MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Janthinobacterium sp. Marseille chromosome

Total Repeats: 2788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009659	TTGCA	2	10	2051	2060	20 %	40 %	20 %	20 %	152980594
2	NC_009659	AACGT	2	10	5521	5530	40 %	20 %	20 %	20 %	152980048
3	NC_009659	TCGAT	2	10	10168	10177	20 %	40 %	20 %	20 %	152982885
4	NC_009659	CATTT	2	10	10644	10653	20 %	60 %	0 %	20 %	152982885
5	NC_009659	ATCAG	2	10	11898	11907	40 %	20 %	20 %	20 %	152982884
6	NC_009659	TTCGA	2	10	12206	12215	20 %	40 %	20 %	20 %	152982884
7	NC_009659	TGATG	2	10	12936	12945	20 %	40 %	40 %	0 %	152981377
8	NC_009659	TCATG	2	10	13386	13395	20 %	40 %	20 %	20 %	152981377
9	NC_009659	ACCGC	2	10	14065	14074	20 %	0 %	20 %	60 %	152981377
10	NC_009659	ACAAA	2	10	16525	16534	80 %	0 %	0 %	20 %	152982408
11	NC_009659	TAACG	2	10	17020	17029	40 %	20 %	20 %	20 %	152982408
12	NC_009659	GCCAT	2	10	19010	19019	20 %	20 %	20 %	40 %	152980555
13	NC_009659	GCGAT	2	10	23788	23797	20 %	20 %	40 %	20 %	152980502
14	NC_009659	CCTGC	2	10	24022	24031	0 %	20 %	20 %	60 %	152981925
15	NC_009659	CTTGG	2	10	25369	25378	0 %	40 %	40 %	20 %	152981539
16	NC_009659	TTTTG	2	10	26387	26396	0 %	80 %	20 %	0 %	152982808
17	NC_009659	GCGTG	2	10	28042	28051	0 %	20 %	60 %	20 %	152981203
18	NC_009659	AGCCT	2	10	28719	28728	20 %	20 %	20 %	40 %	152981203
19	NC_009659	CTGCC	2	10	29958	29967	0 %	20 %	20 %	60 %	152981203
20	NC_009659	CCACT	2	10	30428	30437	20 %	20 %	0 %	60 %	152981819
21	NC_009659	CTTAT	2	10	33150	33159	20 %	60 %	0 %	20 %	152981360
22	NC_009659	ATACG	2	10	33786	33795	40 %	20 %	20 %	20 %	152981360
23	NC_009659	GCGCG	2	10	34393	34402	0 %	0 %	60 %	40 %	152982803
24	NC_009659	TGGCC	2	10	35115	35124	0 %	20 %	40 %	40 %	152982803
25	NC_009659	CACTG	2	10	36436	36445	20 %	20 %	20 %	40 %	152981283
26	NC_009659	CTGCC	2	10	36635	36644	0 %	20 %	20 %	60 %	152981283
27	NC_009659	TAGTG	2	10	40802	40811	20 %	40 %	40 %	0 %	152983019
28	NC_009659	TTGCT	2	10	43165	43174	0 %	60 %	20 %	20 %	152981445
29	NC_009659	GCGTC	2	10	45484	45493	0 %	20 %	40 %	40 %	152982577
30	NC_009659	TTTCC	2	10	46436	46445	0 %	60 %	0 %	40 %	152981388
31	NC_009659	GGCCG	2	10	48220	48229	0 %	0 %	60 %	40 %	152981681
32	NC_009659	TTTCC	2	10	48608	48617	0 %	60 %	0 %	40 %	152982693
33	NC_009659	AGTGA	2	10	51038	51047	40 %	20 %	40 %	0 %	152980973
34	NC_009659	GGCCT	2	10	52736	52745	0 %	20 %	40 %	40 %	152981597
35	NC_009659	CGCAA	2	10	53674	53683	40 %	0 %	20 %	40 %	152982335
36	NC_009659	ATTAC	2	10	53925	53934	40 %	40 %	0 %	20 %	152981797
37	NC_009659	GGCAA	2	10	54696	54705	40 %	0 %	40 %	20 %	152982168
38	NC_009659	GCAAG	2	10	56163	56172	40 %	0 %	40 %	20 %	152982641
39	NC_009659	GCCAG	2	10	58134	58143	20 %	0 %	40 %	40 %	152981913
40	NC_009659	TTCCG	2	10	61015	61024	0 %	40 %	20 %	40 %	152981451
41	NC_009659	ACGGT	2	10	61696	61705	20 %	20 %	40 %	20 %	152982473
42	NC_009659	TCGGT	2	10	63219	63228	0 %	40 %	40 %	20 %	152981188
43	NC_009659	GCCCG	2	10	71906	71915	0 %	0 %	40 %	60 %	152983465
44	NC_009659	CCATT	2	10	76582	76591	20 %	40 %	0 %	40 %	152982435
45	NC_009659	CAGTC	2	10	77831	77840	20 %	20 %	20 %	40 %	152982643
46	NC_009659	GAAAG	2	10	79308	79317	60 %	0 %	40 %	0 %	152982643
47	NC_009659	GGTCC	2	10	81174	81183	0 %	20 %	40 %	40 %	152981400
48	NC_009659	TTTGC	2	10	81204	81213	0 %	60 %	20 %	20 %	152981400
49	NC_009659	TTGCC	2	10	81284	81293	0 %	40 %	20 %	40 %	152981400
50	NC_009659	CACCG	2	10	82404	82413	20 %	0 %	20 %	60 %	152982199
51	NC_009659	CTGGC	2	10	83581	83590	0 %	20 %	40 %	40 %	152982307
52	NC_009659	TCATC	2	10	89537	89546	20 %	40 %	0 %	40 %	152981433
53	NC_009659	ACCAC	2	10	89959	89968	40 %	0 %	0 %	60 %	152981433
54	NC_009659	ATTCA	2	10	90807	90816	40 %	40 %	0 %	20 %	152981433
55	NC_009659	ACGGT	2	10	90826	90835	20 %	20 %	40 %	20 %	152981433
56	NC_009659	GTCGT	2	10	93087	93096	0 %	40 %	40 %	20 %	152981138
57	NC_009659	TCGGT	2	10	93312	93321	0 %	40 %	40 %	20 %	152981138
58	NC_009659	GAAGG	2	10	94275	94284	40 %	0 %	60 %	0 %	152980930
59	NC_009659	TCACT	2	10	94346	94355	20 %	40 %	0 %	40 %	152980930
60	NC_009659	TCCAG	2	10	95691	95700	20 %	20 %	20 %	40 %	152981076
61	NC_009659	TTCAC	2	10	95789	95798	20 %	40 %	0 %	40 %	152981076
62	NC_009659	TTGCC	2	10	96949	96958	0 %	40 %	20 %	40 %	152982890
63	NC_009659	GGCCT	2	10	98194	98203	0 %	20 %	40 %	40 %	152982880
64	NC_009659	TTGAT	2	10	99460	99469	20 %	60 %	20 %	0 %	152982891
65	NC_009659	ATTCA	2	10	99844	99853	40 %	40 %	0 %	20 %	152981082
66	NC_009659	TCGGT	2	10	100967	100976	0 %	40 %	40 %	20 %	152981082
67	NC_009659	GAGGG	2	10	103848	103857	20 %	0 %	80 %	0 %	152980892
68	NC_009659	CCACG	2	10	104313	104322	20 %	0 %	20 %	60 %	152982373
69	NC_009659	TTGCC	2	10	105235	105244	0 %	40 %	20 %	40 %	152981171
70	NC_009659	TGGCG	2	10	106977	106986	0 %	20 %	60 %	20 %	152981427
71	NC_009659	CTGGG	2	10	112541	112550	0 %	20 %	60 %	20 %	152983464
72	NC_009659	ACGCG	2	10	114038	114047	20 %	0 %	40 %	40 %	152982673
73	NC_009659	ATTCA	2	10	114277	114286	40 %	40 %	0 %	20 %	152982673
74	NC_009659	AAGGC	2	10	114678	114687	40 %	0 %	40 %	20 %	152981145
75	NC_009659	GACAG	2	10	118818	118827	40 %	0 %	40 %	20 %	152982699
76	NC_009659	CTGGC	2	10	119852	119861	0 %	20 %	40 %	40 %	152982249
77	NC_009659	GGCAT	2	10	120127	120136	20 %	20 %	40 %	20 %	152982249
78	NC_009659	AATGC	2	10	120679	120688	40 %	20 %	20 %	20 %	152981577
79	NC_009659	CGGCT	2	10	120915	120924	0 %	20 %	40 %	40 %	152981577
80	NC_009659	ATCGA	2	10	124047	124056	40 %	20 %	20 %	20 %	152980236
81	NC_009659	TGACC	2	10	124592	124601	20 %	20 %	20 %	40 %	152980236
82	NC_009659	TGGCC	2	10	125030	125039	0 %	20 %	40 %	40 %	152980236
83	NC_009659	TCCGA	2	10	125284	125293	20 %	20 %	20 %	40 %	152982022
84	NC_009659	TGCAC	2	10	125592	125601	20 %	20 %	20 %	40 %	152982022
85	NC_009659	AAAAT	2	10	126374	126383	80 %	20 %	0 %	0 %	152982446
86	NC_009659	TACCG	2	10	127783	127792	20 %	20 %	20 %	40 %	152983463
87	NC_009659	CCAAG	2	10	127799	127808	40 %	0 %	20 %	40 %	152983463
88	NC_009659	CATCC	2	10	128022	128031	20 %	20 %	0 %	60 %	152981949
89	NC_009659	GATTC	2	10	128309	128318	20 %	40 %	20 %	20 %	152981949
90	NC_009659	TGGCC	2	10	130882	130891	0 %	20 %	40 %	40 %	152980665
91	NC_009659	GGCTG	2	10	132579	132588	0 %	20 %	60 %	20 %	152980701
92	NC_009659	GTGAA	2	10	133260	133269	40 %	20 %	40 %	0 %	152980099
93	NC_009659	AGGCC	2	10	133315	133324	20 %	0 %	40 %	40 %	152980099
94	NC_009659	TCAGG	2	10	141529	141538	20 %	20 %	40 %	20 %	152980958
95	NC_009659	ATCGC	2	10	142692	142701	20 %	20 %	20 %	40 %	152982510
96	NC_009659	GCGGT	2	10	142999	143008	0 %	20 %	60 %	20 %	152982510
97	NC_009659	CTTTG	2	10	143141	143150	0 %	60 %	20 %	20 %	152982510
98	NC_009659	TGGCT	2	10	144000	144009	0 %	40 %	40 %	20 %	152982510
99	NC_009659	ACGGC	2	10	147275	147284	20 %	0 %	40 %	40 %	152981545
100	NC_009659	CGGTG	2	10	147526	147535	0 %	20 %	60 %	20 %	152981545
101	NC_009659	AAGGG	2	10	147802	147811	40 %	0 %	60 %	0 %	152982325
102	NC_009659	GCCTT	2	10	148907	148916	0 %	40 %	20 %	40 %	152980296
103	NC_009659	AGCCC	2	10	159480	159489	20 %	0 %	20 %	60 %	152981357
104	NC_009659	ATGAA	2	10	160005	160014	60 %	20 %	20 %	0 %	152980007
105	NC_009659	AGGCC	2	10	162682	162691	20 %	0 %	40 %	40 %	152980007
106	NC_009659	GTCAG	2	10	163745	163754	20 %	20 %	40 %	20 %	152980966
107	NC_009659	GTTCA	2	10	163876	163885	20 %	40 %	20 %	20 %	152980966
108	NC_009659	GCGAC	2	10	163973	163982	20 %	0 %	40 %	40 %	152980966
109	NC_009659	TTTGA	2	10	164018	164027	20 %	60 %	20 %	0 %	152980966
110	NC_009659	CTTTA	2	10	164602	164611	20 %	60 %	0 %	20 %	152981600
111	NC_009659	CCTTG	2	10	164901	164910	0 %	40 %	20 %	40 %	152981600
112	NC_009659	GCCGG	2	10	166153	166162	0 %	0 %	60 %	40 %	152982008
113	NC_009659	GTGCA	2	10	167234	167243	20 %	20 %	40 %	20 %	152982664
114	NC_009659	CCGCC	2	10	170447	170456	0 %	0 %	20 %	80 %	152981064
115	NC_009659	GTTGT	2	10	171383	171392	0 %	60 %	40 %	0 %	152981119
116	NC_009659	CATTG	2	10	172242	172251	20 %	40 %	20 %	20 %	152981119
117	NC_009659	GGCAA	2	10	172366	172375	40 %	0 %	40 %	20 %	152981119
118	NC_009659	CACAT	2	10	172763	172772	40 %	20 %	0 %	40 %	152982197
119	NC_009659	CACTT	2	10	174361	174370	20 %	40 %	0 %	40 %	152980904
120	NC_009659	GTGCA	2	10	177676	177685	20 %	20 %	40 %	20 %	152981227
121	NC_009659	GCGCG	2	10	178859	178868	0 %	0 %	60 %	40 %	152981227
122	NC_009659	ATTGC	2	10	179290	179299	20 %	40 %	20 %	20 %	152981748
123	NC_009659	CGGCG	2	10	179424	179433	0 %	0 %	60 %	40 %	152981748
124	NC_009659	TGACG	2	10	180832	180841	20 %	20 %	40 %	20 %	152982722
125	NC_009659	ATGAG	2	10	181647	181656	40 %	20 %	40 %	0 %	152981218
126	NC_009659	TGGTT	2	10	182471	182480	0 %	60 %	40 %	0 %	152981218
127	NC_009659	CCTGG	2	10	182563	182572	0 %	20 %	40 %	40 %	152981218
128	NC_009659	CTGGT	2	10	182637	182646	0 %	40 %	40 %	20 %	152981218
129	NC_009659	GAAAA	2	10	183331	183340	80 %	0 %	20 %	0 %	152980006
130	NC_009659	TCCGA	2	10	186796	186805	20 %	20 %	20 %	40 %	152981209
131	NC_009659	GTTCC	2	10	187449	187458	0 %	40 %	20 %	40 %	152981209
132	NC_009659	TGACC	2	10	188196	188205	20 %	20 %	20 %	40 %	152981209
133	NC_009659	ACCAA	2	10	188494	188503	60 %	0 %	0 %	40 %	152981928
134	NC_009659	CCATC	2	10	188679	188688	20 %	20 %	0 %	60 %	152981928
135	NC_009659	GGGCC	2	10	189450	189459	0 %	0 %	60 %	40 %	152981908
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141	NC_009659	ACCGT	2	10	194441	194450	20 %	20 %	20 %	40 %	152980347
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248	NC_009659	ATCGG	2	10	367611	367620	20 %	20 %	40 %	20 %	152980592
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250	NC_009659	GACAA	2	10	374121	374130	60 %	0 %	20 %	20 %	152979973
251	NC_009659	TACGG	2	10	374228	374237	20 %	20 %	40 %	20 %	152979973
252	NC_009659	AATTC	2	10	374479	374488	40 %	40 %	0 %	20 %	152979973
253	NC_009659	CGACC	2	10	377573	377582	20 %	0 %	20 %	60 %	152980441
254	NC_009659	GTCCG	2	10	377723	377732	0 %	20 %	40 %	40 %	152980441
255	NC_009659	GAGCA	2	10	378144	378153	40 %	0 %	40 %	20 %	152980441
256	NC_009659	ACCGC	2	10	378966	378975	20 %	0 %	20 %	60 %	152980162
257	NC_009659	AGCTG	2	10	379380	379389	20 %	20 %	40 %	20 %	152980162
258	NC_009659	GGTTT	2	10	379862	379871	0 %	60 %	40 %	0 %	152980104
259	NC_009659	TCGCT	2	10	379938	379947	0 %	40 %	20 %	40 %	152980104
260	NC_009659	ACGAT	2	10	380695	380704	40 %	20 %	20 %	20 %	152980677
261	NC_009659	GGATG	2	10	382280	382289	20 %	20 %	60 %	0 %	152980378
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263	NC_009659	CCTTG	2	10	385587	385596	0 %	40 %	20 %	40 %	152980668
264	NC_009659	TCCAG	2	10	385650	385659	20 %	20 %	20 %	40 %	152980668
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382	NC_009659	TCGAT	2	10	574213	574222	20 %	40 %	20 %	20 %	152980454
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389	NC_009659	CTGGC	2	10	591348	591357	0 %	20 %	40 %	40 %	152982107
390	NC_009659	GATGC	2	10	591369	591378	20 %	20 %	40 %	20 %	152982107
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