MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	ATTTT	2	10	28274	28283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009637	ATTAT	2	10	30598	30607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009637	ATTAT	2	10	31583	31592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009637	TATTT	2	10	38238	38247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009637	AAAAT	2	10	41909	41918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009637	TTCAG	2	10	78334	78343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009637	CGTTG	2	10	84731	84740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009637	GTACC	2	10	86150	86159	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009637	TAACG	2	10	87970	87979	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009637	GTGAT	2	10	88335	88344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009637	TTGGA	2	10	88729	88738	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009637	TTAAT	2	10	92335	92344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009637	TAAAT	2	10	105312	105321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009637	TAATT	2	10	106175	106184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009637	TTAAA	2	10	107025	107034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009637	AAAAT	2	10	127035	127044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009637	TAATT	2	10	128496	128505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009637	ATAAA	2	10	134763	134772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009637	ATTTT	2	10	138895	138904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009637	TTTTA	2	10	145302	145311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009637	TCTAT	2	10	151753	151762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009637	TATGA	2	10	151772	151781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009637	ATTAT	2	10	155619	155628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009637	TATAA	2	10	157924	157933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009637	AATAA	2	10	164073	164082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009637	AATTA	2	10	164090	164099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009637	AAAAT	2	10	165364	165373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009637	TAAAA	2	10	166804	166813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009637	TCTCA	2	10	167871	167880	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009637	GAGTG	2	10	172044	172053	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009637	TTAAA	2	10	179685	179694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009637	ATTTT	2	10	203607	203616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009637	TATAA	2	10	206214	206223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009637	TTTAA	2	10	206336	206345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009637	ATTTT	2	10	212789	212798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009637	TTTAT	2	10	239699	239708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009637	TTTAA	2	10	249086	249095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009637	CACAA	2	10	260980	260989	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009637	TAAAA	2	10	261944	261953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009637	TAAAA	2	10	263765	263774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009637	ATACC	2	10	279576	279585	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009637	TATTT	2	10	282384	282393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009637	ATTTA	2	10	284397	284406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009637	ATTTG	2	10	289194	289203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009637	TTGAT	2	10	291767	291776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009637	ATCCT	2	10	293129	293138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009637	TAATT	2	10	315678	315687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009637	TTTTA	2	10	320839	320848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009637	CCAAT	2	10	333385	333394	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009637	AAATT	2	10	336499	336508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009637	GATTT	2	10	344727	344736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009637	GTTAA	2	10	350434	350443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009637	ATTTA	2	10	366173	366182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009637	ATAGA	2	10	379109	379118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009637	ATTTA	2	10	382273	382282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009637	TAAAA	2	10	387338	387347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009637	TTAAT	2	10	389122	389131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009637	AATAA	2	10	398278	398287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009637	AATTT	2	10	398298	398307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009637	AAAAT	2	10	398515	398524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009637	TAAAT	2	10	406086	406095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009637	ATTTT	2	10	417425	417434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009637	TCATA	2	10	428644	428653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009637	TAGAT	2	10	431216	431225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009637	AATAT	2	10	442453	442462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009637	AAATC	2	10	442531	442540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009637	AATAT	2	10	461824	461833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009637	AAAAT	2	10	472332	472341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009637	TTTAA	2	10	481040	481049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009637	ATATA	2	10	497014	497023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009637	TAAAA	2	10	514215	514224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009637	ATTAA	2	10	528869	528878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009637	AGATT	2	10	537798	537807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009637	TTTAA	2	10	539531	539540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009637	TAAAA	2	10	561132	561141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009637	AAATA	2	10	563141	563150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009637	GACTA	2	10	573793	573802	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009637	TGATA	2	10	599990	599999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009637	ATTTA	2	10	601220	601229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009637	TATTT	2	10	602025	602034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009637	TTAAA	2	10	613832	613841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009637	ATTTA	2	10	629324	629333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009637	ATAAA	2	10	635417	635426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009637	AAATT	2	10	644338	644347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009637	TAAAA	2	10	649668	649677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009637	CAAAT	2	10	661453	661462	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009637	TAAAA	2	10	672285	672294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009637	TTTTA	2	10	677384	677393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009637	AAAAC	2	10	699024	699033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009637	TCCAA	2	10	699067	699076	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009637	TAAAT	2	10	699556	699565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009637	TAAAA	2	10	699652	699661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009637	TAAAT	2	10	702020	702029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009637	ATTTA	2	10	709302	709311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009637	ACCTA	2	10	709338	709347	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009637	TAAAA	2	10	710746	710755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009637	AAAAG	2	10	716344	716353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009637	AAAAT	2	10	719709	719718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009637	AAAGT	2	10	722413	722422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009637	ATATT	2	10	722438	722447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009637	TTTTA	2	10	730582	730591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009637	AATTT	2	10	735962	735971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009637	TAAAT	2	10	758791	758800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009637	AAATT	2	10	761688	761697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009637	TTTAA	2	10	763068	763077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009637	AGGGA	2	10	778043	778052	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009637	AATTA	2	10	785039	785048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009637	AAAAG	2	10	803142	803151	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009637	CTAAC	2	10	808506	808515	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009637	ATTTT	2	10	809716	809725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009637	ATATA	2	10	816994	817003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009637	AATTA	2	10	820283	820292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009637	AATTA	2	10	820376	820385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009637	TAATT	2	10	822617	822626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009637	AATTA	2	10	822638	822647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009637	TAAAA	2	10	822794	822803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009637	ATAAC	2	10	832812	832821	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009637	GTAGA	2	10	834284	834293	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009637	TAAAA	2	10	837034	837043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009637	TAAAT	2	10	849527	849536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009637	ATTTA	2	10	867938	867947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009637	AAAAT	2	10	868186	868195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009637	ATTAA	2	10	869920	869929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009637	ATAAA	2	10	886584	886593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009637	TAAAA	2	10	893610	893619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009637	CTACC	2	10	893681	893690	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_009637	AAAAT	2	10	893816	893825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009637	TAAAT	2	10	897112	897121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009637	ATTAT	2	10	915079	915088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009637	TTTAA	2	10	918232	918241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009637	AAAAT	2	10	919665	919674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009637	TAAAA	2	10	922259	922268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009637	AATTA	2	10	931320	931329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009637	ATATG	2	10	931380	931389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009637	AATTT	2	10	931423	931432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009637	GTTTT	2	10	934909	934918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009637	TAAAA	2	10	955701	955710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009637	GGGAT	2	10	955788	955797	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009637	TTAAA	2	10	955835	955844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009637	CATAC	2	10	958310	958319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_009637	CCAAG	2	10	958810	958819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009637	TAAAA	2	10	960741	960750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009637	GGGAT	2	10	960828	960837	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009637	TTAAA	2	10	960875	960884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009637	CATAC	2	10	963350	963359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009637	CCAAG	2	10	963850	963859	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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148	NC_009637	ATGAA	2	10	992961	992970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.