MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973610
2	NC_009650	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973612
3	NC_009650	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009650	TCGCT	2	10	7462	7471	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009650	CCAAA	2	10	7693	7702	60 %	0 %	0 %	40 %	152973615
6	NC_009650	GGCCT	2	10	9342	9351	0 %	20 %	40 %	40 %	152973619
7	NC_009650	GAGCA	2	10	9531	9540	40 %	0 %	40 %	20 %	152973619
8	NC_009650	CGGCG	2	10	10944	10953	0 %	0 %	60 %	40 %	152973620
9	NC_009650	GGCCT	2	10	14623	14632	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009650	GAGCA	2	10	14812	14821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009650	TGATC	2	10	16021	16030	20 %	40 %	20 %	20 %	152973626
12	NC_009650	TCAGA	2	10	18148	18157	40 %	20 %	20 %	20 %	152973627
13	NC_009650	CGGTT	2	10	18360	18369	0 %	40 %	40 %	20 %	152973627
14	NC_009650	TGGGC	2	10	21043	21052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009650	AGGAA	2	10	21095	21104	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009650	CGGTT	2	10	21407	21416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009650	TTTAA	2	10	22795	22804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009650	GCTGC	2	10	25700	25709	0 %	20 %	40 %	40 %	152973636
19	NC_009650	TGGCG	2	10	27091	27100	0 %	20 %	60 %	20 %	152973637
20	NC_009650	GTCCG	2	10	27746	27755	0 %	20 %	40 %	40 %	229269515
21	NC_009650	AGGCC	2	10	27808	27817	20 %	0 %	40 %	40 %	229269515
22	NC_009650	GGCCG	2	10	27881	27890	0 %	0 %	60 %	40 %	229269515
23	NC_009650	TCAGG	2	10	29444	29453	20 %	20 %	40 %	20 %	152973641
24	NC_009650	CGGCG	2	10	29504	29513	0 %	0 %	60 %	40 %	152973641
25	NC_009650	TGTTT	2	10	29798	29807	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009650	GGACG	2	10	30329	30338	20 %	0 %	60 %	20 %	152973643
27	NC_009650	CAGTG	2	10	30904	30913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009650	ATCCG	2	10	32182	32191	20 %	20 %	20 %	40 %	152973647
29	NC_009650	CCAGG	2	10	32806	32815	20 %	0 %	40 %	40 %	152973649
30	NC_009650	ATCGT	2	10	33149	33158	20 %	40 %	20 %	20 %	152973649
31	NC_009650	CGGCA	2	10	33500	33509	20 %	0 %	40 %	40 %	152973649
32	NC_009650	GAAGA	2	10	34003	34012	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009650	AACTC	2	10	36390	36399	40 %	20 %	0 %	40 %	152973652
34	NC_009650	GCCAT	2	10	37368	37377	20 %	20 %	20 %	40 %	152973653
35	NC_009650	TGCTC	2	10	37873	37882	0 %	40 %	20 %	40 %	152973653
36	NC_009650	CTTGC	2	10	38516	38525	0 %	40 %	20 %	40 %	152973653
37	NC_009650	CATGA	2	10	43593	43602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009650	GGCAA	2	10	43850	43859	40 %	0 %	40 %	20 %	152973657
39	NC_009650	CTGAA	2	10	44572	44581	40 %	20 %	20 %	20 %	152973659
40	NC_009650	TGGAA	2	10	45836	45845	40 %	20 %	40 %	0 %	152973660
41	NC_009650	CTGTA	2	10	46425	46434	20 %	40 %	20 %	20 %	152973660
42	NC_009650	TCCTT	2	10	47752	47761	0 %	60 %	0 %	40 %	152973661
43	NC_009650	CTTTC	2	10	49503	49512	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009650	AGGGC	2	10	50637	50646	20 %	0 %	60 %	20 %	152973663
45	NC_009650	GGCCT	2	10	51118	51127	0 %	20 %	40 %	40 %	152973663
46	NC_009650	ACGGG	2	10	52371	52380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009650	CCGGC	2	10	52394	52403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_009650	TGATG	2	10	52642	52651	20 %	40 %	40 %	0 %	229269516
49	NC_009650	CCGTG	2	10	52666	52675	0 %	20 %	40 %	40 %	229269516
50	NC_009650	TCCGG	2	10	54707	54716	0 %	20 %	40 %	40 %	152973669
51	NC_009650	AGGGG	2	10	54800	54809	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009650	CCCGG	2	10	54883	54892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_009650	GCCGT	2	10	54931	54940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_009650	CTGCG	2	10	55355	55364	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009650	TGTCG	2	10	55406	55415	0 %	40 %	40 %	20 %	152973670
56	NC_009650	ATCAC	2	10	55841	55850	40 %	20 %	0 %	40 %	152973670
57	NC_009650	CAGGG	2	10	56681	56690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009650	CTCTC	2	10	56779	56788	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009650	CACCG	2	10	58650	58659	20 %	0 %	20 %	60 %	152973682
60	NC_009650	TTTCC	2	10	60927	60936	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009650	TCTGG	2	10	61928	61937	0 %	40 %	40 %	20 %	152973678
62	NC_009650	TGAAC	2	10	63404	63413	40 %	20 %	20 %	20 %	152973680
63	NC_009650	GCTGG	2	10	64338	64347	0 %	20 %	60 %	20 %	152973680
64	NC_009650	CTGCA	2	10	65055	65064	20 %	20 %	20 %	40 %	152973683
65	NC_009650	CGCTG	2	10	65748	65757	0 %	20 %	40 %	40 %	152973684
66	NC_009650	GTGAC	2	10	68455	68464	20 %	20 %	40 %	20 %	152973688
67	NC_009650	CAGTG	2	10	69310	69319	20 %	20 %	40 %	20 %	152973689
68	NC_009650	TTTCC	2	10	69802	69811	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_009650	CATTC	2	10	70554	70563	20 %	40 %	0 %	40 %	152973690
70	NC_009650	ATTCA	2	10	73344	73353	40 %	40 %	0 %	20 %	152973694
71	NC_009650	TTCAG	2	10	75627	75636	20 %	40 %	20 %	20 %	152973698
72	NC_009650	CGTGC	2	10	75999	76008	0 %	20 %	40 %	40 %	152973699
73	NC_009650	AAATG	2	10	80190	80199	60 %	20 %	20 %	0 %	152973705
74	NC_009650	TATTT	2	10	80807	80816	20 %	80 %	0 %	0 %	152973707
75	NC_009650	TACCG	2	10	83268	83277	20 %	20 %	20 %	40 %	152973708
76	NC_009650	TTCGG	2	10	83481	83490	0 %	40 %	40 %	20 %	152973708
77	NC_009650	ACCGT	2	10	84487	84496	20 %	20 %	20 %	40 %	152973710
78	NC_009650	TTCTG	2	10	85815	85824	0 %	60 %	20 %	20 %	152973712
79	NC_009650	AGTCC	2	10	85878	85887	20 %	20 %	20 %	40 %	152973712
80	NC_009650	GAAGG	2	10	87582	87591	40 %	0 %	60 %	0 %	152973714
81	NC_009650	TGGGG	2	10	91595	91604	0 %	20 %	80 %	0 %	152973721
82	NC_009650	GCGTG	2	10	93680	93689	0 %	20 %	60 %	20 %	152973723
83	NC_009650	GCAGC	2	10	95466	95475	20 %	0 %	40 %	40 %	152973723
84	NC_009650	TTTAT	2	10	98524	98533	20 %	80 %	0 %	0 %	152973727
85	NC_009650	CCTGT	2	10	100050	100059	0 %	40 %	20 %	40 %	152973727
86	NC_009650	ACCGT	2	10	100426	100435	20 %	20 %	20 %	40 %	152973727
87	NC_009650	TGACC	2	10	100979	100988	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
88	NC_009650	CACGA	2	10	101175	101184	40 %	0 %	20 %	40 %	152973728
89	NC_009650	GGACG	2	10	102224	102233	20 %	0 %	60 %	20 %	152973728
90	NC_009650	GACCT	2	10	103377	103386	20 %	20 %	20 %	40 %	152973728
91	NC_009650	AAGGA	2	10	104671	104680	60 %	0 %	40 %	0 %	152973728
92	NC_009650	CGGGC	2	10	105220	105229	0 %	0 %	60 %	40 %	152973728
93	NC_009650	CGTAT	2	10	106915	106924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009650	TGGTG	2	10	107047	107056	0 %	40 %	60 %	0 %	152973730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.