MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 1467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	TTTTG	2	10	305	314	0 %	80 %	20 %	0 %	150401931
2	NC_009637	AATTT	2	10	1258	1267	40 %	60 %	0 %	0 %	150401931
3	NC_009637	AAATT	2	10	2418	2427	60 %	40 %	0 %	0 %	150401932
4	NC_009637	TAATC	2	10	3166	3175	40 %	40 %	0 %	20 %	150401932
5	NC_009637	AGCAA	2	10	4052	4061	60 %	0 %	20 %	20 %	150401932
6	NC_009637	GATTA	2	10	4845	4854	40 %	40 %	20 %	0 %	150401933
7	NC_009637	TTCTT	2	10	6527	6536	0 %	80 %	0 %	20 %	150401934
8	NC_009637	CAATG	2	10	6838	6847	40 %	20 %	20 %	20 %	150401934
9	NC_009637	AATTG	2	10	7027	7036	40 %	40 %	20 %	0 %	150401934
10	NC_009637	TGTAT	2	10	7483	7492	20 %	60 %	20 %	0 %	150401934
11	NC_009637	ATCGA	2	10	7568	7577	40 %	20 %	20 %	20 %	150401934
12	NC_009637	GATAT	2	10	8312	8321	40 %	40 %	20 %	0 %	150401935
13	NC_009637	TTTCA	2	10	8828	8837	20 %	60 %	0 %	20 %	150401935
14	NC_009637	ATTTT	2	10	11174	11183	20 %	80 %	0 %	0 %	150401936
15	NC_009637	GAATT	2	10	12234	12243	40 %	40 %	20 %	0 %	150401936
16	NC_009637	GAATT	2	10	13125	13134	40 %	40 %	20 %	0 %	150401936
17	NC_009637	ATGGA	2	10	14283	14292	40 %	20 %	40 %	0 %	150401937
18	NC_009637	ATTAT	2	10	15183	15192	40 %	60 %	0 %	0 %	150401937
19	NC_009637	AATAC	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	150401937
20	NC_009637	TAAAT	2	10	15547	15556	60 %	40 %	0 %	0 %	150401937
21	NC_009637	GACAT	2	10	15937	15946	40 %	20 %	20 %	20 %	150401938
22	NC_009637	TATTG	2	10	17176	17185	20 %	60 %	20 %	0 %	150401940
23	NC_009637	AAAAC	2	10	17642	17651	80 %	0 %	0 %	20 %	150401940
24	NC_009637	ATGGA	2	10	20521	20530	40 %	20 %	40 %	0 %	150401942
25	NC_009637	AAAAT	2	10	21122	21131	80 %	20 %	0 %	0 %	150401943
26	NC_009637	ATCAA	2	10	21545	21554	60 %	20 %	0 %	20 %	150401943
27	NC_009637	AATTT	2	10	21975	21984	40 %	60 %	0 %	0 %	150401943
28	NC_009637	TTAAA	2	10	22748	22757	60 %	40 %	0 %	0 %	150401944
29	NC_009637	ATAAA	2	10	23160	23169	80 %	20 %	0 %	0 %	150401945
30	NC_009637	TTTTG	2	10	23634	23643	0 %	80 %	20 %	0 %	150401945
31	NC_009637	GTAAT	2	10	23808	23817	40 %	40 %	20 %	0 %	150401945
32	NC_009637	TATAA	2	10	23820	23829	60 %	40 %	0 %	0 %	150401945
33	NC_009637	CGAGT	2	10	23970	23979	20 %	20 %	40 %	20 %	150401945
34	NC_009637	ATTTT	2	10	28274	28283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009637	ATTAT	2	10	30598	30607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009637	ATTAT	2	10	31583	31592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009637	TCTTT	2	10	31692	31701	0 %	80 %	0 %	20 %	150401949
38	NC_009637	TCATT	2	10	31933	31942	20 %	60 %	0 %	20 %	150401949
39	NC_009637	TACAG	2	10	32369	32378	40 %	20 %	20 %	20 %	150401949
40	NC_009637	TTGTT	2	10	32559	32568	0 %	80 %	20 %	0 %	150401949
41	NC_009637	ATCAA	2	10	35001	35010	60 %	20 %	0 %	20 %	150401955
42	NC_009637	TTTTC	2	10	35935	35944	0 %	80 %	0 %	20 %	150401955
43	NC_009637	ATTTC	2	10	36464	36473	20 %	60 %	0 %	20 %	150401956
44	NC_009637	GGTCT	2	10	36574	36583	0 %	40 %	40 %	20 %	150401956
45	NC_009637	GTTTT	2	10	36779	36788	0 %	80 %	20 %	0 %	150401956
46	NC_009637	AAATC	2	10	36954	36963	60 %	20 %	0 %	20 %	150401957
47	NC_009637	ATTTC	2	10	37044	37053	20 %	60 %	0 %	20 %	150401957
48	NC_009637	TATTT	2	10	38238	38247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009637	AACAG	2	10	39469	39478	60 %	0 %	20 %	20 %	150401960
50	NC_009637	ATTTA	2	10	40659	40668	40 %	60 %	0 %	0 %	150401961
51	NC_009637	AAAAT	2	10	41909	41918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009637	AAATC	2	10	42004	42013	60 %	20 %	0 %	20 %	150401963
53	NC_009637	ATTTT	2	10	42119	42128	20 %	80 %	0 %	0 %	150401963
54	NC_009637	ATTCG	2	10	42387	42396	20 %	40 %	20 %	20 %	150401964
55	NC_009637	ATTTT	2	10	42594	42603	20 %	80 %	0 %	0 %	150401964
56	NC_009637	ATTTA	2	10	43300	43309	40 %	60 %	0 %	0 %	150401965
57	NC_009637	GTAAA	2	10	44064	44073	60 %	20 %	20 %	0 %	150401965
58	NC_009637	ATTTA	2	10	44148	44157	40 %	60 %	0 %	0 %	150401965
59	NC_009637	ACAAT	2	10	44470	44479	60 %	20 %	0 %	20 %	150401966
60	NC_009637	AAATG	2	10	45271	45280	60 %	20 %	20 %	0 %	150401968
61	NC_009637	TTTAA	2	10	47967	47976	40 %	60 %	0 %	0 %	150401970
62	NC_009637	ATTTT	2	10	51685	51694	20 %	80 %	0 %	0 %	150401973
63	NC_009637	ATATT	2	10	55248	55257	40 %	60 %	0 %	0 %	150401975
64	NC_009637	TTTTC	2	10	56536	56545	0 %	80 %	0 %	20 %	150401977
65	NC_009637	CTTTC	2	10	57585	57594	0 %	60 %	0 %	40 %	150401977
66	NC_009637	TAAAT	2	10	57934	57943	60 %	40 %	0 %	0 %	150401978
67	NC_009637	TGTTT	2	10	58294	58303	0 %	80 %	20 %	0 %	150401978
68	NC_009637	GACCT	2	10	60892	60901	20 %	20 %	20 %	40 %	150401982
69	NC_009637	TTTCC	2	10	61094	61103	0 %	60 %	0 %	40 %	150401983
70	NC_009637	TAGTG	2	10	63643	63652	20 %	40 %	40 %	0 %	150401985
71	NC_009637	AACAA	2	10	71679	71688	80 %	0 %	0 %	20 %	150401989
72	NC_009637	TTTAC	2	10	74287	74296	20 %	60 %	0 %	20 %	150401990
73	NC_009637	AAACG	2	10	76790	76799	60 %	0 %	20 %	20 %	150401990
74	NC_009637	TTTAA	2	10	77841	77850	40 %	60 %	0 %	0 %	150401991
75	NC_009637	ATATA	2	10	78139	78148	60 %	40 %	0 %	0 %	150401991
76	NC_009637	TTCAG	2	10	78334	78343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009637	ACACC	2	10	79878	79887	40 %	0 %	0 %	60 %	150401992
78	NC_009637	TGATA	2	10	79992	80001	40 %	40 %	20 %	0 %	150401992
79	NC_009637	GGTAA	2	10	81901	81910	40 %	20 %	40 %	0 %	150401993
80	NC_009637	ATTTT	2	10	82623	82632	20 %	80 %	0 %	0 %	150401994
81	NC_009637	CGTTG	2	10	84731	84740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009637	GTACC	2	10	86150	86159	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009637	TAACG	2	10	87970	87979	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009637	GTGAT	2	10	88335	88344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009637	TTGGA	2	10	88729	88738	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009637	TTAAT	2	10	92335	92344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009637	AAAAT	2	10	93148	93157	80 %	20 %	0 %	0 %	150402000
88	NC_009637	TGCAT	2	10	95357	95366	20 %	40 %	20 %	20 %	150402003
89	NC_009637	GTAAG	2	10	97187	97196	40 %	20 %	40 %	0 %	150402005
90	NC_009637	GAAAA	2	10	101390	101399	80 %	0 %	20 %	0 %	150402008
91	NC_009637	GAAAT	2	10	101803	101812	60 %	20 %	20 %	0 %	150402008
92	NC_009637	TACAT	2	10	102906	102915	40 %	40 %	0 %	20 %	150402009
93	NC_009637	ATTAA	2	10	104108	104117	60 %	40 %	0 %	0 %	150402010
94	NC_009637	TAAAT	2	10	105312	105321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009637	TAATT	2	10	106175	106184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009637	ATTTA	2	10	106885	106894	40 %	60 %	0 %	0 %	150402014
97	NC_009637	TTAAA	2	10	107025	107034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009637	TTATT	2	10	110141	110150	20 %	80 %	0 %	0 %	150402020
99	NC_009637	ATTTT	2	10	111263	111272	20 %	80 %	0 %	0 %	150402021
100	NC_009637	ATTAT	2	10	111572	111581	40 %	60 %	0 %	0 %	150402021
101	NC_009637	AATTA	2	10	116491	116500	60 %	40 %	0 %	0 %	150402027
102	NC_009637	ACTTC	2	10	118167	118176	20 %	40 %	0 %	40 %	150402029
103	NC_009637	TAAAT	2	10	120193	120202	60 %	40 %	0 %	0 %	150402030
104	NC_009637	GTTTT	2	10	123460	123469	0 %	80 %	20 %	0 %	150402033
105	NC_009637	GGGCG	2	10	125634	125643	0 %	0 %	80 %	20 %	150402035
106	NC_009637	AAAAT	2	10	127035	127044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009637	CAATT	2	10	127119	127128	40 %	40 %	0 %	20 %	150402037
108	NC_009637	AATAT	2	10	127678	127687	60 %	40 %	0 %	0 %	150402037
109	NC_009637	TAATT	2	10	128496	128505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009637	TGTTT	2	10	131429	131438	0 %	80 %	20 %	0 %	150402040
111	NC_009637	TTTCT	2	10	131448	131457	0 %	80 %	0 %	20 %	150402040
112	NC_009637	ATGCA	2	10	133385	133394	40 %	20 %	20 %	20 %	150402041
113	NC_009637	ATAAA	2	10	134763	134772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009637	AAGCT	2	10	135168	135177	40 %	20 %	20 %	20 %	150402044
115	NC_009637	GGGAG	2	10	136302	136311	20 %	0 %	80 %	0 %	150402045
116	NC_009637	ATTTT	2	10	138895	138904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009637	GGGGC	2	10	139646	139655	0 %	0 %	80 %	20 %	150402048
118	NC_009637	TTCTT	2	10	140961	140970	0 %	80 %	0 %	20 %	150402049
119	NC_009637	TTAAA	2	10	143404	143413	60 %	40 %	0 %	0 %	150402051
120	NC_009637	TTGAA	2	10	143570	143579	40 %	40 %	20 %	0 %	150402051
121	NC_009637	TTTTA	2	10	145302	145311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009637	AATTC	2	10	146291	146300	40 %	40 %	0 %	20 %	150402054
123	NC_009637	TACAT	2	10	146777	146786	40 %	40 %	0 %	20 %	150402054
124	NC_009637	GCTTT	2	10	146985	146994	0 %	60 %	20 %	20 %	150402054
125	NC_009637	TTCTT	2	10	148345	148354	0 %	80 %	0 %	20 %	150402055
126	NC_009637	AGAAT	2	10	148427	148436	60 %	20 %	20 %	0 %	150402055
127	NC_009637	AAGAA	2	10	149354	149363	80 %	0 %	20 %	0 %	150402057
128	NC_009637	ATCAA	2	10	150429	150438	60 %	20 %	0 %	20 %	150402058
129	NC_009637	TCTAT	2	10	151753	151762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009637	TATGA	2	10	151772	151781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009637	AATTG	2	10	152385	152394	40 %	40 %	20 %	0 %	150402060
132	NC_009637	TTTTA	2	10	153271	153280	20 %	80 %	0 %	0 %	150402061
133	NC_009637	ATTAT	2	10	155619	155628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009637	TGAAT	2	10	156490	156499	40 %	40 %	20 %	0 %	150402065
135	NC_009637	TATAA	2	10	157924	157933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009637	TAATT	2	10	158702	158711	40 %	60 %	0 %	0 %	150402066
137	NC_009637	GGTGT	2	10	159477	159486	0 %	40 %	60 %	0 %	150402068
138	NC_009637	GGAAA	2	10	159939	159948	60 %	0 %	40 %	0 %	150402068
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259	NC_009637	GAATG	2	10	309067	309076	40 %	20 %	40 %	0 %	150402220
260	NC_009637	CTACA	2	10	310311	310320	40 %	20 %	0 %	40 %	150402220
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263	NC_009637	AGAAA	2	10	318895	318904	80 %	0 %	20 %	0 %	150402230
264	NC_009637	TTCTT	2	10	319663	319672	0 %	80 %	0 %	20 %	150402231
265	NC_009637	GTTTT	2	10	320454	320463	0 %	80 %	20 %	0 %	150402232
266	NC_009637	TTTTA	2	10	320839	320848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009637	GAAAT	2	10	321944	321953	60 %	20 %	20 %	0 %	150402234
268	NC_009637	GGCAA	2	10	323656	323665	40 %	0 %	40 %	20 %	150402236
269	NC_009637	CAGAG	2	10	324672	324681	40 %	0 %	40 %	20 %	150402237
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