MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973418
2	NC_009649	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
3	NC_009649	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973419
4	NC_009649	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973419
5	NC_009649	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
6	NC_009649	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973420
7	NC_009649	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973421
8	NC_009649	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973421
9	NC_009649	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973423
10	NC_009649	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973423
11	NC_009649	TTTC	2	8	8243	8250	0 %	75 %	0 %	25 %	152973424
12	NC_009649	TGAG	2	8	8854	8861	25 %	25 %	50 %	0 %	152973424
13	NC_009649	ATTC	2	8	9389	9396	25 %	50 %	0 %	25 %	152973424
14	NC_009649	AGCC	2	8	9847	9854	25 %	0 %	25 %	50 %	152973424
15	NC_009649	CAGG	2	8	10090	10097	25 %	0 %	50 %	25 %	152973424
16	NC_009649	AAGA	2	8	10098	10105	75 %	0 %	25 %	0 %	152973424
17	NC_009649	CAGT	2	8	10498	10505	25 %	25 %	25 %	25 %	152973425
18	NC_009649	GCAG	2	8	10771	10778	25 %	0 %	50 %	25 %	152973425
19	NC_009649	CTTG	2	8	10818	10825	0 %	50 %	25 %	25 %	152973425
20	NC_009649	GCCT	2	8	10886	10893	0 %	25 %	25 %	50 %	152973425
21	NC_009649	CCGT	2	8	11154	11161	0 %	25 %	25 %	50 %	152973425
22	NC_009649	CTTC	2	8	11167	11174	0 %	50 %	0 %	50 %	152973425
23	NC_009649	ACTG	2	8	11324	11331	25 %	25 %	25 %	25 %	152973425
24	NC_009649	AGAA	2	8	11373	11380	75 %	0 %	25 %	0 %	152973425
25	NC_009649	TTCT	2	8	11762	11769	0 %	75 %	0 %	25 %	152973426
26	NC_009649	TCAA	2	8	12318	12325	50 %	25 %	0 %	25 %	152973426
27	NC_009649	TGAC	2	8	12697	12704	25 %	25 %	25 %	25 %	152973426
28	NC_009649	CAGG	2	8	12808	12815	25 %	0 %	50 %	25 %	152973426
29	NC_009649	TTTC	2	8	13290	13297	0 %	75 %	0 %	25 %	152973426
30	NC_009649	ACGC	2	8	14551	14558	25 %	0 %	25 %	50 %	152973427
31	NC_009649	TGCC	2	8	15166	15173	0 %	25 %	25 %	50 %	152973427
32	NC_009649	CCAG	2	8	15381	15388	25 %	0 %	25 %	50 %	152973427
33	NC_009649	TTCA	2	8	15611	15618	25 %	50 %	0 %	25 %	152973428
34	NC_009649	CATA	2	8	15736	15743	50 %	25 %	0 %	25 %	152973428
35	NC_009649	CTGG	2	8	15836	15843	0 %	25 %	50 %	25 %	152973428
36	NC_009649	GCCA	2	8	15968	15975	25 %	0 %	25 %	50 %	152973428
37	NC_009649	CCAG	2	8	16339	16346	25 %	0 %	25 %	50 %	152973428
38	NC_009649	ATAA	2	8	17427	17434	75 %	25 %	0 %	0 %	152973429
39	NC_009649	GAAA	2	8	17682	17689	75 %	0 %	25 %	0 %	152973429
40	NC_009649	TCAA	2	8	17937	17944	50 %	25 %	0 %	25 %	152973429
41	NC_009649	CGGG	2	8	18530	18537	0 %	0 %	75 %	25 %	152973429
42	NC_009649	ATTC	2	8	18595	18602	25 %	50 %	0 %	25 %	152973429
43	NC_009649	AGTG	2	8	19288	19295	25 %	25 %	50 %	0 %	152973429
44	NC_009649	CCAG	2	8	19756	19763	25 %	0 %	25 %	50 %	152973429
45	NC_009649	GCAG	2	8	20766	20773	25 %	0 %	50 %	25 %	152973430
46	NC_009649	TGGC	2	8	21100	21107	0 %	25 %	50 %	25 %	152973430
47	NC_009649	CCCA	2	8	21710	21717	25 %	0 %	0 %	75 %	152973431
48	NC_009649	GCGG	2	8	22114	22121	0 %	0 %	75 %	25 %	152973431
49	NC_009649	TCAT	2	8	22242	22249	25 %	50 %	0 %	25 %	152973431
50	NC_009649	CTCC	2	8	22285	22292	0 %	25 %	0 %	75 %	152973431
51	NC_009649	CATG	2	8	22464	22471	25 %	25 %	25 %	25 %	152973431
52	NC_009649	CATG	2	8	22517	22524	25 %	25 %	25 %	25 %	152973431
53	NC_009649	ATGC	2	8	23477	23484	25 %	25 %	25 %	25 %	152973432
54	NC_009649	GCTG	2	8	24421	24428	0 %	25 %	50 %	25 %	152973433
55	NC_009649	ATTC	2	8	26358	26365	25 %	50 %	0 %	25 %	152973435
56	NC_009649	TATT	2	8	26497	26504	25 %	75 %	0 %	0 %	152973435
57	NC_009649	TAAA	2	8	26533	26540	75 %	25 %	0 %	0 %	152973435
58	NC_009649	GTGG	2	8	26585	26592	0 %	25 %	75 %	0 %	152973435
59	NC_009649	TGAT	2	8	27508	27515	25 %	50 %	25 %	0 %	152973436
60	NC_009649	AAGG	2	8	27546	27553	50 %	0 %	50 %	0 %	152973436
61	NC_009649	ATGA	2	8	28070	28077	50 %	25 %	25 %	0 %	152973437
62	NC_009649	TATT	2	8	28554	28561	25 %	75 %	0 %	0 %	152973437
63	NC_009649	TAAC	2	8	29870	29877	50 %	25 %	0 %	25 %	152973439
64	NC_009649	CGCC	2	8	30210	30217	0 %	0 %	25 %	75 %	152973440
65	NC_009649	GCAT	2	8	31659	31666	25 %	25 %	25 %	25 %	152973442
66	NC_009649	GTTC	2	8	32234	32241	0 %	50 %	25 %	25 %	152973443
67	NC_009649	GCTG	2	8	33519	33526	0 %	25 %	50 %	25 %	152973445
68	NC_009649	CTCG	2	8	35383	35390	0 %	25 %	25 %	50 %	152973447
69	NC_009649	GGTC	2	8	35391	35398	0 %	25 %	50 %	25 %	152973447
70	NC_009649	CAGC	2	8	35740	35747	25 %	0 %	25 %	50 %	152973447
71	NC_009649	CTTG	2	8	35830	35837	0 %	50 %	25 %	25 %	152973448
72	NC_009649	CTGC	2	8	36701	36708	0 %	25 %	25 %	50 %	152973449
73	NC_009649	CGGT	2	8	37064	37071	0 %	25 %	50 %	25 %	152973449
74	NC_009649	TCGG	2	8	37154	37161	0 %	25 %	50 %	25 %	152973449
75	NC_009649	ACCA	2	8	37588	37595	50 %	0 %	0 %	50 %	152973450
76	NC_009649	GATC	2	8	38337	38344	25 %	25 %	25 %	25 %	152973450
77	NC_009649	ACCT	2	8	38805	38812	25 %	25 %	0 %	50 %	152973451
78	NC_009649	GCTG	2	8	39023	39030	0 %	25 %	50 %	25 %	152973451
79	NC_009649	GCCA	2	8	41184	41191	25 %	0 %	25 %	50 %	152973453
80	NC_009649	GCCA	2	8	42025	42032	25 %	0 %	25 %	50 %	152973454
81	NC_009649	GCGG	2	8	42316	42323	0 %	0 %	75 %	25 %	152973454
82	NC_009649	GCTG	2	8	42865	42872	0 %	25 %	50 %	25 %	152973455
83	NC_009649	CCTG	2	8	44318	44325	0 %	25 %	25 %	50 %	152973456
84	NC_009649	CGGC	2	8	46894	46901	0 %	0 %	50 %	50 %	152973457
85	NC_009649	GCGA	2	8	47337	47344	25 %	0 %	50 %	25 %	152973457
86	NC_009649	GGCG	2	8	47356	47363	0 %	0 %	75 %	25 %	152973458
87	NC_009649	CGCT	2	8	47526	47533	0 %	25 %	25 %	50 %	152973458
88	NC_009649	AGCA	2	8	48060	48067	50 %	0 %	25 %	25 %	152973459
89	NC_009649	TGGC	2	8	48669	48676	0 %	25 %	50 %	25 %	152973460
90	NC_009649	GGCT	2	8	50562	50569	0 %	25 %	50 %	25 %	152973463
91	NC_009649	CATC	2	8	51469	51476	25 %	25 %	0 %	50 %	152973464
92	NC_009649	CCAG	2	8	51847	51854	25 %	0 %	25 %	50 %	152973464
93	NC_009649	GCAG	2	8	52201	52208	25 %	0 %	50 %	25 %	152973464
94	NC_009649	AAAG	2	8	52452	52459	75 %	0 %	25 %	0 %	152973464
95	NC_009649	CTGA	2	8	52633	52640	25 %	25 %	25 %	25 %	152973464
96	NC_009649	TGAA	2	8	52969	52976	50 %	25 %	25 %	0 %	152973465
97	NC_009649	TCAT	2	8	52987	52994	25 %	50 %	0 %	25 %	152973465
98	NC_009649	CAGA	2	8	53205	53212	50 %	0 %	25 %	25 %	152973465
99	NC_009649	CTGT	2	8	53223	53230	0 %	50 %	25 %	25 %	152973465
100	NC_009649	GTTC	2	8	53424	53431	0 %	50 %	25 %	25 %	152973465
101	NC_009649	TCAT	2	8	53435	53442	25 %	50 %	0 %	25 %	152973465
102	NC_009649	GTCG	2	8	53820	53827	0 %	25 %	50 %	25 %	152973466
103	NC_009649	AACA	2	8	54421	54428	75 %	0 %	0 %	25 %	152973466
104	NC_009649	AGCC	2	8	54606	54613	25 %	0 %	25 %	50 %	152973466
105	NC_009649	ATAA	2	8	55106	55113	75 %	25 %	0 %	0 %	152973467
106	NC_009649	GCGA	2	8	55380	55387	25 %	0 %	50 %	25 %	152973468
107	NC_009649	AACG	2	8	55512	55519	50 %	0 %	25 %	25 %	152973468
108	NC_009649	CAGC	2	8	55601	55608	25 %	0 %	25 %	50 %	152973468
109	NC_009649	CATG	2	8	56252	56259	25 %	25 %	25 %	25 %	152973470
110	NC_009649	AGCC	2	8	56473	56480	25 %	0 %	25 %	50 %	152973471
111	NC_009649	CCCA	2	8	56558	56565	25 %	0 %	0 %	75 %	152973471
112	NC_009649	GCAG	2	8	58020	58027	25 %	0 %	50 %	25 %	152973474
113	NC_009649	CAGC	2	8	58267	58274	25 %	0 %	25 %	50 %	152973474
114	NC_009649	CATC	2	8	58718	58725	25 %	25 %	0 %	50 %	152973475
115	NC_009649	TTCC	2	8	59308	59315	0 %	50 %	0 %	50 %	152973476
116	NC_009649	CCAG	2	8	60692	60699	25 %	0 %	25 %	50 %	152973478
117	NC_009649	TGGT	2	8	60706	60713	0 %	50 %	50 %	0 %	152973478
118	NC_009649	TCGC	2	8	60826	60833	0 %	25 %	25 %	50 %	152973478
119	NC_009649	CAGC	2	8	62106	62113	25 %	0 %	25 %	50 %	152973479
120	NC_009649	ACCG	2	8	63046	63053	25 %	0 %	25 %	50 %	152973480
121	NC_009649	CCAG	2	8	63495	63502	25 %	0 %	25 %	50 %	152973481
122	NC_009649	CAGG	2	8	66516	66523	25 %	0 %	50 %	25 %	152973483
123	NC_009649	CTGC	2	8	66729	66736	0 %	25 %	25 %	50 %	152973483
124	NC_009649	TCCG	2	8	67010	67017	0 %	25 %	25 %	50 %	152973484
125	NC_009649	GATT	2	8	67054	67061	25 %	50 %	25 %	0 %	152973484
126	NC_009649	CAAT	2	8	67630	67637	50 %	25 %	0 %	25 %	152973485
127	NC_009649	AGGA	2	8	68278	68285	50 %	0 %	50 %	0 %	152973486
128	NC_009649	GCAT	2	8	68429	68436	25 %	25 %	25 %	25 %	152973486
129	NC_009649	AACA	2	8	69783	69790	75 %	0 %	0 %	25 %	152973488
130	NC_009649	AGAA	2	8	70645	70652	75 %	0 %	25 %	0 %	152973489
131	NC_009649	GTCA	2	8	70746	70753	25 %	25 %	25 %	25 %	152973489
132	NC_009649	CATG	2	8	71030	71037	25 %	25 %	25 %	25 %	152973490
133	NC_009649	CATG	2	8	71777	71784	25 %	25 %	25 %	25 %	152973491
134	NC_009649	CAGT	2	8	73475	73482	25 %	25 %	25 %	25 %	152973493
135	NC_009649	GCTG	2	8	73572	73579	0 %	25 %	50 %	25 %	152973493
136	NC_009649	GACG	2	8	73699	73706	25 %	0 %	50 %	25 %	152973493
137	NC_009649	ATCA	2	8	74354	74361	50 %	25 %	0 %	25 %	152973495
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.