MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973419
2	NC_009649	TCAAAT	2	12	11713	11724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152973426
3	NC_009649	GGGCCG	2	12	15642	15653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973428
4	NC_009649	AAAAGA	2	12	16801	16812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152973428
5	NC_009649	GATGGC	2	12	17056	17067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152973429
6	NC_009649	CAGACG	2	12	20592	20603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973430
7	NC_009649	ACGGCC	2	12	25273	25284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973434
8	NC_009649	CGTAAA	2	12	30133	30144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973440
9	NC_009649	GCTTGC	2	12	34588	34599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973446
10	NC_009649	TCGGCG	2	12	34608	34619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973446
11	NC_009649	GCCGAT	2	12	35871	35882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973448
12	NC_009649	CAAAAG	2	12	36089	36100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973448
13	NC_009649	TGGGGC	2	12	37847	37858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	152973450
14	NC_009649	CGCCGA	2	12	39508	39519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152973452
15	NC_009649	GCAAGC	2	12	39528	39539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973452
16	NC_009649	GGGAGC	2	12	46252	46263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973457
17	NC_009649	CTGGCA	2	12	47390	47401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973458
18	NC_009649	TCGCGC	2	12	48135	48146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152973459
19	NC_009649	GCGCGA	2	12	48487	48498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152973459
20	NC_009649	CTGAAA	2	12	49957	49968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973462
21	NC_009649	TTAAAG	2	12	53020	53031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152973465
22	NC_009649	GAAAGC	2	12	59658	59669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152973477
23	NC_009649	CAACGT	2	12	70162	70173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152973489
24	NC_009649	CGGCAA	2	12	78109	78120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973499
25	NC_009649	TAGGTG	2	12	78309	78320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152973499
26	NC_009649	TTCATT	2	12	78351	78362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152973499
27	NC_009649	TTGATG	2	12	80821	80832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152973502
28	NC_009649	CCGTGG	2	12	80846	80857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973502
29	NC_009649	GACTGA	2	12	81916	81927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152973503
30	NC_009649	CCCACC	2	12	82056	82067	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	152973503
31	NC_009649	TCCATA	2	12	88364	88375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973505
32	NC_009649	TAATTT	2	12	90445	90456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973507
33	NC_009649	GATTGC	2	12	91888	91899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973509
34	NC_009649	CGTAAA	2	12	94928	94939	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973513
35	NC_009649	AGATTA	2	12	101736	101747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152973519
36	NC_009649	CGTAAA	2	12	103163	103174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152973520
37	NC_009649	GGGTTC	2	12	121041	121052	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	152973533
38	NC_009649	GAAAAA	2	12	124138	124149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152973538
39	NC_009649	CGAGGA	2	12	124986	124997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152973539
40	NC_009649	TGAAAA	2	12	130499	130510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152973544
41	NC_009649	CCGCTG	2	12	131214	131225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152973545
42	NC_009649	GATATC	2	12	136612	136623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152973552
43	NC_009649	TCTGGC	2	12	146338	146349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973567
44	NC_009649	TCTCTT	2	12	147789	147800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973570
45	NC_009649	GGGAAG	2	12	156038	156049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973580
46	NC_009649	GGTCAC	2	12	156154	156165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152973580
47	NC_009649	ACATCA	2	12	160672	160683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152973588
48	NC_009649	GTTCAG	2	12	161271	161282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973588
49	NC_009649	CTGATG	2	12	166854	166865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152973593
50	NC_009649	GGATAA	2	12	169093	169104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973594
51	NC_009649	AGCGGG	2	12	170379	170390	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	152973594
52	NC_009649	GGATAA	2	12	172936	172947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973594
53	NC_009649	TTTGCC	2	12	174711	174722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152973595
54	NC_009649	GCCGGT	2	12	175467	175478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152973596

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.