MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinobacillus succinogenes 130Z chromosome

Total Repeats: 887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009655	AATCAA	2	12	2493	2504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977690
2	NC_009655	ATCTTT	2	12	9982	9993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977697
3	NC_009655	CTATCC	2	12	11327	11338	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009655	AAAAAG	2	12	16654	16665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152977706
5	NC_009655	ATCAAT	2	12	19711	19722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977709
6	NC_009655	CGCCTG	2	12	21175	21186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152977709
7	NC_009655	AAAATA	2	12	30870	30881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009655	ATTTCA	2	12	34951	34962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009655	GCCTTC	2	12	38479	38490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009655	TCCCTC	2	12	39585	39596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152977718
11	NC_009655	AAGACA	2	12	42616	42627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152977721
12	NC_009655	AAAATA	2	12	47064	47075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009655	CCACTT	2	12	48881	48892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977727
14	NC_009655	CTTTAT	2	12	59247	59258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977732
15	NC_009655	GGAAAC	2	12	60830	60841	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152977734
16	NC_009655	GCAATT	2	12	61546	61557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977735
17	NC_009655	TGCCAT	2	12	64579	64590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977739
18	NC_009655	TCCGCT	2	12	67457	67468	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977740
19	NC_009655	ACTTTC	2	12	72586	72597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152977744
20	NC_009655	ACGCTG	2	12	72673	72684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977744
21	NC_009655	GCTTCC	2	12	75022	75033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977745
22	NC_009655	CACCCA	2	12	81698	81709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152977751
23	NC_009655	CCGTCA	2	12	90566	90577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977760
24	NC_009655	GATGCG	2	12	90688	90699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977760
25	NC_009655	ATTTTT	2	12	92060	92071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	152977761
26	NC_009655	CGTCAT	2	12	93615	93626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977764
27	NC_009655	CGACCG	2	12	93629	93640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977764
28	NC_009655	GAACTG	2	12	98841	98852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152977769
29	NC_009655	ATTCCG	2	12	100489	100500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152977770
30	NC_009655	AAAATC	2	12	103211	103222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977772
31	NC_009655	GGCATT	2	12	103324	103335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977772
32	NC_009655	TACGGT	2	12	107071	107082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977775
33	NC_009655	TTTTCC	2	12	108054	108065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152977777
34	NC_009655	TTAACC	2	12	112572	112583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152977781
35	NC_009655	CAGCCC	2	12	115572	115583	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	152977782
36	NC_009655	AAACCA	2	12	122467	122478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152977789
37	NC_009655	CGGTTA	2	12	123232	123243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977789
38	NC_009655	CAATAA	2	12	125173	125184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977791
39	NC_009655	TTCCCA	2	12	126869	126880	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977792
40	NC_009655	CCGCGC	2	12	129710	129721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152977795
41	NC_009655	CTTTGG	2	12	131634	131645	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977797
42	NC_009655	AAAAAT	2	12	132642	132653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009655	CAATAA	6	36	133035	133070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009655	GAAAGC	2	12	137410	137421	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152977801
45	NC_009655	CGGCAT	2	12	138924	138935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977801
46	NC_009655	CCATGA	2	12	151561	151572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977812
47	NC_009655	ACTAAA	2	12	153362	153373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	152977814
48	NC_009655	GTAAAA	2	12	153467	153478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977814
49	NC_009655	TTGCGG	2	12	156140	156151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152977816
50	NC_009655	GATAAA	2	12	159063	159074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977818
51	NC_009655	CCGCAA	2	12	159458	159469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977818
52	NC_009655	CCGCAG	2	12	162320	162331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977821
53	NC_009655	TAACTG	2	12	166454	166465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977827
54	NC_009655	TATTCA	2	12	167209	167220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152977827
55	NC_009655	CACCAT	2	12	167375	167386	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152977827
56	NC_009655	TTCGGA	2	12	167934	167945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977828
57	NC_009655	CTTATT	2	12	168524	168535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977828
58	NC_009655	TTCGCC	2	12	168834	168845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152977828
59	NC_009655	GGCTGC	2	12	169735	169746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152977829
60	NC_009655	TGTCGG	2	12	172490	172501	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152977831
61	NC_009655	CCGATG	2	12	177300	177311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977835
62	NC_009655	TATCAA	2	12	178643	178654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977835
63	NC_009655	AAACCA	2	12	186332	186343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152977842
64	NC_009655	TTTTCA	2	12	190439	190450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977846
65	NC_009655	GTTGCT	2	12	191803	191814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977848
66	NC_009655	GGTTAA	2	12	193517	193528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152977849
67	NC_009655	GCGGAA	2	12	193910	193921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152977850
68	NC_009655	ACCGAA	2	12	193958	193969	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977850
69	NC_009655	TCAGCA	2	12	194764	194775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977851
70	NC_009655	CGGCAA	2	12	195065	195076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977851
71	NC_009655	TTCCGG	2	12	196587	196598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977852
72	NC_009655	ATCGGT	2	12	198112	198123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977853
73	NC_009655	CATCGA	2	12	198663	198674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977853
74	NC_009655	TGTTGA	2	12	203361	203372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152977856
75	NC_009655	AGTAAA	2	12	205409	205420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152977858
76	NC_009655	GCTTTA	2	12	208404	208415	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152977861
77	NC_009655	GCGTCG	2	12	211606	211617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152977864
78	NC_009655	ATACCG	2	12	212065	212076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977864
79	NC_009655	TTTTCC	2	12	213334	213345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152977866
80	NC_009655	GGCGCC	2	12	215158	215169	0 %	0 %	50 %	50 %	152977868
81	NC_009655	TCGGTT	2	12	218045	218056	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152977869
82	NC_009655	TGGCAT	2	12	221434	221445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977871
83	NC_009655	TCGGCA	2	12	226811	226822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977877
84	NC_009655	CATTGT	2	12	231909	231920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152977881
85	NC_009655	CCATCG	2	12	235705	235716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977885
86	NC_009655	GTTTAA	2	12	237152	237163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152977887
87	NC_009655	TTTTTC	2	12	238536	238547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152977889
88	NC_009655	AGGCGT	2	12	239026	239037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977889
89	NC_009655	GTATGC	2	12	239149	239160	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977889
90	NC_009655	ATCCGC	2	12	241391	241402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152977891
91	NC_009655	GTCTTT	2	12	243345	243356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152977893
92	NC_009655	CGGACA	2	12	247439	247450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977897
93	NC_009655	CCAAAC	2	12	248506	248517	50 %	0 %	0 %	50 %	152977898
94	NC_009655	GACCAA	2	12	250034	250045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977899
95	NC_009655	ATTTTC	2	12	250430	250441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152977899
96	NC_009655	CTTGCG	2	12	251186	251197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977900
97	NC_009655	AGCCCA	2	12	254121	254132	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977903
98	NC_009655	TTAAAA	2	12	258670	258681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009655	CGAACC	2	12	259174	259185	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977908
100	NC_009655	ACTTCT	2	12	260026	260037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152977909
101	NC_009655	GAACCG	2	12	260735	260746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152977910
102	NC_009655	CGGATA	2	12	261252	261263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152977911
103	NC_009655	GGATGC	2	12	264969	264980	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152977914
104	NC_009655	TAGCTG	2	12	269408	269419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009655	AGGTAA	2	12	270047	270058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152977920
106	NC_009655	AAAATA	2	12	273126	273137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009655	GCAGCC	2	12	274691	274702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977924
108	NC_009655	ACGGTT	2	12	274725	274736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152977924
109	NC_009655	TAAAAA	2	12	276920	276931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009655	CAACCG	2	12	277232	277243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977927
111	NC_009655	TTCGTC	2	12	278780	278791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152977929
112	NC_009655	AAATCC	2	12	285679	285690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152977938
113	NC_009655	TACGGC	2	12	286004	286015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152977938
114	NC_009655	AGCAAT	2	12	291910	291921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152977944
115	NC_009655	AAACTT	2	12	293189	293200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977944
116	NC_009655	TGCGCT	2	12	295184	295195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977946
117	NC_009655	AATCTG	2	12	303840	303851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977954
118	NC_009655	CCGCTT	2	12	306356	306367	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009655	GGCACC	2	12	312975	312986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152977962
120	NC_009655	CATTAA	2	12	313056	313067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977962
121	NC_009655	CAACAG	2	12	315808	315819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152977964
122	NC_009655	AACGCT	2	12	316104	316115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152977964
123	NC_009655	GTTCTT	2	12	316888	316899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152977964
124	NC_009655	ATTTCA	2	12	320247	320258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009655	GCCTTC	2	12	323775	323786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009655	CAGCGG	2	12	330598	330609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152977974
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128	NC_009655	TTCCGG	2	12	331917	331928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977975
129	NC_009655	GGTTCC	2	12	332254	332265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152977975
130	NC_009655	TTCCAC	2	12	332647	332658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	152977976
131	NC_009655	GCAACC	2	12	336970	336981	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152977982
132	NC_009655	AAACTT	2	12	346239	346250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152977990
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136	NC_009655	TGCAAT	2	12	351176	351187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152977996
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138	NC_009655	TTGAGG	2	12	360028	360039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009655	CGAAAC	2	12	367117	367128	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152978006
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141	NC_009655	ATATTT	2	12	369308	369319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009655	TGGCTT	2	12	369579	369590	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152978008
143	NC_009655	TTCCGC	2	12	375308	375319	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152978014
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148	NC_009655	GGATGC	2	12	392637	392648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152978030
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171	NC_009655	ATTTAC	2	12	457248	457259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_009655	TATCCG	2	12	458880	458891	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978089
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179	NC_009655	GCAGGT	2	12	466484	466495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152978095
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186	NC_009655	GATTAT	2	12	499450	499461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152978125
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205	NC_009655	ATATCA	2	12	536399	536410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152978171
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213	NC_009655	TTTTTA	2	12	553248	553259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_009655	ACCGAT	2	12	553662	553673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152978184
215	NC_009655	GAAATA	2	12	558471	558482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152978189
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219	NC_009655	TGAAAT	2	12	566946	566957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
220	NC_009655	GTTAAG	2	12	568941	568952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152978195
221	NC_009655	TCTAAA	2	12	572433	572444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152978201
222	NC_009655	GGCGTT	2	12	578831	578842	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152978208
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226	NC_009655	TATTTT	2	12	587747	587758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	152978215
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228	NC_009655	GTTTAC	2	12	591501	591512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152978218
229	NC_009655	TCGTTA	2	12	593529	593540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_009655	TAGGAT	2	12	593647	593658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
231	NC_009655	GCCTTC	2	12	597703	597714	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152978225
232	NC_009655	ACAATC	2	12	605756	605767	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152978229
233	NC_009655	ATGCCA	2	12	605991	606002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152978229
234	NC_009655	ACCGGC	2	12	607625	607636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152978230
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283	NC_009655	TCCAGT	2	12	748835	748846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152978367
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340	NC_009655	TATTAA	2	12	878455	878466	50 %	50 %	0 %	0 %	152978494
341	NC_009655	CGGAAG	2	12	883030	883041	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152978497
342	NC_009655	TGTGGG	2	12	883594	883605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
343	NC_009655	AATTTG	2	12	889371	889382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152978503
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346	NC_009655	TATATT	2	12	897356	897367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_009655	CGGCAT	2	12	898409	898420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152978515
348	NC_009655	GGATTT	2	12	899630	899641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152978515
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350	NC_009655	TTGCGA	2	12	901722	901733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
351	NC_009655	CTGGCG	2	12	904373	904384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152978521
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358	NC_009655	TGAAAT	2	12	915571	915582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_009655	AACGTA	2	12	977242	977253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152978585
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444	NC_009655	TGGCGG	2	12	1151296	1151307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	152978720
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446	NC_009655	ATTCGT	2	12	1155655	1155666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152978726
447	NC_009655	GTTCAA	2	12	1173600	1173611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152978740
448	NC_009655	CATATT	2	12	1178764	1178775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152978746
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450	NC_009655	TGAAAT	2	12	1184586	1184597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009655	CATTAA	2	12	1188244	1188255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152978749
452	NC_009655	TGGGAA	2	12	1189391	1189402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152978750
453	NC_009655	TTGAAT	2	12	1190351	1190362	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152978751
454	NC_009655	TTTGGT	2	12	1193527	1193538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152978753
455	NC_009655	TCGCCG	2	12	1193919	1193930	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152978753
456	NC_009655	TATCCA	2	12	1194319	1194330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152978753
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458	NC_009655	AATTTC	2	12	1205153	1205164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152978761
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