MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus succinogenes 130Z chromosome

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009655	CTATCC	2	12	11327	11338	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009655	AAAATA	2	12	30870	30881	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009655	ATTTCA	2	12	34951	34962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009655	GCCTTC	2	12	38479	38490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009655	AAAATA	2	12	47064	47075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009655	AAAAAT	2	12	132642	132653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009655	CAATAA	6	36	133035	133070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009655	TTAAAA	2	12	258670	258681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009655	TAGCTG	2	12	269408	269419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009655	AAAATA	2	12	273126	273137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009655	TAAAAA	2	12	276920	276931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009655	CCGCTT	2	12	306356	306367	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009655	ATTTCA	2	12	320247	320258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009655	GCCTTC	2	12	323775	323786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009655	TTGAGG	2	12	360028	360039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009655	ATATTT	2	12	369308	369319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009655	ATTTAC	2	12	457248	457259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009655	TATTTT	2	12	492946	492957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009655	AAGATT	2	12	530489	530500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009655	TTTTTA	2	12	553248	553259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009655	CGAAGG	2	12	563570	563581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009655	TGAAAT	2	12	566946	566957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009655	TCGTTA	2	12	593529	593540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009655	TAGGAT	2	12	593647	593658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009655	TAAATA	2	12	705779	705790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009655	ATGAAA	2	12	709448	709459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009655	TTTTAA	2	12	747389	747400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009655	TACGGT	2	12	778989	779000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009655	ATTTTT	2	12	789365	789376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009655	TTTTAA	2	12	832097	832108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009655	CCGAGC	2	12	832466	832477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009655	TGTGGG	2	12	883594	883605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009655	TATATT	2	12	897356	897367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009655	TTGCGA	2	12	901722	901733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009655	CGAAGG	2	12	912195	912206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009655	TGAAAT	2	12	915571	915582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009655	GGAAAA	2	12	955196	955207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009655	GGCTGT	2	12	973754	973765	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009655	GATAAA	2	12	988627	988638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009655	GGAACA	2	12	1083749	1083760	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009655	CAACTG	2	12	1084149	1084160	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009655	ATCAAA	2	12	1098897	1098908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009655	TTTAAA	2	12	1115416	1115427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009655	CGAAGG	2	12	1131265	1131276	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009655	TGAAAT	2	12	1134794	1134805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009655	AGACCT	2	12	1149401	1149412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009655	CGAAGG	2	12	1181210	1181221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009655	TGAAAT	2	12	1184586	1184597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009655	TAATTA	2	12	1209420	1209431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009655	GTTTTT	2	12	1263885	1263896	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009655	TTAATT	2	12	1271343	1271354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009655	TCGATC	2	12	1320730	1320741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009655	TTTGTT	2	12	1350222	1350233	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009655	AAGTTT	2	12	1350285	1350296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009655	GGGTGG	2	12	1380982	1380993	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009655	CCGTTA	2	12	1411366	1411377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009655	GGGAAA	2	12	1446840	1446851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009655	TTTAAT	2	12	1446945	1446956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009655	AAATCT	2	12	1467213	1467224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009655	TTTTTA	2	12	1485260	1485271	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009655	CTTTTG	2	12	1491298	1491309	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009655	ATTTTC	2	12	1541549	1541560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009655	GTTAAC	2	12	1549286	1549297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009655	AAAATA	2	12	1605080	1605091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009655	CTTTTG	2	12	1608883	1608894	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009655	GATCTA	2	12	1631990	1632001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009655	GAATAT	2	12	1638068	1638079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009655	CAATTT	2	12	1638162	1638173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009655	TTAAAA	2	12	1639227	1639238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009655	TAAAAA	2	12	1645973	1645984	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009655	TTCCTT	2	12	1657496	1657507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009655	AAAAAG	2	12	1660976	1660987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009655	AAAAAC	2	12	1665196	1665207	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009655	TTTTTC	2	12	1672345	1672356	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009655	AACACC	2	12	1703193	1703204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009655	TTTACA	2	12	1713588	1713599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009655	AAATTA	2	12	1750146	1750157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009655	CGAATC	2	12	1770775	1770786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009655	CAGGGA	2	12	1812573	1812584	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009655	TCTTTA	2	12	1818770	1818781	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009655	TAATTT	2	12	1863785	1863796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009655	AAAAAT	2	12	1887286	1887297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009655	ATTTAA	2	12	1969328	1969339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009655	GGCTTT	2	12	1971881	1971892	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009655	ATAAAA	2	12	1980238	1980249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009655	ATTTTT	2	12	1989564	1989575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009655	CGTTAT	2	12	2030792	2030803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009655	CTTTTA	2	12	2039772	2039783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009655	AAATTA	2	12	2072792	2072803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009655	CCTAGT	2	12	2073229	2073240	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009655	GATCAA	2	12	2108033	2108044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009655	ATTGCT	2	12	2158307	2158318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009655	GACTGT	2	12	2181680	2181691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009655	CGAAAA	2	12	2199132	2199143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009655	ACAGAC	2	12	2221374	2221385	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009655	TTGAGG	2	12	2302158	2302169	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009655	ATTTGG	2	12	2307686	2307697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.