MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Kineococcus radiotolerans SRS30216 plasmid pKRAD02

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009660	CGC	2	6	466	471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
2	NC_009660	CGG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
3	NC_009660	GCG	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
4	NC_009660	GCG	2	6	543	548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
5	NC_009660	GCT	2	6	565	570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963955
6	NC_009660	CCG	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
7	NC_009660	GCC	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
8	NC_009660	GGC	2	6	644	649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
9	NC_009660	CGC	2	6	656	661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
10	NC_009660	CCA	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
11	NC_009660	CCA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
12	NC_009660	CGG	3	9	736	744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
13	NC_009660	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963955
14	NC_009660	CGG	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963955
15	NC_009660	CCA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963955
16	NC_009660	GCT	2	6	916	921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
17	NC_009660	CGT	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
18	NC_009660	TCC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152963956
19	NC_009660	GCA	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963956
20	NC_009660	CGG	3	9	1116	1124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963956
21	NC_009660	CAG	2	6	1156	1161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963956
22	NC_009660	CTG	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963956
23	NC_009660	GCG	2	6	1276	1281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963956
24	NC_009660	GCG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963957
25	NC_009660	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963957
26	NC_009660	GCA	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963957
27	NC_009660	CTG	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963957
28	NC_009660	CGG	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963957
29	NC_009660	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
30	NC_009660	GGT	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
31	NC_009660	GGT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
32	NC_009660	CGG	2	6	1846	1851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
33	NC_009660	ACC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
34	NC_009660	GGT	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
35	NC_009660	ACC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
36	NC_009660	CAC	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
37	NC_009660	GGT	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
38	NC_009660	CCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
39	NC_009660	CGC	2	6	2063	2068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
40	NC_009660	CCA	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
41	NC_009660	GCC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
42	NC_009660	CGT	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
43	NC_009660	CGC	2	6	2266	2271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
44	NC_009660	CAC	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
45	NC_009660	CTG	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
46	NC_009660	CCA	3	9	2296	2304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
47	NC_009660	CGG	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
48	NC_009660	CGC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
49	NC_009660	CCG	2	6	2403	2408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
50	NC_009660	CAC	3	9	2429	2437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
51	NC_009660	GGC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
52	NC_009660	GGC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
53	NC_009660	CAC	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
54	NC_009660	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
55	NC_009660	CAC	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
56	NC_009660	CTG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
57	NC_009660	CAG	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
58	NC_009660	ACG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
59	NC_009660	GCC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
60	NC_009660	GGC	2	6	2891	2896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
61	NC_009660	CAC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963958
62	NC_009660	CGA	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
63	NC_009660	CCG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
64	NC_009660	CGC	2	6	3091	3096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
65	NC_009660	TCC	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152963958
66	NC_009660	CGG	2	6	3169	3174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
67	NC_009660	CGT	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
68	NC_009660	TGC	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
69	NC_009660	GCC	3	9	3213	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
70	NC_009660	GCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
71	NC_009660	ACG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
72	NC_009660	CGC	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
73	NC_009660	CAG	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
74	NC_009660	CGT	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
75	NC_009660	CGT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
76	NC_009660	GCG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
77	NC_009660	CCG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
78	NC_009660	TCG	2	6	3639	3644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
79	NC_009660	TGG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963958
80	NC_009660	CGG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
81	NC_009660	CTG	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
82	NC_009660	CAG	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
83	NC_009660	GCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
84	NC_009660	GCC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
85	NC_009660	GCG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
86	NC_009660	GCA	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
87	NC_009660	AGC	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
88	NC_009660	CGT	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
89	NC_009660	CAG	2	6	4007	4012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
90	NC_009660	CAG	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
91	NC_009660	GGC	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
92	NC_009660	GCA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
93	NC_009660	CAG	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
94	NC_009660	GCA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963958
95	NC_009660	CCG	2	6	4186	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963958
96	NC_009660	CTG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
97	NC_009660	ACT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152963958
98	NC_009660	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963958
99	NC_009660	TGC	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963958
100	NC_009660	CGG	2	6	4551	4556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
101	NC_009660	GCG	2	6	4624	4629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
102	NC_009660	CAC	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963959
103	NC_009660	CGG	3	9	4734	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
104	NC_009660	GCG	2	6	4748	4753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
105	NC_009660	GCG	2	6	4764	4769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
106	NC_009660	TGC	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963959
107	NC_009660	CGG	2	6	4887	4892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963959
108	NC_009660	TCA	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152963959
109	NC_009660	CCA	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152963960
110	NC_009660	GCC	2	6	5032	5037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963960
111	NC_009660	CAG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963960
112	NC_009660	GGC	2	6	5057	5062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963960
113	NC_009660	GTC	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963960
114	NC_009660	CAG	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963960
115	NC_009660	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152963960
116	NC_009660	GCG	2	6	5190	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963960
117	NC_009660	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963960
118	NC_009660	TCA	2	6	5212	5217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152963961
119	NC_009660	GCG	2	6	5297	5302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963961
120	NC_009660	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963961
121	NC_009660	GCG	2	6	5379	5384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963961
122	NC_009660	GGC	2	6	5426	5431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963961
123	NC_009660	ACG	2	6	5460	5465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963961
124	NC_009660	GCG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963962
125	NC_009660	TGC	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963962
126	NC_009660	CCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152963962
127	NC_009660	CGG	2	6	5929	5934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963962
128	NC_009660	GCT	3	9	5971	5979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963962
129	NC_009660	GTC	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152963962
130	NC_009660	GCG	2	6	6087	6092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152963962
131	NC_009660	ACG	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152963962
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.