MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 chromosome

Total Repeats: 3527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009648	CCGGG	2	10	1301	1310	0 %	0 %	60 %	40 %	152968584
2	NC_009648	CGCTG	2	10	3115	3124	0 %	20 %	40 %	40 %	152968585
3	NC_009648	GGCCG	2	10	7671	7680	0 %	0 %	60 %	40 %	152968589
4	NC_009648	GTGAA	2	10	9062	9071	40 %	20 %	40 %	0 %	152968590
5	NC_009648	TACGG	2	10	11037	11046	20 %	20 %	40 %	20 %	152968592
6	NC_009648	GCTGA	2	10	13053	13062	20 %	20 %	40 %	20 %	152968595
7	NC_009648	CTCGC	2	10	18086	18095	0 %	20 %	20 %	60 %	152968598
8	NC_009648	AAGGG	2	10	18316	18325	40 %	0 %	60 %	0 %	152968599
9	NC_009648	TCGAC	2	10	18611	18620	20 %	20 %	20 %	40 %	152968599
10	NC_009648	CGGTG	2	10	21734	21743	0 %	20 %	60 %	20 %	152968602
11	NC_009648	ATCGA	2	10	22101	22110	40 %	20 %	20 %	20 %	152968602
12	NC_009648	GTGAC	2	10	24078	24087	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009648	CGAAG	2	10	24876	24885	40 %	0 %	40 %	20 %	152968605
14	NC_009648	TGCTA	2	10	25219	25228	20 %	40 %	20 %	20 %	152968605
15	NC_009648	GCCGA	2	10	25990	25999	20 %	0 %	40 %	40 %	152968606
16	NC_009648	CTGCA	2	10	27987	27996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009648	GTCGG	2	10	28741	28750	0 %	20 %	60 %	20 %	152968609
18	NC_009648	CAGAA	2	10	30954	30963	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009648	GCCGA	2	10	31103	31112	20 %	0 %	40 %	40 %	152968611
20	NC_009648	GCCGA	2	10	31226	31235	20 %	0 %	40 %	40 %	152968611
21	NC_009648	CGGCG	2	10	31507	31516	0 %	0 %	60 %	40 %	152968611
22	NC_009648	GCGCG	2	10	32457	32466	0 %	0 %	60 %	40 %	152968612
23	NC_009648	GCACC	2	10	34784	34793	20 %	0 %	20 %	60 %	152968614
24	NC_009648	TTAAT	2	10	36010	36019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009648	CGCTG	2	10	38034	38043	0 %	20 %	40 %	40 %	152968617
26	NC_009648	GCGCA	2	10	39750	39759	20 %	0 %	40 %	40 %	152968618
27	NC_009648	GCCGC	2	10	43439	43448	0 %	0 %	40 %	60 %	152968621
28	NC_009648	CTGCG	2	10	45253	45262	0 %	20 %	40 %	40 %	152968622
29	NC_009648	CGTAC	2	10	46202	46211	20 %	20 %	20 %	40 %	152968622
30	NC_009648	TGCAC	2	10	47853	47862	20 %	20 %	20 %	40 %	152968624
31	NC_009648	GCCAT	2	10	50039	50048	20 %	20 %	20 %	40 %	152968626
32	NC_009648	CCGGG	2	10	50917	50926	0 %	0 %	60 %	40 %	152968627
33	NC_009648	TCGCT	2	10	53232	53241	0 %	40 %	20 %	40 %	152968630
34	NC_009648	TTGCT	2	10	56068	56077	0 %	60 %	20 %	20 %	152968632
35	NC_009648	TTGCG	2	10	57363	57372	0 %	40 %	40 %	20 %	152968632
36	NC_009648	ACGCT	2	10	62563	62572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009648	CACGT	2	10	64630	64639	20 %	20 %	20 %	40 %	152968639
38	NC_009648	CGCGG	2	10	65335	65344	0 %	0 %	60 %	40 %	152968639
39	NC_009648	CTGTC	2	10	67133	67142	0 %	40 %	20 %	40 %	152968640
40	NC_009648	AGCGC	2	10	69630	69639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009648	CAGCG	2	10	70515	70524	20 %	0 %	40 %	40 %	152968642
42	NC_009648	GCCGG	2	10	70815	70824	0 %	0 %	60 %	40 %	152968642
43	NC_009648	CGAGC	2	10	70940	70949	20 %	0 %	40 %	40 %	152968642
44	NC_009648	GCTGT	2	10	71552	71561	0 %	40 %	40 %	20 %	152968642
45	NC_009648	GGCCA	2	10	72997	73006	20 %	0 %	40 %	40 %	152968643
46	NC_009648	AGCGA	2	10	73492	73501	40 %	0 %	40 %	20 %	152968643
47	NC_009648	GGGGC	2	10	74470	74479	0 %	0 %	80 %	20 %	152968644
48	NC_009648	CAGCA	2	10	75336	75345	40 %	0 %	20 %	40 %	152968645
49	NC_009648	GCGCG	2	10	75877	75886	0 %	0 %	60 %	40 %	152968646
50	NC_009648	GCCCA	2	10	82923	82932	20 %	0 %	20 %	60 %	152968652
51	NC_009648	TTATA	2	10	84217	84226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009648	CCGAA	2	10	85262	85271	40 %	0 %	20 %	40 %	152968654
53	NC_009648	AAAGC	2	10	86254	86263	60 %	0 %	20 %	20 %	152968655
54	NC_009648	GCCGC	2	10	87635	87644	0 %	0 %	40 %	60 %	152968656
55	NC_009648	CAGCG	2	10	89005	89014	20 %	0 %	40 %	40 %	152968657
56	NC_009648	GCGAT	2	10	89026	89035	20 %	20 %	40 %	20 %	152968657
57	NC_009648	TCTCT	2	10	90092	90101	0 %	60 %	0 %	40 %	152968657
58	NC_009648	TGCAG	2	10	90299	90308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009648	AATAA	2	10	90448	90457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009648	GACCG	2	10	93883	93892	20 %	0 %	40 %	40 %	152968661
61	NC_009648	CCGGT	2	10	97788	97797	0 %	20 %	40 %	40 %	152968663
62	NC_009648	AGCTG	2	10	100239	100248	20 %	20 %	40 %	20 %	152968665
63	NC_009648	TTATT	3	15	100870	100884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009648	GTCGC	2	10	103270	103279	0 %	20 %	40 %	40 %	152968669
65	NC_009648	ATCGC	2	10	104617	104626	20 %	20 %	20 %	40 %	152968669
66	NC_009648	AGCGC	2	10	105898	105907	20 %	0 %	40 %	40 %	152968670
67	NC_009648	CTGCA	2	10	106024	106033	20 %	20 %	20 %	40 %	152968670
68	NC_009648	CGGGG	2	10	108481	108490	0 %	0 %	80 %	20 %	152968672
69	NC_009648	CAGCG	2	10	109071	109080	20 %	0 %	40 %	40 %	152968673
70	NC_009648	CGCTG	2	10	110240	110249	0 %	20 %	40 %	40 %	152968674
71	NC_009648	CGGCG	2	10	111251	111260	0 %	0 %	60 %	40 %	152968674
72	NC_009648	CGGCG	2	10	112306	112315	0 %	0 %	60 %	40 %	152968675
73	NC_009648	GATCC	2	10	113836	113845	20 %	20 %	20 %	40 %	152968676
74	NC_009648	AGCCG	2	10	114429	114438	20 %	0 %	40 %	40 %	152968677
75	NC_009648	CCGGC	2	10	120801	120810	0 %	0 %	40 %	60 %	152968683
76	NC_009648	CGCTG	2	10	121693	121702	0 %	20 %	40 %	40 %	152968683
77	NC_009648	GCGCG	2	10	123961	123970	0 %	0 %	60 %	40 %	152968686
78	NC_009648	CAAAT	2	10	125049	125058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009648	AGCGC	2	10	127038	127047	20 %	0 %	40 %	40 %	152968689
80	NC_009648	GGCAG	2	10	128383	128392	20 %	0 %	60 %	20 %	152968690
81	NC_009648	CTGTT	2	10	128891	128900	0 %	60 %	20 %	20 %	152968690
82	NC_009648	GCGCT	2	10	132034	132043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009648	CGAGA	2	10	135101	135110	40 %	0 %	40 %	20 %	152968697
84	NC_009648	TTGTT	2	10	136295	136304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009648	GACTG	2	10	138727	138736	20 %	20 %	40 %	20 %	152968699
86	NC_009648	TATGG	2	10	138859	138868	20 %	40 %	40 %	0 %	152968699
87	NC_009648	GAAGA	2	10	140616	140625	60 %	0 %	40 %	0 %	152968700
88	NC_009648	GGCCA	2	10	144536	144545	20 %	0 %	40 %	40 %	152968703
89	NC_009648	GCTGG	2	10	145379	145388	0 %	20 %	60 %	20 %	152968704
90	NC_009648	GCGCT	2	10	145695	145704	0 %	20 %	40 %	40 %	152968704
91	NC_009648	CATCA	2	10	146334	146343	40 %	20 %	0 %	40 %	152968704
92	NC_009648	CTGGT	2	10	148770	148779	0 %	40 %	40 %	20 %	152968705
93	NC_009648	CAGGT	2	10	151353	151362	20 %	20 %	40 %	20 %	152968708
94	NC_009648	CCGTC	2	10	152514	152523	0 %	20 %	20 %	60 %	152968709
95	NC_009648	CGGCG	2	10	154384	154393	0 %	0 %	60 %	40 %	152968709
96	NC_009648	CAGCG	2	10	154420	154429	20 %	0 %	40 %	40 %	152968709
97	NC_009648	GCCGC	2	10	156299	156308	0 %	0 %	40 %	60 %	152968712
98	NC_009648	GCATG	2	10	156853	156862	20 %	20 %	40 %	20 %	152968712
99	NC_009648	CAGCG	2	10	159505	159514	20 %	0 %	40 %	40 %	152968713
100	NC_009648	GTTCA	2	10	160713	160722	20 %	40 %	20 %	20 %	152968715
101	NC_009648	CACGA	2	10	161324	161333	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009648	GGTCA	2	10	161524	161533	20 %	20 %	40 %	20 %	152968716
103	NC_009648	GTTTC	2	10	163880	163889	0 %	60 %	20 %	20 %	152968719
104	NC_009648	CGCGG	2	10	166356	166365	0 %	0 %	60 %	40 %	152968722
105	NC_009648	GGCGC	2	10	167691	167700	0 %	0 %	60 %	40 %	152968724
106	NC_009648	GGCGC	2	10	167727	167736	0 %	0 %	60 %	40 %	152968724
107	NC_009648	GGCGT	2	10	168806	168815	0 %	20 %	60 %	20 %	152968724
108	NC_009648	CTGGC	2	10	173140	173149	0 %	20 %	40 %	40 %	152968729
109	NC_009648	ATCGC	2	10	173510	173519	20 %	20 %	20 %	40 %	152968729
110	NC_009648	GCGCC	3	15	175888	175902	0 %	0 %	40 %	60 %	152968731
111	NC_009648	CAGGG	2	10	177254	177263	20 %	0 %	60 %	20 %	152968733
112	NC_009648	GAGCA	2	10	177382	177391	40 %	0 %	40 %	20 %	152968733
113	NC_009648	GCCAG	2	10	179554	179563	20 %	0 %	40 %	40 %	152968736
114	NC_009648	AGCGC	2	10	181082	181091	20 %	0 %	40 %	40 %	152968739
115	NC_009648	AGGGC	2	10	181178	181187	20 %	0 %	60 %	20 %	152968739
116	NC_009648	CTGGC	2	10	184364	184373	0 %	20 %	40 %	40 %	152968741
117	NC_009648	TGGCG	2	10	186992	187001	0 %	20 %	60 %	20 %	152968744
118	NC_009648	ATAAC	2	10	189725	189734	60 %	20 %	0 %	20 %	152968744
119	NC_009648	ACTTT	2	10	191086	191095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009648	CTTGC	2	10	194249	194258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009648	GCGCG	2	10	197466	197475	0 %	0 %	60 %	40 %	152968748
122	NC_009648	TCAGT	2	10	200697	200706	20 %	40 %	20 %	20 %	152968750
123	NC_009648	GACCG	2	10	200803	200812	20 %	0 %	40 %	40 %	152968750
124	NC_009648	CGAGG	2	10	201121	201130	20 %	0 %	60 %	20 %	152968750
125	NC_009648	TCTGG	2	10	202086	202095	0 %	40 %	40 %	20 %	152968751
126	NC_009648	CGTGG	2	10	203910	203919	0 %	20 %	60 %	20 %	152968753
127	NC_009648	GCGCT	2	10	204558	204567	0 %	20 %	40 %	40 %	152968754
128	NC_009648	GCCAG	2	10	204980	204989	20 %	0 %	40 %	40 %	152968754
129	NC_009648	CGCGG	2	10	205162	205171	0 %	0 %	60 %	40 %	152968754
130	NC_009648	TGCGC	2	10	206519	206528	0 %	20 %	40 %	40 %	152968756
131	NC_009648	ACCTG	2	10	206608	206617	20 %	20 %	20 %	40 %	152968756
132	NC_009648	TGCGC	2	10	208213	208222	0 %	20 %	40 %	40 %	152968757
133	NC_009648	GAACT	2	10	208556	208565	40 %	20 %	20 %	20 %	152968757
134	NC_009648	TACCG	2	10	210049	210058	20 %	20 %	20 %	40 %	152968758
135	NC_009648	TAGCC	2	10	213656	213665	20 %	20 %	20 %	40 %	152968761
136	NC_009648	CGATT	2	10	214063	214072	20 %	40 %	20 %	20 %	152968761
137	NC_009648	CTGAA	2	10	215886	215895	40 %	20 %	20 %	20 %	395342342
138	NC_009648	AAGCG	2	10	215950	215959	40 %	0 %	40 %	20 %	395342342
139	NC_009648	GTCTG	2	10	218407	218416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009648	TTGCG	2	10	219091	219100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009648	CGTCT	2	10	219762	219771	0 %	40 %	20 %	40 %	152968767
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149	NC_009648	CGCGG	2	10	229714	229723	0 %	0 %	60 %	40 %	152968776
150	NC_009648	CAGCG	2	10	230657	230666	20 %	0 %	40 %	40 %	152968777
151	NC_009648	ACGGG	2	10	231039	231048	20 %	0 %	60 %	20 %	152968778
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154	NC_009648	GTTTA	2	10	244573	244582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_009648	CAGGC	2	10	266605	266614	20 %	0 %	40 %	40 %	152968808
177	NC_009648	GGTTA	2	10	266643	266652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009648	TGCGA	2	10	269647	269656	20 %	20 %	40 %	20 %	152968810
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386	NC_009648	GCTGC	2	10	552218	552227	0 %	20 %	40 %	40 %	152969073
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396	NC_009648	CGCGA	2	10	566799	566808	20 %	0 %	40 %	40 %	152969084
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