MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009650	TCGCT	2	10	7462	7471	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009650	GGCCT	2	10	14623	14632	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009650	GAGCA	2	10	14812	14821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009650	TGGGC	2	10	21043	21052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009650	AGGAA	2	10	21095	21104	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009650	CGGTT	2	10	21407	21416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009650	TTTAA	2	10	22795	22804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009650	TGTTT	2	10	29798	29807	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009650	CAGTG	2	10	30904	30913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009650	GAAGA	2	10	34003	34012	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009650	CATGA	2	10	43593	43602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009650	CTTTC	2	10	49503	49512	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009650	ACGGG	2	10	52371	52380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009650	CCGGC	2	10	52394	52403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009650	AGGGG	2	10	54800	54809	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009650	CCCGG	2	10	54883	54892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009650	GCCGT	2	10	54931	54940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009650	CTGCG	2	10	55355	55364	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009650	CAGGG	2	10	56681	56690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009650	CTCTC	2	10	56779	56788	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009650	TTTCC	2	10	60927	60936	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009650	TTTCC	2	10	69802	69811	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009650	CGTAT	2	10	106915	106924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.