MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973610
2	NC_009650	CGCCAG	2	12	11436	11447	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973621
3	NC_009650	ATGGGC	2	12	12063	12074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152973622
4	NC_009650	CCAGCG	2	12	17052	17063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973626
5	NC_009650	AGCGGC	2	12	20976	20987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009650	TTACCT	2	12	24319	24330	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152973633
7	NC_009650	AGCGCG	2	12	25418	25429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152973635
8	NC_009650	GGCAGG	2	12	25503	25514	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973635
9	NC_009650	GCGCTG	2	12	33019	33030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973649
10	NC_009650	GCCTTG	2	12	38085	38096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973653
11	NC_009650	CTTGGA	2	12	38726	38737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973653
12	NC_009650	CTGGTA	2	12	41314	41325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973655
13	NC_009650	CAAACT	2	12	42888	42899	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152973655
14	NC_009650	GATGCT	2	12	46924	46935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009650	CAGCTG	2	12	48499	48510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009650	CCGCAA	2	12	50920	50931	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152973663
17	NC_009650	GCTGCA	2	12	51781	51792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973664
18	NC_009650	GACGAA	2	12	54552	54563	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152973669
19	NC_009650	TTGCCG	2	12	55033	55044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009650	GAAAAA	2	12	58243	58254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152973675
21	NC_009650	CGAGGA	2	12	59091	59102	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152973676
22	NC_009650	GAAAGG	2	12	62059	62070	50 %	0 %	50 %	0 %	152973678
23	NC_009650	TGGTCA	2	12	63420	63431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973680
24	NC_009650	GGCAGG	2	12	65854	65865	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973684
25	NC_009650	GGCCTC	2	12	68803	68814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009650	TGGAGC	2	12	69259	69270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152973689
27	NC_009650	AAAATT	2	12	72326	72337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009650	TCTGAA	2	12	74353	74364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152973695
29	NC_009650	TGGAGA	2	12	81637	81648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152973708
30	NC_009650	CGCTGA	2	12	82021	82032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973708
31	NC_009650	CATCAC	2	12	83300	83311	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152973708
32	NC_009650	GGGAAG	2	12	87735	87746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973714
33	NC_009650	GGTCAC	2	12	87851	87862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973714
34	NC_009650	ACATCA	2	12	92369	92380	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152973722
35	NC_009650	GTTCAG	2	12	92968	92979	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973722
36	NC_009650	CTGATG	2	12	98551	98562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973727
37	NC_009650	GGATAA	2	12	100790	100801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973728
38	NC_009650	AGCGGG	2	12	102076	102087	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973728
39	NC_009650	GGATAA	2	12	104633	104644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973728
40	NC_009650	TTTGCC	2	12	106408	106419	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152973729
41	NC_009650	GCCGGT	2	12	107164	107175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.