MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	ATTTTT	2	12	73	84	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	ATATTT	2	12	2624	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009635	TTTTTA	2	12	18282	18293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009635	TAATTA	2	12	19200	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009635	TTTTTG	2	12	21748	21759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009635	ATTATA	2	12	27008	27019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009635	GTATAT	2	12	40485	40496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009635	ATTTTT	2	12	55075	55086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009635	TTTTAT	2	12	57509	57520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009635	TAATAT	2	12	75943	75954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009635	TATATT	2	12	102805	102816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009635	ATTTAT	2	12	104068	104079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009635	TATTTT	2	12	106517	106528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009635	TTTAAT	2	12	109385	109396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009635	TTTATT	2	12	114939	114950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009635	TAAAAT	2	12	134476	134487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009635	TATCAA	2	12	142009	142020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009635	ATTAAT	2	12	143157	143168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009635	TATAAT	2	12	162306	162317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009635	TATAAA	2	12	170404	170415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009635	TAATTT	3	18	179859	179876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009635	ATTAAT	2	12	188604	188615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009635	TAAAAA	2	12	196433	196444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009635	AATTTA	2	12	204122	204133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009635	TTATAT	2	12	204601	204612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009635	ATTATA	2	12	215238	215249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009635	TATAAA	2	12	215979	215990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009635	TTATAT	2	12	220214	220225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009635	AAAACG	2	12	227058	227069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009635	TAAAAA	2	12	237587	237598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009635	AATAAA	2	12	237599	237610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009635	ATATTA	2	12	242164	242175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009635	TATAAA	2	12	243192	243203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009635	AATTTA	2	12	245395	245406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009635	ATTATA	2	12	258531	258542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009635	ATATAA	2	12	269145	269156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009635	TTAATT	2	12	274053	274064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009635	ATATTT	3	18	289773	289790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	AATTAT	2	12	296146	296157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009635	AATATA	2	12	299786	299797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009635	TTTATA	4	24	301682	301705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009635	ATATGT	2	12	303003	303014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009635	AAAGGA	2	12	314128	314139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009635	TTTATT	2	12	315251	315262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009635	TGCTTT	2	12	331526	331537	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009635	GTTATT	2	12	333781	333792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009635	TAAATA	2	12	335244	335255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009635	TAAAAA	2	12	339904	339915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009635	TAAAAA	2	12	339946	339957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009635	TATAAT	2	12	341059	341070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009635	ATATAA	2	12	356161	356172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009635	TAAATA	2	12	363334	363345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009635	ATATTA	2	12	367615	367626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009635	TAAAAA	2	12	383149	383160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009635	TAAAAA	2	12	418833	418844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009635	TTAAAA	2	12	459634	459645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009635	TTCTAT	2	12	462589	462600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009635	TAATAT	2	12	468527	468538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009635	ATAGTT	2	12	471973	471984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009635	ATTTAT	2	12	478559	478570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009635	ATTTAT	2	12	481060	481071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009635	TTTATT	3	18	506913	506930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009635	TGTATA	2	12	511907	511918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009635	TTAATA	2	12	519751	519762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	TAAATA	2	12	526693	526704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009635	TAAAAT	2	12	547155	547166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009635	GAAAGT	2	12	553252	553263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009635	AAAAAT	2	12	553498	553509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009635	TGATTT	2	12	554771	554782	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	ATAAAA	2	12	558347	558358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009635	TAAAAT	2	12	588995	589006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009635	TACATA	7	42	594072	594113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009635	CATATA	2	12	594122	594133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009635	GTATTG	2	12	604222	604233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009635	TATATG	2	12	607819	607830	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009635	TGATTT	2	12	626308	626319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009635	TAATTT	2	12	627730	627741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009635	AAATAT	2	12	641842	641853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009635	AAATAA	2	12	644293	644304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009635	ATATTA	2	12	646234	646245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009635	AATATT	2	12	649560	649571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009635	TAAATT	2	12	651178	651189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009635	GTTATT	2	12	653597	653608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009635	TAAAAT	2	12	662127	662138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009635	TAATCA	2	12	670922	670933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009635	TAAAAA	2	12	673527	673538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009635	TAAAAA	2	12	673590	673601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009635	AAATTT	2	12	686820	686831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009635	AAAAAC	2	12	686918	686929	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009635	ATTTAC	2	12	692906	692917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009635	TAATAT	2	12	704793	704804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	TAATTT	2	12	708825	708836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009635	TTTTAT	2	12	709860	709871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009635	ATTAGA	2	12	716847	716858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009635	AATATA	2	12	720135	720146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009635	AAAAAT	2	12	734014	734025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009635	TTTGAT	2	12	755287	755298	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009635	ATGGAT	2	12	768702	768713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009635	ATAACA	2	12	777574	777585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009635	ACTAAA	2	12	797249	797260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009635	TAATTT	2	12	809574	809585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009635	ATTTAA	2	12	811234	811245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009635	TTTAAA	2	12	812668	812679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009635	ATAAAT	3	18	819470	819487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009635	AATATA	2	12	832662	832673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009635	ATTTAT	2	12	839715	839726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009635	TTATTG	2	12	839727	839738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009635	ATCATT	2	12	842741	842752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009635	TATATT	2	12	860346	860357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009635	ATATTT	2	12	861809	861820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009635	TATTTT	2	12	865029	865040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009635	TTTTTA	2	12	867758	867769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	AAATTA	2	12	869474	869485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009635	AATAAA	2	12	870850	870861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009635	AAATGC	2	12	900352	900363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009635	TTTATA	2	12	901827	901838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	TTTTAT	2	12	902161	902172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009635	CTATAT	2	12	912362	912373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009635	TAAAAA	2	12	916779	916790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009635	ATAAAA	2	12	919675	919686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009635	TATAAT	2	12	920544	920555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009635	AAATAT	2	12	927741	927752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009635	TAAAAA	2	12	929586	929597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009635	TAAAAA	2	12	929632	929643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009635	CAAAAC	2	12	942291	942302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009635	CAACAT	2	12	950685	950696	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009635	AATTTA	2	12	971403	971414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	TAAAAA	2	12	980353	980364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009635	ATAATG	2	12	986584	986595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009635	AATAAA	3	18	990282	990299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009635	ATATGC	2	12	997409	997420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_009635	AAAATA	2	12	1004912	1004923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	AATATA	2	12	1017593	1017604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009635	AATAAA	2	12	1017736	1017747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009635	ATATAA	2	12	1021729	1021740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.