MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973610
2	NC_009650	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973612
3	NC_009650	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
4	NC_009650	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
5	NC_009650	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
6	NC_009650	TC	3	6	7796	7801	0 %	50 %	0 %	50 %	152973615
7	NC_009650	CG	4	8	8341	8348	0 %	0 %	50 %	50 %	152973616
8	NC_009650	CT	3	6	8597	8602	0 %	50 %	0 %	50 %	152973617
9	NC_009650	CG	3	6	8667	8672	0 %	0 %	50 %	50 %	152973617
10	NC_009650	GC	3	6	9542	9547	0 %	0 %	50 %	50 %	152973619
11	NC_009650	GA	3	6	9661	9666	50 %	0 %	50 %	0 %	152973619
12	NC_009650	GC	3	6	10284	10289	0 %	0 %	50 %	50 %	152973620
13	NC_009650	GC	3	6	10828	10833	0 %	0 %	50 %	50 %	152973620
14	NC_009650	GC	3	6	11507	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	152973621
15	NC_009650	CA	3	6	12028	12033	50 %	0 %	0 %	50 %	152973622
16	NC_009650	GA	3	6	16191	16196	50 %	0 %	50 %	0 %	152973626
17	NC_009650	TA	3	6	17538	17543	50 %	50 %	0 %	0 %	152973626
18	NC_009650	CA	3	6	19640	19645	50 %	0 %	0 %	50 %	152973629
19	NC_009650	GA	3	6	19742	19747	50 %	0 %	50 %	0 %	152973629
20	NC_009650	CG	3	6	20228	20233	0 %	0 %	50 %	50 %	152973629
21	NC_009650	GA	3	6	22944	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	152973632
22	NC_009650	GC	3	6	23469	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
23	NC_009650	GC	3	6	24174	24179	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
24	NC_009650	GC	3	6	24504	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
25	NC_009650	GC	3	6	24903	24908	0 %	0 %	50 %	50 %	152973634
26	NC_009650	CG	3	6	25300	25305	0 %	0 %	50 %	50 %	152973634
27	NC_009650	GC	3	6	25376	25381	0 %	0 %	50 %	50 %	152973635
28	NC_009650	GC	3	6	25663	25668	0 %	0 %	50 %	50 %	152973636
29	NC_009650	CG	3	6	25788	25793	0 %	0 %	50 %	50 %	152973636
30	NC_009650	CG	3	6	26203	26208	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
31	NC_009650	GC	4	8	26224	26231	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
32	NC_009650	GT	3	6	26554	26559	0 %	50 %	50 %	0 %	152973637
33	NC_009650	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
34	NC_009650	GC	3	6	26595	26600	0 %	0 %	50 %	50 %	152973637
35	NC_009650	GT	3	6	26676	26681	0 %	50 %	50 %	0 %	152973637
36	NC_009650	CA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	0 %	50 %	152973637
37	NC_009650	GC	3	6	28099	28104	0 %	0 %	50 %	50 %	229269515
38	NC_009650	GT	3	6	28839	28844	0 %	50 %	50 %	0 %	152973640
39	NC_009650	GT	3	6	31167	31172	0 %	50 %	50 %	0 %	152973644
40	NC_009650	GC	4	8	31249	31256	0 %	0 %	50 %	50 %	152973644
41	NC_009650	TG	3	6	31747	31752	0 %	50 %	50 %	0 %	152973646
42	NC_009650	TC	3	6	34600	34605	0 %	50 %	0 %	50 %	152973650
43	NC_009650	AT	3	6	34678	34683	50 %	50 %	0 %	0 %	152973650
44	NC_009650	AT	3	6	34860	34865	50 %	50 %	0 %	0 %	152973651
45	NC_009650	AT	3	6	35000	35005	50 %	50 %	0 %	0 %	152973651
46	NC_009650	CA	3	6	38944	38949	50 %	0 %	0 %	50 %	152973653
47	NC_009650	AG	3	6	41725	41730	50 %	0 %	50 %	0 %	152973655
48	NC_009650	CA	3	6	42481	42486	50 %	0 %	0 %	50 %	152973655
49	NC_009650	TC	3	6	43082	43087	0 %	50 %	0 %	50 %	152973655
50	NC_009650	CG	3	6	44976	44981	0 %	0 %	50 %	50 %	152973659
51	NC_009650	CG	3	6	45056	45061	0 %	0 %	50 %	50 %	152973659
52	NC_009650	CG	3	6	47212	47217	0 %	0 %	50 %	50 %	152973661
53	NC_009650	AG	3	6	47485	47490	50 %	0 %	50 %	0 %	152973661
54	NC_009650	GC	3	6	50865	50870	0 %	0 %	50 %	50 %	152973663
55	NC_009650	CT	3	6	54155	54160	0 %	50 %	0 %	50 %	152973669
56	NC_009650	CG	3	6	56382	56387	0 %	0 %	50 %	50 %	152973671
57	NC_009650	CG	3	6	57066	57071	0 %	0 %	50 %	50 %	152973673
58	NC_009650	GC	3	6	58638	58643	0 %	0 %	50 %	50 %	152973682
59	NC_009650	GC	3	6	59130	59135	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
60	NC_009650	CG	4	8	59263	59270	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
61	NC_009650	GC	3	6	59325	59330	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
62	NC_009650	GC	4	8	59346	59353	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
63	NC_009650	CT	3	6	59358	59363	0 %	50 %	0 %	50 %	152973676
64	NC_009650	TC	3	6	59608	59613	0 %	50 %	0 %	50 %	152973676
65	NC_009650	CG	3	6	59743	59748	0 %	0 %	50 %	50 %	152973676
66	NC_009650	AC	3	6	60109	60114	50 %	0 %	0 %	50 %	152973676
67	NC_009650	GC	3	6	60311	60316	0 %	0 %	50 %	50 %	152973677
68	NC_009650	AC	3	6	63511	63516	50 %	0 %	0 %	50 %	152973680
69	NC_009650	TG	3	6	64832	64837	0 %	50 %	50 %	0 %	152973681
70	NC_009650	CG	3	6	64937	64942	0 %	0 %	50 %	50 %	152973681
71	NC_009650	TC	3	6	65579	65584	0 %	50 %	0 %	50 %	152973683
72	NC_009650	TG	3	6	65872	65877	0 %	50 %	50 %	0 %	152973684
73	NC_009650	TG	3	6	66193	66198	0 %	50 %	50 %	0 %	152973685
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75	NC_009650	TG	3	6	68510	68515	0 %	50 %	50 %	0 %	152973688
76	NC_009650	GT	3	6	69210	69215	0 %	50 %	50 %	0 %	152973689
77	NC_009650	TG	3	6	70904	70909	0 %	50 %	50 %	0 %	152973690
78	NC_009650	TA	3	6	72665	72670	50 %	50 %	0 %	0 %	152973693
79	NC_009650	GT	3	6	72789	72794	0 %	50 %	50 %	0 %	152973693
80	NC_009650	GC	3	6	76208	76213	0 %	0 %	50 %	50 %	152973699
81	NC_009650	AT	3	6	76459	76464	50 %	50 %	0 %	0 %	152973700
82	NC_009650	TC	3	6	77808	77813	0 %	50 %	0 %	50 %	152973700
83	NC_009650	TA	3	6	79491	79496	50 %	50 %	0 %	0 %	152973704
84	NC_009650	TA	3	6	79803	79808	50 %	50 %	0 %	0 %	152973705
85	NC_009650	TA	3	6	80173	80178	50 %	50 %	0 %	0 %	152973705
86	NC_009650	TG	3	6	80801	80806	0 %	50 %	50 %	0 %	152973707
87	NC_009650	GT	3	6	81815	81820	0 %	50 %	50 %	0 %	152973708
88	NC_009650	CT	3	6	82247	82252	0 %	50 %	0 %	50 %	152973708
89	NC_009650	TG	3	6	82675	82680	0 %	50 %	50 %	0 %	152973708
90	NC_009650	CT	3	6	83111	83116	0 %	50 %	0 %	50 %	152973708
91	NC_009650	CG	3	6	83276	83281	0 %	0 %	50 %	50 %	152973708
92	NC_009650	GC	3	6	83619	83624	0 %	0 %	50 %	50 %	152973708
93	NC_009650	TC	3	6	83848	83853	0 %	50 %	0 %	50 %	152973709
94	NC_009650	CT	3	6	83972	83977	0 %	50 %	0 %	50 %	152973709
95	NC_009650	GC	3	6	84069	84074	0 %	0 %	50 %	50 %	152973709
96	NC_009650	TG	3	6	85291	85296	0 %	50 %	50 %	0 %	152973712
97	NC_009650	CT	3	6	87131	87136	0 %	50 %	0 %	50 %	152973714
98	NC_009650	CA	3	6	87416	87421	50 %	0 %	0 %	50 %	152973714
99	NC_009650	TG	3	6	89046	89051	0 %	50 %	50 %	0 %	152973715
100	NC_009650	AT	3	6	89113	89118	50 %	50 %	0 %	0 %	152973715
101	NC_009650	TC	3	6	89205	89210	0 %	50 %	0 %	50 %	152973716
102	NC_009650	AT	3	6	91298	91303	50 %	50 %	0 %	0 %	152973721
103	NC_009650	AT	3	6	93099	93104	50 %	50 %	0 %	0 %	152973723
104	NC_009650	TG	3	6	93579	93584	0 %	50 %	50 %	0 %	152973723
105	NC_009650	CT	3	6	94269	94274	0 %	50 %	0 %	50 %	152973723
106	NC_009650	GC	3	6	94714	94719	0 %	0 %	50 %	50 %	152973723
107	NC_009650	AG	3	6	95166	95171	50 %	0 %	50 %	0 %	152973723
108	NC_009650	TA	3	6	96201	96206	50 %	50 %	0 %	0 %	152973724
109	NC_009650	TA	3	6	96365	96370	50 %	50 %	0 %	0 %	152973724
110	NC_009650	TG	3	6	97910	97915	0 %	50 %	50 %	0 %	152973726
111	NC_009650	CT	3	6	97951	97956	0 %	50 %	0 %	50 %	152973726
112	NC_009650	GC	3	6	99372	99377	0 %	0 %	50 %	50 %	152973727
113	NC_009650	GT	3	6	99680	99685	0 %	50 %	50 %	0 %	152973727
114	NC_009650	AC	3	6	101207	101212	50 %	0 %	0 %	50 %	152973728
115	NC_009650	TC	3	6	101259	101264	0 %	50 %	0 %	50 %	152973728
116	NC_009650	GT	3	6	101797	101802	0 %	50 %	50 %	0 %	152973728
117	NC_009650	AC	3	6	102919	102924	50 %	0 %	0 %	50 %	152973728
118	NC_009650	CG	3	6	103795	103800	0 %	0 %	50 %	50 %	152973728
119	NC_009650	CG	3	6	103824	103829	0 %	0 %	50 %	50 %	152973728
120	NC_009650	GC	3	6	103860	103865	0 %	0 %	50 %	50 %	152973728
121	NC_009650	AC	3	6	106089	106094	50 %	0 %	0 %	50 %	152973729
122	NC_009650	GC	3	6	107150	107155	0 %	0 %	50 %	50 %	152973730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.