MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	ATTTAA	2	12	1051	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	150401931
2	NC_009637	AAAGTT	2	12	1758	1769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150401931
3	NC_009637	AAAATG	2	12	2562	2573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401932
4	NC_009637	TAAATT	2	12	2722	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
5	NC_009637	ATCTAA	2	12	3253	3264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150401932
6	NC_009637	AATGCA	2	12	4540	4551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401933
7	NC_009637	TTTGCT	2	12	6971	6982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150401934
8	NC_009637	AAATAA	2	12	10182	10193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150401935
9	NC_009637	TAAAGA	2	12	12019	12030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401936
10	NC_009637	AAAAAG	2	12	16219	16230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150401938
11	NC_009637	AAAAAG	2	12	17526	17537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150401940
12	NC_009637	TAAAAA	2	12	22821	22832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150401944
13	NC_009637	AATTTC	2	12	23503	23514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401945
14	NC_009637	TTTTAA	2	12	24340	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401946
15	NC_009637	TATTAA	2	12	30813	30824	50 %	50 %	0 %	0 %	150401948
16	NC_009637	CTTTTT	2	12	31047	31058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401948
17	NC_009637	GAAAGT	2	12	32745	32756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150401950
18	NC_009637	CATTTT	2	12	35551	35562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150401955
19	NC_009637	TTTCAA	2	12	36615	36626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401956
20	NC_009637	TTTTTC	2	12	37183	37194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401957
21	NC_009637	TCGTCA	2	12	37354	37365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150401958
22	NC_009637	AAGTCC	2	12	46052	46063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150401968
23	NC_009637	AAAATC	2	12	48586	48597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150401971
24	NC_009637	TCTTGA	2	12	51037	51048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150401973
25	NC_009637	TCATTA	2	12	51655	51666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401973
26	NC_009637	TAATTT	2	12	54224	54235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401974
27	NC_009637	TTTTCT	2	12	55493	55504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401975
28	NC_009637	AAGATC	2	12	55651	55662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401975
29	NC_009637	TGAAAC	2	12	63110	63121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401984
30	NC_009637	GATGTA	2	12	68244	68255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401988
31	NC_009637	TTTGAT	2	12	72329	72340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150401989
32	NC_009637	TTGAAT	2	12	73737	73748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150401989
33	NC_009637	GAAAAT	2	12	75657	75668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401990
34	NC_009637	GTAAAT	2	12	79647	79658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150401992
35	NC_009637	ACCGAT	2	12	100773	100784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402007
36	NC_009637	ATAAAA	2	12	103947	103958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402010
37	NC_009637	AATACC	2	12	107550	107561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150402015
38	NC_009637	TTAATT	2	12	107781	107792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402015
39	NC_009637	AATTTT	2	12	110599	110610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402020
40	NC_009637	CAATTG	2	12	112219	112230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402022
41	NC_009637	TTCAAA	2	12	113665	113676	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150402023
42	NC_009637	TTTCAA	2	12	114382	114393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402024
43	NC_009637	TGAAGC	2	12	117478	117489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402028
44	NC_009637	AAAAAT	2	12	118370	118381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402029
45	NC_009637	TCACCA	2	12	128839	128850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150402038
46	NC_009637	TTCCAA	2	12	130337	130348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402039
47	NC_009637	GTTTCC	2	12	133577	133588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150402041
48	NC_009637	ATTGTT	2	12	138021	138032	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150402047
49	NC_009637	CTTGGA	2	12	138075	138086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150402047
50	NC_009637	ATTGAA	2	12	139805	139816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150402048
51	NC_009637	TCCAGG	2	12	141309	141320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150402049
52	NC_009637	ATTAAT	2	12	143113	143124	50 %	50 %	0 %	0 %	150402050
53	NC_009637	TCCAAT	2	12	143771	143782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402051
54	NC_009637	GTCAAC	2	12	146554	146565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402054
55	NC_009637	TATTCA	2	12	147747	147758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402055
56	NC_009637	AAAACT	2	12	150915	150926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402058
57	NC_009637	AAACTA	2	12	154225	154236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402062
58	NC_009637	GACCTT	2	12	159654	159665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402068
59	NC_009637	GGAATC	2	12	160044	160055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402068
60	NC_009637	AGACAC	2	12	160830	160841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150402068
61	NC_009637	TTGAAT	2	12	161996	162007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150402069
62	NC_009637	GTTGCA	2	12	163116	163127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150402071
63	NC_009637	ATCAAA	2	12	163334	163345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402071
64	NC_009637	GCAATA	2	12	163578	163589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402071
65	NC_009637	TCAAAA	2	12	163608	163619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402071
66	NC_009637	TATATT	2	12	168960	168971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402078
67	NC_009637	CATTTA	2	12	170342	170353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402079
68	NC_009637	TTTTCT	2	12	170356	170367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150402079
69	NC_009637	CACCGA	2	12	174122	174133	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	150402086
70	NC_009637	GCGTAA	2	12	178370	178381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402092
71	NC_009637	ATCTGT	2	12	178438	178449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402092
72	NC_009637	ATTCCA	2	12	179033	179044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402093
73	NC_009637	CTGCAA	2	12	179373	179384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402093
74	NC_009637	TTTACA	2	12	180428	180439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402094
75	NC_009637	AAATTT	2	12	180614	180625	50 %	50 %	0 %	0 %	150402094
76	NC_009637	CTGAAG	2	12	185248	185259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402101
77	NC_009637	AAGAGA	2	12	187268	187279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150402101
78	NC_009637	AAAGAT	2	12	195295	195306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402111
79	NC_009637	ACAAAA	2	12	196407	196418	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150402112
80	NC_009637	CATGAA	2	12	196652	196663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402112
81	NC_009637	ATGCAA	2	12	198862	198873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402115
82	NC_009637	CAAGCG	2	12	200760	200771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150402118
83	NC_009637	CCAAAA	2	12	200879	200890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150402118
84	NC_009637	ATGCAA	2	12	201567	201578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402118
85	NC_009637	TGAAAA	2	12	203492	203503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402119
86	NC_009637	TAAAAA	2	12	207251	207262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402123
87	NC_009637	AAGGAA	2	12	208615	208626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150402124
88	NC_009637	TTCTAC	2	12	210627	210638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150402126
89	NC_009637	TCCATG	2	12	210697	210708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402126
90	NC_009637	AAAAGA	2	12	215810	215821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150402130
91	NC_009637	CCAAAA	2	12	216438	216449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150402130
92	NC_009637	ATTTGC	2	12	220819	220830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402135
93	NC_009637	CAAAAA	2	12	223531	223542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150402139
94	NC_009637	CCAGTT	2	12	224898	224909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402140
95	NC_009637	AAATGA	2	12	230918	230929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402146
96	NC_009637	ATAATT	2	12	231119	231130	50 %	50 %	0 %	0 %	150402147
97	NC_009637	TCTTGT	2	12	233552	233563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150402150
98	NC_009637	CAATTC	2	12	235677	235688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402152
99	NC_009637	AAACTA	2	12	236442	236453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402152
100	NC_009637	TTTATC	2	12	238722	238733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402154
101	NC_009637	ATTGAA	2	12	246256	246267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150402160
102	NC_009637	AACTAA	2	12	248685	248696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402164
103	NC_009637	TAAAAC	2	12	251531	251542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402168
104	NC_009637	AGTTTC	2	12	256940	256951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402175
105	NC_009637	CAATTT	2	12	258958	258969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402177
106	NC_009637	CAAATC	2	12	262054	262065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150402180
107	NC_009637	TTTTCA	2	12	264154	264165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402181
108	NC_009637	GAATAC	2	12	265491	265502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402182
109	NC_009637	CGAGTG	2	12	269142	269153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150402183
110	NC_009637	GTTGAA	2	12	270649	270660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150402185
111	NC_009637	TACAAC	2	12	272428	272439	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150402186
112	NC_009637	GTTGAA	2	12	274362	274373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150402188
113	NC_009637	GCAACT	2	12	275925	275936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402189
114	NC_009637	CAGTTC	2	12	277198	277209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402190
115	NC_009637	TTTTAA	2	12	277743	277754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402191
116	NC_009637	ATTTTA	2	12	290513	290524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402202
117	NC_009637	AGTTTT	2	12	295833	295844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150402207
118	NC_009637	TTGGAA	2	12	297717	297728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150402208
119	NC_009637	GTTTTT	2	12	300154	300165	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150402212
120	NC_009637	TTTCAT	2	12	309236	309247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402220
121	NC_009637	TTGAAA	2	12	309800	309811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150402220
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216	NC_009637	TCAAAA	2	12	535371	535382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402454
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218	NC_009637	CTGAAA	2	12	538858	538869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402456
219	NC_009637	AAAGAT	2	12	539928	539939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402458
220	NC_009637	TGTGGT	2	12	542660	542671	0 %	50 %	50 %	0 %	150402461
221	NC_009637	AAACGG	2	12	544775	544786	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150402462
222	NC_009637	TTGCAA	2	12	547168	547179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402464
223	NC_009637	TGAGTA	2	12	549362	549373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150402465
224	NC_009637	AAAAGA	2	12	550948	550959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150402466
225	NC_009637	AGCCCG	2	12	556918	556929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	150402472
226	NC_009637	TAAAAA	2	12	560554	560565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402475
227	NC_009637	ATCACT	2	12	561074	561085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402475
228	NC_009637	CTAAAA	2	12	561706	561717	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402476
229	NC_009637	ATTCTT	2	12	566796	566807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402483
230	NC_009637	TTAATT	2	12	566976	566987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402484
231	NC_009637	CCATTG	2	12	567405	567416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402484
232	NC_009637	TCGATT	2	12	572141	572152	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402488
233	NC_009637	GATGTG	2	12	573460	573471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150402488
234	NC_009637	GAAGCT	2	12	576093	576104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402492
235	NC_009637	TGAAGA	2	12	578747	578758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150402498
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239	NC_009637	TCTGAA	2	12	590103	590114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402511
240	NC_009637	TCTGAA	2	12	593202	593213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402513
241	NC_009637	GCTCCA	2	12	593571	593582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150402513
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243	NC_009637	TACCGA	2	12	595706	595717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402516
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253	NC_009637	AATTTA	2	12	625610	625621	50 %	50 %	0 %	0 %	150402544
254	NC_009637	ATCTGA	2	12	625925	625936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402545
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458	NC_009637	TTGCAG	2	12	1122700	1122711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150403075
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