MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 1319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009641	GTTGAA	2	12	3198	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220214
2	NC_009641	TGGCGG	2	12	5376	5387	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	151220216
3	NC_009641	GTTATC	2	12	7304	7315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220217
4	NC_009641	CAGATA	2	12	8213	8224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220217
5	NC_009641	CAAGCT	2	12	8272	8283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220217
6	NC_009641	GTAATG	2	12	9260	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220217
7	NC_009641	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	151220219
8	NC_009641	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220219
9	NC_009641	GCTTTA	2	12	17447	17458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220224
10	NC_009641	TTTGAA	2	12	18268	18279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220224
11	NC_009641	TAAAGG	2	12	20315	20326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	151220226
12	NC_009641	TTGAAG	2	12	20512	20523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220226
13	NC_009641	TGATTG	2	12	21716	21727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220227
14	NC_009641	TGAAAT	2	12	22047	22058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220227
15	NC_009641	AAGGAA	2	12	22485	22496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220228
16	NC_009641	TGAATT	2	12	25414	25425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220229
17	NC_009641	ATTTCA	2	12	27898	27909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220231
18	NC_009641	CTAAAG	2	12	29032	29043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220232
19	NC_009641	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220234
20	NC_009641	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220235
21	NC_009641	ACAAAT	2	12	34755	34766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220236
22	NC_009641	AATTAA	2	12	34846	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220236
23	NC_009641	TTAATG	2	12	37608	37619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220238
24	NC_009641	AAGTCA	2	12	38816	38827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220239
25	NC_009641	AAAAAG	2	12	38930	38941	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220239
26	NC_009641	GAAAAA	2	12	39243	39254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220239
27	NC_009641	AATTAT	2	12	41482	41493	50 %	50 %	0 %	0 %	151220241
28	NC_009641	ACCCTT	2	12	43321	43332	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	151220242
29	NC_009641	ATTTCT	2	12	47845	47856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151220248
30	NC_009641	ATATTT	2	12	47953	47964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220248
31	NC_009641	AAGGAA	2	12	48937	48948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220249
32	NC_009641	TTTAGC	2	12	49986	49997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220250
33	NC_009641	AAATAA	2	12	50037	50048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	151220250
34	NC_009641	GTTAGA	2	12	52160	52171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
35	NC_009641	AAAAGA	2	12	52214	52225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220251
36	NC_009641	GCTAAA	2	12	55001	55012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220253
37	NC_009641	TAAAGA	2	12	58313	58324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220257
38	NC_009641	AACCAC	2	12	62182	62193	50 %	0 %	0 %	50 %	151220259
39	NC_009641	AACCGA	2	12	65502	65513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	151220261
40	NC_009641	CATTAC	2	12	67204	67215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220262
41	NC_009641	ATAGAT	2	12	70403	70414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220264
42	NC_009641	TATCAT	2	12	71170	71181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220265
43	NC_009641	TTTATT	2	12	71578	71589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	151220266
44	NC_009641	TATTTG	2	12	71664	71675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	151220266
45	NC_009641	TAAATA	2	12	73097	73108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220266
46	NC_009641	TTTTTC	2	12	74941	74952	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	151220267
47	NC_009641	TAAGCC	2	12	76802	76813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220269
48	NC_009641	ATCGCA	2	12	78017	78028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220270
49	NC_009641	TTTGAA	2	12	79048	79059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220271
50	NC_009641	GCAATG	2	12	88005	88016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220277
51	NC_009641	TGAAGA	2	12	88840	88851	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	151220278
52	NC_009641	TTTCAT	2	12	89521	89532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151220279
53	NC_009641	TGTATA	2	12	94198	94209	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220284
54	NC_009641	TCGAAA	2	12	95699	95710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220286
55	NC_009641	CTATTG	2	12	98285	98296	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220288
56	NC_009641	CATATG	2	12	99488	99499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220289
57	NC_009641	GGTATG	2	12	102533	102544	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	151220292
58	NC_009641	CAGATT	2	12	105131	105142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220294
59	NC_009641	AGATAT	2	12	112530	112541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220300
60	NC_009641	TAAAGC	2	12	114140	114151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220302
61	NC_009641	TTTTGA	2	12	114326	114337	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	151220302
62	NC_009641	GATATG	2	12	122436	122447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220310
63	NC_009641	ATTTGA	2	12	126342	126353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220313
64	NC_009641	GATTTT	2	12	130853	130864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	151220318
65	NC_009641	ACAAAG	2	12	135373	135384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	151220322
66	NC_009641	TGTAAT	2	12	136397	136408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220323
67	NC_009641	AAAGAT	2	12	137386	137397	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220325
68	NC_009641	CAATAT	2	12	139857	139868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	151220326
69	NC_009641	TTGGTA	2	12	143712	143723	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220330
70	NC_009641	GCGATT	2	12	143732	143743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	151220330
71	NC_009641	AAATTT	2	12	143830	143841	50 %	50 %	0 %	0 %	151220330
72	NC_009641	ACCTGC	2	12	146732	146743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	151220333
73	NC_009641	AAGATA	2	12	146878	146889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220333
74	NC_009641	CGTTAA	2	12	149812	149823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220335
75	NC_009641	CTATTA	2	12	151663	151674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220335
76	NC_009641	TATGAT	2	12	153197	153208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220335
77	NC_009641	TTGAAA	2	12	153649	153660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220335
78	NC_009641	AACATT	2	12	156089	156100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	151220335
79	NC_009641	AGCAAC	2	12	159578	159589	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	151220339
80	NC_009641	TGTTTG	2	12	159626	159637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220339
81	NC_009641	CACCTT	2	12	161630	161641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	151220341
82	NC_009641	ACCTTT	2	12	162135	162146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	151220341
83	NC_009641	GTAAAT	2	12	165871	165882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220344
84	NC_009641	ATTTTA	2	12	167467	167478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220345
85	NC_009641	TATCTT	2	12	172082	172093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151220348
86	NC_009641	ATTTGG	2	12	173095	173106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220349
87	NC_009641	GAGTTT	2	12	176438	176449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220351
88	NC_009641	CCCTGA	2	12	181015	181026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	151220355
89	NC_009641	TCCTGA	2	12	181834	181845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	151220355
90	NC_009641	TCAATT	2	12	183985	183996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220357
91	NC_009641	AATATG	2	12	185285	185296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220358
92	NC_009641	AAAAAT	2	12	188777	188788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	151220360
93	NC_009641	AGGACA	2	12	190638	190649	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	151220362
94	NC_009641	ACATTT	2	12	190974	190985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220362
95	NC_009641	TTCTTG	2	12	195902	195913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	151220366
96	NC_009641	GGACGT	2	12	206404	206415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	151220374
97	NC_009641	TGGTAT	2	12	235547	235558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	151220393
98	NC_009641	TATAGA	2	12	238901	238912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	151220396
99	NC_009641	ACGATG	2	12	245530	245541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220401
100	NC_009641	AAGTAA	2	12	256512	256523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220411
101	NC_009641	ATAAAG	2	12	257493	257504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220412
102	NC_009641	GACATT	2	12	259131	259142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220413
103	NC_009641	GATTTC	2	12	260950	260961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220415
104	NC_009641	TTCATA	2	12	261520	261531	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220416
105	NC_009641	GATTAT	2	12	266472	266483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220421
106	NC_009641	ATGGTG	2	12	266605	266616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	151220421
107	NC_009641	CAGCAA	2	12	266992	267003	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	151220421
108	NC_009641	TCTTCA	2	12	272572	272583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	151220427
109	NC_009641	TTATCT	2	12	272668	272679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	151220427
110	NC_009641	TTTATT	2	12	273737	273748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	151220428
111	NC_009641	AATCCT	2	12	273774	273785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220428
112	NC_009641	GAAAAA	2	12	276288	276299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220432
113	NC_009641	GATACA	2	12	277453	277464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220432
114	NC_009641	AATCAA	2	12	278459	278470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220432
115	NC_009641	ACAAGA	2	12	280620	280631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	151220434
116	NC_009641	AGGACA	2	12	280998	281009	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	151220434
117	NC_009641	TGAAGA	2	12	284109	284120	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	151220435
118	NC_009641	TAAAAC	2	12	290563	290574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220442
119	NC_009641	CGGAAT	2	12	292228	292239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220445
120	NC_009641	TAAAAC	2	12	294719	294730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220449
121	NC_009641	CTGAAT	2	12	302123	302134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220460
122	NC_009641	GAAAAA	2	12	306318	306329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220463
123	NC_009641	TTTATT	2	12	306903	306914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	151220464
124	NC_009641	ACGAAT	2	12	307381	307392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220464
125	NC_009641	GAAACA	2	12	308983	308994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	151220465
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127	NC_009641	AAGAAA	2	12	325349	325360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220480
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130	NC_009641	GCTAAA	2	12	330486	330497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220487
131	NC_009641	CAAATA	2	12	333959	333970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220493
132	NC_009641	ATGACG	2	12	334186	334197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220493
133	NC_009641	TAAAGA	2	12	335705	335716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220496
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137	NC_009641	TGAAGA	2	12	343566	343577	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	151220506
138	NC_009641	CATTTG	2	12	346359	346370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220512
139	NC_009641	TAGATG	2	12	356922	356933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220519
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141	NC_009641	AATGCA	2	12	365105	365116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220526
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148	NC_009641	TTTATT	2	12	389195	389206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	151220550
149	NC_009641	TTTAAA	2	12	389375	389386	50 %	50 %	0 %	0 %	151220550
150	NC_009641	AGGACA	2	12	395780	395791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	151220558
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217	NC_009641	AAAATG	2	12	558344	558355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	151220698
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219	NC_009641	AAAAAG	2	12	569678	569689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220706
220	NC_009641	TGCAGG	2	12	572132	572143	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	151220710
221	NC_009641	CATTTA	2	12	572767	572778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220711
222	NC_009641	GCTGAA	2	12	573456	573467	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220712
223	NC_009641	AGCTAA	2	12	573791	573802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220712
224	NC_009641	CAGTAG	2	12	574820	574831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220714
225	NC_009641	ACGATG	2	12	579063	579074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220716
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227	NC_009641	AAGTTG	2	12	582511	582522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220717
228	NC_009641	CTGGTA	2	12	583294	583305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	151220717
229	NC_009641	TTGTAC	2	12	584151	584162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220719
230	NC_009641	ACGACT	2	12	585018	585029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220721
231	NC_009641	AACGTG	2	12	585991	586002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	151220721
232	NC_009641	TTCGAA	2	12	586512	586523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220721
233	NC_009641	TACAGC	2	12	588758	588769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220723
234	NC_009641	TTGCTA	2	12	589039	589050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	151220723
235	NC_009641	AAATCA	2	12	590162	590173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	151220724
236	NC_009641	TTATGA	2	12	595802	595813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	151220728
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239	NC_009641	ACTGCA	2	12	601929	601940	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220735
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242	NC_009641	GACTCA	2	12	603912	603923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220735
243	NC_009641	GATTCA	2	12	603930	603941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220735
244	NC_009641	GACTCA	2	12	603948	603959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220735
245	NC_009641	GACTCA	2	12	603984	603995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220735
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247	NC_009641	GATTCA	2	12	604038	604049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220735
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254	NC_009641	GACTCA	2	12	604206	604217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220735
255	NC_009641	GATTCA	2	12	604242	604253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220735
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257	NC_009641	TCAGAT	2	12	604299	604310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220735
258	NC_009641	GATTCA	2	12	604314	604325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220735
259	NC_009641	TGTAAC	2	12	606662	606673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220736
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264	NC_009641	GATTCA	2	12	608346	608357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220736
265	NC_009641	GATTCA	2	12	608364	608375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	151220736
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280	NC_009641	GACTCA	2	12	612276	612287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220737
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282	NC_009641	GACTCA	2	12	612402	612413	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220737
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333	NC_009641	CATTGC	2	12	717164	717175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	151220846
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459	NC_009641	CTGAAA	2	12	966722	966733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151221082
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