MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973419
2	NC_009649	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973421
3	NC_009649	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009649	CAGGG	2	10	7598	7607	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009649	CAACG	2	10	9696	9705	40 %	0 %	20 %	40 %	152973424
6	NC_009649	AGACG	2	10	11975	11984	40 %	0 %	40 %	20 %	152973426
7	NC_009649	TTTGC	2	10	15453	15462	0 %	60 %	20 %	20 %	152973427
8	NC_009649	TGATC	2	10	15495	15504	20 %	40 %	20 %	20 %	152973427
9	NC_009649	AATTC	2	10	17143	17152	40 %	40 %	0 %	20 %	152973429
10	NC_009649	CGCAG	2	10	17161	17170	20 %	0 %	40 %	40 %	152973429
11	NC_009649	AACTG	2	10	18088	18097	40 %	20 %	20 %	20 %	152973429
12	NC_009649	AGACC	2	10	18157	18166	40 %	0 %	20 %	40 %	152973429
13	NC_009649	TGACC	2	10	18880	18889	20 %	20 %	20 %	40 %	152973429
14	NC_009649	CTGTC	2	10	19485	19494	0 %	40 %	20 %	40 %	152973429
15	NC_009649	TTGCG	2	10	20092	20101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009649	TTTTC	2	10	20205	20214	0 %	80 %	0 %	20 %	152973430
17	NC_009649	TGCTC	2	10	24760	24769	0 %	40 %	20 %	40 %	152973433
18	NC_009649	AGGCC	2	10	24949	24958	20 %	0 %	40 %	40 %	152973433
19	NC_009649	AAAAT	2	10	26875	26884	80 %	20 %	0 %	0 %	152973435
20	NC_009649	TTATC	2	10	27747	27756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009649	TGATG	2	10	27939	27948	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009649	TCTCA	2	10	28989	28998	20 %	40 %	0 %	40 %	152973438
23	NC_009649	GCAGG	2	10	29456	29465	20 %	0 %	60 %	20 %	152973438
24	NC_009649	CTTTT	2	10	29674	29683	0 %	80 %	0 %	20 %	152973439
25	NC_009649	CCAGC	2	10	30228	30237	20 %	0 %	20 %	60 %	152973440
26	NC_009649	TCCCA	2	10	32274	32283	20 %	20 %	0 %	60 %	152973443
27	NC_009649	TGACC	2	10	33058	33067	20 %	20 %	20 %	40 %	152973443
28	NC_009649	TGCTC	2	10	33858	33867	0 %	40 %	20 %	40 %	152973445
29	NC_009649	AGGCC	2	10	34047	34056	20 %	0 %	40 %	40 %	152973444
30	NC_009649	AACTG	2	10	34185	34194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009649	CGCTC	2	10	35327	35336	0 %	20 %	20 %	60 %	152973447
32	NC_009649	GCTTG	2	10	39408	39417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009649	ACGAG	2	10	44480	44489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009649	GCGCC	2	10	44856	44865	0 %	0 %	40 %	60 %	152973457
35	NC_009649	GCGCA	2	10	45528	45537	20 %	0 %	40 %	40 %	152973457
36	NC_009649	CGGCC	2	10	46093	46102	0 %	0 %	40 %	60 %	152973457
37	NC_009649	CCGTG	2	10	46424	46433	0 %	20 %	40 %	40 %	152973457
38	NC_009649	CGGGC	2	10	48812	48821	0 %	0 %	60 %	40 %	152973461
39	NC_009649	GACGC	2	10	50457	50466	20 %	0 %	40 %	40 %	152973463
40	NC_009649	CTTCC	2	10	53662	53671	0 %	40 %	0 %	60 %	152973466
41	NC_009649	GTGAG	2	10	54188	54197	20 %	20 %	60 %	0 %	152973466
42	NC_009649	GTTCA	2	10	54250	54259	20 %	40 %	20 %	20 %	152973466
43	NC_009649	GTTGA	2	10	55883	55892	20 %	40 %	40 %	0 %	152973469
44	NC_009649	AACAC	2	10	55944	55953	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009649	CTTCA	2	10	56289	56298	20 %	40 %	0 %	40 %	152973470
46	NC_009649	CAATC	2	10	56640	56649	40 %	20 %	0 %	40 %	152973471
47	NC_009649	ATCAT	2	10	58764	58773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009649	ATATC	2	10	58835	58844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009649	TATCA	2	10	58873	58882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009649	GCCAT	2	10	62457	62466	20 %	20 %	20 %	40 %	152973479
51	NC_009649	CCCGG	2	10	64277	64286	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_009649	CGGGA	2	10	65951	65960	20 %	0 %	60 %	20 %	152973482
53	NC_009649	ACCAT	2	10	67259	67268	40 %	20 %	0 %	40 %	152973484
54	NC_009649	TTCAG	2	10	67543	67552	20 %	40 %	20 %	20 %	152973484
55	NC_009649	AAAAT	2	10	68098	68107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009649	TGGAA	2	10	68332	68341	40 %	20 %	40 %	0 %	152973486
57	NC_009649	AGCGG	2	10	68834	68843	20 %	0 %	60 %	20 %	152973487
58	NC_009649	CAGGC	2	10	69531	69540	20 %	0 %	40 %	40 %	152973488
59	NC_009649	GGCAT	2	10	69826	69835	20 %	20 %	40 %	20 %	152973488
60	NC_009649	ATCGA	2	10	70629	70638	40 %	20 %	20 %	20 %	152973489
61	NC_009649	AGACC	2	10	72932	72941	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009649	CATCG	2	10	74016	74025	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009649	TTCCC	2	10	75102	75111	0 %	40 %	0 %	60 %	152973496
64	NC_009649	AGTTA	2	10	75233	75242	40 %	40 %	20 %	0 %	152973496
65	NC_009649	GGTCA	2	10	78902	78911	20 %	20 %	40 %	20 %	152973499
66	NC_009649	TAAAT	2	10	79103	79112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009649	AATGA	2	10	79132	79141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009649	CGTAT	2	10	80243	80252	20 %	40 %	20 %	20 %	152973501
69	NC_009649	ACGCA	2	10	81059	81068	40 %	0 %	20 %	40 %	152973503
70	NC_009649	GACAG	2	10	83087	83096	40 %	0 %	40 %	20 %	152973503
71	NC_009649	ATTCG	2	10	83608	83617	20 %	40 %	20 %	20 %	152973504
72	NC_009649	CGTCG	2	10	85192	85201	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_009649	CTGTC	2	10	85323	85332	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009649	AGGCA	2	10	87159	87168	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009649	AGCTC	2	10	91622	91631	20 %	20 %	20 %	40 %	152973509
76	NC_009649	TTATC	2	10	92735	92744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009649	CCGTC	2	10	93333	93342	0 %	20 %	20 %	60 %	152973510
78	NC_009649	ATCAC	2	10	94714	94723	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_009649	CCAGC	2	10	95023	95032	20 %	0 %	20 %	60 %	152973513
80	NC_009649	ATGGC	2	10	95915	95924	20 %	20 %	40 %	20 %	152973514
81	NC_009649	GTGAT	2	10	96593	96602	20 %	40 %	40 %	0 %	152973515
82	NC_009649	TACTG	2	10	98115	98124	20 %	40 %	20 %	20 %	152973516
83	NC_009649	CTGTA	2	10	100785	100794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009649	CCCTT	2	10	102044	102053	0 %	40 %	0 %	60 %	152973519
85	NC_009649	CCAGC	2	10	103258	103267	20 %	0 %	20 %	60 %	152973520
86	NC_009649	ATGGC	2	10	104150	104159	20 %	20 %	40 %	20 %	152973521
87	NC_009649	TTTGC	2	10	106714	106723	0 %	60 %	20 %	20 %	152973523
88	NC_009649	TGATC	2	10	106756	106765	20 %	40 %	20 %	20 %	152973523
89	NC_009649	AGACG	2	10	108448	108457	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009649	ACAGA	2	10	108561	108570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009649	CTTCT	2	10	110782	110791	0 %	60 %	0 %	40 %	152973527
92	NC_009649	ACTGA	2	10	113051	113060	40 %	20 %	20 %	20 %	229269514
93	NC_009649	CTGCA	2	10	113256	113265	20 %	20 %	20 %	40 %	229269514
94	NC_009649	TCACA	2	10	117422	117431	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009649	AGGGA	2	10	118875	118884	40 %	0 %	60 %	0 %	152973532
96	NC_009649	GGAGA	2	10	119636	119645	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009649	ATCGG	2	10	120303	120312	20 %	20 %	40 %	20 %	152973533
98	NC_009649	ACGAT	2	10	120550	120559	40 %	20 %	20 %	20 %	152973533
99	NC_009649	GAGTG	2	10	121335	121344	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009649	GCCAT	2	10	121634	121643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009649	TCGCG	2	10	121738	121747	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009649	GTGCC	2	10	121829	121838	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009649	CTGCG	2	10	121990	121999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009649	TGTCG	2	10	122041	122050	0 %	40 %	40 %	20 %	152973535
105	NC_009649	CCTCA	2	10	122683	122692	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_009649	GCCGC	2	10	123721	123730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_009649	TTTCC	2	10	126822	126831	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009649	CGCAG	2	10	128157	128166	20 %	0 %	40 %	40 %	152973542
109	NC_009649	TGTGG	2	10	128659	128668	0 %	40 %	60 %	0 %	152973543
110	NC_009649	ATGAA	2	10	129551	129560	60 %	20 %	20 %	0 %	152973543
111	NC_009649	GCGTT	2	10	129917	129926	0 %	40 %	40 %	20 %	152973543
112	NC_009649	ATGGT	2	10	132110	132119	20 %	40 %	40 %	0 %	152973547
113	NC_009649	CTGGT	2	10	133763	133772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009649	GTAGC	2	10	134190	134199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009649	GCCGC	2	10	135416	135425	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_009649	TTTCC	2	10	137916	137925	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_009649	GCCGC	2	10	138204	138213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_009649	CATTC	2	10	138669	138678	20 %	40 %	0 %	40 %	152973556
119	NC_009649	GGAAA	2	10	140935	140944	60 %	0 %	40 %	0 %	152973559
120	NC_009649	TTCAG	2	10	143787	143796	20 %	40 %	20 %	20 %	152973564
121	NC_009649	CGTGC	2	10	144159	144168	0 %	20 %	40 %	40 %	152973565
122	NC_009649	TGACC	2	10	145348	145357	20 %	20 %	20 %	40 %	152973566
123	NC_009649	AAGCT	2	10	146753	146762	40 %	20 %	20 %	20 %	152973568
124	NC_009649	TACCG	2	10	151985	151994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009649	TTCGG	2	10	152198	152207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009649	ACCGT	2	10	153204	153213	20 %	20 %	20 %	40 %	152973577
127	NC_009649	TTCTG	2	10	154118	154127	0 %	60 %	20 %	20 %	229269513
128	NC_009649	AGTCC	2	10	154181	154190	20 %	20 %	20 %	40 %	229269513
129	NC_009649	GAAGG	2	10	155885	155894	40 %	0 %	60 %	0 %	152973580
130	NC_009649	TGGGG	2	10	159898	159907	0 %	20 %	80 %	0 %	152973587
131	NC_009649	GCGTG	2	10	161983	161992	0 %	20 %	60 %	20 %	152973589
132	NC_009649	GCAGC	2	10	163769	163778	20 %	0 %	40 %	40 %	152973589
133	NC_009649	TTTAT	2	10	166827	166836	20 %	80 %	0 %	0 %	152973593
134	NC_009649	CCTGT	2	10	168353	168362	0 %	40 %	20 %	40 %	152973593
135	NC_009649	ACCGT	2	10	168729	168738	20 %	20 %	20 %	40 %	152973593
136	NC_009649	TGACC	2	10	169282	169291	20 %	20 %	20 %	40 %	152973594
137	NC_009649	CACGA	2	10	169478	169487	40 %	0 %	20 %	40 %	152973594
138	NC_009649	GGACG	2	10	170527	170536	20 %	0 %	60 %	20 %	152973594
139	NC_009649	GACCT	2	10	171680	171689	20 %	20 %	20 %	40 %	152973594
140	NC_009649	AAGGA	2	10	172974	172983	60 %	0 %	40 %	0 %	152973594
141	NC_009649	CGGGC	2	10	173523	173532	0 %	0 %	60 %	40 %	152973594
142	NC_009649	CGTAT	2	10	175218	175227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009649	TGGTG	2	10	175350	175359	0 %	40 %	60 %	0 %	152973596

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.