MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus succinogenes 130Z chromosome

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009655	TATAG	2	10	30529	30538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009655	GAAAT	2	10	30576	30585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009655	AATTA	2	10	30820	30829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009655	TAACC	2	10	35530	35539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009655	CGACT	2	10	35858	35867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009655	TCGGT	2	10	36233	36242	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009655	TCGCT	2	10	36459	36468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009655	AATGA	2	10	36917	36926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009655	GCTTT	2	10	37615	37624	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009655	CTTTT	2	10	45539	45548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009655	CTATT	2	10	85575	85584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009655	TAAAA	2	10	93182	93191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009655	TAAGT	2	10	96016	96025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009655	TGTTC	2	10	96168	96177	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009655	CGATC	2	10	113478	113487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009655	GAATT	2	10	130269	130278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009655	AATAA	2	10	132715	132724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009655	ATTTT	2	10	173370	173379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009655	TCGAT	2	10	194095	194104	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009655	TCAAA	2	10	210621	210630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009655	CTGTT	2	10	210872	210881	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009655	GTTTA	2	10	216274	216283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009655	ATAAA	2	10	222059	222068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009655	AAATT	2	10	225586	225595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009655	GATAA	2	10	230101	230110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009655	CTATT	2	10	237869	237878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009655	GATCA	2	10	246065	246074	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009655	CAAAA	2	10	256940	256949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009655	TTTAC	2	10	259762	259771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009655	AAAAT	2	10	267138	267147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009655	CGATT	2	10	276850	276859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009655	TCCCA	2	10	281058	281067	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_009655	AGTTT	2	10	289643	289652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009655	GAAAA	2	10	312331	312340	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009655	AAATT	2	10	318987	318996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009655	TAACC	2	10	320826	320835	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009655	CGACT	2	10	321154	321163	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009655	TCGGT	2	10	321529	321538	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009655	TCGCT	2	10	321755	321764	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009655	AATGA	2	10	322213	322222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009655	GCTTT	2	10	322911	322920	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009655	AAACA	2	10	347789	347798	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009655	GTTTC	2	10	364227	364236	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009655	GTTAA	2	10	375925	375934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009655	TTTTA	2	10	380292	380301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009655	AAAGA	2	10	389964	389973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009655	ATAAA	2	10	400258	400267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009655	TTAAA	2	10	436951	436960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009655	ATTTA	2	10	437537	437546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009655	ATAAA	2	10	449580	449589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009655	AGTTT	2	10	458128	458137	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009655	AAAGA	2	10	461628	461637	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009655	TATCA	2	10	467656	467665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009655	TTATT	2	10	482758	482767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009655	GGGGA	2	10	482882	482891	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009655	GATTT	2	10	489878	489887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009655	TTTTA	2	10	491210	491219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009655	CGGAA	2	10	494743	494752	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009655	AACGG	2	10	494777	494786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009655	GAAAA	2	10	509671	509680	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009655	ATTAA	2	10	522358	522367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009655	GCTCA	2	10	527950	527959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009655	CAGGG	2	10	533114	533123	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009655	TCTAC	2	10	538830	538839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_009655	TCTTT	2	10	543321	543330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009655	TCGGT	2	10	553149	553158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009655	AAGAA	2	10	554934	554943	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009655	GTTTA	2	10	564759	564768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009655	AGCGA	2	10	565440	565449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009655	AGTCG	2	10	566041	566050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009655	AGGTT	2	10	566368	566377	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009655	TTTTG	2	10	570595	570604	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009655	TTTTA	2	10	589876	589885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009655	ATGAA	2	10	598083	598092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009655	TATGC	2	10	649593	649602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009655	CATCA	2	10	678356	678365	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009655	ATTTT	2	10	689050	689059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009655	CAAAA	2	10	694538	694547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009655	TTTAC	2	10	698952	698961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009655	TTTAC	2	10	705705	705714	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009655	CGTTA	2	10	721341	721350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009655	ATTGA	2	10	723533	723542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009655	ACAGC	3	15	731147	731161	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009655	TTTGT	2	10	735878	735887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009655	TTTTC	2	10	743040	743049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009655	TTTAT	2	10	754097	754106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009655	AAACG	2	10	767240	767249	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009655	AAGAT	2	10	779620	779629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009655	ACTTT	2	10	780595	780604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009655	ATTTT	2	10	795448	795457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009655	CGAAA	2	10	808122	808131	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009655	TTTTA	2	10	814446	814455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009655	GTTTT	2	10	822978	822987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009655	TTTCA	2	10	824486	824495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009655	TTTAT	2	10	830074	830083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009655	ATAAA	2	10	843938	843947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009655	GCGGG	2	10	853554	853563	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009655	GTAGA	2	10	871015	871024	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009655	GTTTA	2	10	913384	913393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009655	AGCGA	2	10	914065	914074	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009655	AGTCG	2	10	914666	914675	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009655	AGGTT	2	10	914993	915002	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009655	TAAGG	2	10	924415	924424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009655	TCAGG	2	10	933691	933700	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009655	AAATC	2	10	947878	947887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009655	GAATG	2	10	968576	968585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009655	AACAA	2	10	973198	973207	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009655	AAAAT	2	10	973567	973576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009655	TTTGT	2	10	973801	973810	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009655	CTTTT	2	10	973889	973898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009655	AAATA	2	10	981773	981782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009655	CTTTT	2	10	994018	994027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009655	TAGTT	2	10	1000458	1000467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009655	TGTAG	2	10	1002218	1002227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009655	TGTTT	2	10	1005012	1005021	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009655	ATTTA	2	10	1015095	1015104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009655	GCACA	2	10	1024076	1024085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009655	AGCAA	2	10	1052469	1052478	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009655	TCGCT	2	10	1052559	1052568	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009655	AAAAG	2	10	1071591	1071600	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009655	TATGC	2	10	1081607	1081616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009655	CTGAG	2	10	1082048	1082057	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009655	TATAT	2	10	1083312	1083321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009655	TTCCG	2	10	1083911	1083920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009655	CCCGT	2	10	1084363	1084372	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_009655	CCGTG	2	10	1084564	1084573	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009655	TAAAT	2	10	1093654	1093663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009655	GAGAA	2	10	1094189	1094198	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009655	TAAAT	2	10	1094798	1094807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009655	GGAAA	2	10	1102232	1102241	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009655	AATCC	2	10	1108075	1108084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009655	CTTTT	2	10	1108196	1108205	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009655	GGGCG	2	10	1120348	1120357	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009655	GTTTA	2	10	1132607	1132616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009655	AGCGA	2	10	1133288	1133297	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009655	AGTCG	2	10	1133889	1133898	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009655	AGGTT	2	10	1134216	1134225	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009655	TGCTT	2	10	1157793	1157802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009655	TAGTC	2	10	1159016	1159025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009655	GTTTA	2	10	1182399	1182408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009655	AGCGA	2	10	1183080	1183089	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009655	AGTCG	2	10	1183681	1183690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009655	AGGTT	2	10	1184008	1184017	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009655	TAAAA	2	10	1196344	1196353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009655	AAGTT	2	10	1206922	1206931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009655	ACAGA	2	10	1229968	1229977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_009655	ACGTT	2	10	2256768	2256777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_009655	TTTTA	2	10	2273593	2273602	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009655	GCAAA	2	10	2283298	2283307	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_009655	AAACG	2	10	2286350	2286359	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_009655	GCATT	2	10	2301039	2301048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_009655	CTCAA	2	10	2301117	2301126	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
268	NC_009655	CTTGC	2	10	2302432	2302441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_009655	ATAAA	2	10	2317164	2317173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.