MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 chromosome

Total Repeats: 634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009648	GTGAC	2	10	24078	24087	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009648	CTGCA	2	10	27987	27996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009648	CAGAA	2	10	30954	30963	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009648	TTAAT	2	10	36010	36019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009648	ACGCT	2	10	62563	62572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009648	AGCGC	2	10	69630	69639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009648	TTATA	2	10	84217	84226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009648	TGCAG	2	10	90299	90308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009648	AATAA	2	10	90448	90457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009648	TTATT	3	15	100870	100884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009648	CAAAT	2	10	125049	125058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009648	GCGCT	2	10	132034	132043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009648	TTGTT	2	10	136295	136304	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009648	CACGA	2	10	161324	161333	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009648	ACTTT	2	10	191086	191095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009648	CTTGC	2	10	194249	194258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009648	GTCTG	2	10	218407	218416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009648	TTGCG	2	10	219091	219100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009648	TCGCC	2	10	226187	226196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009648	GTTTA	2	10	244573	244582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009648	GCGTT	2	10	249132	249141	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009648	CGGTT	2	10	249255	249264	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009648	GACAA	2	10	258922	258931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009648	GGTTA	2	10	266643	266652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009648	GGTGA	2	10	270122	270131	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009648	TTGGT	2	10	284420	284429	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009648	TGTTC	2	10	287209	287218	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009648	GAGCG	2	10	294619	294628	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009648	CAAAA	2	10	300755	300764	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009648	TCTGC	2	10	301901	301910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009648	AGACC	2	10	310756	310765	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009648	ATATG	2	10	311547	311556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009648	CTCGC	2	10	322074	322083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009648	AGCGG	2	10	323690	323699	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009648	TCGGG	2	10	324234	324243	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009648	TGTTT	2	10	339341	339350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009648	CGTTT	2	10	344780	344789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009648	GCTTT	2	10	348760	348769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009648	GCGCT	2	10	351217	351226	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009648	AGCGC	2	10	356905	356914	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009648	TGAAA	2	10	357924	357933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009648	GTTTT	2	10	367030	367039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009648	CAGCT	2	10	368952	368961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009648	AACGC	2	10	396767	396776	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009648	ACGCT	2	10	410465	410474	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009648	CGCGG	2	10	416758	416767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009648	TTGTG	2	10	421787	421796	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009648	GAGGG	2	10	430224	430233	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009648	AAAAT	2	10	435404	435413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009648	GTTTT	2	10	438376	438385	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009648	CAGGT	2	10	461951	461960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009648	AGCGT	2	10	469561	469570	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009648	TGTTA	2	10	479671	479680	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009648	CTGAC	2	10	484342	484351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009648	GCGAC	2	10	501278	501287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009648	CGTCT	2	10	502363	502372	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009648	GAAAG	2	10	515843	515852	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009648	AGCGC	2	10	517420	517429	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009648	TTTTA	2	10	522896	522905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009648	TGGCG	2	10	533870	533879	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009648	GTAGC	2	10	535716	535725	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009648	AGGTT	2	10	542962	542971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009648	AGCGC	2	10	551868	551877	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009648	AATAA	2	10	554240	554249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009648	TTTCA	2	10	560961	560970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009648	ACACG	2	10	577854	577863	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009648	TTTAT	2	10	579179	579188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009648	AGGGT	2	10	579211	579220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009648	GCGCT	2	10	583009	583018	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009648	GCGCT	2	10	583127	583136	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009648	GGTGC	2	10	583216	583225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009648	CCTCG	2	10	589427	589436	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009648	GGGCG	2	10	597859	597868	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009648	CCACT	2	10	598662	598671	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009648	GCGGG	2	10	600986	600995	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009648	TTTTG	2	10	602560	602569	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009648	AAATA	2	10	609491	609500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009648	CCAGC	2	10	609951	609960	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_009648	TCGGG	2	10	611721	611730	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009648	GTTAA	2	10	611852	611861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009648	CGGTC	2	10	623628	623637	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_009648	AGCGC	2	10	632258	632267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009648	AAGCG	2	10	651205	651214	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009648	TTATT	2	10	656332	656341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009648	GCGCT	2	10	672015	672024	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009648	GCAGA	2	10	674004	674013	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009648	ACAGA	2	10	678291	678300	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009648	GGGAG	2	10	681443	681452	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009648	TGATA	2	10	689849	689858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009648	AGCGC	2	10	691273	691282	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009648	TGCGC	2	10	698328	698337	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009648	GGTAA	2	10	708812	708821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009648	AGCGC	2	10	708927	708936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009648	CTCTC	2	10	717902	717911	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_009648	TCGCG	2	10	742913	742922	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009648	GGAGG	2	10	747178	747187	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009648	GCATA	2	10	763231	763240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009648	TTGGT	2	10	767470	767479	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009648	ATATT	2	10	767554	767563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009648	TTTCT	2	10	789860	789869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009648	GTTAT	2	10	809797	809806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009648	CGGGC	2	10	814123	814132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009648	ATTTA	2	10	828157	828166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009648	GGCGA	2	10	838147	838156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009648	AAGCG	2	10	838428	838437	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009648	GGCGA	2	10	838951	838960	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009648	GGCGA	2	10	839293	839302	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009648	GTCGC	2	10	840695	840704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_009648	AGGCC	2	10	844712	844721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009648	TTTTG	2	10	846572	846581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009648	ATGTT	2	10	846631	846640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009648	TTTCA	2	10	868218	868227	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009648	AGGGC	2	10	873156	873165	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009648	AAAAG	2	10	881626	881635	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009648	AGCGC	2	10	881780	881789	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009648	TTTCG	2	10	885605	885614	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009648	CCGCT	2	10	885615	885624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_009648	GCGCT	2	10	891228	891237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_009648	TCGGG	2	10	891583	891592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009648	AGCGC	2	10	891840	891849	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009648	TCTTT	2	10	898668	898677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009648	AGCGC	2	10	909518	909527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009648	AGCGC	2	10	909636	909645	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009648	CCGGG	2	10	924582	924591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009648	GCAAG	2	10	929351	929360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009648	GGCCG	2	10	939809	939818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009648	AAGTT	2	10	960700	960709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009648	GCGCC	2	10	962973	962982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_009648	CAGGG	2	10	962992	963001	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009648	GCGCT	2	10	969620	969629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009648	ACTTT	2	10	975927	975936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009648	GGCGA	2	10	977035	977044	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009648	AGCGC	2	10	998557	998566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009648	GGCAG	2	10	1003272	1003281	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009648	CCTTT	2	10	1016767	1016776	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009648	CAGCG	2	10	1025569	1025578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009648	CTTTT	2	10	1038676	1038685	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009648	TTTTC	2	10	1116935	1116944	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009648	AGCAG	2	10	1149748	1149757	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009648	AGCGC	2	10	1163860	1163869	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009648	CCTAT	2	10	1165016	1165025	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009648	CAGCG	2	10	1180029	1180038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009648	AGCGC	2	10	1180224	1180233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009648	CGCAG	2	10	1187174	1187183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_009648	GTGCC	2	10	1193224	1193233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009648	AGGGC	2	10	1198545	1198554	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009648	TCGCT	2	10	1200044	1200053	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_009648	TCGCT	2	10	1200298	1200307	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_009648	TCGCT	2	10	1200480	1200489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_009648	AAAAG	2	10	1200595	1200604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_009648	CGCTG	2	10	1205358	1205367	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_009648	TCGCT	2	10	1205538	1205547	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_009648	AAAAG	2	10	1205653	1205662	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009648	GATCG	2	10	1211721	1211730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009648	TGTCC	2	10	1248702	1248711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_009648	TTGGT	2	10	1259724	1259733	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_009648	CGCGC	2	10	1280584	1280593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
160	NC_009648	AGCGC	2	10	1289433	1289442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_009648	GGCGA	2	10	1293934	1293943	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009648	CGCTT	2	10	1304059	1304068	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_009648	TCGTA	2	10	1304490	1304499	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_009648	AGAAA	2	10	1318138	1318147	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009648	GGATA	2	10	1322229	1322238	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_009648	TTACT	2	10	1329206	1329215	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_009648	AGCGC	2	10	1355570	1355579	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_009648	CCCGA	2	10	1355798	1355807	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
175	NC_009648	AGCGC	2	10	1356057	1356066	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_009648	AATGG	2	10	1391429	1391438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009648	CGCCA	2	10	1415019	1415028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_009648	ATAAC	2	10	1423337	1423346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_009648	CCGCG	2	10	1441964	1441973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
184	NC_009648	CCGGG	2	10	1450394	1450403	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
185	NC_009648	ACACA	2	10	1454153	1454162	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_009648	GCGCG	2	10	1458571	1458580	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
187	NC_009648	GCCAG	2	10	1467476	1467485	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_009648	CTGCG	2	10	1477633	1477642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_009648	AAGGA	2	10	1483562	1483571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009648	GCACT	2	10	1502498	1502507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_009648	GGTGG	2	10	1503686	1503695	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009648	TCGCC	2	10	1515122	1515131	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
197	NC_009648	CCGAC	2	10	1515499	1515508	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
198	NC_009648	CCGGG	2	10	1519093	1519102	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
199	NC_009648	CCTCG	2	10	1563340	1563349	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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204	NC_009648	CCTGA	2	10	1595990	1595999	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_009648	GCAAG	2	10	1987975	1987984	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_009648	AGCGC	2	10	1992983	1992992	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
253	NC_009648	CGCCC	2	10	1998977	1998986	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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269	NC_009648	GCCGT	2	10	2123585	2123594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_009648	ATCTT	2	10	2128521	2128530	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_009648	CTGGC	2	10	2128888	2128897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
272	NC_009648	AATTT	2	10	2137880	2137889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009648	AAATA	2	10	2154066	2154075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_009648	GCGTG	2	10	2207749	2207758	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_009648	TCTCT	2	10	2208439	2208448	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
283	NC_009648	GCCTC	2	10	2218130	2218139	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_009648	GTAAA	2	10	2224001	2224010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009648	AAAAT	2	10	3318053	3318062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009648	TTTTC	2	10	3318167	3318176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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