MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973419
2	NC_009649	TCAAAT	2	12	11713	11724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152973426
3	NC_009649	AATTAA	2	12	14013	14024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009649	GGGCCG	2	12	15642	15653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973428
5	NC_009649	AAAAGA	2	12	16801	16812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152973428
6	NC_009649	GATGGC	2	12	17056	17067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152973429
7	NC_009649	CAGACG	2	12	20592	20603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973430
8	NC_009649	ACGGCC	2	12	25273	25284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973434
9	NC_009649	GCTTCG	2	12	25868	25879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009649	CGTAAA	2	12	30133	30144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973440
11	NC_009649	GCTTGC	2	12	34588	34599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973446
12	NC_009649	TCGGCG	2	12	34608	34619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973446
13	NC_009649	GCCGAT	2	12	35871	35882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973448
14	NC_009649	CAAAAG	2	12	36089	36100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973448
15	NC_009649	TGGGGC	2	12	37847	37858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	152973450
16	NC_009649	CGCCGA	2	12	39508	39519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973452
17	NC_009649	GCAAGC	2	12	39528	39539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973452
18	NC_009649	TCCAAT	2	12	41698	41709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009649	ATGGAA	2	12	42512	42523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009649	GGGAGC	2	12	46252	46263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973457
21	NC_009649	CTGGCA	2	12	47390	47401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973458
22	NC_009649	TCGCGC	2	12	48135	48146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152973459
23	NC_009649	GCGCGA	2	12	48487	48498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152973459
24	NC_009649	CTGAAA	2	12	49957	49968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973462
25	NC_009649	TTAAAG	2	12	53020	53031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152973465
26	NC_009649	GAAAGC	2	12	59658	59669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152973477
27	NC_009649	GACCGC	2	12	64786	64797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009649	AACCAG	2	12	65218	65229	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009649	CAACGT	2	12	70162	70173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152973489
30	NC_009649	TCAGGC	2	12	74213	74224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009649	CGGCAA	2	12	78109	78120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973499
32	NC_009649	TAGGTG	2	12	78309	78320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152973499
33	NC_009649	TTCATT	2	12	78351	78362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152973499
34	NC_009649	TTGATG	2	12	80821	80832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152973502
35	NC_009649	CCGTGG	2	12	80846	80857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973502
36	NC_009649	GACTGA	2	12	81916	81927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152973503
37	NC_009649	CCCACC	2	12	82056	82067	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	152973503
38	NC_009649	TTCAGG	2	12	84126	84137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009649	GATATC	2	12	85096	85107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009649	ACATAC	2	12	86995	87006	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009649	TCCATA	2	12	88364	88375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973505
42	NC_009649	TAATTT	2	12	90445	90456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973507
43	NC_009649	GATTGC	2	12	91888	91899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973509
44	NC_009649	CGTAAA	2	12	94928	94939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973513
45	NC_009649	TTCCAT	2	12	96301	96312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009649	AGATTA	2	12	101736	101747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152973519
47	NC_009649	CGTAAA	2	12	103163	103174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973520
48	NC_009649	TCTGAA	2	12	108434	108445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009649	GGGTTC	2	12	121041	121052	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152973533
50	NC_009649	GAAAAA	2	12	124138	124149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152973538
51	NC_009649	CGAGGA	2	12	124986	124997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152973539
52	NC_009649	TGAAAA	2	12	130499	130510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152973544
53	NC_009649	CCGCTG	2	12	131214	131225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152973545
54	NC_009649	GATATC	2	12	136612	136623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152973552
55	NC_009649	AAAATT	2	12	140441	140452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009649	TCTGGC	2	12	146338	146349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973567
57	NC_009649	TCTCTT	2	12	147789	147800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973570
58	NC_009649	CGCTGA	2	12	150738	150749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009649	CATCAC	2	12	152017	152028	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009649	GGGAAG	2	12	156038	156049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973580
61	NC_009649	GGTCAC	2	12	156154	156165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973580
62	NC_009649	ACATCA	2	12	160672	160683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152973588
63	NC_009649	GTTCAG	2	12	161271	161282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973588
64	NC_009649	CTGATG	2	12	166854	166865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973593
65	NC_009649	GGATAA	2	12	169093	169104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973594
66	NC_009649	AGCGGG	2	12	170379	170390	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973594
67	NC_009649	GGATAA	2	12	172936	172947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973594
68	NC_009649	TTTGCC	2	12	174711	174722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152973595
69	NC_009649	GCCGGT	2	12	175467	175478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973596

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.