MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009650	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009650	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973610
4	NC_009650	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973612
5	NC_009650	CT	3	6	5031	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009650	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
7	NC_009650	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
8	NC_009650	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
9	NC_009650	AG	4	8	7043	7050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009650	AG	3	6	7585	7590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009650	TC	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	152973615
12	NC_009650	CG	4	8	8341	8348	0 %	0 %	50 %	50 %	152973616
13	NC_009650	CT	3	6	8597	8602	0 %	50 %	0 %	50 %	152973617
14	NC_009650	CG	3	6	8667	8672	0 %	0 %	50 %	50 %	152973617
15	NC_009650	GC	3	6	9542	9547	0 %	0 %	50 %	50 %	152973619
16	NC_009650	GA	3	6	9661	9666	50 %	0 %	50 %	0 %	152973619
17	NC_009650	GC	3	6	10284	10289	0 %	0 %	50 %	50 %	152973620
18	NC_009650	GC	3	6	10828	10833	0 %	0 %	50 %	50 %	152973620
19	NC_009650	CG	4	8	10990	10997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009650	GC	3	6	11507	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	152973621
21	NC_009650	CA	3	6	12028	12033	50 %	0 %	0 %	50 %	152973622
22	NC_009650	GC	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009650	GA	3	6	16191	16196	50 %	0 %	50 %	0 %	152973626
24	NC_009650	TA	3	6	17538	17543	50 %	50 %	0 %	0 %	152973626
25	NC_009650	CA	3	6	19640	19645	50 %	0 %	0 %	50 %	152973629
26	NC_009650	GA	3	6	19742	19747	50 %	0 %	50 %	0 %	152973629
27	NC_009650	CG	3	6	20228	20233	0 %	0 %	50 %	50 %	152973629
28	NC_009650	GT	3	6	20515	20520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009650	GA	3	6	20633	20638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009650	CG	3	6	21245	21250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009650	AT	3	6	21371	21376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009650	AT	3	6	22763	22768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009650	GA	3	6	22944	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	152973632
34	NC_009650	GC	3	6	23469	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
35	NC_009650	GC	3	6	24174	24179	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
36	NC_009650	GC	3	6	24504	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
37	NC_009650	GC	3	6	24903	24908	0 %	0 %	50 %	50 %	152973634
38	NC_009650	CG	3	6	25300	25305	0 %	0 %	50 %	50 %	152973634
39	NC_009650	GC	3	6	25376	25381	0 %	0 %	50 %	50 %	152973635
40	NC_009650	GC	3	6	25663	25668	0 %	0 %	50 %	50 %	152973636
41	NC_009650	CG	3	6	25788	25793	0 %	0 %	50 %	50 %	152973636
42	NC_009650	CG	3	6	26203	26208	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
43	NC_009650	GC	4	8	26224	26231	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
44	NC_009650	GT	3	6	26554	26559	0 %	50 %	50 %	0 %	152973637
45	NC_009650	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
46	NC_009650	GC	3	6	26595	26600	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
47	NC_009650	GT	3	6	26676	26681	0 %	50 %	50 %	0 %	152973637
48	NC_009650	CA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	0 %	50 %	152973637
49	NC_009650	GC	3	6	28099	28104	0 %	0 %	50 %	50 %	229269515
50	NC_009650	GT	3	6	28839	28844	0 %	50 %	50 %	0 %	152973640
51	NC_009650	TA	3	6	29754	29759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009650	TC	3	6	30613	30618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009650	GC	3	6	30673	30678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009650	TC	3	6	30796	30801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009650	GT	3	6	31167	31172	0 %	50 %	50 %	0 %	152973644
56	NC_009650	GC	4	8	31249	31256	0 %	0 %	50 %	50 %	152973644
57	NC_009650	TG	3	6	31747	31752	0 %	50 %	50 %	0 %	152973646
58	NC_009650	TG	3	6	34346	34351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009650	CG	3	6	34417	34422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009650	TC	3	6	34600	34605	0 %	50 %	0 %	50 %	152973650
61	NC_009650	AT	3	6	34678	34683	50 %	50 %	0 %	0 %	152973650
62	NC_009650	CT	3	6	34703	34708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009650	AT	3	6	34860	34865	50 %	50 %	0 %	0 %	152973651
64	NC_009650	AT	3	6	35000	35005	50 %	50 %	0 %	0 %	152973651
65	NC_009650	CT	3	6	35370	35375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009650	CA	3	6	38944	38949	50 %	0 %	0 %	50 %	152973653
67	NC_009650	AG	3	6	41725	41730	50 %	0 %	50 %	0 %	152973655
68	NC_009650	CA	3	6	42481	42486	50 %	0 %	0 %	50 %	152973655
69	NC_009650	TC	3	6	43082	43087	0 %	50 %	0 %	50 %	152973655
70	NC_009650	CA	3	6	44488	44493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009650	CG	3	6	44976	44981	0 %	0 %	50 %	50 %	152973659
72	NC_009650	CG	3	6	45056	45061	0 %	0 %	50 %	50 %	152973659
73	NC_009650	GT	3	6	46870	46875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009650	CG	3	6	47212	47217	0 %	0 %	50 %	50 %	152973661
75	NC_009650	AG	3	6	47485	47490	50 %	0 %	50 %	0 %	152973661
76	NC_009650	AT	3	6	47994	47999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009650	CT	4	8	48287	48294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009650	TC	3	6	48812	48817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009650	CG	3	6	49331	49336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009650	GC	3	6	50865	50870	0 %	0 %	50 %	50 %	152973663
81	NC_009650	CT	3	6	54155	54160	0 %	50 %	0 %	50 %	152973669
82	NC_009650	GA	3	6	55153	55158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009650	CG	3	6	56382	56387	0 %	0 %	50 %	50 %	152973671
84	NC_009650	CG	3	6	56713	56718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009650	GA	4	8	56745	56752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009650	CG	3	6	57066	57071	0 %	0 %	50 %	50 %	152973673
87	NC_009650	GT	3	6	57131	57136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009650	TC	3	6	57532	57537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009650	CG	3	6	57891	57896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009650	GC	3	6	58638	58643	0 %	0 %	50 %	50 %	152973682
91	NC_009650	GC	3	6	59130	59135	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
92	NC_009650	CG	4	8	59263	59270	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
93	NC_009650	GC	3	6	59325	59330	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
94	NC_009650	GC	4	8	59346	59353	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
95	NC_009650	CT	3	6	59358	59363	0 %	50 %	0 %	50 %	152973676
96	NC_009650	TC	3	6	59608	59613	0 %	50 %	0 %	50 %	152973676
97	NC_009650	CG	3	6	59743	59748	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
98	NC_009650	AC	3	6	60109	60114	50 %	0 %	0 %	50 %	152973676
99	NC_009650	GC	3	6	60311	60316	0 %	0 %	50 %	50 %	152973677
100	NC_009650	CG	3	6	60876	60881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009650	CG	3	6	61277	61282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009650	AC	3	6	63511	63516	50 %	0 %	0 %	50 %	152973680
103	NC_009650	TG	3	6	64832	64837	0 %	50 %	50 %	0 %	152973681
104	NC_009650	CG	3	6	64937	64942	0 %	0 %	50 %	50 %	152973681
105	NC_009650	TC	3	6	65579	65584	0 %	50 %	0 %	50 %	152973683
106	NC_009650	TG	3	6	65872	65877	0 %	50 %	50 %	0 %	152973684
107	NC_009650	TG	3	6	66193	66198	0 %	50 %	50 %	0 %	152973685
108	NC_009650	CG	3	6	67446	67451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009650	CA	3	6	68355	68360	50 %	0 %	0 %	50 %	152973688
110	NC_009650	TG	3	6	68510	68515	0 %	50 %	50 %	0 %	152973688
111	NC_009650	GT	3	6	69210	69215	0 %	50 %	50 %	0 %	152973689
112	NC_009650	CG	3	6	69751	69756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009650	CG	3	6	70153	70158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009650	TG	3	6	70904	70909	0 %	50 %	50 %	0 %	152973690
115	NC_009650	AT	3	6	72286	72291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009650	TG	3	6	72605	72610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009650	TA	3	6	72665	72670	50 %	50 %	0 %	0 %	152973693
118	NC_009650	GT	3	6	72789	72794	0 %	50 %	50 %	0 %	152973693
119	NC_009650	GC	3	6	76208	76213	0 %	0 %	50 %	50 %	152973699
120	NC_009650	AT	3	6	76459	76464	50 %	50 %	0 %	0 %	152973700
121	NC_009650	TC	3	6	77808	77813	0 %	50 %	0 %	50 %	152973700
122	NC_009650	AT	3	6	78728	78733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009650	TA	3	6	79171	79176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009650	TA	3	6	79491	79496	50 %	50 %	0 %	0 %	152973704
125	NC_009650	TA	3	6	79803	79808	50 %	50 %	0 %	0 %	152973705
126	NC_009650	TA	3	6	80173	80178	50 %	50 %	0 %	0 %	152973705
127	NC_009650	TG	3	6	80801	80806	0 %	50 %	50 %	0 %	152973707
128	NC_009650	GT	3	6	81815	81820	0 %	50 %	50 %	0 %	152973708
129	NC_009650	CT	3	6	82247	82252	0 %	50 %	0 %	50 %	152973708
130	NC_009650	TG	3	6	82675	82680	0 %	50 %	50 %	0 %	152973708
131	NC_009650	CT	3	6	83111	83116	0 %	50 %	0 %	50 %	152973708
132	NC_009650	CG	3	6	83276	83281	0 %	0 %	50 %	50 %	152973708
133	NC_009650	GC	3	6	83619	83624	0 %	0 %	50 %	50 %	152973708
134	NC_009650	TC	3	6	83848	83853	0 %	50 %	0 %	50 %	152973709
135	NC_009650	CT	3	6	83972	83977	0 %	50 %	0 %	50 %	152973709
136	NC_009650	GC	3	6	84069	84074	0 %	0 %	50 %	50 %	152973709
137	NC_009650	TG	3	6	85291	85296	0 %	50 %	50 %	0 %	152973712
138	NC_009650	TC	3	6	86183	86188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009650	CT	3	6	87131	87136	0 %	50 %	0 %	50 %	152973714
140	NC_009650	CA	3	6	87416	87421	50 %	0 %	0 %	50 %	152973714
141	NC_009650	TG	3	6	89046	89051	0 %	50 %	50 %	0 %	152973715
142	NC_009650	AT	3	6	89113	89118	50 %	50 %	0 %	0 %	152973715
143	NC_009650	TC	3	6	89205	89210	0 %	50 %	0 %	50 %	152973716
144	NC_009650	GT	3	6	90469	90474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009650	AT	3	6	91298	91303	50 %	50 %	0 %	0 %	152973721
146	NC_009650	AT	3	6	93099	93104	50 %	50 %	0 %	0 %	152973723
147	NC_009650	TG	3	6	93579	93584	0 %	50 %	50 %	0 %	152973723
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.