MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973419
2	NC_009649	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973421
3	NC_009649	CAACG	2	10	9696	9705	40 %	0 %	20 %	40 %	152973424
4	NC_009649	AGACG	2	10	11975	11984	40 %	0 %	40 %	20 %	152973426
5	NC_009649	TTTGC	2	10	15453	15462	0 %	60 %	20 %	20 %	152973427
6	NC_009649	TGATC	2	10	15495	15504	20 %	40 %	20 %	20 %	152973427
7	NC_009649	AATTC	2	10	17143	17152	40 %	40 %	0 %	20 %	152973429
8	NC_009649	CGCAG	2	10	17161	17170	20 %	0 %	40 %	40 %	152973429
9	NC_009649	AACTG	2	10	18088	18097	40 %	20 %	20 %	20 %	152973429
10	NC_009649	AGACC	2	10	18157	18166	40 %	0 %	20 %	40 %	152973429
11	NC_009649	TGACC	2	10	18880	18889	20 %	20 %	20 %	40 %	152973429
12	NC_009649	CTGTC	2	10	19485	19494	0 %	40 %	20 %	40 %	152973429
13	NC_009649	TTTTC	2	10	20205	20214	0 %	80 %	0 %	20 %	152973430
14	NC_009649	TGCTC	2	10	24760	24769	0 %	40 %	20 %	40 %	152973433
15	NC_009649	AGGCC	2	10	24949	24958	20 %	0 %	40 %	40 %	152973433
16	NC_009649	AAAAT	2	10	26875	26884	80 %	20 %	0 %	0 %	152973435
17	NC_009649	TCTCA	2	10	28989	28998	20 %	40 %	0 %	40 %	152973438
18	NC_009649	GCAGG	2	10	29456	29465	20 %	0 %	60 %	20 %	152973438
19	NC_009649	CTTTT	2	10	29674	29683	0 %	80 %	0 %	20 %	152973439
20	NC_009649	CCAGC	2	10	30228	30237	20 %	0 %	20 %	60 %	152973440
21	NC_009649	TCCCA	2	10	32274	32283	20 %	20 %	0 %	60 %	152973443
22	NC_009649	TGACC	2	10	33058	33067	20 %	20 %	20 %	40 %	152973443
23	NC_009649	TGCTC	2	10	33858	33867	0 %	40 %	20 %	40 %	152973445
24	NC_009649	AGGCC	2	10	34047	34056	20 %	0 %	40 %	40 %	152973444
25	NC_009649	CGCTC	2	10	35327	35336	0 %	20 %	20 %	60 %	152973447
26	NC_009649	GCGCC	2	10	44856	44865	0 %	0 %	40 %	60 %	152973457
27	NC_009649	GCGCA	2	10	45528	45537	20 %	0 %	40 %	40 %	152973457
28	NC_009649	CGGCC	2	10	46093	46102	0 %	0 %	40 %	60 %	152973457
29	NC_009649	CCGTG	2	10	46424	46433	0 %	20 %	40 %	40 %	152973457
30	NC_009649	CGGGC	2	10	48812	48821	0 %	0 %	60 %	40 %	152973461
31	NC_009649	GACGC	2	10	50457	50466	20 %	0 %	40 %	40 %	152973463
32	NC_009649	CTTCC	2	10	53662	53671	0 %	40 %	0 %	60 %	152973466
33	NC_009649	GTGAG	2	10	54188	54197	20 %	20 %	60 %	0 %	152973466
34	NC_009649	GTTCA	2	10	54250	54259	20 %	40 %	20 %	20 %	152973466
35	NC_009649	GTTGA	2	10	55883	55892	20 %	40 %	40 %	0 %	152973469
36	NC_009649	CTTCA	2	10	56289	56298	20 %	40 %	0 %	40 %	152973470
37	NC_009649	CAATC	2	10	56640	56649	40 %	20 %	0 %	40 %	152973471
38	NC_009649	GCCAT	2	10	62457	62466	20 %	20 %	20 %	40 %	152973479
39	NC_009649	CGGGA	2	10	65951	65960	20 %	0 %	60 %	20 %	152973482
40	NC_009649	ACCAT	2	10	67259	67268	40 %	20 %	0 %	40 %	152973484
41	NC_009649	TTCAG	2	10	67543	67552	20 %	40 %	20 %	20 %	152973484
42	NC_009649	TGGAA	2	10	68332	68341	40 %	20 %	40 %	0 %	152973486
43	NC_009649	AGCGG	2	10	68834	68843	20 %	0 %	60 %	20 %	152973487
44	NC_009649	CAGGC	2	10	69531	69540	20 %	0 %	40 %	40 %	152973488
45	NC_009649	GGCAT	2	10	69826	69835	20 %	20 %	40 %	20 %	152973488
46	NC_009649	ATCGA	2	10	70629	70638	40 %	20 %	20 %	20 %	152973489
47	NC_009649	TTCCC	2	10	75102	75111	0 %	40 %	0 %	60 %	152973496
48	NC_009649	AGTTA	2	10	75233	75242	40 %	40 %	20 %	0 %	152973496
49	NC_009649	GGTCA	2	10	78902	78911	20 %	20 %	40 %	20 %	152973499
50	NC_009649	CGTAT	2	10	80243	80252	20 %	40 %	20 %	20 %	152973501
51	NC_009649	ACGCA	2	10	81059	81068	40 %	0 %	20 %	40 %	152973503
52	NC_009649	GACAG	2	10	83087	83096	40 %	0 %	40 %	20 %	152973503
53	NC_009649	ATTCG	2	10	83608	83617	20 %	40 %	20 %	20 %	152973504
54	NC_009649	AGCTC	2	10	91622	91631	20 %	20 %	20 %	40 %	152973509
55	NC_009649	CCGTC	2	10	93333	93342	0 %	20 %	20 %	60 %	152973510
56	NC_009649	CCAGC	2	10	95023	95032	20 %	0 %	20 %	60 %	152973513
57	NC_009649	ATGGC	2	10	95915	95924	20 %	20 %	40 %	20 %	152973514
58	NC_009649	GTGAT	2	10	96593	96602	20 %	40 %	40 %	0 %	152973515
59	NC_009649	TACTG	2	10	98115	98124	20 %	40 %	20 %	20 %	152973516
60	NC_009649	CCCTT	2	10	102044	102053	0 %	40 %	0 %	60 %	152973519
61	NC_009649	CCAGC	2	10	103258	103267	20 %	0 %	20 %	60 %	152973520
62	NC_009649	ATGGC	2	10	104150	104159	20 %	20 %	40 %	20 %	152973521
63	NC_009649	TTTGC	2	10	106714	106723	0 %	60 %	20 %	20 %	152973523
64	NC_009649	TGATC	2	10	106756	106765	20 %	40 %	20 %	20 %	152973523
65	NC_009649	CTTCT	2	10	110782	110791	0 %	60 %	0 %	40 %	152973527
66	NC_009649	ACTGA	2	10	113051	113060	40 %	20 %	20 %	20 %	229269514
67	NC_009649	CTGCA	2	10	113256	113265	20 %	20 %	20 %	40 %	229269514
68	NC_009649	AGGGA	2	10	118875	118884	40 %	0 %	60 %	0 %	152973532
69	NC_009649	ATCGG	2	10	120303	120312	20 %	20 %	40 %	20 %	152973533
70	NC_009649	ACGAT	2	10	120550	120559	40 %	20 %	20 %	20 %	152973533
71	NC_009649	TGTCG	2	10	122041	122050	0 %	40 %	40 %	20 %	152973535
72	NC_009649	CGCAG	2	10	128157	128166	20 %	0 %	40 %	40 %	152973542
73	NC_009649	TGTGG	2	10	128659	128668	0 %	40 %	60 %	0 %	152973543
74	NC_009649	ATGAA	2	10	129551	129560	60 %	20 %	20 %	0 %	152973543
75	NC_009649	GCGTT	2	10	129917	129926	0 %	40 %	40 %	20 %	152973543
76	NC_009649	ATGGT	2	10	132110	132119	20 %	40 %	40 %	0 %	152973547
77	NC_009649	CATTC	2	10	138669	138678	20 %	40 %	0 %	40 %	152973556
78	NC_009649	GGAAA	2	10	140935	140944	60 %	0 %	40 %	0 %	152973559
79	NC_009649	TTCAG	2	10	143787	143796	20 %	40 %	20 %	20 %	152973564
80	NC_009649	CGTGC	2	10	144159	144168	0 %	20 %	40 %	40 %	152973565
81	NC_009649	TGACC	2	10	145348	145357	20 %	20 %	20 %	40 %	152973566
82	NC_009649	AAGCT	2	10	146753	146762	40 %	20 %	20 %	20 %	152973568
83	NC_009649	ACCGT	2	10	153204	153213	20 %	20 %	20 %	40 %	152973577
84	NC_009649	TTCTG	2	10	154118	154127	0 %	60 %	20 %	20 %	229269513
85	NC_009649	AGTCC	2	10	154181	154190	20 %	20 %	20 %	40 %	229269513
86	NC_009649	GAAGG	2	10	155885	155894	40 %	0 %	60 %	0 %	152973580
87	NC_009649	TGGGG	2	10	159898	159907	0 %	20 %	80 %	0 %	152973587
88	NC_009649	GCGTG	2	10	161983	161992	0 %	20 %	60 %	20 %	152973589
89	NC_009649	GCAGC	2	10	163769	163778	20 %	0 %	40 %	40 %	152973589
90	NC_009649	TTTAT	2	10	166827	166836	20 %	80 %	0 %	0 %	152973593
91	NC_009649	CCTGT	2	10	168353	168362	0 %	40 %	20 %	40 %	152973593
92	NC_009649	ACCGT	2	10	168729	168738	20 %	20 %	20 %	40 %	152973593
93	NC_009649	TGACC	2	10	169282	169291	20 %	20 %	20 %	40 %	152973594
94	NC_009649	CACGA	2	10	169478	169487	40 %	0 %	20 %	40 %	152973594
95	NC_009649	GGACG	2	10	170527	170536	20 %	0 %	60 %	20 %	152973594
96	NC_009649	GACCT	2	10	171680	171689	20 %	20 %	20 %	40 %	152973594
97	NC_009649	AAGGA	2	10	172974	172983	60 %	0 %	40 %	0 %	152973594
98	NC_009649	CGGGC	2	10	173523	173532	0 %	0 %	60 %	40 %	152973594
99	NC_009649	TGGTG	2	10	175350	175359	0 %	40 %	60 %	0 %	152973596

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.