MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009648	GCTGAT	2	12	11337	11348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009648	GCCCTG	2	12	69615	69626	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009648	AGCGCG	2	12	81348	81359	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009648	AAATTA	2	12	90404	90415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009648	TTTTTA	2	12	95753	95764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009648	AAATAT	2	12	155066	155077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009648	AATATC	2	12	305271	305282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009648	TTCAAT	2	12	312936	312947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009648	ATATCG	2	12	319710	319721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009648	GCGCTC	2	12	368905	368916	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009648	TTCCTG	2	12	395804	395815	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009648	AAGACA	2	12	476877	476888	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009648	TCTCTT	2	12	533558	533569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009648	GGCGAT	2	12	533923	533934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009648	TTATTT	2	12	546417	546428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009648	GCTGAC	2	12	572341	572352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009648	CCCGGC	2	12	609246	609257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009648	CCAGCA	2	12	609905	609916	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009648	TCCCTC	2	12	611498	611509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009648	CCGCTG	2	12	623071	623082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009648	AGGGTG	2	12	632101	632112	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009648	GCTCCC	2	12	641631	641642	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009648	AGCTGG	2	12	641782	641793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009648	GGCCAA	2	12	649613	649624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009648	GGATTT	2	12	661171	661182	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009648	ACGTTA	2	12	666136	666147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009648	TGCAAA	2	12	681565	681576	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009648	TTATCG	2	12	689869	689880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009648	CTCCCT	2	12	708977	708988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009648	CGAAGC	2	12	742516	742527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009648	TGCTCA	2	12	777181	777192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009648	GAAAAA	2	12	781422	781433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009648	TGGCGA	2	12	814188	814199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009648	GCCAGC	2	12	897831	897842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009648	TTAATA	2	12	975497	975508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009648	GACGTG	2	12	986480	986491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009648	AAATAT	2	12	1129658	1129669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009648	CAAAGG	2	12	1155530	1155541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009648	AGGGAG	2	12	1172289	1172300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009648	GTCGGC	2	12	1258869	1258880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009648	ATCGTC	2	12	1268356	1268367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009648	CTTTTC	2	12	1298091	1298102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009648	ATTTTC	2	12	1329042	1329053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009648	GATGCC	2	12	1360327	1360338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009648	TGGTTG	2	12	1362756	1362767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009648	GGGAAA	2	12	1387131	1387142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009648	GGCGCG	2	12	1394965	1394976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009648	GAAACA	2	12	1414829	1414840	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009648	GCGGTC	2	12	1414942	1414953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009648	AAGGAG	2	12	1432229	1432240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009648	TGGCGA	2	12	1467498	1467509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009648	CCAACC	2	12	1475024	1475035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009648	TATTCA	2	12	1501848	1501859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009648	CAGCCC	2	12	1540164	1540175	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009648	TGTAAG	2	12	1600182	1600193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009648	TGGCGC	2	12	1601424	1601435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009648	CCTGGC	2	12	1624907	1624918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009648	CGCGCA	2	12	1666867	1666878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009648	GATCAA	2	12	1721305	1721316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009648	CAGCAC	2	12	1736948	1736959	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009648	AATACG	2	12	1738956	1738967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009648	CAGGAT	2	12	1745942	1745953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009648	ATCTTT	2	12	1771495	1771506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009648	CCGCTG	2	12	1785782	1785793	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009648	GCTTTG	2	12	1793057	1793068	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009648	CGAACA	2	12	1801951	1801962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009648	ATGGGG	2	12	1820510	1820521	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009648	GCTGGG	2	12	1827729	1827740	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009648	TTCAGG	2	12	1832020	1832031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009648	CAGCGC	2	12	1863964	1863975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009648	AGCGCC	2	12	1864265	1864276	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009648	GAGTAG	2	12	1877911	1877922	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009648	AAACAA	2	12	1882619	1882630	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009648	ATCTGT	2	12	1900466	1900477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009648	GCCACC	2	12	1916774	1916785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009648	AGCGCA	2	12	1940649	1940660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009648	CGGGTG	2	12	1977853	1977864	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009648	TCACCC	2	12	1992832	1992843	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009648	AATCTC	2	12	2009423	2009434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009648	ACATAA	2	12	2013735	2013746	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009648	GCTAAG	2	12	2014130	2014141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009648	TTTCCC	2	12	2038319	2038330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009648	CCAGAC	2	12	2094942	2094953	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009648	TGACGC	2	12	2095407	2095418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009648	TGCCTC	2	12	2117349	2117360	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009648	TATGTT	2	12	2137940	2137951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009648	AAAAAG	2	12	2171202	2171213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009648	CAGCGC	2	12	2172612	2172623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009648	CTGCGT	2	12	2187775	2187786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009648	ACCGGC	2	12	2204732	2204743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009648	TCGGTC	2	12	2229959	2229970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009648	TGCTGG	2	12	2252219	2252230	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009648	GTGTAA	2	12	2257848	2257859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009648	CGTCAT	2	12	2290218	2290229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009648	CTGCCG	2	12	2292600	2292611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009648	GGGTAT	2	12	2428313	2428324	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009648	TTATAA	2	12	2445798	2445809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009648	GAATAA	2	12	2564465	2564476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009648	AGATAA	2	12	2580970	2580981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009648	CGCTTG	2	12	2593086	2593097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009648	CGTTTT	2	12	2608085	2608096	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009648	AAAATA	2	12	2623290	2623301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009648	AGCGTC	2	12	2669203	2669214	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009648	AATAAA	2	12	2677306	2677317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009648	GCGGAT	2	12	2683790	2683801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009648	GATTCG	2	12	2688185	2688196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_009648	AACTGA	2	12	2706795	2706806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009648	AATGTG	2	12	2719375	2719386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009648	AATGAG	2	12	2745711	2745722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009648	GAAAGT	2	12	2843629	2843640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009648	TCTCGT	2	12	2863234	2863245	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009648	GCAAAA	2	12	2891799	2891810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009648	CATTAA	2	12	2949794	2949805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009648	GGGGAG	2	12	2951956	2951967	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009648	AGAAAA	2	12	2973487	2973498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009648	TCATTG	2	12	3001310	3001321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009648	AAAAAC	2	12	3020558	3020569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009648	CAAGTG	2	12	3029421	3029432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009648	AGCCAC	2	12	3054858	3054869	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009648	CGGCAT	2	12	3105051	3105062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009648	CTGGCG	2	12	3105847	3105858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009648	CCATGC	2	12	3114067	3114078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009648	GCAGGG	2	12	3199173	3199184	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009648	AAAGGC	2	12	3240350	3240361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009648	TAAGGG	2	12	3253043	3253054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009648	GCAGCC	2	12	3268084	3268095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009648	ATGAAA	2	12	3279772	3279783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009648	GCTGGC	2	12	3295764	3295775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009648	GGTTTA	2	12	3297723	3297734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009648	GCTGGC	2	12	3297995	3298006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009648	TCGACA	2	12	3358596	3358607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009648	GTAAGC	2	12	3431022	3431033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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134	NC_009648	GATAAA	2	12	3485734	3485745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_009648	GCGATC	2	12	3582453	3582464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_009648	TTCACT	2	12	3647669	3647680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_009648	AGTCCG	2	12	3721398	3721409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009648	AGTCCG	2	12	3721561	3721572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_009648	CCAGGC	2	12	3725476	3725487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009648	GCCTGC	2	12	3765740	3765751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009648	TTGACC	2	12	3795632	3795643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_009648	CGATCC	2	12	3854958	3854969	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_009648	AATGAT	2	12	3861194	3861205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_009648	ACAAAA	2	12	3945607	3945618	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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165	NC_009648	ATGGGG	2	12	4054241	4054252	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_009648	CAGCGA	2	12	5282101	5282112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.