MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009650	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009650	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009650	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009650	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009650	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009650	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009650	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009650	GCCC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009650	GCCA	2	8	7140	7147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009650	ACGC	2	8	7549	7556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009650	ATTA	2	8	11989	11996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009650	GGCG	2	8	14836	14843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009650	CCTG	2	8	17941	17948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009650	ACAA	2	8	20647	20654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009650	GATT	2	8	22775	22782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009650	CTGA	2	8	29763	29770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009650	TCCC	2	8	30740	30747	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_009650	CGGA	2	8	30849	30856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009650	CGGG	2	8	30995	31002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009650	ATTA	2	8	31005	31012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009650	CTGA	2	8	33826	33833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009650	CAGC	2	8	34140	34147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009650	CAGC	2	8	34749	34756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009650	TTGG	2	8	35347	35354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009650	GGAT	2	8	43329	43336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009650	GAAA	2	8	44415	44422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009650	ATTG	2	8	46722	46729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009650	GACA	2	8	48773	48780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009650	GCCG	2	8	49217	49224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009650	GACG	2	8	52488	52495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009650	CCCT	2	8	54811	54818	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_009650	TCTG	2	8	57576	57583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009650	AGGA	2	8	58838	58845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009650	TCTG	2	8	60963	60970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009650	ACAG	2	8	67801	67808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009650	TTTC	2	8	72386	72393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009650	AAAT	2	8	74416	74423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009650	AGAC	2	8	86829	86836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009650	GAGG	2	8	86872	86879	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009650	ATTC	2	8	97479	97486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009650	ATTT	2	8	97534	97541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009650	TTAT	2	8	97601	97608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009650	GTTA	2	8	97759	97766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.