %	50 %	50 %	152998539
78	NC_009661	CA	3	6	62161	62166	50 %	0 %	0 %	50 %	152998539
79	NC_009661	GT	3	6	63513	63518	0 %	50 %	50 %	0 %	152998539
80	NC_009661	AC	3	6	64497	64502	50 %	0 %	0 %	50 %	152998540
81	NC_009661	CG	3	6	66796	66801	0 %	0 %	50 %	50 %	152998542
82	NC_009661	GC	3	6	66997	67002	0 %	0 %	50 %	50 %	152998542
83	NC_009661	GC	3	6	67134	67139	0 %	0 %	50 %	50 %	152998543
84	NC_009661	GC	3	6	70113	70118	0 %	0 %	50 %	50 %	152998546
85	NC_009661	CT	3	6	72399	72404	0 %	50 %	0 %	50 %	152998548
86	NC_009661	GA	3	6	73286	73291	50 %	0 %	50 %	0 %	152998549
87	NC_009661	AT	3	6	73366	73371	50 %	50 %	0 %	0 %	152998549
88	NC_009661	CA	3	6	73630	73635	50 %	0 %	0 %	50 %	152998549
89	NC_009661	CT	3	6	74601	74606	0 %	50 %	0 %	50 %	152998550
90	NC_009661	CA	3	6	74794	74799	50 %	0 %	0 %	50 %	152998550
91	NC_009661	CT	3	6	76892	76897	0 %	50 %	0 %	50 %	152998551
92	NC_009661	TG	3	6	79445	79450	0 %	50 %	50 %	0 %	152998553
93	NC_009661	CA	3	6	81824	81829	50 %	0 %	0 %	50 %	152998553
94	NC_009661	AG	3	6	81981	81986	50 %	0 %	50 %	0 %	152998554
95	NC_009661	TA	3	6	82103	82108	50 %	50 %	0 %	0 %	152998554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.