MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009650	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973609
3	NC_009650	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009650	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009650	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
6	NC_009650	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973610
7	NC_009650	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973610
8	NC_009650	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
9	NC_009650	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973611
10	NC_009650	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973612
11	NC_009650	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973612
12	NC_009650	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009650	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009650	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009650	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973614
16	NC_009650	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973614
17	NC_009650	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009650	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009650	GCCC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009650	GCCA	2	8	7140	7147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009650	ACGC	2	8	7549	7556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009650	TGGC	2	8	9037	9044	0 %	25 %	50 %	25 %	152973617
23	NC_009650	TCAG	2	8	9152	9159	25 %	25 %	25 %	25 %	152973618
24	NC_009650	GGCG	2	8	9555	9562	0 %	0 %	75 %	25 %	152973619
25	NC_009650	CAGC	2	8	9872	9879	25 %	0 %	25 %	50 %	152973619
26	NC_009650	CCAG	2	8	10688	10695	25 %	0 %	25 %	50 %	152973620
27	NC_009650	CGGT	2	8	11065	11072	0 %	25 %	50 %	25 %	152973621
28	NC_009650	CTGG	2	8	11355	11362	0 %	25 %	50 %	25 %	152973621
29	NC_009650	AGAT	2	8	11467	11474	50 %	25 %	25 %	0 %	152973621
30	NC_009650	ATTA	2	8	11989	11996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009650	GCCT	2	8	12084	12091	0 %	25 %	25 %	50 %	152973622
32	NC_009650	CGCT	2	8	12802	12809	0 %	25 %	25 %	50 %	152973622
33	NC_009650	TCGG	2	8	12853	12860	0 %	25 %	50 %	25 %	152973622
34	NC_009650	GCTG	2	8	13137	13144	0 %	25 %	50 %	25 %	152973623
35	NC_009650	CCCG	2	8	13747	13754	0 %	0 %	25 %	75 %	152973624
36	NC_009650	CTGA	2	8	13807	13814	25 %	25 %	25 %	25 %	152973624
37	NC_009650	GCCT	2	8	14315	14322	0 %	25 %	25 %	50 %	152973625
38	NC_009650	CCTG	2	8	14487	14494	0 %	25 %	25 %	50 %	152973625
39	NC_009650	GGCG	2	8	14836	14843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009650	CTGC	2	8	15108	15115	0 %	25 %	25 %	50 %	152973626
41	NC_009650	AGTC	2	8	15364	15371	25 %	25 %	25 %	25 %	152973626
42	NC_009650	ATTG	2	8	15829	15836	25 %	50 %	25 %	0 %	152973626
43	NC_009650	CTGT	2	8	16336	16343	0 %	50 %	25 %	25 %	152973626
44	NC_009650	TGCC	2	8	16432	16439	0 %	25 %	25 %	50 %	152973626
45	NC_009650	CAGC	2	8	16839	16846	25 %	0 %	25 %	50 %	152973626
46	NC_009650	AGCG	2	8	16964	16971	25 %	0 %	50 %	25 %	152973626
47	NC_009650	CGTT	2	8	17513	17520	0 %	50 %	25 %	25 %	152973626
48	NC_009650	GGAA	2	8	17710	17717	50 %	0 %	50 %	0 %	152973626
49	NC_009650	CCTG	2	8	17941	17948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009650	CCAG	2	8	18126	18133	25 %	0 %	25 %	50 %	152973627
51	NC_009650	CAAA	2	8	18853	18860	75 %	0 %	0 %	25 %	152973628
52	NC_009650	GCGA	2	8	19314	19321	25 %	0 %	50 %	25 %	152973628
53	NC_009650	AGCC	2	8	19877	19884	25 %	0 %	25 %	50 %	152973629
54	NC_009650	AGGC	2	8	20191	20198	25 %	0 %	50 %	25 %	152973629
55	NC_009650	ACAA	2	8	20647	20654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009650	ACTT	2	8	22282	22289	25 %	50 %	0 %	25 %	152973631
57	NC_009650	TGAA	2	8	22381	22388	50 %	25 %	25 %	0 %	152973631
58	NC_009650	TGGA	2	8	22503	22510	25 %	25 %	50 %	0 %	152973631
59	NC_009650	GGCT	2	8	22553	22560	0 %	25 %	50 %	25 %	152973631
60	NC_009650	GATT	2	8	22775	22782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009650	CAGC	2	8	23155	23162	25 %	0 %	25 %	50 %	152973632
62	NC_009650	GCTG	2	8	24659	24666	0 %	25 %	50 %	25 %	152973634
63	NC_009650	CCGC	2	8	24751	24758	0 %	0 %	25 %	75 %	152973634
64	NC_009650	GCAG	2	8	24850	24857	25 %	0 %	50 %	25 %	152973634
65	NC_009650	CTGG	2	8	25043	25050	0 %	25 %	50 %	25 %	152973634
66	NC_009650	GAAC	2	8	25401	25408	50 %	0 %	25 %	25 %	152973635
67	NC_009650	AAGG	2	8	25450	25457	50 %	0 %	50 %	0 %	152973635
68	NC_009650	CTGC	2	8	26146	26153	0 %	25 %	25 %	50 %	152973637
69	NC_009650	CGGC	2	8	26338	26345	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
70	NC_009650	GCCG	2	8	26402	26409	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
71	NC_009650	CTGG	2	8	26663	26670	0 %	25 %	50 %	25 %	152973637
72	NC_009650	GCGG	2	8	27032	27039	0 %	0 %	75 %	25 %	152973637
73	NC_009650	AACC	2	8	27930	27937	50 %	0 %	0 %	50 %	229269515
74	NC_009650	CCGT	2	8	28499	28506	0 %	25 %	25 %	50 %	152973639
75	NC_009650	CAGC	2	8	28627	28634	25 %	0 %	25 %	50 %	152973639
76	NC_009650	ACTG	2	8	28724	28731	25 %	25 %	25 %	25 %	152973639
77	NC_009650	TGCC	2	8	29434	29441	0 %	25 %	25 %	50 %	152973641
78	NC_009650	CTGA	2	8	29763	29770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009650	GGCG	2	8	30021	30028	0 %	0 %	75 %	25 %	152973642
80	NC_009650	GCTC	2	8	30374	30381	0 %	25 %	25 %	50 %	152973643
81	NC_009650	TCCC	2	8	30740	30747	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009650	CGGA	2	8	30849	30856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009650	CGGG	2	8	30995	31002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009650	ATTA	2	8	31005	31012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009650	GGAC	2	8	31418	31425	25 %	0 %	50 %	25 %	152973645
86	NC_009650	GGAC	2	8	31973	31980	25 %	0 %	50 %	25 %	152973646
87	NC_009650	AATA	2	8	32783	32790	75 %	25 %	0 %	0 %	152973648
88	NC_009650	CGGC	2	8	33116	33123	0 %	0 %	50 %	50 %	152973649
89	NC_009650	CCGG	2	8	33130	33137	0 %	0 %	50 %	50 %	152973649
90	NC_009650	AGCC	2	8	33139	33146	25 %	0 %	25 %	50 %	152973649
91	NC_009650	CAGC	2	8	33183	33190	25 %	0 %	25 %	50 %	152973649
92	NC_009650	CTGA	2	8	33826	33833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009650	CAGC	2	8	34140	34147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009650	CAGC	2	8	34749	34756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009650	TTGG	2	8	35347	35354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009650	CTGC	2	8	35400	35407	0 %	25 %	25 %	50 %	152973652
97	NC_009650	AACG	2	8	36225	36232	50 %	0 %	25 %	25 %	152973652
98	NC_009650	CGCC	2	8	36991	36998	0 %	0 %	25 %	75 %	152973653
99	NC_009650	ATCA	2	8	37196	37203	50 %	25 %	0 %	25 %	152973653
100	NC_009650	TACA	2	8	37748	37755	50 %	25 %	0 %	25 %	152973653
101	NC_009650	GGTC	2	8	37824	37831	0 %	25 %	50 %	25 %	152973653
102	NC_009650	TGAA	2	8	37988	37995	50 %	25 %	25 %	0 %	152973653
103	NC_009650	GAAT	2	8	38296	38303	50 %	25 %	25 %	0 %	152973653
104	NC_009650	GGCT	3	12	38366	38377	0 %	25 %	50 %	25 %	152973653
105	NC_009650	TTGC	2	8	38717	38724	0 %	50 %	25 %	25 %	152973653
106	NC_009650	CGGT	2	8	38826	38833	0 %	25 %	50 %	25 %	152973653
107	NC_009650	TTTC	2	8	39037	39044	0 %	75 %	0 %	25 %	152973653
108	NC_009650	TCCA	2	8	39269	39276	25 %	25 %	0 %	50 %	152973653
109	NC_009650	CCGC	2	8	39799	39806	0 %	0 %	25 %	75 %	152973653
110	NC_009650	AATC	2	8	39928	39935	50 %	25 %	0 %	25 %	152973654
111	NC_009650	CCAG	2	8	41400	41407	25 %	0 %	25 %	50 %	152973655
112	NC_009650	AGGT	2	8	42029	42036	25 %	25 %	50 %	0 %	152973655
113	NC_009650	CAAC	2	8	42106	42113	50 %	0 %	0 %	50 %	152973655
114	NC_009650	GGAT	2	8	43329	43336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009650	CTTC	2	8	43955	43962	0 %	50 %	0 %	50 %	152973657
116	NC_009650	CATT	2	8	44077	44084	25 %	50 %	0 %	25 %	152973657
117	NC_009650	TCTA	2	8	44100	44107	25 %	50 %	0 %	25 %	152973657
118	NC_009650	GAAA	2	8	44415	44422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009650	ACTT	2	8	44751	44758	25 %	50 %	0 %	25 %	152973659
120	NC_009650	CTGC	2	8	44787	44794	0 %	25 %	25 %	50 %	152973659
121	NC_009650	CAGA	2	8	44811	44818	50 %	0 %	25 %	25 %	152973659
122	NC_009650	ATCA	2	8	45933	45940	50 %	25 %	0 %	25 %	152973660
123	NC_009650	CGAT	2	8	45967	45974	25 %	25 %	25 %	25 %	152973660
124	NC_009650	ATTG	2	8	46722	46729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009650	ACCG	2	8	47124	47131	25 %	0 %	25 %	50 %	152973661
126	NC_009650	AGTC	2	8	47636	47643	25 %	25 %	25 %	25 %	152973661
127	NC_009650	AAGG	2	8	47770	47777	50 %	0 %	50 %	0 %	152973661
128	NC_009650	GACA	2	8	48773	48780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009650	GCCG	2	8	49217	49224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009650	TGAG	2	8	50547	50554	25 %	25 %	50 %	0 %	152973663
131	NC_009650	TGCG	2	8	50871	50878	0 %	25 %	50 %	25 %	152973663
132	NC_009650	TTCT	2	8	51231	51238	0 %	75 %	0 %	25 %	152973664
133	NC_009650	CTCA	2	8	51459	51466	25 %	25 %	0 %	50 %	152973664
134	NC_009650	GACG	2	8	52488	52495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009650	ATTC	2	8	52621	52628	25 %	50 %	0 %	25 %	229269516
136	NC_009650	CAGA	2	8	52729	52736	50 %	0 %	25 %	25 %	229269516
137	NC_009650	GACG	2	8	52750	52757	25 %	0 %	50 %	25 %	229269516
138	NC_009650	GATG	2	8	53481	53488	25 %	25 %	50 %	0 %	152973667
139	NC_009650	GGCT	2	8	54080	54087	0 %	25 %	50 %	25 %	152973669
140	NC_009650	GGCT	2	8	54135	54142	0 %	25 %	50 %	25 %	152973669
141	NC_009650	GGCT	2	8	54313	54320	0 %	25 %	50 %	25 %	152973669
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143	NC_009650	CCTC	2	8	54403	54410	0 %	25 %	0 %	75 %	152973669
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282	NC_009650	GCTG	2	8	106556	106563	0 %	25 %	50 %	25 %	152973729
283	NC_009650	GTGA	2	8	106648	106655	25 %	25 %	50 %	0 %	152973729
284	NC_009650	AGCG	2	8	107495	107502	25 %	0 %	50 %	25 %	152973730
285	NC_009650	GCTG	2	8	107549	107556	0 %	25 %	50 %	25 %	152973730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.