MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN5

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009651	GGCG	2	8	1287	1294	0 %	0 %	75 %	25 %	152973734
2	NC_009651	CAGC	2	8	1604	1611	25 %	0 %	25 %	50 %	152973734
3	NC_009651	CAGC	2	8	2159	2166	25 %	0 %	25 %	50 %	152973735
4	NC_009651	CGGG	2	8	2978	2985	0 %	0 %	75 %	25 %	152973736
5	NC_009651	CCGC	2	8	3385	3392	0 %	0 %	25 %	75 %	152973736
6	NC_009651	CATC	2	8	5855	5862	25 %	25 %	0 %	50 %	152973740
7	NC_009651	GACG	2	8	7976	7983	25 %	0 %	50 %	25 %	152973743
8	NC_009651	GAGG	2	8	8042	8049	25 %	0 %	75 %	0 %	152973743
9	NC_009651	AGGC	2	8	8108	8115	25 %	0 %	50 %	25 %	152973743
10	NC_009651	CAGC	2	8	8131	8138	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
11	NC_009651	AGCC	2	8	8310	8317	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
12	NC_009651	GCCA	2	8	8362	8369	25 %	0 %	25 %	50 %	152973743
13	NC_009651	CATC	2	8	8964	8971	25 %	25 %	0 %	50 %	152973745
14	NC_009651	CGTC	2	8	9695	9702	0 %	25 %	25 %	50 %	229269517
15	NC_009651	TCTG	2	8	9716	9723	0 %	50 %	25 %	25 %	229269517
16	NC_009651	GAAT	2	8	9824	9831	50 %	25 %	25 %	0 %	229269517
17	NC_009651	GGCG	2	8	10946	10953	0 %	0 %	75 %	25 %	152973748
18	NC_009651	CAGC	2	8	11263	11270	25 %	0 %	25 %	50 %	152973748
19	NC_009651	CTGC	2	8	11694	11701	0 %	25 %	25 %	50 %	152973749
20	NC_009651	TCTG	2	8	12501	12508	0 %	50 %	25 %	25 %	152973750
21	NC_009651	GGCT	2	8	13578	13585	0 %	25 %	50 %	25 %	152973751
22	NC_009651	CTGG	2	8	14127	14134	0 %	25 %	50 %	25 %	152973752
23	NC_009651	CGGT	2	8	14239	14246	0 %	25 %	50 %	25 %	152973752
24	NC_009651	CGCC	2	8	14294	14301	0 %	0 %	25 %	75 %	152973752
25	NC_009651	CCGA	2	8	14809	14816	25 %	0 %	25 %	50 %	152973752
26	NC_009651	ATGC	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	152973753
27	NC_009651	GCAG	2	8	18930	18937	25 %	0 %	50 %	25 %	152973754
28	NC_009651	TCTG	2	8	19149	19156	0 %	50 %	25 %	25 %	152973754
29	NC_009651	GAAA	2	8	19320	19327	75 %	0 %	25 %	0 %	152973754
30	NC_009651	GTCA	2	8	19908	19915	25 %	25 %	25 %	25 %	152973756
31	NC_009651	CGTG	2	8	20325	20332	0 %	25 %	50 %	25 %	152973756
32	NC_009651	ACCC	2	8	20710	20717	25 %	0 %	0 %	75 %	152973756
33	NC_009651	CACC	2	8	20968	20975	25 %	0 %	0 %	75 %	152973756
34	NC_009651	GGCG	2	8	23400	23407	0 %	0 %	75 %	25 %	152973759
35	NC_009651	CAGC	2	8	23717	23724	25 %	0 %	25 %	50 %	152973759
36	NC_009651	CAAT	2	8	25068	25075	50 %	25 %	0 %	25 %	152973761
37	NC_009651	CTTT	2	8	25243	25250	0 %	75 %	0 %	25 %	152973761
38	NC_009651	ATAA	2	8	25312	25319	75 %	25 %	0 %	0 %	152973761
39	NC_009651	AATA	2	8	25583	25590	75 %	25 %	0 %	0 %	152973762
40	NC_009651	AATG	2	8	25633	25640	50 %	25 %	25 %	0 %	152973762
41	NC_009651	GCAG	2	8	25954	25961	25 %	0 %	50 %	25 %	152973762
42	NC_009651	ATTT	2	8	26165	26172	25 %	75 %	0 %	0 %	152973762
43	NC_009651	GGCG	2	8	26342	26349	0 %	0 %	75 %	25 %	152973763
44	NC_009651	GGCT	2	8	27000	27007	0 %	25 %	50 %	25 %	152973764
45	NC_009651	TTTC	2	8	27562	27569	0 %	75 %	0 %	25 %	152973765
46	NC_009651	GCCA	2	8	27586	27593	25 %	0 %	25 %	50 %	152973765
47	NC_009651	ATTC	2	8	27635	27642	25 %	50 %	0 %	25 %	152973765
48	NC_009651	GGCG	2	8	28524	28531	0 %	0 %	75 %	25 %	152973766
49	NC_009651	CAGC	2	8	28841	28848	25 %	0 %	25 %	50 %	152973766
50	NC_009651	ATTG	2	8	29296	29303	25 %	50 %	25 %	0 %	152973767
51	NC_009651	TATG	2	8	29338	29345	25 %	50 %	25 %	0 %	152973767
52	NC_009651	TTGA	2	8	30473	30480	25 %	50 %	25 %	0 %	152973768
53	NC_009651	AATA	2	8	30822	30829	75 %	25 %	0 %	0 %	152973768
54	NC_009651	TTCT	2	8	31185	31192	0 %	75 %	0 %	25 %	152973769
55	NC_009651	TGAT	2	8	31489	31496	25 %	50 %	25 %	0 %	152973769
56	NC_009651	AGCG	2	8	32971	32978	25 %	0 %	50 %	25 %	152973770
57	NC_009651	GAGC	2	8	32998	33005	25 %	0 %	50 %	25 %	152973770
58	NC_009651	TTGC	2	8	33050	33057	0 %	50 %	25 %	25 %	152973770
59	NC_009651	GTTT	2	8	33620	33627	0 %	75 %	25 %	0 %	152973770
60	NC_009651	CGGC	2	8	34737	34744	0 %	0 %	50 %	50 %	152973771
61	NC_009651	TGGC	2	8	34766	34773	0 %	25 %	50 %	25 %	152973771
62	NC_009651	GGAT	2	8	35093	35100	25 %	25 %	50 %	0 %	152973772
63	NC_009651	AGAA	2	8	35112	35119	75 %	0 %	25 %	0 %	152973772
64	NC_009651	AGCC	2	8	35242	35249	25 %	0 %	25 %	50 %	152973772
65	NC_009651	AGAC	2	8	35540	35547	50 %	0 %	25 %	25 %	152973773
66	NC_009651	GCAA	2	8	35817	35824	50 %	0 %	25 %	25 %	152973773
67	NC_009651	TGCC	2	8	35976	35983	0 %	25 %	25 %	50 %	152973773
68	NC_009651	GCTG	2	8	37201	37208	0 %	25 %	50 %	25 %	152973774
69	NC_009651	TCAA	2	8	37273	37280	50 %	25 %	0 %	25 %	152973774
70	NC_009651	CGCC	2	8	38001	38008	0 %	0 %	25 %	75 %	152973775
71	NC_009651	ATCG	2	8	38105	38112	25 %	25 %	25 %	25 %	152973775
72	NC_009651	CTGG	2	8	38543	38550	0 %	25 %	50 %	25 %	152973776
73	NC_009651	GGCG	2	8	39954	39961	0 %	0 %	75 %	25 %	152973777
74	NC_009651	CAGC	2	8	40271	40278	25 %	0 %	25 %	50 %	152973777
75	NC_009651	GCCT	2	8	41109	41116	0 %	25 %	25 %	50 %	152973778
76	NC_009651	TTAT	2	8	41735	41742	25 %	75 %	0 %	0 %	152973779
77	NC_009651	CTGA	2	8	43221	43228	25 %	25 %	25 %	25 %	152973780
78	NC_009651	ACTT	2	8	43783	43790	25 %	50 %	0 %	25 %	152973781
79	NC_009651	GACT	2	8	45130	45137	25 %	25 %	25 %	25 %	152973782
80	NC_009651	AACG	2	8	45302	45309	50 %	0 %	25 %	25 %	152973782
81	NC_009651	TAAG	2	8	46359	46366	50 %	25 %	25 %	0 %	152973783
82	NC_009651	GGCT	2	8	46401	46408	0 %	25 %	50 %	25 %	152973783
83	NC_009651	CCTG	2	8	46410	46417	0 %	25 %	25 %	50 %	152973783
84	NC_009651	GCTG	2	8	46878	46885	0 %	25 %	50 %	25 %	152973783
85	NC_009651	ACCG	2	8	47882	47889	25 %	0 %	25 %	50 %	152973783
86	NC_009651	CTGC	2	8	47910	47917	0 %	25 %	25 %	50 %	152973783
87	NC_009651	CCCG	2	8	48021	48028	0 %	0 %	25 %	75 %	152973783
88	NC_009651	CGGG	2	8	48690	48697	0 %	0 %	75 %	25 %	152973784
89	NC_009651	TCCA	2	8	49181	49188	25 %	25 %	0 %	50 %	152973784
90	NC_009651	GCAC	2	8	49556	49563	25 %	0 %	25 %	50 %	152973784
91	NC_009651	GCTG	2	8	49605	49612	0 %	25 %	50 %	25 %	152973784
92	NC_009651	TGTT	2	8	49632	49639	0 %	75 %	25 %	0 %	152973784
93	NC_009651	GGCG	2	8	50364	50371	0 %	0 %	75 %	25 %	152973785
94	NC_009651	GCTG	2	8	50537	50544	0 %	25 %	50 %	25 %	152973785
95	NC_009651	GTCA	2	8	50930	50937	25 %	25 %	25 %	25 %	152973785
96	NC_009651	GCTG	2	8	50992	50999	0 %	25 %	50 %	25 %	152973785
97	NC_009651	TGGC	2	8	51752	51759	0 %	25 %	50 %	25 %	152973787
98	NC_009651	TGAA	2	8	52689	52696	50 %	25 %	25 %	0 %	152973789
99	NC_009651	AGTC	2	8	53240	53247	25 %	25 %	25 %	25 %	152973789
100	NC_009651	CGGC	2	8	53928	53935	0 %	0 %	50 %	50 %	152973790
101	NC_009651	CAGC	2	8	53995	54002	25 %	0 %	25 %	50 %	152973790
102	NC_009651	TGGG	2	8	55586	55593	0 %	25 %	75 %	0 %	152973792
103	NC_009651	TGGC	2	8	55955	55962	0 %	25 %	50 %	25 %	152973792
104	NC_009651	CCGT	2	8	56850	56857	0 %	25 %	25 %	50 %	152973793
105	NC_009651	TGTA	2	8	57786	57793	25 %	50 %	25 %	0 %	152973794
106	NC_009651	ATGG	2	8	58348	58355	25 %	25 %	50 %	0 %	152973794
107	NC_009651	GCGA	2	8	59374	59381	25 %	0 %	50 %	25 %	152973795
108	NC_009651	GGCG	2	8	59887	59894	0 %	0 %	75 %	25 %	152973796
109	NC_009651	ACCC	2	8	60420	60427	25 %	0 %	0 %	75 %	152973796
110	NC_009651	GCCG	2	8	60623	60630	0 %	0 %	50 %	50 %	152973796
111	NC_009651	GCGA	2	8	60864	60871	25 %	0 %	50 %	25 %	152973796
112	NC_009651	ATGG	2	8	61360	61367	25 %	25 %	50 %	0 %	152973797
113	NC_009651	TGAG	2	8	61955	61962	25 %	25 %	50 %	0 %	152973798
114	NC_009651	TGCG	2	8	62279	62286	0 %	25 %	50 %	25 %	152973798
115	NC_009651	TTCT	2	8	62639	62646	0 %	75 %	0 %	25 %	152973799
116	NC_009651	CTCA	2	8	62867	62874	25 %	25 %	0 %	50 %	152973799
117	NC_009651	GCTG	2	8	63420	63427	0 %	25 %	50 %	25 %	152973800
118	NC_009651	ACTG	2	8	66816	66823	25 %	25 %	25 %	25 %	152973805
119	NC_009651	GGCG	2	8	67384	67391	0 %	0 %	75 %	25 %	152973806
120	NC_009651	CAGC	2	8	67701	67708	25 %	0 %	25 %	50 %	152973806
121	NC_009651	ATGA	2	8	68652	68659	50 %	25 %	25 %	0 %	152973807
122	NC_009651	TTTC	2	8	68780	68787	0 %	75 %	0 %	25 %	152973807
123	NC_009651	TGAT	2	8	68947	68954	25 %	50 %	25 %	0 %	152973807
124	NC_009651	CTGA	2	8	69299	69306	25 %	25 %	25 %	25 %	152973808
125	NC_009651	GCCA	2	8	69414	69421	25 %	0 %	25 %	50 %	152973809
126	NC_009651	GCTG	2	8	71767	71774	0 %	25 %	50 %	25 %	152973811
127	NC_009651	TGGG	2	8	72643	72650	0 %	25 %	75 %	0 %	152973812
128	NC_009651	CACG	2	8	74140	74147	25 %	0 %	25 %	50 %	152973813
129	NC_009651	CATC	2	8	74269	74276	25 %	25 %	0 %	50 %	152973813
130	NC_009651	CGAA	2	8	74644	74651	50 %	0 %	25 %	25 %	152973814
131	NC_009651	GACG	2	8	74666	74673	25 %	0 %	50 %	25 %	152973814
132	NC_009651	CGGG	2	8	75834	75841	0 %	0 %	75 %	25 %	152973815
133	NC_009651	GCTG	2	8	76914	76921	0 %	25 %	50 %	25 %	152973817
134	NC_009651	CGCC	2	8	77231	77238	0 %	0 %	25 %	75 %	152973817
135	NC_009651	CTGG	2	8	77605	77612	0 %	25 %	50 %	25 %	152973818
136	NC_009651	CGGG	2	8	78438	78445	0 %	0 %	75 %	25 %	152973818
137	NC_009651	ACGC	2	8	78875	78882	25 %	0 %	25 %	50 %	152973818
138	NC_009651	ATGA	2	8	78971	78978	50 %	25 %	25 %	0 %	152973818
139	NC_009651	CCGG	2	8	79120	79127	0 %	0 %	50 %	50 %	152973819
140	NC_009651	TATC	2	8	80073	80080	25 %	50 %	0 %	25 %	152973820
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.